MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223 chromosome

Total Repeats: 29213

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010321	ATC	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036432
2	NC_010321	CCA	2	6	143	148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036432
3	NC_010321	ACA	2	6	152	157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036432
4	NC_010321	ATT	2	6	187	192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036432
5	NC_010321	GAT	2	6	193	198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036432
6	NC_010321	TAA	2	6	239	244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036432
7	NC_010321	ACG	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036432
8	NC_010321	AGA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
9	NC_010321	GAA	3	9	328	336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
10	NC_010321	ACT	2	6	385	390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036432
11	NC_010321	GGA	2	6	520	525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036432
12	NC_010321	GAC	2	6	652	657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036432
13	NC_010321	GAA	2	6	664	669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
14	NC_010321	TTC	2	6	698	703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036432
15	NC_010321	GAT	2	6	709	714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036432
16	NC_010321	AAG	2	6	746	751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
17	NC_010321	CAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036432
18	NC_010321	ACC	2	6	816	821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036432
19	NC_010321	AGA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
20	NC_010321	CCA	2	6	892	897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036432
21	NC_010321	CGA	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036432
22	NC_010321	TAA	2	6	1025	1030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036432
23	NC_010321	TAA	2	6	1110	1115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036432
24	NC_010321	GAA	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
25	NC_010321	AGA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
26	NC_010321	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
27	NC_010321	TAC	2	6	1305	1310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036432
28	NC_010321	ATT	2	6	1672	1677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036433
29	NC_010321	ACT	2	6	1718	1723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036433
30	NC_010321	TTC	2	6	1731	1736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036433
31	NC_010321	AGA	3	9	1828	1836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036433
32	NC_010321	TAG	2	6	1845	1850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036433
33	NC_010321	TAA	2	6	2055	2060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036433
34	NC_010321	AGA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036433
35	NC_010321	AAT	2	6	2489	2494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036433
36	NC_010321	TTA	2	6	2523	2528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036433
37	NC_010321	TCT	2	6	2534	2539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036433
38	NC_010321	GAT	2	6	2557	2562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036433
39	NC_010321	TTA	2	6	2624	2629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036433
40	NC_010321	GAA	3	9	2651	2659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036433
41	NC_010321	TAA	3	9	2694	2702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036433
42	NC_010321	GGA	2	6	2854	2859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036434
43	NC_010321	TTA	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036435
44	NC_010321	TAA	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036435
45	NC_010321	ATT	2	6	3192	3197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036435
46	NC_010321	AAT	2	6	3211	3216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036435
47	NC_010321	ATA	2	6	3365	3370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036435
48	NC_010321	AAG	2	6	3372	3377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036435
49	NC_010321	TGT	2	6	3418	3423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036435
50	NC_010321	TGA	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036435
51	NC_010321	TAG	2	6	3546	3551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036435
52	NC_010321	TGA	2	6	3573	3578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036435
53	NC_010321	ATT	2	6	3585	3590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036435
54	NC_010321	CAG	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036435
55	NC_010321	GAA	2	6	3695	3700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036435
56	NC_010321	ACA	2	6	3764	3769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036435
57	NC_010321	ATT	2	6	3800	3805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036435
58	NC_010321	TTC	2	6	3832	3837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036435
59	NC_010321	TAC	2	6	4015	4020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036435
60	NC_010321	GTT	2	6	4067	4072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036435
61	NC_010321	GGC	2	6	4111	4116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036436
62	NC_010321	ACT	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036436
63	NC_010321	GAA	3	9	4210	4218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036436
64	NC_010321	TAT	2	6	4287	4292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036436
65	NC_010321	AAG	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036436
66	NC_010321	TTG	2	6	4391	4396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036437
67	NC_010321	AAG	2	6	4411	4416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
68	NC_010321	ATT	2	6	4444	4449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
69	NC_010321	GGA	2	6	4657	4662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036437
70	NC_010321	AGA	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
71	NC_010321	TAT	2	6	4936	4941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
72	NC_010321	ATT	2	6	4967	4972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
73	NC_010321	CAG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036437
74	NC_010321	AGC	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036437
75	NC_010321	AGT	2	6	5265	5270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036437
76	NC_010321	GAG	2	6	5332	5337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036437
77	NC_010321	ATT	2	6	5339	5344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
78	NC_010321	AAG	3	9	5420	5428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
79	NC_010321	TGG	2	6	5437	5442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036437
80	NC_010321	CTA	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036437
81	NC_010321	ATA	2	6	5546	5551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036437
82	NC_010321	AAG	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
