MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008698	CTTC	2	8	218535	218542	0 %	50 %	0 %	50 %	119719166
4002	NC_008698	CGCC	2	8	218583	218590	0 %	0 %	25 %	75 %	119719166
4003	NC_008698	GC	3	6	218604	218609	0 %	0 %	50 %	50 %	119719166
4004	NC_008698	ACC	2	6	218624	218629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719166
4005	NC_008698	TTC	2	6	218640	218645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719166
4006	NC_008698	GCT	2	6	218646	218651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719166
4007	NC_008698	CCT	2	6	218752	218757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719166
4008	NC_008698	AGGCT	2	10	218759	218768	20 %	20 %	40 %	20 %	119719166
4009	NC_008698	TGGG	2	8	218808	218815	0 %	25 %	75 %	0 %	119719166
4010	NC_008698	ACG	2	6	218817	218822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719166
4011	NC_008698	GGA	2	6	218833	218838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719166
4012	NC_008698	CGAGC	2	10	218928	218937	20 %	0 %	40 %	40 %	119719166
4013	NC_008698	AGT	2	6	219003	219008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719166
4014	NC_008698	GCT	2	6	219015	219020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719166
4015	NC_008698	TCT	2	6	219027	219032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719166
4016	NC_008698	CCT	2	6	219135	219140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719166
4017	NC_008698	GC	3	6	219237	219242	0 %	0 %	50 %	50 %	119719166
4018	NC_008698	CTT	2	6	219252	219257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719166
4019	NC_008698	AGA	2	6	219300	219305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719166
4020	NC_008698	CAC	2	6	219322	219327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719166
4021	NC_008698	TGC	2	6	219380	219385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719166
4022	NC_008698	CTCG	2	8	219598	219605	0 %	25 %	25 %	50 %	119719167
4023	NC_008698	GCC	2	6	219643	219648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719167
4024	NC_008698	CT	3	6	219699	219704	0 %	50 %	0 %	50 %	119719167
4025	NC_008698	CGA	2	6	219768	219773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719167
4026	NC_008698	CCG	2	6	219774	219779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719167
4027	NC_008698	CTT	2	6	219864	219869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719167
4028	NC_008698	AGT	2	6	219914	219919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719167
4029	NC_008698	AGG	2	6	219949	219954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719167
4030	NC_008698	GTA	2	6	219968	219973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719167
4031	NC_008698	GCC	2	6	219998	220003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719167
4032	NC_008698	TTC	2	6	220064	220069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719167
4033	NC_008698	GTC	2	6	220088	220093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719167
4034	NC_008698	GCC	2	6	220139	220144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719167
4035	NC_008698	TCC	2	6	220149	220154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719167
4036	NC_008698	TGG	2	6	220197	220202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719167
4037	NC_008698	GCAC	2	8	220352	220359	25 %	0 %	25 %	50 %	119719167
4038	NC_008698	GAA	2	6	220390	220395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719167
4039	NC_008698	GT	3	6	220476	220481	0 %	50 %	50 %	0 %	119719167
4040	NC_008698	GAG	3	9	220502	220510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719167
4041	NC_008698	CGT	2	6	220537	220542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719167
4042	NC_008698	GTAC	2	8	220546	220553	25 %	25 %	25 %	25 %	119719167
4043	NC_008698	GAA	2	6	220568	220573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719167
4044	NC_008698	ATAG	2	8	220709	220716	50 %	25 %	25 %	0 %	119719167
4045	NC_008698	GAG	2	6	220778	220783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719167
4046	NC_008698	TTC	2	6	220784	220789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719167
4047	NC_008698	AGA	2	6	220845	220850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719167
4048	NC_008698	GAA	2	6	221033	221038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719168
4049	NC_008698	GAA	2	6	221055	221060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719168
4050	NC_008698	G	6	6	221077	221082	0 %	0 %	100 %	0 %	119719168
4051	NC_008698	CCG	3	9	221152	221160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719168
4052	NC_008698	TA	3	6	221229	221234	50 %	50 %	0 %	0 %	119719168
4053	NC_008698	GTA	2	6	221277	221282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719168
4054	NC_008698	CGA	2	6	221339	221344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719168
4055	NC_008698	AAT	2	6	221378	221383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719168
4056	NC_008698	TC	3	6	221391	221396	0 %	50 %	0 %	50 %	119719168
4057	NC_008698	TCG	2	6	221485	221490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719168
4058	NC_008698	CTA	2	6	221546	221551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719168
4059	NC_008698	CTC	2	6	221597	221602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719168
4060	NC_008698	GAG	2	6	221631	221636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719168
4061	NC_008698	GAA	2	6	221793	221798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719168
4062	NC_008698	TC	3	6	221954	221959	0 %	50 %	0 %	50 %	119719168
4063	NC_008698	AGC	2	6	221961	221966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719168
4064	NC_008698	ACT	2	6	221969	221974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719168
4065	NC_008698	TTC	2	6	222081	222086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719168
4066	NC_008698	CGG	2	6	222122	222127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719168
