MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008698	TCGGG	2	10	303149	303158	0 %	20 %	60 %	20 %	119719252
5502	NC_008698	CAT	2	6	303180	303185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719252
5503	NC_008698	CGC	2	6	303188	303193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719252
5504	NC_008698	CTG	2	6	303204	303209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719252
5505	NC_008698	GTA	2	6	303255	303260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719252
5506	NC_008698	CTC	2	6	303330	303335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719252
5507	NC_008698	CTC	2	6	303423	303428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719252
5508	NC_008698	CT	5	10	303440	303449	0 %	50 %	0 %	50 %	119719252
5509	NC_008698	TCT	3	9	303464	303472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719252
5510	NC_008698	CGC	2	6	303503	303508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719252
5511	NC_008698	CGG	2	6	303545	303550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719252
5512	NC_008698	GTG	2	6	303585	303590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719252
5513	NC_008698	TAGG	2	8	303603	303610	25 %	25 %	50 %	0 %	119719252
5514	NC_008698	GCC	2	6	303634	303639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719252
5515	NC_008698	TCC	2	6	303659	303664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719252
5516	NC_008698	TTC	2	6	303688	303693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719252
5517	NC_008698	GAC	2	6	303771	303776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719252
5518	NC_008698	CTG	2	6	303823	303828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719252
5519	NC_008698	TC	3	6	303830	303835	0 %	50 %	0 %	50 %	119719252
5520	NC_008698	TCC	2	6	303862	303867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719252
5521	NC_008698	GCA	2	6	303954	303959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719252
5522	NC_008698	AG	3	6	303968	303973	50 %	0 %	50 %	0 %	119719252
5523	NC_008698	CAG	2	6	303999	304004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719252
5524	NC_008698	CCTT	2	8	304016	304023	0 %	50 %	0 %	50 %	119719252
5525	NC_008698	TTC	2	6	304084	304089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719252
5526	NC_008698	TGG	2	6	304100	304105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719252
5527	NC_008698	CTT	2	6	304215	304220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719252
5528	NC_008698	GAA	3	9	304455	304463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719252
5529	NC_008698	TGC	2	6	304807	304812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719252
5530	NC_008698	CTT	2	6	305127	305132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719253
5531	NC_008698	AGT	3	9	305145	305153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719253
5532	NC_008698	GAA	2	6	305170	305175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719253
5533	NC_008698	GAA	2	6	305220	305225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719253
5534	NC_008698	CCG	2	6	305348	305353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719253
5535	NC_008698	GCG	2	6	305401	305406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719253
5536	NC_008698	GA	4	8	305452	305459	50 %	0 %	50 %	0 %	119719253
5537	NC_008698	GTG	2	6	305534	305539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719253
5538	NC_008698	GGAAG	2	10	305581	305590	40 %	0 %	60 %	0 %	119719253
5539	NC_008698	AGG	2	6	305760	305765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719253
5540	NC_008698	CTC	2	6	305788	305793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719253
5541	NC_008698	AG	3	6	305818	305823	50 %	0 %	50 %	0 %	119719253
5542	NC_008698	GAA	2	6	305853	305858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719253
5543	NC_008698	AGC	2	6	305904	305909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719253
5544	NC_008698	CA	3	6	305917	305922	50 %	0 %	0 %	50 %	119719253
5545	NC_008698	GCG	2	6	305972	305977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719253
5546	NC_008698	AGA	2	6	305997	306002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719253
5547	NC_008698	GCTA	2	8	306024	306031	25 %	25 %	25 %	25 %	119719253
5548	NC_008698	ACC	2	6	306036	306041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719253
5549	NC_008698	ACGG	2	8	306070	306077	25 %	0 %	50 %	25 %	119719253
5550	NC_008698	GA	3	6	306156	306161	50 %	0 %	50 %	0 %	119719253
5551	NC_008698	GAG	2	6	306166	306171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719253
5552	NC_008698	AG	4	8	306175	306182	50 %	0 %	50 %	0 %	119719253
5553	NC_008698	CGAG	2	8	306242	306249	25 %	0 %	50 %	25 %	119719253
5554	NC_008698	TCG	2	6	306254	306259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719253
5555	NC_008698	GTA	2	6	306304	306309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719253
5556	NC_008698	CGT	2	6	306396	306401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719253
5557	NC_008698	GGC	2	6	306426	306431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719253
5558	NC_008698	GAAA	2	8	306439	306446	75 %	0 %	25 %	0 %	119719253
5559	NC_008698	GC	3	6	306509	306514	0 %	0 %	50 %	50 %	119719253
5560	NC_008698	TCT	2	6	306538	306543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719253
5561	NC_008698	AAT	2	6	306616	306621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719253
5562	NC_008698	ATA	2	6	306627	306632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719253
5563	NC_008698	GGC	2	6	306718	306723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719254
5564	NC_008698	TGG	2	6	306796	306801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719254
5565	NC_008698	GA	3	6	306803	306808	50 %	0 %	50 %	0 %	119719254
5566	NC_008698	GGA	2	6	306874	306879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719254
5567	NC_008698	AGGG	2	8	306908	306915	25 %	0 %	75 %	0 %	119719254
5568	NC_008698	TC	3	6	306925	306930	0 %	50 %	0 %	50 %	119719254
5569	NC_008698	CGA	2	6	307072	307077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719254
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5571	NC_008698	TTC	2	6	307247	307252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719254
5572	NC_008698	GAG	2	6	307273	307278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719254
5573	NC_008698	GAGGAA	2	12	307283	307294	50 %	0 %	50 %	0 %	119719254
5574	NC_008698	AGGA	2	8	307304	307311	50 %	0 %	50 %	0 %	119719254
5575	NC_008698	ATA	2	6	307313	307318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719254
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5589	NC_008698	TCT	2	6	307977	307982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719254
5590	NC_008698	GAA	2	6	307987	307992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719254
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5593	NC_008698	GGA	2	6	308059	308064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719254
5594	NC_008698	TA	3	6	308099	308104	50 %	50 %	0 %	0 %	119719254
5595	NC_008698	GAG	2	6	308113	308118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719254
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5600	NC_008698	CTCG	2	8	308290	308297	0 %	25 %	25 %	50 %	119719254
5601	NC_008698	TAG	2	6	308409	308414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719254
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5603	NC_008698	CTACT	2	10	308486	308495	20 %	40 %	0 %	40 %	119719254
5604	NC_008698	GA	3	6	308543	308548	50 %	0 %	50 %	0 %	119719254
5605	NC_008698	AAG	2	6	308558	308563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719254
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5609	NC_008698	GGA	2	6	308964	308969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719254
5610	NC_008698	GGC	2	6	309005	309010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719254
5611	NC_008698	AGT	2	6	309037	309042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719254
5612	NC_008698	CTCTC	2	10	309086	309095	0 %	40 %	0 %	60 %	119719254
5613	NC_008698	CTT	2	6	309109	309114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719254
5614	NC_008698	ATCC	2	8	309166	309173	25 %	25 %	0 %	50 %	119719254
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5616	NC_008698	CATG	2	8	309196	309203	25 %	25 %	25 %	25 %	119719254
5617	NC_008698	GAT	2	6	309223	309228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719254
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