MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008698	CGC	2	6	81800	81805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719023
1502	NC_008698	GAA	2	6	81845	81850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719023
1503	NC_008698	GTG	2	6	82029	82034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719024
1504	NC_008698	CAG	2	6	82052	82057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719024
1505	NC_008698	TC	3	6	82066	82071	0 %	50 %	0 %	50 %	119719024
1506	NC_008698	GGCC	2	8	82081	82088	0 %	0 %	50 %	50 %	119719024
1507	NC_008698	TCT	2	6	82138	82143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719024
1508	NC_008698	GGT	2	6	82187	82192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719024
1509	NC_008698	CTC	2	6	82257	82262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719024
1510	NC_008698	CGT	2	6	82394	82399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719024
1511	NC_008698	TC	3	6	82425	82430	0 %	50 %	0 %	50 %	119719024
1512	NC_008698	TCC	2	6	82464	82469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719024
1513	NC_008698	CCG	2	6	82570	82575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719024
1514	NC_008698	GAA	2	6	82625	82630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719024
1515	NC_008698	CGT	2	6	82636	82641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719024
1516	NC_008698	CGAA	2	8	82680	82687	50 %	0 %	25 %	25 %	119719024
1517	NC_008698	TTC	2	6	82688	82693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719024
1518	NC_008698	CTA	2	6	82741	82746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719024
1519	NC_008698	TCG	2	6	82773	82778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719024
1520	NC_008698	CTC	2	6	82830	82835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719025
1521	NC_008698	GCTATC	2	12	82897	82908	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119719025
1522	NC_008698	TGG	2	6	82976	82981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719025
1523	NC_008698	TGT	2	6	82994	82999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719025
1524	NC_008698	TC	3	6	83082	83087	0 %	50 %	0 %	50 %	119719025
1525	NC_008698	GTA	2	6	83259	83264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719025
1526	NC_008698	TCC	2	6	83272	83277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719025
1527	NC_008698	GAA	2	6	83309	83314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719026
1528	NC_008698	CT	3	6	83371	83376	0 %	50 %	0 %	50 %	119719026
1529	NC_008698	GGA	2	6	83444	83449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719026
1530	NC_008698	GAA	2	6	83459	83464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719026
1531	NC_008698	CCT	2	6	83467	83472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719026
1532	NC_008698	AAC	2	6	83474	83479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719026
1533	NC_008698	TCGC	2	8	83607	83614	0 %	25 %	25 %	50 %	119719026
1534	NC_008698	CTC	2	6	83624	83629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719026
1535	NC_008698	TCC	2	6	83631	83636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719026
1536	NC_008698	CT	3	6	83653	83658	0 %	50 %	0 %	50 %	119719026
1537	NC_008698	GA	3	6	83694	83699	50 %	0 %	50 %	0 %	119719026
1538	NC_008698	GTT	2	6	83720	83725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719026
1539	NC_008698	TC	4	8	83787	83794	0 %	50 %	0 %	50 %	119719026
1540	NC_008698	CGC	2	6	83923	83928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719026
1541	NC_008698	CG	3	6	84315	84320	0 %	0 %	50 %	50 %	119719027
1542	NC_008698	CGA	2	6	84341	84346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719027
1543	NC_008698	GA	3	6	84429	84434	50 %	0 %	50 %	0 %	119719027
1544	NC_008698	CG	3	6	84508	84513	0 %	0 %	50 %	50 %	119719027
1545	NC_008698	CCT	2	6	84514	84519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719027
1546	NC_008698	CTC	2	6	84574	84579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719027
1547	NC_008698	ATG	2	6	84630	84635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719027
1548	NC_008698	TTC	2	6	84696	84701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719027
1549	NC_008698	CTC	2	6	84743	84748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719027
1550	NC_008698	TAC	2	6	84818	84823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719027
1551	NC_008698	CCT	2	6	84856	84861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719027
1552	NC_008698	GTA	2	6	84902	84907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719027
1553	NC_008698	CA	3	6	84912	84917	50 %	0 %	0 %	50 %	119719027
1554	NC_008698	TTC	2	6	84942	84947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719027
1555	NC_008698	CTC	2	6	84977	84982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719027
1556	NC_008698	TATAG	2	10	85006	85015	40 %	40 %	20 %	0 %	119719028
1557	NC_008698	CTTT	2	8	85021	85028	0 %	75 %	0 %	25 %	119719028
1558	NC_008698	TCC	2	6	85053	85058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719028
1559	NC_008698	CGC	2	6	85100	85105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719028
1560	NC_008698	ATC	2	6	85194	85199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719028