4067	NC_008698	TCCG	2	8	222144	222151	0 %	25 %	25 %	50 %	119719168
4068	NC_008698	GAG	2	6	222171	222176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719168
4069	NC_008698	AAC	2	6	222184	222189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719168
4070	NC_008698	TGG	2	6	222199	222204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719168
4071	NC_008698	CAA	2	6	222280	222285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719169
4072	NC_008698	TCA	2	6	222290	222295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719169
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4074	NC_008698	A	7	7	222496	222502	100 %	0 %	0 %	0 %	119719169
4075	NC_008698	CTC	2	6	222510	222515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719169
4076	NC_008698	GGCA	2	8	222524	222531	25 %	0 %	50 %	25 %	119719169
4077	NC_008698	TTG	2	6	222613	222618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719169
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4079	NC_008698	ACCT	2	8	222739	222746	25 %	25 %	0 %	50 %	119719169
4080	NC_008698	TAA	2	6	222778	222783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719169
4081	NC_008698	CG	4	8	222968	222975	0 %	0 %	50 %	50 %	119719169
4082	NC_008698	G	6	6	223097	223102	0 %	0 %	100 %	0 %	119719170
4083	NC_008698	ACG	2	6	223130	223135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719170
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4085	NC_008698	CT	3	6	223355	223360	0 %	50 %	0 %	50 %	119719170
4086	NC_008698	GAG	2	6	223414	223419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719170
4087	NC_008698	CGG	2	6	223433	223438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719170
4088	NC_008698	ACA	2	6	223508	223513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719171
4089	NC_008698	CT	3	6	223541	223546	0 %	50 %	0 %	50 %	119719171
4090	NC_008698	ACC	2	6	223562	223567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719171
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4092	NC_008698	CAAG	2	8	223825	223832	50 %	0 %	25 %	25 %	119719171
4093	NC_008698	GC	3	6	223910	223915	0 %	0 %	50 %	50 %	119719171
4094	NC_008698	AAG	2	6	223943	223948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719171
4095	NC_008698	GAG	2	6	223969	223974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719171
4096	NC_008698	AG	3	6	223973	223978	50 %	0 %	50 %	0 %	119719171
4097	NC_008698	TAG	2	6	224194	224199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719172
4098	NC_008698	TAG	2	6	224218	224223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719172
4099	NC_008698	GAA	2	6	224243	224248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719172
4100	NC_008698	TA	3	6	224362	224367	50 %	50 %	0 %	0 %	119719172
4101	NC_008698	GCTGT	2	10	224396	224405	0 %	40 %	40 %	20 %	119719172
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4103	NC_008698	TC	3	6	224547	224552	0 %	50 %	0 %	50 %	119719173
4104	NC_008698	ACG	2	6	224626	224631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719173
4105	NC_008698	TCG	3	9	224665	224673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719173
4106	NC_008698	TTC	2	6	224694	224699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719173
4107	NC_008698	GAA	2	6	224709	224714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719173
4108	NC_008698	CTCC	2	8	224723	224730	0 %	25 %	0 %	75 %	119719173
4109	NC_008698	GGTA	2	8	224752	224759	25 %	25 %	50 %	0 %	119719173
4110	NC_008698	ACT	2	6	224812	224817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719173
4111	NC_008698	ATC	2	6	224860	224865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719173
4112	NC_008698	TCT	2	6	224912	224917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719173
4113	NC_008698	G	6	6	224939	224944	0 %	0 %	100 %	0 %	119719173
4114	NC_008698	TATCGT	2	12	225000	225011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119719173
4115	NC_008698	CTC	2	6	225141	225146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719173
4116	NC_008698	GAC	2	6	225150	225155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719173
4117	NC_008698	CAG	2	6	225180	225185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719173
4118	NC_008698	CTT	2	6	225216	225221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719173
4119	NC_008698	C	6	6	225283	225288	0 %	0 %	0 %	100 %	119719173
4120	NC_008698	AGT	2	6	225289	225294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719173
4121	NC_008698	TAT	3	9	225405	225413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719173
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4247	NC_008698	CGTT	2	8	232258	232265	0 %	50 %	25 %	25 %	119719181
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4364	NC_008698	TCCC	2	8	238185	238192	0 %	25 %	0 %	75 %	119719187
4365	NC_008698	CT	3	6	238377	238382	0 %	50 %	0 %	50 %	119719187
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4491	NC_008698	G	6	6	247070	247075	0 %	0 %	100 %	0 %	119719199
4492	NC_008698	TCT	2	6	247097	247102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719199
4493	NC_008698	CGC	2	6	247176	247181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719199
4494	NC_008698	CAG	2	6	247335	247340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719200
4495	NC_008698	TTCTC	2	10	247432	247441	0 %	60 %	0 %	40 %	119719200
4496	NC_008698	CGA	2	6	247454	247459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719200
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4498	NC_008698	ACT	2	6	247516	247521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719200
4499	NC_008698	ATC	2	6	247549	247554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719200
4500	NC_008698	TTC	2	6	247570	247575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719200

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