MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 104348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008312	ATG	2	6	208836	208841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474049
2502	NC_008312	AAT	2	6	209436	209441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474050
2503	NC_008312	GTTA	2	8	209503	209510	25 %	50 %	25 %	0 %	113474050
2504	NC_008312	AAG	2	6	209552	209557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474050
2505	NC_008312	TGC	2	6	209595	209600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474050
2506	NC_008312	CTTTAG	2	12	209636	209647	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	113474050
2507	NC_008312	A	9	9	209667	209675	100 %	0 %	0 %	0 %	113474050
2508	NC_008312	AG	3	6	209771	209776	50 %	0 %	50 %	0 %	113474050
2509	NC_008312	A	7	7	209777	209783	100 %	0 %	0 %	0 %	113474050
2510	NC_008312	GAAGT	2	10	209813	209822	40 %	20 %	40 %	0 %	113474050
2511	NC_008312	AGA	2	6	209835	209840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474050
2512	NC_008312	TAG	2	6	209852	209857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474050
2513	NC_008312	ATT	2	6	209864	209869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474050
2514	NC_008312	AGA	2	6	209910	209915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474050
2515	NC_008312	ACT	2	6	209938	209943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474050
2516	NC_008312	A	7	7	209957	209963	100 %	0 %	0 %	0 %	113474050
2517	NC_008312	AAATG	2	10	209991	210000	60 %	20 %	20 %	0 %	113474050
2518	NC_008312	ATA	2	6	210044	210049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474050
2519	NC_008312	ACA	2	6	210070	210075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474050
2520	NC_008312	GCT	2	6	210088	210093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474050
2521	NC_008312	A	6	6	210103	210108	100 %	0 %	0 %	0 %	113474050
2522	NC_008312	TGA	2	6	210183	210188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474050
2523	NC_008312	TGA	2	6	210195	210200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474050
2524	NC_008312	ATG	2	6	210236	210241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474050
2525	NC_008312	AAG	2	6	210354	210359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474050
2526	NC_008312	TAA	2	6	210374	210379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474050
2527	NC_008312	A	7	7	210378	210384	100 %	0 %	0 %	0 %	113474050
2528	NC_008312	AGA	2	6	210396	210401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474050
2529	NC_008312	ATG	2	6	210407	210412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474050
2530	NC_008312	CTT	2	6	210434	210439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474050
2531	NC_008312	ATT	2	6	210484	210489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474050
2532	NC_008312	TTTA	2	8	210522	210529	25 %	75 %	0 %	0 %	113474050
2533	NC_008312	ATG	2	6	210574	210579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474050
2534	NC_008312	ACA	2	6	210645	210650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474050
2535	NC_008312	AGA	2	6	210726	210731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474050
2536	NC_008312	GT	3	6	210741	210746	0 %	50 %	50 %	0 %	113474050
2537	NC_008312	TTG	2	6	210772	210777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474050
2538	NC_008312	TTC	4	12	210816	210827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474050
2539	NC_008312	AAG	2	6	210851	210856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474050
2540	NC_008312	AAT	2	6	210878	210883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474050
2541	NC_008312	TTA	2	6	210885	210890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474051
2542	NC_008312	GTAC	2	8	211017	211024	25 %	25 %	25 %	25 %	113474051
2543	NC_008312	TTGG	2	8	211027	211034	0 %	50 %	50 %	0 %	113474051
2544	NC_008312	AGT	2	6	211046	211051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474051
2545	NC_008312	TAT	2	6	211068	211073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474051
2546	NC_008312	AAAT	2	8	211093	211100	75 %	25 %	0 %	0 %	113474051
2547	NC_008312	TAT	2	6	211130	211135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474051
2548	NC_008312	AGA	2	6	211160	211165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474051
2549	NC_008312	AAG	3	9	211261	211269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474051
2550	NC_008312	GCT	2	6	211298	211303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474051
2551	NC_008312	TAA	2	6	211321	211326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474051
2552	NC_008312	CAA	2	6	211327	211332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474051
2553	NC_008312	CAT	2	6	211351	211356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474051
2554	NC_008312	AAAGT	2	10	211417	211426	60 %	20 %	20 %	0 %	113474051
2555	NC_008312	TTA	2	6	211434	211439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474051
2556	NC_008312	AAT	2	6	211476	211481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474051
2557	NC_008312	A	6	6	211501	211506	100 %	0 %	0 %	0 %	113474051
2558	NC_008312	ATCT	2	8	211513	211520	25 %	50 %	0 %	25 %	113474051
2559	NC_008312	AT	3	6	211537	211542	50 %	50 %	0 %	0 %	113474051
2560	NC_008312	A	6	6	211547	211552	100 %	0 %	0 %	0 %	113474051
2561	NC_008312	AGA	2	6	211637	211642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474051
2562	NC_008312	CAA	2	6	211650	211655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474051
2563	NC_008312	AGG	2	6	211679	211684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113474051
2564	NC_008312	TCA	2	6	211781	211786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474051
2565	NC_008312	ACA	2	6	211819	211824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474051
