MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008698	G	6	6	247586	247591	0 %	0 %	100 %	0 %	119719200
4502	NC_008698	CCA	2	6	247604	247609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719200
4503	NC_008698	TCG	2	6	247633	247638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719200
4504	NC_008698	GGC	2	6	247654	247659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719200
4505	NC_008698	CTC	2	6	247722	247727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719200
4506	NC_008698	GAA	2	6	247805	247810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719201
4507	NC_008698	TTG	2	6	247815	247820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719201
4508	NC_008698	CTAGC	2	10	247876	247885	20 %	20 %	20 %	40 %	119719201
4509	NC_008698	TCC	2	6	247899	247904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719201
4510	NC_008698	TCG	2	6	247912	247917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719201
4511	NC_008698	GC	3	6	248067	248072	0 %	0 %	50 %	50 %	119719202
4512	NC_008698	C	6	6	248160	248165	0 %	0 %	0 %	100 %	119719202
4513	NC_008698	TCG	2	6	248171	248176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719202
4514	NC_008698	CTC	2	6	248181	248186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719202
4515	NC_008698	TTC	2	6	248207	248212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719202
4516	NC_008698	CAT	2	6	248320	248325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719202
4517	NC_008698	CTT	2	6	248368	248373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719202
4518	NC_008698	TAT	2	6	248383	248388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719202
4519	NC_008698	CGC	2	6	248398	248403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719202
4520	NC_008698	TGT	2	6	248436	248441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719202
4521	NC_008698	GTT	2	6	248447	248452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719202
4522	NC_008698	CTC	2	6	248453	248458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719202
4523	NC_008698	CGA	2	6	248523	248528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719202
4524	NC_008698	TGGCG	2	10	248562	248571	0 %	20 %	60 %	20 %	119719202
4525	NC_008698	CATC	2	8	248730	248737	25 %	25 %	0 %	50 %	119719202
4526	NC_008698	CAT	2	6	248755	248760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719202
4527	NC_008698	AGT	2	6	248796	248801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719202
4528	NC_008698	GTG	2	6	248834	248839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719202
4529	NC_008698	GCC	2	6	249053	249058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719202
4530	NC_008698	GA	3	6	249128	249133	50 %	0 %	50 %	0 %	119719202
4531	NC_008698	AG	3	6	249188	249193	50 %	0 %	50 %	0 %	119719202
4532	NC_008698	CTC	3	9	249235	249243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719202
4533	NC_008698	CTCA	2	8	249253	249260	25 %	25 %	0 %	50 %	119719202
4534	NC_008698	CTT	2	6	249287	249292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719203
4535	NC_008698	CTC	2	6	249330	249335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719203
4536	NC_008698	TAT	2	6	249371	249376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719203
4537	NC_008698	CGT	2	6	249403	249408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719203
4538	NC_008698	GAA	3	9	249518	249526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719203
4539	NC_008698	AGCG	2	8	249575	249582	25 %	0 %	50 %	25 %	119719203
4540	NC_008698	CT	4	8	249631	249638	0 %	50 %	0 %	50 %	119719203
4541	NC_008698	ACTG	2	8	249654	249661	25 %	25 %	25 %	25 %	119719203
4542	NC_008698	CGA	2	6	249667	249672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719203
4543	NC_008698	CGC	2	6	249862	249867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719203
4544	NC_008698	CCT	2	6	249907	249912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719203
4545	NC_008698	ACCGT	2	10	250077	250086	20 %	20 %	20 %	40 %	119719203
4546	NC_008698	CGT	2	6	250159	250164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719203
4547	NC_008698	CTC	2	6	250175	250180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719203
4548	NC_008698	GGA	2	6	250240	250245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719203
4549	NC_008698	TGGC	2	8	250294	250301	0 %	25 %	50 %	25 %	119719203
4550	NC_008698	CCA	2	6	250303	250308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719203
4551	NC_008698	GTT	2	6	250319	250324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719203
4552	NC_008698	AGC	2	6	250335	250340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719203
4553	NC_008698	CTT	2	6	250352	250357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719203
