MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008698	TTC	2	6	193106	193111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719131
3502	NC_008698	GTAC	2	8	193147	193154	25 %	25 %	25 %	25 %	119719131
3503	NC_008698	TCT	2	6	193164	193169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719131
3504	NC_008698	TTC	2	6	193401	193406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719132
3505	NC_008698	CT	3	6	193457	193462	0 %	50 %	0 %	50 %	119719132
3506	NC_008698	CGT	2	6	193463	193468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719132
3507	NC_008698	TCG	2	6	193498	193503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719132
3508	NC_008698	GA	3	6	193513	193518	50 %	0 %	50 %	0 %	119719132
3509	NC_008698	GGAG	2	8	193693	193700	25 %	0 %	75 %	0 %	119719132
3510	NC_008698	CAT	2	6	193703	193708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719132
3511	NC_008698	TCG	2	6	193771	193776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719132
3512	NC_008698	CCTC	2	8	193812	193819	0 %	25 %	0 %	75 %	119719132
3513	NC_008698	GAT	2	6	193820	193825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719132
3514	NC_008698	GCGCG	2	10	193842	193851	0 %	0 %	60 %	40 %	119719132
3515	NC_008698	AGCG	2	8	193875	193882	25 %	0 %	50 %	25 %	119719132
3516	NC_008698	AGG	2	6	193984	193989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719133
3517	NC_008698	CTC	2	6	194001	194006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719133
3518	NC_008698	CT	3	6	194016	194021	0 %	50 %	0 %	50 %	119719133
3519	NC_008698	CT	3	6	194055	194060	0 %	50 %	0 %	50 %	119719133
3520	NC_008698	GAA	2	6	194106	194111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719133
3521	NC_008698	CG	3	6	194177	194182	0 %	0 %	50 %	50 %	119719133
3522	NC_008698	TAC	2	6	194232	194237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719133
3523	NC_008698	CCTT	2	8	194301	194308	0 %	50 %	0 %	50 %	119719133
3524	NC_008698	CTC	2	6	194314	194319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719133
3525	NC_008698	TAC	2	6	194370	194375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719133
3526	NC_008698	CAT	2	6	194406	194411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719133
3527	NC_008698	AAT	2	6	194473	194478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719134
3528	NC_008698	TC	3	6	194485	194490	0 %	50 %	0 %	50 %	119719134
3529	NC_008698	ACT	2	6	194508	194513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719134
3530	NC_008698	CT	3	6	194542	194547	0 %	50 %	0 %	50 %	119719134
3531	NC_008698	GTA	2	6	194564	194569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719134
3532	NC_008698	GGTC	2	8	194595	194602	0 %	25 %	50 %	25 %	119719134
3533	NC_008698	ACG	2	6	194634	194639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719134
3534	NC_008698	CAT	2	6	194704	194709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719134
3535	NC_008698	GAA	2	6	194820	194825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719134
3536	NC_008698	GCG	2	6	194886	194891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719134
3537	NC_008698	GAG	2	6	194945	194950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719134
3538	NC_008698	TTC	2	6	195038	195043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719134
3539	NC_008698	GAT	2	6	195080	195085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719134
3540	NC_008698	TTCG	2	8	195104	195111	0 %	50 %	25 %	25 %	119719134
3541	NC_008698	GCTG	2	8	195175	195182	0 %	25 %	50 %	25 %	119719134
3542	NC_008698	GAA	2	6	195225	195230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719134
3543	NC_008698	GC	3	6	195255	195260	0 %	0 %	50 %	50 %	119719135
3544	NC_008698	GTAG	2	8	195323	195330	25 %	25 %	50 %	0 %	119719135
3545	NC_008698	CTGC	2	8	195341	195348	0 %	25 %	25 %	50 %	119719135
3546	NC_008698	GGT	2	6	195386	195391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719135
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3549	NC_008698	TGGC	2	8	195610	195617	0 %	25 %	50 %	25 %	119719135
3550	NC_008698	CT	3	6	195660	195665	0 %	50 %	0 %	50 %	119719135
3551	NC_008698	TC	3	6	195672	195677	0 %	50 %	0 %	50 %	119719135
3552	NC_008698	TC	3	6	195692	195697	0 %	50 %	0 %	50 %	119719135
3553	NC_008698	CAA	2	6	195848	195853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719135
3554	NC_008698	AGGG	2	8	195919	195926	25 %	0 %	75 %	0 %	119719135
3555	NC_008698	TCT	2	6	196067	196072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719135
3556	NC_008698	CGGG	2	8	196183	196190	0 %	0 %	75 %	25 %	119719135
3557	NC_008698	TGT	2	6	196207	196212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719135
3558	NC_008698	CATT	2	8	196228	196235	25 %	50 %	0 %	25 %	119719135
3559	NC_008698	AG	4	8	196241	196248	50 %	0 %	50 %	0 %	119719135
3560	NC_008698	GCCC	2	8	196270	196277	0 %	0 %	25 %	75 %	119719135
3561	NC_008698	C	6	6	196275	196280	0 %	0 %	0 %	100 %	119719135