1561	NC_008698	CGA	2	6	85240	85245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719028
1562	NC_008698	CCCTGT	2	12	85282	85293	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119719028
1563	NC_008698	TCG	2	6	85404	85409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719028
1564	NC_008698	CT	3	6	85456	85461	0 %	50 %	0 %	50 %	119719028
1565	NC_008698	GCCCCA	2	12	85468	85479	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119719028
1566	NC_008698	GTA	2	6	85529	85534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719028
1567	NC_008698	CCT	2	6	85540	85545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719028
1568	NC_008698	CGT	2	6	85582	85587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719028
1569	NC_008698	C	6	6	85608	85613	0 %	0 %	0 %	100 %	119719028
1570	NC_008698	GTC	2	6	85620	85625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719028
1571	NC_008698	TTC	2	6	85629	85634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719028
1572	NC_008698	GCC	2	6	85670	85675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719028
1573	NC_008698	CCG	2	6	85774	85779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719028
1574	NC_008698	TCGCCG	2	12	85912	85923	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119719028
1575	NC_008698	TAA	2	6	85948	85953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719028
1576	NC_008698	TCG	2	6	85956	85961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719028
1577	NC_008698	GCTA	2	8	85979	85986	25 %	25 %	25 %	25 %	119719028
1578	NC_008698	CCG	2	6	85987	85992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719028
1579	NC_008698	GGC	2	6	86000	86005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719028
1580	NC_008698	CTT	2	6	86059	86064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719028
1581	NC_008698	GGA	2	6	86108	86113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719028
1582	NC_008698	GTA	2	6	86159	86164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719028
1583	NC_008698	CCTT	2	8	86290	86297	0 %	50 %	0 %	50 %	119719029
1584	NC_008698	GAA	2	6	86381	86386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719029
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1586	NC_008698	CCCTC	2	10	86518	86527	0 %	20 %	0 %	80 %	119719029
1587	NC_008698	GA	3	6	86613	86618	50 %	0 %	50 %	0 %	119719029
1588	NC_008698	CCT	2	6	86620	86625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719029
1589	NC_008698	ACTTC	2	10	86785	86794	20 %	40 %	0 %	40 %	119719029
1590	NC_008698	GCCGT	2	10	86808	86817	0 %	20 %	40 %	40 %	119719029
1591	NC_008698	CTC	2	6	86844	86849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719029
1592	NC_008698	CTA	2	6	86884	86889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719029
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1594	NC_008698	CTA	2	6	86995	87000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719029
1595	NC_008698	GC	3	6	87002	87007	0 %	0 %	50 %	50 %	119719029
1596	NC_008698	TTC	2	6	87024	87029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719029
1597	NC_008698	GAT	2	6	87038	87043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719029
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1599	NC_008698	AGT	2	6	87384	87389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719030
1600	NC_008698	CGC	2	6	87469	87474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719030
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1602	NC_008698	ACC	2	6	87533	87538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719030
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1604	NC_008698	TCG	2	6	87704	87709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719030
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1607	NC_008698	TC	3	6	87749	87754	0 %	50 %	0 %	50 %	119719030
1608	NC_008698	TTC	2	6	87773	87778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719030
1609	NC_008698	CG	3	6	87807	87812	0 %	0 %	50 %	50 %	119719030
1610	NC_008698	C	6	6	87836	87841	0 %	0 %	0 %	100 %	119719030
1611	NC_008698	GAAC	2	8	87937	87944	50 %	0 %	25 %	25 %	119719030
1612	NC_008698	ACC	2	6	88003	88008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719030
1613	NC_008698	ATG	2	6	88013	88018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719030
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1616	NC_008698	GA	3	6	88124	88129	50 %	0 %	50 %	0 %	119719030
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1620	NC_008698	TCC	2	6	88214	88219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719030
1621	NC_008698	GCC	2	6	88294	88299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719030
1622	NC_008698	TGT	2	6	88467	88472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719030
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1624	NC_008698	GAT	2	6	88698	88703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719031
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1999	NC_008698	GC	3	6	109412	109417	0 %	0 %	50 %	50 %	119719051
2000	NC_008698	GGT	2	6	109487	109492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719051

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