MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 38800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010483	AAG	2	6	256245	256250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288072
5502	NC_010483	ATCTCG	2	12	256269	256280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	170288073
5503	NC_010483	CTT	2	6	256285	256290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288073
5504	NC_010483	CACTCT	2	12	256430	256441	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	170288073
5505	NC_010483	CAC	2	6	256442	256447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288073
5506	NC_010483	GTC	2	6	256448	256453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288073
5507	NC_010483	TCG	2	6	256495	256500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288073
5508	NC_010483	ACA	2	6	256557	256562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288073
5509	NC_010483	GTCT	2	8	256597	256604	0 %	50 %	25 %	25 %	170288073
5510	NC_010483	CT	3	6	256609	256614	0 %	50 %	0 %	50 %	170288073
5511	NC_010483	GGC	2	6	256640	256645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288073
5512	NC_010483	GAAG	2	8	256679	256686	50 %	0 %	50 %	0 %	170288073
5513	NC_010483	TTC	2	6	256689	256694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288073
5514	NC_010483	AGA	2	6	256699	256704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288073
5515	NC_010483	CT	3	6	256706	256711	0 %	50 %	0 %	50 %	170288073
5516	NC_010483	TC	3	6	256720	256725	0 %	50 %	0 %	50 %	170288073
5517	NC_010483	TTC	2	6	256745	256750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288073
5518	NC_010483	TCA	2	6	256810	256815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288073
5519	NC_010483	AAGA	2	8	256859	256866	75 %	0 %	25 %	0 %	170288073
5520	NC_010483	AGG	2	6	256874	256879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288073
5521	NC_010483	GAGG	2	8	256886	256893	25 %	0 %	75 %	0 %	170288073
5522	NC_010483	CGTG	2	8	256942	256949	0 %	25 %	50 %	25 %	170288073
5523	NC_010483	GAT	2	6	256955	256960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288073
5524	NC_010483	ATC	2	6	257046	257051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288073
5525	NC_010483	TCC	2	6	257229	257234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288074
5526	NC_010483	GTC	2	6	257264	257269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288074
5527	NC_010483	CTT	2	6	257363	257368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288074
5528	NC_010483	CTCAC	2	10	257376	257385	20 %	20 %	0 %	60 %	170288075
5529	NC_010483	GAA	2	6	257598	257603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288075
5530	NC_010483	TGT	2	6	257631	257636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288075
5531	NC_010483	T	6	6	257691	257696	0 %	100 %	0 %	0 %	170288075
5532	NC_010483	CTT	2	6	257736	257741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288075
5533	NC_010483	TGA	2	6	257756	257761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288075
5534	NC_010483	TGG	2	6	257847	257852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288076
5535	NC_010483	TCT	2	6	257894	257899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288076
5536	NC_010483	TCT	2	6	257911	257916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288076
5537	NC_010483	CTT	2	6	257992	257997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288076
5538	NC_010483	TTC	2	6	258009	258014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288076
5539	NC_010483	CTG	2	6	258084	258089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288076
5540	NC_010483	TTC	2	6	258193	258198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288076
5541	NC_010483	CTCTG	2	10	258205	258214	0 %	40 %	20 %	40 %	170288076
5542	NC_010483	CTT	2	6	258282	258287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288076
5543	NC_010483	TC	4	8	258293	258300	0 %	50 %	0 %	50 %	170288076
5544	NC_010483	CA	3	6	258631	258636	50 %	0 %	0 %	50 %	170288077
5545	NC_010483	AGA	2	6	258637	258642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288077
5546	NC_010483	AAG	2	6	258667	258672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288077
5547	NC_010483	TTTCA	2	10	258673	258682	20 %	60 %	0 %	20 %	170288077
5548	NC_010483	TCCA	2	8	258706	258713	25 %	25 %	0 %	50 %	170288077
5549	NC_010483	GAA	2	6	258779	258784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288077
5550	NC_010483	A	6	6	258800	258805	100 %	0 %	0 %	0 %	170288077
5551	NC_010483	AG	4	8	258808	258815	50 %	0 %	50 %	0 %	170288077
5552	NC_010483	ACG	2	6	258825	258830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288077
5553	NC_010483	TGA	2	6	258858	258863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288077
5554	NC_010483	GATC	2	8	258883	258890	25 %	25 %	25 %	25 %	170288077
5555	NC_010483	GGA	2	6	258925	258930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288077
5556	NC_010483	CTA	2	6	259033	259038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288077
5557	NC_010483	AGA	2	6	259077	259082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288077
5558	NC_010483	TGG	2	6	259161	259166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288078
5559	NC_010483	GCAG	2	8	259231	259238	25 %	0 %	50 %	25 %	170288078
5560	NC_010483	CAA	2	6	259254	259259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288078
5561	NC_010483	TCC	2	6	259284	259289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288078
5562	NC_010483	GTG	2	6	259302	259307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288078