3562	NC_008698	ATCT	2	8	196295	196302	25 %	50 %	0 %	25 %	119719135
3563	NC_008698	ATC	2	6	196305	196310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719135
3564	NC_008698	TCAC	2	8	196349	196356	25 %	25 %	0 %	50 %	119719136
3565	NC_008698	TCG	2	6	196360	196365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719136
3566	NC_008698	CG	3	6	196364	196369	0 %	0 %	50 %	50 %	119719136
3567	NC_008698	GAA	2	6	196481	196486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719136
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3570	NC_008698	TGGTT	2	10	196863	196872	0 %	60 %	40 %	0 %	119719136
3571	NC_008698	GCG	2	6	196884	196889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719136
3572	NC_008698	CT	4	8	196915	196922	0 %	50 %	0 %	50 %	119719136
3573	NC_008698	GA	3	6	196976	196981	50 %	0 %	50 %	0 %	119719137
3574	NC_008698	CT	3	6	197019	197024	0 %	50 %	0 %	50 %	119719137
3575	NC_008698	ACG	2	6	197057	197062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719137
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3578	NC_008698	GTA	2	6	197140	197145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719137
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3580	NC_008698	ATG	2	6	197195	197200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719137
3581	NC_008698	CTT	2	6	197229	197234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719137
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3585	NC_008698	CTA	2	6	197377	197382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719138
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3587	NC_008698	AAT	2	6	197483	197488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719138
3588	NC_008698	GA	3	6	197510	197515	50 %	0 %	50 %	0 %	119719138
3589	NC_008698	CGAAGA	2	12	197569	197580	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119719138
3590	NC_008698	CT	3	6	197586	197591	0 %	50 %	0 %	50 %	119719138
3591	NC_008698	GA	3	6	197613	197618	50 %	0 %	50 %	0 %	119719138
3592	NC_008698	G	6	6	197644	197649	0 %	0 %	100 %	0 %	119719138
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3595	NC_008698	ACG	2	6	197706	197711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719138
3596	NC_008698	ACG	2	6	197766	197771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719138
3597	NC_008698	AGA	2	6	197772	197777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719138
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3599	NC_008698	CT	3	6	197831	197836	0 %	50 %	0 %	50 %	119719138
3600	NC_008698	CTG	2	6	197919	197924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719138
3601	NC_008698	AGA	2	6	197944	197949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719138
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3603	NC_008698	CGG	2	6	198004	198009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719138
3604	NC_008698	GCCT	2	8	198041	198048	0 %	25 %	25 %	50 %	119719139
3605	NC_008698	TCCT	2	8	198093	198100	0 %	50 %	0 %	50 %	119719139
3606	NC_008698	CCT	2	6	198119	198124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719139
3607	NC_008698	GAG	2	6	198184	198189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719139
3608	NC_008698	TCG	2	6	198191	198196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719139
3609	NC_008698	GGC	2	6	198274	198279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719139
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3613	NC_008698	CCT	2	6	198393	198398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719139
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3619	NC_008698	TCC	2	6	198767	198772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719139
3620	NC_008698	ACC	2	6	198776	198781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719139
3621	NC_008698	TG	3	6	198836	198841	0 %	50 %	50 %	0 %	119719139
3622	NC_008698	TG	3	6	198930	198935	0 %	50 %	50 %	0 %	119719139
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3991	NC_008698	TC	3	6	218093	218098	0 %	50 %	0 %	50 %	119719165
3992	NC_008698	CGA	2	6	218121	218126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719165
3993	NC_008698	AGGC	2	8	218271	218278	25 %	0 %	50 %	25 %	119719165
3994	NC_008698	ACC	2	6	218303	218308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719166
3995	NC_008698	GAA	2	6	218320	218325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719166
3996	NC_008698	CAG	2	6	218329	218334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719166
3997	NC_008698	TCC	2	6	218338	218343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719166
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3999	NC_008698	GAG	2	6	218434	218439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719166
4000	NC_008698	CGACGC	2	12	218484	218495	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119719166

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