4554	NC_008698	TCCT	2	8	250371	250378	0 %	50 %	0 %	50 %	119719203
4555	NC_008698	TAT	2	6	250421	250426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719203
4556	NC_008698	AG	3	6	250635	250640	50 %	0 %	50 %	0 %	119719203
4557	NC_008698	ACG	2	6	250659	250664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719203
4558	NC_008698	GA	3	6	250927	250932	50 %	0 %	50 %	0 %	119719203
4559	NC_008698	CCTCC	2	10	250985	250994	0 %	20 %	0 %	80 %	119719203
4560	NC_008698	G	6	6	251051	251056	0 %	0 %	100 %	0 %	119719203
4561	NC_008698	CGC	2	6	251224	251229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719203
4562	NC_008698	CGG	2	6	251258	251263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719203
4563	NC_008698	CCT	2	6	251305	251310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719203
4564	NC_008698	CT	4	8	251402	251409	0 %	50 %	0 %	50 %	119719203
4565	NC_008698	G	6	6	251452	251457	0 %	0 %	100 %	0 %	119719203
4566	NC_008698	CGC	2	6	251458	251463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719203
4567	NC_008698	GCC	2	6	251487	251492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719203
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4569	NC_008698	TCT	2	6	251578	251583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719203
4570	NC_008698	TATG	2	8	251639	251646	25 %	50 %	25 %	0 %	119719203
4571	NC_008698	TTC	2	6	251764	251769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719203
4572	NC_008698	TCG	2	6	251805	251810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719203
4573	NC_008698	ATC	2	6	251853	251858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719203
4574	NC_008698	GA	3	6	251863	251868	50 %	0 %	50 %	0 %	119719203
4575	NC_008698	AG	3	6	251967	251972	50 %	0 %	50 %	0 %	119719204
4576	NC_008698	CGC	2	6	252047	252052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719204
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4579	NC_008698	GAG	2	6	252147	252152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719204
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4581	NC_008698	CCT	2	6	252223	252228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719204
4582	NC_008698	TACCC	2	10	252270	252279	20 %	20 %	0 %	60 %	119719204
4583	NC_008698	GGT	2	6	252311	252316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719204
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4587	NC_008698	ACG	2	6	252449	252454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719204
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4589	NC_008698	ATT	2	6	252568	252573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719204
4590	NC_008698	ACG	2	6	252634	252639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719204
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4594	NC_008698	CCG	2	6	252877	252882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719204
4595	NC_008698	GAG	2	6	252941	252946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719204
4596	NC_008698	AGGG	2	8	252973	252980	25 %	0 %	75 %	0 %	119719204
4597	NC_008698	CCT	2	6	253014	253019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719204
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4602	NC_008698	TGT	2	6	253106	253111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719204
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4604	NC_008698	ACC	2	6	253135	253140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719204
4605	NC_008698	GTA	2	6	253215	253220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719204
4606	NC_008698	CGC	2	6	253293	253298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719204
4607	NC_008698	CGC	2	6	253368	253373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719204
4608	NC_008698	GAG	2	6	253400	253405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719204
4609	NC_008698	TCCTCT	2	12	253441	253452	0 %	50 %	0 %	50 %	119719204
4610	NC_008698	ACT	2	6	253561	253566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719204
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4621	NC_008698	CAG	2	6	253836	253841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719204
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4623	NC_008698	GA	3	6	253873	253878	50 %	0 %	50 %	0 %	119719204
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4989	NC_008698	GAAG	2	8	276714	276721	50 %	0 %	50 %	0 %	119719226
4990	NC_008698	AAGCT	2	10	276740	276749	40 %	20 %	20 %	20 %	119719226
4991	NC_008698	AGA	2	6	276916	276921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719226
4992	NC_008698	TC	3	6	276934	276939	0 %	50 %	0 %	50 %	119719226
4993	NC_008698	AAG	3	9	276953	276961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719226
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