2566	NC_008312	A	6	6	211829	211834	100 %	0 %	0 %	0 %	113474051
2567	NC_008312	TA	3	6	211842	211847	50 %	50 %	0 %	0 %	113474051
2568	NC_008312	TA	3	6	212948	212953	50 %	50 %	0 %	0 %	113474052
2569	NC_008312	AGC	2	6	212971	212976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474052
2570	NC_008312	AAT	2	6	212990	212995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474052
2571	NC_008312	TAG	2	6	213024	213029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474052
2572	NC_008312	GTT	2	6	213033	213038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474052
2573	NC_008312	CATT	2	8	213108	213115	25 %	50 %	0 %	25 %	113474052
2574	NC_008312	CT	3	6	213118	213123	0 %	50 %	0 %	50 %	113474052
2575	NC_008312	GAC	2	6	213159	213164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474052
2576	NC_008312	TGC	2	6	213201	213206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474052
2577	NC_008312	ATT	2	6	213211	213216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474052
2578	NC_008312	TTG	2	6	213235	213240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474052
2579	NC_008312	AGG	2	6	213291	213296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113474052
2580	NC_008312	AATCA	2	10	213334	213343	60 %	20 %	0 %	20 %	113474052
2581	NC_008312	ATTT	2	8	213375	213382	25 %	75 %	0 %	0 %	113474052
2582	NC_008312	TCA	2	6	213488	213493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474052
2583	NC_008312	AATA	2	8	213549	213556	75 %	25 %	0 %	0 %	113474052
2584	NC_008312	CCA	2	6	213611	213616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113474052
2585	NC_008312	CAG	2	6	213645	213650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474052
2586	NC_008312	TAAT	2	8	213698	213705	50 %	50 %	0 %	0 %	113474052
2587	NC_008312	TAT	2	6	213729	213734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474052
2588	NC_008312	TGT	2	6	213805	213810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474052
2589	NC_008312	AGA	2	6	213836	213841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474052
2590	NC_008312	TAG	2	6	213858	213863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474052
2591	NC_008312	TTA	2	6	213905	213910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474052
2592	NC_008312	TGAT	2	8	213961	213968	25 %	50 %	25 %	0 %	113474052
2593	NC_008312	CTA	2	6	213981	213986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474052
2594	NC_008312	TGT	2	6	214072	214077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474052
2595	NC_008312	TTA	2	6	214079	214084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474052
2596	NC_008312	CTT	3	9	214116	214124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474052
2597	NC_008312	TTGA	2	8	214204	214211	25 %	50 %	25 %	0 %	113474052
2598	NC_008312	ACC	2	6	214282	214287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113474052
2599	NC_008312	GTC	2	6	214377	214382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474052
2600	NC_008312	GTA	2	6	214403	214408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474052
2601	NC_008312	ATA	2	6	214450	214455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474052
2602	NC_008312	TGTA	2	8	214496	214503	25 %	50 %	25 %	0 %	113474052
2603	NC_008312	T	8	8	214526	214533	0 %	100 %	0 %	0 %	113474052
2604	NC_008312	TTC	2	6	214674	214679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474053
2605	NC_008312	CTG	2	6	214772	214777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474053
2606	NC_008312	AATT	2	8	215052	215059	50 %	50 %	0 %	0 %	113474053
2607	NC_008312	TCC	2	6	215064	215069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113474053
2608	NC_008312	CTA	2	6	215077	215082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474053
2609	NC_008312	GTT	2	6	215156	215161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474053
2610	NC_008312	TCT	2	6	215167	215172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474053
2611	NC_008312	AACTG	2	10	215307	215316	40 %	20 %	20 %	20 %	113474053
2612	NC_008312	TGA	2	6	215353	215358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474053
2613	NC_008312	AT	3	6	215454	215459	50 %	50 %	0 %	0 %	113474053
2614	NC_008312	TAT	2	6	215487	215492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474053
2615	NC_008312	T	6	6	215529	215534	0 %	100 %	0 %	0 %	113474053
2616	NC_008312	TTC	2	6	215565	215570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474053
2617	NC_008312	ATT	2	6	215601	215606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474053
2618	NC_008312	AGG	2	6	215703	215708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113474053
2619	NC_008312	TAT	2	6	215796	215801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474054
2620	NC_008312	TAT	2	6	215821	215826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474054
2621	NC_008312	GAT	2	6	215845	215850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474054
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2623	NC_008312	TTTTA	2	10	215907	215916	20 %	80 %	0 %	0 %	113474054
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2993	NC_008312	TAGT	2	8	252124	252131	25 %	50 %	25 %	0 %	113474074
2994	NC_008312	GGA	2	6	252133	252138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113474074
2995	NC_008312	TAT	3	9	252154	252162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474074
2996	NC_008312	CTA	3	9	252174	252182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474074
2997	NC_008312	TAT	3	9	252212	252220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474074
2998	NC_008312	ACCAA	2	10	252239	252248	60 %	0 %	0 %	40 %	113474074
2999	NC_008312	TAGT	2	8	252259	252266	25 %	50 %	25 %	0 %	113474074
3000	NC_008312	T	7	7	252272	252278	0 %	100 %	0 %	0 %	113474074

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