MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 26840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007520	ACA	2	6	4	9	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484347
2	NC_007520	AGA	3	9	96	104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484347
3	NC_007520	TGG	2	6	194	199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484347
4	NC_007520	GCC	2	6	319	324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484347
5	NC_007520	TCC	2	6	366	371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78484347
6	NC_007520	GCG	2	6	448	453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484347
7	NC_007520	TGG	2	6	483	488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484347
8	NC_007520	GGC	2	6	514	519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484347
9	NC_007520	GTG	2	6	592	597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484347
10	NC_007520	TGA	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484347
11	NC_007520	GTT	2	6	693	698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484347
12	NC_007520	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484347
13	NC_007520	AAG	2	6	740	745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484347
14	NC_007520	TTC	2	6	748	753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484347
15	NC_007520	ACC	2	6	885	890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484347
16	NC_007520	GGC	2	6	927	932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484347
17	NC_007520	CAA	2	6	1051	1056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484347
18	NC_007520	CAA	2	6	1108	1113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484347
19	NC_007520	ATT	2	6	1154	1159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484347
20	NC_007520	AGA	2	6	1192	1197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484347
21	NC_007520	ACG	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484347
22	NC_007520	ATC	2	6	1352	1357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484347
23	NC_007520	GAA	2	6	1363	1368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484347
24	NC_007520	ATT	2	6	1390	1395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484347
25	NC_007520	TGA	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484348
26	NC_007520	GAT	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484348
27	NC_007520	TGT	2	6	2052	2057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484348
28	NC_007520	TGA	3	9	2206	2214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484348
29	NC_007520	GAA	2	6	2264	2269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484348
30	NC_007520	TTG	2	6	2378	2383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484348
31	NC_007520	GCG	2	6	2390	2395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484348
32	NC_007520	ACT	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484348
33	NC_007520	GAA	2	6	2579	2584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484348
34	NC_007520	CAG	2	6	2614	2619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484348
35	NC_007520	TCA	2	6	2664	2669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484348
36	NC_007520	ACA	2	6	2811	2816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484349
37	NC_007520	TGC	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484349
38	NC_007520	CCA	2	6	2958	2963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484349
39	NC_007520	GAA	2	6	3160	3165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484349
40	NC_007520	CAT	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484349
41	NC_007520	TGG	2	6	3326	3331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484349
42	NC_007520	CGC	2	6	3333	3338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484349
43	NC_007520	AAG	2	6	3581	3586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484349
44	NC_007520	CAA	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484349
45	NC_007520	TTA	2	6	3637	3642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484349
46	NC_007520	AGC	2	6	3863	3868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484349
47	NC_007520	TCG	2	6	4057	4062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484350
48	NC_007520	ATT	2	6	4122	4127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484350
49	NC_007520	CGA	2	6	4265	4270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484350
50	NC_007520	ACG	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484350
51	NC_007520	CTT	2	6	4639	4644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484350
52	NC_007520	TGG	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484351
53	NC_007520	CAC	2	6	4739	4744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484351
54	NC_007520	TCA	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484351
55	NC_007520	TCG	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484351
56	NC_007520	CAA	3	9	5048	5056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484351
57	NC_007520	TGA	2	6	5142	5147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484351
58	NC_007520	AAC	2	6	5199	5204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484351
59	NC_007520	GCA	2	6	5341	5346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484351
60	NC_007520	TTG	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484351
61	NC_007520	GAT	2	6	5417	5422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484351
62	NC_007520	ACA	2	6	5464	5469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484351
63	NC_007520	CAA	2	6	5591	5596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484351
64	NC_007520	TTG	2	6	5693	5698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484351
65	NC_007520	GCA	2	6	5902	5907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484351
66	NC_007520	AGG	2	6	5956	5961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78484351
67	NC_007520	CGC	2	6	6254	6259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484352
68	NC_007520	CAG	2	6	6386	6391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484352
69	NC_007520	CAA	2	6	6396	6401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
70	NC_007520	ACA	2	6	6440	6445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
71	NC_007520	AAC	2	6	6466	6471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
72	NC_007520	AGC	2	6	6766	6771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484352
73	NC_007520	ATG	2	6	6786	6791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484352
74	NC_007520	AAC	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
75	NC_007520	ACA	2	6	7025	7030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
76	NC_007520	AAG	2	6	7057	7062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484352
77	NC_007520	CAA	2	6	7101	7106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
78	NC_007520	GAA	2	6	7119	7124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484352
79	NC_007520	CTG	2	6	7182	7187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484352
80	NC_007520	ACA	2	6	7193	7198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484352
81	NC_007520	TGA	2	6	7353	7358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484353
