MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 41956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007520	AGA	2	6	230354	230359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484541
4002	NC_007520	A	7	7	230638	230644	100 %	0 %	0 %	0 %	78484541
4003	NC_007520	CTG	2	6	230660	230665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484541
4004	NC_007520	TTG	2	6	230696	230701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484541
4005	NC_007520	AG	3	6	230702	230707	50 %	0 %	50 %	0 %	78484541
4006	NC_007520	CAA	2	6	230782	230787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484541
4007	NC_007520	AAGCG	2	10	230809	230818	40 %	0 %	40 %	20 %	78484541
4008	NC_007520	GAA	3	9	230833	230841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484541
4009	NC_007520	AAG	2	6	230867	230872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484541
4010	NC_007520	AGA	2	6	230895	230900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484541
4011	NC_007520	A	6	6	230911	230916	100 %	0 %	0 %	0 %	78484541
4012	NC_007520	ACA	2	6	230935	230940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484541
4013	NC_007520	CGT	2	6	230960	230965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484541
4014	NC_007520	ATG	2	6	230995	231000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484541
4015	NC_007520	GAA	2	6	231067	231072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484541
4016	NC_007520	CAA	2	6	231125	231130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484541
4017	NC_007520	CGT	2	6	231133	231138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484541
4018	NC_007520	AAC	2	6	231230	231235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484541
4019	NC_007520	CGA	2	6	231256	231261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484541
4020	NC_007520	CTG	2	6	231332	231337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484541
4021	NC_007520	TGG	2	6	231344	231349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484541
4022	NC_007520	T	6	6	231378	231383	0 %	100 %	0 %	0 %	78484541
4023	NC_007520	GAT	2	6	231403	231408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484541
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4027	NC_007520	GCT	2	6	231465	231470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484541
4028	NC_007520	TGT	2	6	231603	231608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484541
4029	NC_007520	GAAG	2	8	231609	231616	50 %	0 %	50 %	0 %	78484541
4030	NC_007520	ACA	2	6	231694	231699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484541
4031	NC_007520	TGG	2	6	231803	231808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484541
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4033	NC_007520	GGA	2	6	232089	232094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78484541
4034	NC_007520	GTT	2	6	232104	232109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484541
4035	NC_007520	ATT	2	6	232201	232206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484541
4036	NC_007520	ATTG	2	8	232311	232318	25 %	50 %	25 %	0 %	78484541
4037	NC_007520	GAC	2	6	232419	232424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484541
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4039	NC_007520	GAA	2	6	232477	232482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484541
4040	NC_007520	A	6	6	232516	232521	100 %	0 %	0 %	0 %	78484541
4041	NC_007520	AAAG	2	8	232542	232549	75 %	0 %	25 %	0 %	78484541
4042	NC_007520	AAG	2	6	232558	232563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484541
4043	NC_007520	GCC	2	6	232567	232572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484541
4044	NC_007520	A	7	7	232573	232579	100 %	0 %	0 %	0 %	78484541
4045	NC_007520	CTG	2	6	232595	232600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484541
4046	NC_007520	GCCG	2	8	232608	232615	0 %	0 %	50 %	50 %	78484541
4047	NC_007520	AAAG	2	8	232617	232624	75 %	0 %	25 %	0 %	78484541
4048	NC_007520	A	7	7	232633	232639	100 %	0 %	0 %	0 %	78484541
4049	NC_007520	GTT	2	6	232929	232934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484542
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4051	NC_007520	CCT	2	6	232976	232981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78484542
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4053	NC_007520	TTG	2	6	233123	233128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484542
4054	NC_007520	TTC	2	6	233155	233160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484542
4055	NC_007520	A	6	6	233219	233224	100 %	0 %	0 %	0 %	78484542
4056	NC_007520	GTTT	2	8	233240	233247	0 %	75 %	25 %	0 %	78484542
4057	NC_007520	TGG	2	6	233300	233305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484542
4058	NC_007520	TGGTG	2	10	233352	233361	0 %	40 %	60 %	0 %	78484542
4059	NC_007520	TGG	2	6	233419	233424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484542
4060	NC_007520	AATCGC	2	12	233545	233556	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78484542
4061	NC_007520	CTT	2	6	233598	233603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484542
4062	NC_007520	TTG	2	6	233614	233619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484542
4063	NC_007520	GGTG	2	8	233730	233737	0 %	25 %	75 %	0 %	78484542
4064	NC_007520	TGG	2	6	233756	233761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484542
4065	NC_007520	T	7	7	233780	233786	0 %	100 %	0 %	0 %	78484542
4066	NC_007520	GTGG	2	8	233805	233812	0 %	25 %	75 %	0 %	78484542
4067	NC_007520	GAC	2	6	233934	233939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484542
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4069	NC_007520	T	8	8	233965	233972	0 %	100 %	0 %	0 %	78484542
