MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008698	TCT	2	6	277404	277409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719227
5002	NC_008698	GA	3	6	277481	277486	50 %	0 %	50 %	0 %	119719227
5003	NC_008698	CTT	2	6	277520	277525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719228
5004	NC_008698	ACC	2	6	277581	277586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719228
5005	NC_008698	CCT	2	6	277613	277618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719228
5006	NC_008698	CT	3	6	277651	277656	0 %	50 %	0 %	50 %	119719228
5007	NC_008698	CCCT	2	8	277705	277712	0 %	25 %	0 %	75 %	119719228
5008	NC_008698	CCT	2	6	277731	277736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719228
5009	NC_008698	CTT	3	9	277746	277754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719228
5010	NC_008698	CCA	2	6	277760	277765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719228
5011	NC_008698	TCCT	2	8	277898	277905	0 %	50 %	0 %	50 %	119719228
5012	NC_008698	GTC	2	6	277908	277913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719228
5013	NC_008698	CTA	2	6	277955	277960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719228
5014	NC_008698	TCC	2	6	278048	278053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719228
5015	NC_008698	CCT	2	6	278087	278092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719228
5016	NC_008698	CTC	2	6	278288	278293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719229
5017	NC_008698	GA	3	6	278417	278422	50 %	0 %	50 %	0 %	119719229
5018	NC_008698	AG	3	6	278429	278434	50 %	0 %	50 %	0 %	119719229
5019	NC_008698	CCT	2	6	278507	278512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719229
5020	NC_008698	CTC	2	6	278663	278668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719229
5021	NC_008698	GTG	2	6	278697	278702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719229
5022	NC_008698	GAGG	2	8	278747	278754	25 %	0 %	75 %	0 %	119719229
5023	NC_008698	GAT	2	6	278815	278820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719229
5024	NC_008698	GAGAA	2	10	278902	278911	60 %	0 %	40 %	0 %	119719230
5025	NC_008698	A	7	7	278993	278999	100 %	0 %	0 %	0 %	119719230
5026	NC_008698	GGA	3	9	279067	279075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719230
5027	NC_008698	TGAGGG	2	12	279078	279089	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	119719230
5028	NC_008698	TC	3	6	279182	279187	0 %	50 %	0 %	50 %	119719230
5029	NC_008698	AAG	2	6	279198	279203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719230
5030	NC_008698	AATT	2	8	279223	279230	50 %	50 %	0 %	0 %	119719230
5031	NC_008698	CT	3	6	279281	279286	0 %	50 %	0 %	50 %	119719231
5032	NC_008698	GTT	2	6	279486	279491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719231
5033	NC_008698	T	7	7	279490	279496	0 %	100 %	0 %	0 %	119719231
5034	NC_008698	GAA	2	6	279535	279540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719231
5035	NC_008698	CCA	2	6	279545	279550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719231
5036	NC_008698	CT	3	6	279565	279570	0 %	50 %	0 %	50 %	119719231
5037	NC_008698	CCT	2	6	279629	279634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719231
5038	NC_008698	ACCC	2	8	279721	279728	25 %	0 %	0 %	75 %	119719232
5039	NC_008698	TAC	2	6	279746	279751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719232
5040	NC_008698	CTC	2	6	279786	279791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719232
5041	NC_008698	TCC	2	6	279816	279821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719232
5042	NC_008698	TCC	2	6	279873	279878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719232
5043	NC_008698	TTC	2	6	279887	279892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719232
5044	NC_008698	TCC	2	6	279909	279914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719232
5045	NC_008698	TCA	2	6	279937	279942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719232
5046	NC_008698	TC	3	6	279970	279975	0 %	50 %	0 %	50 %	119719232
5047	NC_008698	TCT	2	6	280031	280036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719233
5048	NC_008698	ACG	2	6	280097	280102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5049	NC_008698	TCCAT	2	10	280103	280112	20 %	40 %	0 %	40 %	119719233
5050	NC_008698	TCG	2	6	280115	280120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5051	NC_008698	CCG	2	6	280149	280154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719233
5052	NC_008698	CAG	2	6	280185	280190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5053	NC_008698	CGAA	2	8	280205	280212	50 %	0 %	25 %	25 %	119719233
5054	NC_008698	TTC	2	6	280220	280225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719233
5055	NC_008698	TAT	2	6	280249	280254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719233
5056	NC_008698	CT	3	6	280312	280317	0 %	50 %	0 %	50 %	119719233
5057	NC_008698	TCC	3	9	280334	280342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719233
5058	NC_008698	CAC	2	6	280367	280372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719233
5059	NC_008698	TGT	2	6	280389	280394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719233