82	NC_007520	TCT	2	6	7451	7456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484353
83	NC_007520	CAA	2	6	7757	7762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484353
84	NC_007520	CAT	2	6	7855	7860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484353
85	NC_007520	CAG	2	6	7906	7911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484353
86	NC_007520	TAT	2	6	7939	7944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484353
87	NC_007520	AAG	2	6	7995	8000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484353
88	NC_007520	AGC	2	6	8181	8186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484353
89	NC_007520	ACA	2	6	8235	8240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484353
90	NC_007520	GTT	2	6	8282	8287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484353
91	NC_007520	TTC	2	6	8324	8329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484353
92	NC_007520	CAG	2	6	8371	8376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484353
93	NC_007520	AAT	2	6	8424	8429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484353
94	NC_007520	TTG	2	6	8478	8483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484354
95	NC_007520	GGT	2	6	8502	8507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484354
96	NC_007520	ATC	2	6	8571	8576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484354
97	NC_007520	AAC	2	6	8611	8616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484354
98	NC_007520	TCA	2	6	8620	8625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484354
99	NC_007520	AAG	2	6	8719	8724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484354
100	NC_007520	CTG	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484354
101	NC_007520	GGA	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78484354
102	NC_007520	CAA	2	6	9050	9055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484354
103	NC_007520	ATG	2	6	9061	9066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484354
104	NC_007520	GAA	2	6	9090	9095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484354
105	NC_007520	GTG	2	6	9309	9314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484354
106	NC_007520	CAA	2	6	9324	9329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484354
107	NC_007520	TCT	2	6	9379	9384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484354
108	NC_007520	GGT	2	6	9446	9451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484354
109	NC_007520	TGA	2	6	9535	9540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484354
110	NC_007520	TGG	2	6	9619	9624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484354
111	NC_007520	GCC	2	6	9627	9632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484354
112	NC_007520	GTG	4	12	9633	9644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484354
113	NC_007520	CAC	2	6	9656	9661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484354
114	NC_007520	GGT	2	6	9734	9739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484354
115	NC_007520	TTA	2	6	9751	9756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484354
116	NC_007520	ATT	2	6	9831	9836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484354
117	NC_007520	GTC	2	6	9887	9892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484354
118	NC_007520	AAG	2	6	10174	10179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484354
119	NC_007520	TCG	2	6	10198	10203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484354
120	NC_007520	AAG	2	6	10456	10461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484354
121	NC_007520	GAT	2	6	10479	10484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484354
122	NC_007520	TTC	2	6	10624	10629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484354
123	NC_007520	CGA	2	6	10711	10716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484354
124	NC_007520	ACA	2	6	10739	10744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484354
125	NC_007520	TTA	2	6	10776	10781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484354
126	NC_007520	TGG	2	6	10789	10794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484354
127	NC_007520	GAA	2	6	10800	10805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484354
128	NC_007520	TAT	2	6	10944	10949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484354
129	NC_007520	CAA	2	6	10977	10982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484354
130	NC_007520	GGT	3	9	11003	11011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484354
131	NC_007520	TAT	2	6	11036	11041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484354
132	NC_007520	GGC	2	6	11112	11117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484354
133	NC_007520	TGA	2	6	11212	11217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484354
134	NC_007520	TTA	2	6	11424	11429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484354
135	NC_007520	TGA	2	6	11434	11439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484354
136	NC_007520	TGC	2	6	11518	11523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484355
137	NC_007520	GCT	2	6	11629	11634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484355
138	NC_007520	CAA	2	6	11657	11662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484355
139	NC_007520	ACC	2	6	11672	11677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484355
140	NC_007520	AAC	2	6	11725	11730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484355
141	NC_007520	CGT	2	6	11991	11996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484356
142	NC_007520	GTC	2	6	12027	12032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484356
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145	NC_007520	ATC	2	6	12279	12284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484356
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148	NC_007520	CAA	2	6	12895	12900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484357
149	NC_007520	GAT	2	6	12996	13001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484357
150	NC_007520	ACA	2	6	13014	13019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484357
151	NC_007520	GTG	2	6	13030	13035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484357
152	NC_007520	TGA	2	6	13224	13229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484357
153	NC_007520	AAT	2	6	13240	13245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484357
154	NC_007520	ACA	2	6	13271	13276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484357
155	NC_007520	ACA	2	6	13305	13310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484357
156	NC_007520	TGC	2	6	13328	13333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484357
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163	NC_007520	GTT	2	6	14087	14092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484358
164	NC_007520	GAA	3	9	14162	14170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484358
165	NC_007520	GAT	2	6	14225	14230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484358
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259	NC_007520	CAA	2	6	21683	21688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484363
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