5563	NC_010483	TGG	2	6	259308	259313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288078
5564	NC_010483	GCT	2	6	259364	259369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288078
5565	NC_010483	A	6	6	259427	259432	100 %	0 %	0 %	0 %	170288078
5566	NC_010483	AG	3	6	259446	259451	50 %	0 %	50 %	0 %	170288078
5567	NC_010483	GTG	2	6	259457	259462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288078
5568	NC_010483	ACG	2	6	259482	259487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288078
5569	NC_010483	CA	3	6	259512	259517	50 %	0 %	0 %	50 %	170288078
5570	NC_010483	GAG	2	6	259530	259535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288078
5571	NC_010483	AAC	2	6	259611	259616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288079
5572	NC_010483	GATA	2	8	259676	259683	50 %	25 %	25 %	0 %	170288079
5573	NC_010483	T	6	6	259711	259716	0 %	100 %	0 %	0 %	170288079
5574	NC_010483	TCC	2	6	259792	259797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288079
5575	NC_010483	GAA	2	6	259808	259813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288079
5576	NC_010483	TCA	2	6	259819	259824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288079
5577	NC_010483	CGG	2	6	259826	259831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288079
5578	NC_010483	CGG	2	6	259838	259843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288079
5579	NC_010483	GGAC	2	8	259901	259908	25 %	0 %	50 %	25 %	170288079
5580	NC_010483	CGA	2	6	259958	259963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288079
5581	NC_010483	TCA	3	9	260032	260040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288079
5582	NC_010483	CGG	2	6	260059	260064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288079
5583	NC_010483	TCT	2	6	260134	260139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288079
5584	NC_010483	CCG	2	6	260140	260145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288079
5585	NC_010483	ACC	2	6	260244	260249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288079
5586	NC_010483	CAA	2	6	260336	260341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288079
5587	NC_010483	TAC	2	6	260352	260357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288079
5588	NC_010483	GAA	2	6	260361	260366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288079
5589	NC_010483	GAA	2	6	260402	260407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288079
5590	NC_010483	GAACGA	2	12	260535	260546	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	170288080
5591	NC_010483	TCT	2	6	260565	260570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288080
5592	NC_010483	GAAG	2	8	260574	260581	50 %	0 %	50 %	0 %	170288080
5593	NC_010483	TCA	2	6	260621	260626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288080
5594	NC_010483	GAA	2	6	260645	260650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288080
5595	NC_010483	GAG	2	6	260656	260661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288080
5596	NC_010483	AAAG	2	8	260705	260712	75 %	0 %	25 %	0 %	170288080
5597	NC_010483	GT	3	6	260733	260738	0 %	50 %	50 %	0 %	170288080
5598	NC_010483	AG	3	6	260752	260757	50 %	0 %	50 %	0 %	170288080
5599	NC_010483	GA	3	6	260767	260772	50 %	0 %	50 %	0 %	170288080
5600	NC_010483	CGA	2	6	260874	260879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288080
5601	NC_010483	AC	3	6	260882	260887	50 %	0 %	0 %	50 %	170288080
5602	NC_010483	AGCA	2	8	260911	260918	50 %	0 %	25 %	25 %	170288080
5603	NC_010483	CG	3	6	260984	260989	0 %	0 %	50 %	50 %	170288080
5604	NC_010483	GGA	2	6	261012	261017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288080
5605	NC_010483	GA	3	6	261033	261038	50 %	0 %	50 %	0 %	170288080
5606	NC_010483	CTC	2	6	261133	261138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288080
5607	NC_010483	CGA	2	6	261207	261212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288080
5608	NC_010483	GTCC	2	8	261252	261259	0 %	25 %	25 %	50 %	170288080
5609	NC_010483	GAAG	2	8	261318	261325	50 %	0 %	50 %	0 %	170288080
5610	NC_010483	CTT	2	6	261337	261342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288080
5611	NC_010483	AGC	2	6	261379	261384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288080
5612	NC_010483	CAT	2	6	261387	261392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288080
5613	NC_010483	GAA	2	6	261415	261420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288080
5614	NC_010483	CGAT	2	8	261434	261441	25 %	25 %	25 %	25 %	170288080
5615	NC_010483	ATC	2	6	261694	261699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288080
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5617	NC_010483	GAT	2	6	261720	261725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288080
5618	NC_010483	GGT	2	6	261783	261788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288080
5619	NC_010483	GAA	2	6	261796	261801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288080
5620	NC_010483	TC	3	6	261886	261891	0 %	50 %	0 %	50 %	170288081
5621	NC_010483	TCGA	2	8	261932	261939	25 %	25 %	25 %	25 %	170288081
5622	NC_010483	TCT	2	6	262021	262026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288081
5623	NC_010483	AGA	2	6	262099	262104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288081
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5732	NC_010483	GAAG	2	8	267134	267141	50 %	0 %	50 %	0 %	170288088
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5743	NC_010483	A	6	6	267735	267740	100 %	0 %	0 %	0 %	170288088
5744	NC_010483	GGA	2	6	267756	267761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288088
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