MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 42311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009828	CA	3	6	151005	151010	50 %	0 %	0 %	50 %	157363010
3002	NC_009828	TTA	2	6	151014	151019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363010
3003	NC_009828	GAT	2	6	151033	151038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363010
3004	NC_009828	A	8	8	151058	151065	100 %	0 %	0 %	0 %	157363010
3005	NC_009828	TC	3	6	151113	151118	0 %	50 %	0 %	50 %	157363010
3006	NC_009828	AAT	2	6	151261	151266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363010
3007	NC_009828	AG	3	6	151296	151301	50 %	0 %	50 %	0 %	157363010
3008	NC_009828	A	6	6	151384	151389	100 %	0 %	0 %	0 %	157363010
3009	NC_009828	AT	4	8	151444	151451	50 %	50 %	0 %	0 %	157363010
3010	NC_009828	GCA	2	6	151473	151478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363010
3011	NC_009828	GCT	2	6	151480	151485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363010
3012	NC_009828	A	6	6	151506	151511	100 %	0 %	0 %	0 %	157363010
3013	NC_009828	CTA	2	6	151521	151526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363011
3014	NC_009828	ATC	2	6	151536	151541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363011
3015	NC_009828	CTT	2	6	151572	151577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363011
3016	NC_009828	A	6	6	151630	151635	100 %	0 %	0 %	0 %	157363011
3017	NC_009828	ACA	2	6	151642	151647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363011
3018	NC_009828	GCA	2	6	151670	151675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363011
3019	NC_009828	AAGT	2	8	151678	151685	50 %	25 %	25 %	0 %	157363011
3020	NC_009828	ATC	2	6	151703	151708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363011
3021	NC_009828	A	6	6	151713	151718	100 %	0 %	0 %	0 %	157363011
3022	NC_009828	A	7	7	151732	151738	100 %	0 %	0 %	0 %	157363011
3023	NC_009828	CT	3	6	151815	151820	0 %	50 %	0 %	50 %	157363011
3024	NC_009828	TA	3	6	151853	151858	50 %	50 %	0 %	0 %	157363011
3025	NC_009828	GCT	2	6	151878	151883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363011
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3028	NC_009828	TGC	2	6	151964	151969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363011
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3030	NC_009828	ACA	2	6	152099	152104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363011
3031	NC_009828	ATCA	2	8	152136	152143	50 %	25 %	0 %	25 %	157363011
3032	NC_009828	A	6	6	152181	152186	100 %	0 %	0 %	0 %	157363011
3033	NC_009828	AGA	2	6	152192	152197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363011
3034	NC_009828	CAG	2	6	152250	152255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363011
3035	NC_009828	ATAAA	2	10	152437	152446	80 %	20 %	0 %	0 %	157363011
3036	NC_009828	AGA	2	6	152471	152476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363011
3037	NC_009828	AGT	2	6	152678	152683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363011
3038	NC_009828	GTT	2	6	152775	152780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363011
3039	NC_009828	GGA	2	6	152930	152935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363011
3040	NC_009828	CAG	2	6	152971	152976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363011
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3042	NC_009828	TGG	2	6	153065	153070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363011
3043	NC_009828	GCT	2	6	153108	153113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363011
3044	NC_009828	AAATA	2	10	153122	153131	80 %	20 %	0 %	0 %	157363011
3045	NC_009828	AT	3	6	153133	153138	50 %	50 %	0 %	0 %	157363011
3046	NC_009828	AAGC	2	8	153153	153160	50 %	0 %	25 %	25 %	157363011
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3052	NC_009828	GAT	2	6	153678	153683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363013
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3054	NC_009828	A	6	6	153732	153737	100 %	0 %	0 %	0 %	157363013
3055	NC_009828	ATTG	2	8	153758	153765	25 %	50 %	25 %	0 %	157363013
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3057	NC_009828	A	7	7	153911	153917	100 %	0 %	0 %	0 %	157363013
3058	NC_009828	AG	3	6	153939	153944	50 %	0 %	50 %	0 %	157363013
3059	NC_009828	GACTG	2	10	153984	153993	20 %	20 %	40 %	20 %	157363013
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3062	NC_009828	A	7	7	154136	154142	100 %	0 %	0 %	0 %	157363013
3063	NC_009828	GAA	2	6	154152	154157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363013
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3069	NC_009828	TGA	2	6	154283	154288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363013
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3071	NC_009828	A	7	7	154381	154387	100 %	0 %	0 %	0 %	157363013
3072	NC_009828	GAC	2	6	154388	154393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363013
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3074	NC_009828	TTG	2	6	154462	154467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363013
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3082	NC_009828	GAA	2	6	154692	154697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363014
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3085	NC_009828	A	6	6	154833	154838	100 %	0 %	0 %	0 %	157363014
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3091	NC_009828	AGAA	2	8	155213	155220	75 %	0 %	25 %	0 %	157363014
3092	NC_009828	CATT	2	8	155228	155235	25 %	50 %	0 %	25 %	157363014
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3095	NC_009828	GAA	2	6	155448	155453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363014
3096	NC_009828	TA	3	6	155460	155465	50 %	50 %	0 %	0 %	157363014
3097	NC_009828	A	6	6	155548	155553	100 %	0 %	0 %	0 %	157363014
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3101	NC_009828	CA	3	6	155798	155803	50 %	0 %	0 %	50 %	157363015
3102	NC_009828	CTTC	2	8	155836	155843	0 %	50 %	0 %	50 %	157363015
3103	NC_009828	AGA	2	6	155862	155867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363015
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3105	NC_009828	CCTT	2	8	156043	156050	0 %	50 %	0 %	50 %	157363015
3106	NC_009828	CTA	2	6	156065	156070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363015
3107	NC_009828	ATG	2	6	156139	156144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363015
3108	NC_009828	TC	3	6	156264	156269	0 %	50 %	0 %	50 %	157363016
3109	NC_009828	T	6	6	156275	156280	0 %	100 %	0 %	0 %	157363016
3110	NC_009828	TTC	2	6	156288	156293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363016
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3112	NC_009828	TC	3	6	156386	156391	0 %	50 %	0 %	50 %	157363016
3113	NC_009828	T	6	6	156393	156398	0 %	100 %	0 %	0 %	157363016
3114	NC_009828	GAA	2	6	156414	156419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363016
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3118	NC_009828	TAT	2	6	156612	156617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363017
3119	NC_009828	AGCG	2	8	156657	156664	25 %	0 %	50 %	25 %	157363017
3120	NC_009828	GTT	2	6	156820	156825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363017
3121	NC_009828	CT	4	8	156869	156876	0 %	50 %	0 %	50 %	157363017
3122	NC_009828	CTG	2	6	156881	156886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363017
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3498	NC_009828	GCA	2	6	174401	174406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363038
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3500	NC_009828	TTAT	2	8	174526	174533	25 %	75 %	0 %	0 %	157363038

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