4070	NC_007520	TGT	2	6	233981	233986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484542
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4073	NC_007520	A	6	6	234196	234201	100 %	0 %	0 %	0 %	78484542
4074	NC_007520	GAA	3	9	234221	234229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484542
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4079	NC_007520	CCT	2	6	234650	234655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78484543
4080	NC_007520	AG	3	6	234656	234661	50 %	0 %	50 %	0 %	78484543
4081	NC_007520	T	6	6	234743	234748	0 %	100 %	0 %	0 %	78484543
4082	NC_007520	AATGT	2	10	234813	234822	40 %	40 %	20 %	0 %	78484543
4083	NC_007520	CGGT	2	8	234833	234840	0 %	25 %	50 %	25 %	78484543
4084	NC_007520	TGG	2	6	234843	234848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484543
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4088	NC_007520	ATG	2	6	234975	234980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484543
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4092	NC_007520	GAT	2	6	235169	235174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484543
4093	NC_007520	TTGA	2	8	235232	235239	25 %	50 %	25 %	0 %	78484543
4094	NC_007520	A	6	6	235239	235244	100 %	0 %	0 %	0 %	78484543
4095	NC_007520	TTG	2	6	235253	235258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484543
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4098	NC_007520	AAG	2	6	235442	235447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484543
4099	NC_007520	TGA	2	6	235480	235485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484543
4100	NC_007520	CAA	2	6	235555	235560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484543
4101	NC_007520	ATTG	2	8	235582	235589	25 %	50 %	25 %	0 %	78484543
4102	NC_007520	GATCA	2	10	235599	235608	40 %	20 %	20 %	20 %	78484543
4103	NC_007520	GCG	2	6	235790	235795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484543
4104	NC_007520	AGC	2	6	235824	235829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484543
4105	NC_007520	GATTTG	2	12	235841	235852	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	78484543
4106	NC_007520	CAAAAT	2	12	235854	235865	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	78484543
4107	NC_007520	TAT	2	6	235883	235888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484543
4108	NC_007520	AGA	2	6	235933	235938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484543
4109	NC_007520	TTG	2	6	236021	236026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484543
4110	NC_007520	GGC	2	6	236053	236058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484543
4111	NC_007520	TTA	2	6	236086	236091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484543
4112	NC_007520	CAACT	2	10	236128	236137	40 %	20 %	0 %	40 %	78484543
4113	NC_007520	GTT	2	6	236186	236191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484543
4114	NC_007520	A	6	6	236247	236252	100 %	0 %	0 %	0 %	78484543
4115	NC_007520	TTC	2	6	236422	236427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484544
4116	NC_007520	CGG	2	6	236595	236600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484544
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4118	NC_007520	TGG	2	6	236646	236651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484544
4119	NC_007520	AAG	2	6	236685	236690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484544
4120	NC_007520	TTA	2	6	236782	236787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484544
4121	NC_007520	AAG	2	6	236814	236819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484544
4122	NC_007520	GA	3	6	236827	236832	50 %	0 %	50 %	0 %	78484544
4123	NC_007520	A	6	6	236948	236953	100 %	0 %	0 %	0 %	78484544
4124	NC_007520	CAT	2	6	237140	237145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484545
4125	NC_007520	GTC	2	6	237162	237167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484545
4126	NC_007520	T	6	6	237233	237238	0 %	100 %	0 %	0 %	78484545
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4129	NC_007520	GTC	2	6	237375	237380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484545
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4231	NC_007520	T	6	6	243080	243085	0 %	100 %	0 %	0 %	78484551
4232	NC_007520	TACCG	2	10	243087	243096	20 %	20 %	20 %	40 %	78484551
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4246	NC_007520	GGAA	2	8	243777	243784	50 %	0 %	50 %	0 %	78484551
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4482	NC_007520	GAT	2	6	256595	256600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484561
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4485	NC_007520	GAAA	2	8	256798	256805	75 %	0 %	25 %	0 %	78484561
4486	NC_007520	CAA	2	6	256826	256831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484561
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4490	NC_007520	GGTT	2	8	257013	257020	0 %	50 %	50 %	0 %	78484562
4491	NC_007520	CCA	2	6	257100	257105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484562
4492	NC_007520	ATCGC	2	10	257114	257123	20 %	20 %	20 %	40 %	78484562
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4494	NC_007520	ACGTGA	2	12	257197	257208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78484562
4495	NC_007520	TTCA	2	8	257254	257261	25 %	50 %	0 %	25 %	78484562
4496	NC_007520	CAT	2	6	257269	257274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484562
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4498	NC_007520	TGC	2	6	257297	257302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484562
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