83	NC_010321	GCT	2	6	5683	5688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036437
84	NC_010321	ACA	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036437
85	NC_010321	CTT	2	6	5752	5757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036437
86	NC_010321	ATG	3	9	5758	5766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036437
87	NC_010321	GAA	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
88	NC_010321	AAG	2	6	6077	6082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
89	NC_010321	TAT	2	6	6238	6243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
90	NC_010321	ATA	2	6	6265	6270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036437
91	NC_010321	AGG	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036437
92	NC_010321	ATT	2	6	6297	6302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
93	NC_010321	AGA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
94	NC_010321	ATA	2	6	6349	6354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036437
95	NC_010321	GAA	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
96	NC_010321	TTG	2	6	6681	6686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036438
97	NC_010321	TCT	2	6	6844	6849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036438
98	NC_010321	ATT	3	9	6868	6876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036438
99	NC_010321	CCA	2	6	6932	6937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036438
100	NC_010321	ATC	2	6	6985	6990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036438
101	NC_010321	ATA	2	6	7062	7067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036438
102	NC_010321	CCG	2	6	7087	7092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167036438
103	NC_010321	GCT	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036438
104	NC_010321	CCT	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167036438
105	NC_010321	TCT	2	6	7290	7295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036438
106	NC_010321	TAA	2	6	7335	7340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036438
107	NC_010321	TCC	2	6	7380	7385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167036439
108	NC_010321	CAT	2	6	7408	7413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036439
109	NC_010321	TTC	2	6	7448	7453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036439
110	NC_010321	TTA	2	6	7576	7581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036439
111	NC_010321	TCT	2	6	7611	7616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036439
112	NC_010321	TTA	2	6	7695	7700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036439
113	NC_010321	TAT	2	6	7757	7762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036439
114	NC_010321	CAA	2	6	7856	7861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036439
115	NC_010321	CAG	2	6	7867	7872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036439
116	NC_010321	GCT	2	6	7878	7883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036439
117	NC_010321	TAG	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036439
118	NC_010321	TCT	2	6	8069	8074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036439
119	NC_010321	AGA	2	6	8120	8125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036439
120	NC_010321	TGT	2	6	8143	8148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036439
121	NC_010321	TCA	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036439
122	NC_010321	TGT	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036439
123	NC_010321	TTA	3	9	8329	8337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036439
124	NC_010321	TCT	2	6	8355	8360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036439
125	NC_010321	TTA	2	6	8410	8415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036439
126	NC_010321	AGT	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036439
127	NC_010321	CTT	2	6	8479	8484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036439
128	NC_010321	TGT	2	6	8485	8490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036439
129	NC_010321	ACA	2	6	8493	8498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036439
130	NC_010321	TTA	3	9	8566	8574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036439
131	NC_010321	TAT	2	6	8578	8583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036439
132	NC_010321	TAC	2	6	8787	8792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036440
133	NC_010321	CTT	2	6	8798	8803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036440
134	NC_010321	CAT	2	6	8804	8809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036440
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249	NC_010321	GGC	2	6	18163	18168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036447
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255	NC_010321	AGG	2	6	18978	18983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036447
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257	NC_010321	AAG	2	6	19133	19138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036448
258	NC_010321	TTC	2	6	19176	19181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036448
259	NC_010321	GAA	2	6	19321	19326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036448
260	NC_010321	AAT	2	6	19425	19430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036448
261	NC_010321	TGG	2	6	19437	19442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036448
262	NC_010321	TGC	2	6	19492	19497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036449
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265	NC_010321	TCT	2	6	19745	19750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036449
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271	NC_010321	TTC	2	6	20060	20065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036449
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273	NC_010321	AGA	2	6	20279	20284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036449
274	NC_010321	AAG	2	6	20340	20345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036449
275	NC_010321	ATG	2	6	20379	20384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036449
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279	NC_010321	GTG	2	6	20520	20525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036449
280	NC_010321	GAA	2	6	20627	20632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036450
281	NC_010321	AGG	2	6	20740	20745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036450
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285	NC_010321	TGA	2	6	21409	21414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036450
286	NC_010321	ATG	2	6	21618	21623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036450
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290	NC_010321	GAA	2	6	21776	21781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036450
291	NC_010321	GGA	2	6	21800	21805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036450
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362	NC_010321	AAT	2	6	28546	28551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036456
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