MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 38800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010483	TCA	2	6	143203	143208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287956
3002	NC_010483	GGA	2	6	143217	143222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287956
3003	NC_010483	CAG	2	6	143228	143233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287956
3004	NC_010483	TTC	2	6	143236	143241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287956
3005	NC_010483	AAAC	2	8	143249	143256	75 %	0 %	0 %	25 %	170287956
3006	NC_010483	AAG	2	6	143292	143297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287956
3007	NC_010483	AAG	2	6	143303	143308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287956
3008	NC_010483	ACA	2	6	143311	143316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287956
3009	NC_010483	AAAGA	2	10	143330	143339	80 %	0 %	20 %	0 %	170287956
3010	NC_010483	CAT	2	6	143372	143377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287956
3011	NC_010483	CCA	2	6	143501	143506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170287956
3012	NC_010483	GAT	2	6	143531	143536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287956
3013	NC_010483	AGCAG	2	10	143546	143555	40 %	0 %	40 %	20 %	170287956
3014	NC_010483	CAAG	2	8	143593	143600	50 %	0 %	25 %	25 %	170287956
3015	NC_010483	CTGT	2	8	143608	143615	0 %	50 %	25 %	25 %	170287956
3016	NC_010483	GAA	2	6	143638	143643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287956
3017	NC_010483	GTA	2	6	143733	143738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287956
3018	NC_010483	TCC	2	6	143944	143949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287957
3019	NC_010483	TCCT	2	8	144003	144010	0 %	50 %	0 %	50 %	170287957
3020	NC_010483	TCG	2	6	144016	144021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287957
3021	NC_010483	CT	3	6	144094	144099	0 %	50 %	0 %	50 %	170287957
3022	NC_010483	CTT	2	6	144245	144250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287957
3023	NC_010483	CGA	2	6	144299	144304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287957
3024	NC_010483	ATG	2	6	144313	144318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287957
3025	NC_010483	TCT	2	6	144357	144362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287957
3026	NC_010483	GTT	2	6	144369	144374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287957
3027	NC_010483	GCG	2	6	144415	144420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170287957
3028	NC_010483	TTC	2	6	144508	144513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287957
3029	NC_010483	AGC	2	6	144516	144521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287957
3030	NC_010483	CTTT	2	8	144563	144570	0 %	75 %	0 %	25 %	170287957
3031	NC_010483	CAT	2	6	144582	144587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287957
3032	NC_010483	TGT	2	6	144782	144787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287957
3033	NC_010483	CAA	2	6	144827	144832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287957
3034	NC_010483	T	7	7	144890	144896	0 %	100 %	0 %	0 %	170287957
3035	NC_010483	CGA	2	6	144968	144973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287957
3036	NC_010483	ATC	2	6	144979	144984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287957
3037	NC_010483	CAG	2	6	144987	144992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287957
3038	NC_010483	ACT	2	6	145030	145035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287957
3039	NC_010483	GGC	2	6	145158	145163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170287957
3040	NC_010483	CCG	2	6	145211	145216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170287957
3041	NC_010483	GC	3	6	145258	145263	0 %	0 %	50 %	50 %	170287957
3042	NC_010483	GT	3	6	145289	145294	0 %	50 %	50 %	0 %	170287957
3043	NC_010483	TCC	2	6	145356	145361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287957
3044	NC_010483	TTC	2	6	145362	145367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287957
3045	NC_010483	GAG	2	6	145401	145406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287957
3046	NC_010483	ACA	2	6	145444	145449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287957
3047	NC_010483	CTT	2	6	145529	145534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287957
3048	NC_010483	TTC	2	6	145551	145556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287957
3049	NC_010483	CTCTAT	2	12	145557	145568	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	170287957
3050	NC_010483	CT	3	6	145643	145648	0 %	50 %	0 %	50 %	170287957
3051	NC_010483	GAT	2	6	145665	145670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287957
3052	NC_010483	GAT	2	6	145701	145706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287957
3053	NC_010483	TCT	2	6	145745	145750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287957
3054	NC_010483	TTTTC	2	10	145751	145760	0 %	80 %	0 %	20 %	170287957