5060	NC_008698	AAGT	2	8	280434	280441	50 %	25 %	25 %	0 %	119719233
5061	NC_008698	CTC	2	6	280500	280505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719233
5062	NC_008698	CGC	2	6	280629	280634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719233
5063	NC_008698	GCC	2	6	280710	280715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719233
5064	NC_008698	C	6	6	280727	280732	0 %	0 %	0 %	100 %	119719233
5065	NC_008698	GACCAC	2	12	280750	280761	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119719233
5066	NC_008698	TCG	2	6	280815	280820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5067	NC_008698	GTC	2	6	280837	280842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5068	NC_008698	C	6	6	280848	280853	0 %	0 %	0 %	100 %	119719233
5069	NC_008698	G	6	6	280881	280886	0 %	0 %	100 %	0 %	119719233
5070	NC_008698	TCCT	2	8	280902	280909	0 %	50 %	0 %	50 %	119719233
5071	NC_008698	CGT	2	6	280941	280946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5072	NC_008698	AACG	2	8	280954	280961	50 %	0 %	25 %	25 %	119719233
5073	NC_008698	CCTC	2	8	281021	281028	0 %	25 %	0 %	75 %	119719233
5074	NC_008698	GC	3	6	281071	281076	0 %	0 %	50 %	50 %	119719233
5075	NC_008698	CAG	2	6	281085	281090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5076	NC_008698	GTA	2	6	281098	281103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719233
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5078	NC_008698	GTA	2	6	281128	281133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719233
5079	NC_008698	TCA	2	6	281187	281192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719233
5080	NC_008698	ATCAGA	2	12	281243	281254	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119719234
5081	NC_008698	AGC	2	6	281266	281271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719234
5082	NC_008698	AGT	2	6	281363	281368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719234
5083	NC_008698	AC	3	6	281409	281414	50 %	0 %	0 %	50 %	119719234
5084	NC_008698	GGTAC	2	10	281876	281885	20 %	20 %	40 %	20 %	119719234
5085	NC_008698	GA	3	6	281917	281922	50 %	0 %	50 %	0 %	119719234
5086	NC_008698	CCT	2	6	281952	281957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719234
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5088	NC_008698	CGA	2	6	281976	281981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719234
5089	NC_008698	GAC	2	6	281982	281987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719234
5090	NC_008698	GTA	2	6	282293	282298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719235
5091	NC_008698	G	6	6	282330	282335	0 %	0 %	100 %	0 %	119719235
5092	NC_008698	ATT	2	6	282390	282395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719235
5093	NC_008698	GC	3	6	282434	282439	0 %	0 %	50 %	50 %	119719235
5094	NC_008698	TC	3	6	282504	282509	0 %	50 %	0 %	50 %	119719235
5095	NC_008698	GAC	2	6	282563	282568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719235
5096	NC_008698	AG	3	6	282603	282608	50 %	0 %	50 %	0 %	119719235
5097	NC_008698	TC	3	6	282659	282664	0 %	50 %	0 %	50 %	119719235
5098	NC_008698	GCC	2	6	282681	282686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719235
5099	NC_008698	GCT	2	6	282739	282744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719235
5100	NC_008698	TCC	2	6	282770	282775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719235
5101	NC_008698	AGG	2	6	282780	282785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719235
5102	NC_008698	GCC	2	6	282816	282821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719235
5103	NC_008698	GTA	2	6	282872	282877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719235
5104	NC_008698	CT	3	6	282938	282943	0 %	50 %	0 %	50 %	119719235
5105	NC_008698	CCCCA	2	10	282961	282970	20 %	0 %	0 %	80 %	119719235
5106	NC_008698	CGT	2	6	282979	282984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719235
5107	NC_008698	TCC	3	9	283023	283031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719235
5108	NC_008698	CGC	3	9	283046	283054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719235
5109	NC_008698	GTG	2	6	283067	283072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719235
5110	NC_008698	TC	3	6	283089	283094	0 %	50 %	0 %	50 %	119719235
5111	NC_008698	CTC	2	6	283112	283117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719235
5112	NC_008698	CCT	2	6	283124	283129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719235
5113	NC_008698	GTA	2	6	283136	283141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719235
5114	NC_008698	CGT	2	6	283265	283270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719235
5115	NC_008698	GA	3	6	283326	283331	50 %	0 %	50 %	0 %	119719235
5116	NC_008698	CCGT	2	8	283410	283417	0 %	25 %	25 %	50 %	119719235
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5121	NC_008698	TAT	2	6	283523	283528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719235
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5123	NC_008698	CAA	2	6	283589	283594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719235
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