MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 plasmid pTPEN01

Total Repeats: 576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008696	CAC	2	6	27202	27207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709801
502	NC_008696	CCT	2	6	27272	27277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709801
503	NC_008696	CCT	2	6	27290	27295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709801
504	NC_008696	CTC	2	6	27321	27326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709801
505	NC_008696	CTC	2	6	27360	27365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709801
506	NC_008696	C	6	6	27506	27511	0 %	0 %	0 %	100 %	119709801
507	NC_008696	GTG	2	6	27525	27530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119709801
508	NC_008696	GCC	2	6	27706	27711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119709802
509	NC_008696	GGCGAG	2	12	27768	27779	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	119709802
510	NC_008696	CTTGAC	2	12	27795	27806	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119709802
511	NC_008696	GAA	2	6	27865	27870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119709803
512	NC_008696	GCG	2	6	27971	27976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709803
513	NC_008696	GTA	2	6	28136	28141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119709804
514	NC_008696	TTC	2	6	28179	28184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709804
515	NC_008696	AGA	2	6	28192	28197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119709804
516	NC_008696	TGT	2	6	28247	28252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119709804
517	NC_008696	CTA	2	6	28270	28275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119709804
518	NC_008696	GCATAG	2	12	28424	28435	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119709805
519	NC_008696	GCC	2	6	28486	28491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119709805
520	NC_008696	TCC	3	9	28550	28558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709805
521	NC_008696	GGC	2	6	28638	28643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709805
522	NC_008696	ATC	2	6	28672	28677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119709805
523	NC_008696	GAGC	2	8	28830	28837	25 %	0 %	50 %	25 %	119709805
524	NC_008696	AGA	3	9	28839	28847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119709805
525	NC_008696	CTC	2	6	28878	28883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709806
526	NC_008696	CTT	2	6	28895	28900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709806
527	NC_008696	CCT	2	6	28901	28906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709806
528	NC_008696	CTC	2	6	28914	28919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709806
529	NC_008696	CCT	2	6	28928	28933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709806
530	NC_008696	CTT	2	6	28949	28954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709806
531	NC_008696	C	6	6	28960	28965	0 %	0 %	0 %	100 %	119709806
532	NC_008696	G	6	6	29025	29030	0 %	0 %	100 %	0 %	119709806
533	NC_008696	CGA	2	6	29069	29074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709806
534	NC_008696	GTA	2	6	29106	29111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119709806
535	NC_008696	CAC	2	6	29238	29243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709806
536	NC_008696	CCT	2	6	29400	29405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709806
537	NC_008696	CTG	2	6	29413	29418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119709806
538	NC_008696	CGT	2	6	29447	29452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119709806
539	NC_008696	AGCCA	2	10	29506	29515	40 %	0 %	20 %	40 %	119709806
540	NC_008696	TCCC	2	8	29521	29528	0 %	25 %	0 %	75 %	119709806
541	NC_008696	GCC	2	6	29530	29535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119709806
542	NC_008696	CAC	2	6	29710	29715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709807
543	NC_008696	CTT	3	9	29723	29731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709807
544	NC_008696	CCT	3	9	29740	29748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709807
545	NC_008696	GACG	2	8	29794	29801	25 %	0 %	50 %	25 %	119709807
546	NC_008696	CCGTA	2	10	29803	29812	20 %	20 %	20 %	40 %	119709807
547	NC_008696	GAG	2	6	29813	29818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119709807
548	NC_008696	TCGTC	2	10	29842	29851	0 %	40 %	20 %	40 %	119709807
549	NC_008696	CGG	2	6	29858	29863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709807
550	NC_008696	CTC	2	6	30051	30056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709807
551	NC_008696	CAC	2	6	30119	30124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709807
552	NC_008696	CAC	2	6	30162	30167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709808
553	NC_008696	GCCT	2	8	30205	30212	0 %	25 %	25 %	50 %	119709808
554	NC_008696	GAG	2	6	30243	30248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119709808
555	NC_008696	CAC	2	6	30264	30269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709808
556	NC_008696	CAG	2	6	30321	30326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709808
557	NC_008696	ACC	2	6	30496	30501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709808
558	NC_008696	G	6	6	30510	30515	0 %	0 %	100 %	0 %	119709808
559	NC_008696	GCTCAG	2	12	30543	30554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119709808
560	NC_008696	GTT	2	6	30579	30584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119709808
561	NC_008696	CTC	2	6	30639	30644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709808
562	NC_008696	CCA	2	6	30697	30702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709809
563	NC_008696	TA	3	6	30724	30729	50 %	50 %	0 %	0 %	119709809
564	NC_008696	GTT	2	6	30738	30743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119709809
565	NC_008696	GTT	2	6	30791	30796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119709809
566	NC_008696	CG	3	6	30854	30859	0 %	0 %	50 %	50 %	119709809
567	NC_008696	AGCC	2	8	30940	30947	25 %	0 %	25 %	50 %	119709809
568	NC_008696	CAC	2	6	31055	31060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709809
569	NC_008696	CTG	2	6	31077	31082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119709809
570	NC_008696	ACA	2	6	31159	31164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119709809
571	NC_008696	GGAC	2	8	31198	31205	25 %	0 %	50 %	25 %	119709809
572	NC_008696	CTT	2	6	31211	31216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709809
573	NC_008696	ACG	2	6	31269	31274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709809
574	NC_008696	ACT	2	6	31434	31439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119709809
575	NC_008696	CCA	2	6	31453	31458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709809
576	NC_008696	TCC	2	6	31470	31475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709809

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