3055	NC_010483	GAC	2	6	145761	145766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287957
3056	NC_010483	TCTT	2	8	145795	145802	0 %	75 %	0 %	25 %	170287957
3057	NC_010483	GCT	2	6	145814	145819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287957
3058	NC_010483	TCT	2	6	145834	145839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287957
3059	NC_010483	ATG	2	6	145852	145857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287957
3060	NC_010483	TTC	2	6	145869	145874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287957
3061	NC_010483	TTCACG	2	12	145897	145908	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	170287957
3062	NC_010483	GAA	2	6	145928	145933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287957
3063	NC_010483	ACC	2	6	146018	146023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170287958
3064	NC_010483	TCC	3	9	146048	146056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287958
3065	NC_010483	TAT	2	6	146152	146157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170287958
3066	NC_010483	ATG	3	9	146195	146203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287958
3067	NC_010483	TCT	2	6	146208	146213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287958
3068	NC_010483	TA	3	6	146227	146232	50 %	50 %	0 %	0 %	170287958
3069	NC_010483	TCTT	2	8	146262	146269	0 %	75 %	0 %	25 %	170287958
3070	NC_010483	GA	3	6	146360	146365	50 %	0 %	50 %	0 %	170287959
3071	NC_010483	CAC	2	6	146369	146374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170287959
3072	NC_010483	TGA	2	6	146377	146382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287959
3073	NC_010483	TCA	2	6	146392	146397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287959
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3079	NC_010483	ACC	2	6	146651	146656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170287960
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3086	NC_010483	CTTC	2	8	146990	146997	0 %	50 %	0 %	50 %	170287960
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3091	NC_010483	TGA	2	6	147165	147170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287960
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3093	NC_010483	CT	3	6	147276	147281	0 %	50 %	0 %	50 %	170287960
3094	NC_010483	TCA	2	6	147287	147292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287960
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3099	NC_010483	TCA	2	6	147413	147418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287961
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3101	NC_010483	TTG	2	6	147427	147432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287961
3102	NC_010483	T	6	6	147482	147487	0 %	100 %	0 %	0 %	170287961
3103	NC_010483	TC	3	6	147630	147635	0 %	50 %	0 %	50 %	170287961
3104	NC_010483	CTTT	2	8	147683	147690	0 %	75 %	0 %	25 %	170287961
3105	NC_010483	TC	4	8	147784	147791	0 %	50 %	0 %	50 %	170287961
3106	NC_010483	TCC	2	6	147805	147810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287961
3107	NC_010483	TCG	2	6	147893	147898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287961
3108	NC_010483	TTC	2	6	147954	147959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287961
3109	NC_010483	CGC	2	6	147981	147986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170287961
3110	NC_010483	CTG	2	6	147987	147992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287961
3111	NC_010483	TCC	2	6	148099	148104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287961
3112	NC_010483	TC	3	6	148180	148185	0 %	50 %	0 %	50 %	170287961
3113	NC_010483	GA	3	6	148192	148197	50 %	0 %	50 %	0 %	170287961
3114	NC_010483	TCT	2	6	148198	148203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287961
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3117	NC_010483	AGG	2	6	148453	148458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287962
3118	NC_010483	AGGT	2	8	148498	148505	25 %	25 %	50 %	0 %	170287962
3119	NC_010483	GAAC	2	8	148544	148551	50 %	0 %	25 %	25 %	170287962
3120	NC_010483	GCGGA	2	10	148566	148575	20 %	0 %	60 %	20 %	170287962
3121	NC_010483	GAAA	2	8	148610	148617	75 %	0 %	25 %	0 %	170287962
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3493	NC_010483	ACT	2	6	165309	165314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287976
3494	NC_010483	TTC	2	6	165344	165349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287976
3495	NC_010483	GAT	2	6	165380	165385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287976
3496	NC_010483	ACT	2	6	165396	165401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287976
3497	NC_010483	AC	3	6	165498	165503	50 %	0 %	0 %	50 %	170287976
3498	NC_010483	AAG	2	6	165545	165550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287976
3499	NC_010483	GA	3	6	165601	165606	50 %	0 %	50 %	0 %	170287976
3500	NC_010483	A	6	6	165614	165619	100 %	0 %	0 %	0 %	170287976

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