MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 41956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007520	CTG	2	6	202574	202579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484516
3502	NC_007520	TTC	2	6	203057	203062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484517
3503	NC_007520	TTA	2	6	203230	203235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484517
3504	NC_007520	GCAG	2	8	203270	203277	25 %	0 %	50 %	25 %	78484517
3505	NC_007520	ATG	2	6	203319	203324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484517
3506	NC_007520	TCT	2	6	203364	203369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484517
3507	NC_007520	ACGA	2	8	203372	203379	50 %	0 %	25 %	25 %	78484517
3508	NC_007520	TCA	2	6	203451	203456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484517
3509	NC_007520	TTCT	2	8	203459	203466	0 %	75 %	0 %	25 %	78484517
3510	NC_007520	CCG	2	6	203500	203505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484517
3511	NC_007520	CTTT	2	8	203541	203548	0 %	75 %	0 %	25 %	78484517
3512	NC_007520	GTT	2	6	203573	203578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484517
3513	NC_007520	TTG	2	6	203603	203608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484517
3514	NC_007520	ATG	2	6	203615	203620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484517
3515	NC_007520	CAC	2	6	203792	203797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484517
3516	NC_007520	GAA	2	6	203846	203851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484517
3517	NC_007520	GT	3	6	203935	203940	0 %	50 %	50 %	0 %	78484517
3518	NC_007520	TTC	2	6	204029	204034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484517
3519	NC_007520	GAT	2	6	204151	204156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484517
3520	NC_007520	GTG	2	6	204198	204203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484517
3521	NC_007520	C	7	7	204205	204211	0 %	0 %	0 %	100 %	78484517
3522	NC_007520	TAA	2	6	204215	204220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484517
3523	NC_007520	TCA	2	6	204244	204249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484517
3524	NC_007520	TGA	2	6	204286	204291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484517
3525	NC_007520	T	6	6	204343	204348	0 %	100 %	0 %	0 %	78484517
3526	NC_007520	CAG	2	6	204349	204354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484517
3527	NC_007520	TTA	2	6	204387	204392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484517
3528	NC_007520	ACG	2	6	204402	204407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484517
3529	NC_007520	CG	3	6	204524	204529	0 %	0 %	50 %	50 %	78484517
3530	NC_007520	CAC	2	6	204551	204556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484517
3531	NC_007520	GAA	2	6	204562	204567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484517
3532	NC_007520	CGA	2	6	204595	204600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484517
3533	NC_007520	CCAT	2	8	204609	204616	25 %	25 %	0 %	50 %	78484517
3534	NC_007520	CTT	2	6	204664	204669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484517
3535	NC_007520	GTT	2	6	204735	204740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484517
3536	NC_007520	CGC	2	6	204784	204789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484517
3537	NC_007520	TTC	2	6	204794	204799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484517
3538	NC_007520	GTC	2	6	204884	204889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484517
3539	NC_007520	CTT	2	6	204934	204939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484517
3540	NC_007520	GTT	2	6	204986	204991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484517
3541	NC_007520	GAAAGA	2	12	204998	205009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484517
3542	NC_007520	CCG	2	6	205023	205028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484517
3543	NC_007520	TTTG	2	8	205051	205058	0 %	75 %	25 %	0 %	78484517
3544	NC_007520	TTA	2	6	205095	205100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484517
3545	NC_007520	ATG	2	6	205146	205151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484517
3546	NC_007520	TCA	2	6	205245	205250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484517
3547	NC_007520	T	6	6	205280	205285	0 %	100 %	0 %	0 %	78484517
3548	NC_007520	CTG	2	6	205298	205303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484517
3549	NC_007520	CTT	2	6	205321	205326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484517
3550	NC_007520	CAC	2	6	205343	205348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484517
3551	NC_007520	GAT	2	6	205511	205516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484517
3552	NC_007520	AAT	2	6	205577	205582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484517
3553	NC_007520	ACAA	2	8	205635	205642	75 %	0 %	0 %	25 %	78484517
3554	NC_007520	TGT	2	6	205645	205650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484517
3555	NC_007520	GTG	2	6	205764	205769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484517
3556	NC_007520	GCC	2	6	205778	205783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484517
3557	NC_007520	AAT	2	6	205784	205789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484517
3558	NC_007520	AACC	2	8	205794	205801	50 %	0 %	0 %	50 %	78484517
3559	NC_007520	TCA	2	6	205848	205853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484517
3560	NC_007520	CA	3	6	205909	205914	50 %	0 %	0 %	50 %	78484517
3561	NC_007520	TTC	2	6	205925	205930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484517
3562	NC_007520	TTC	2	6	205946	205951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484517
3563	NC_007520	GGT	2	6	206021	206026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484517
3564	NC_007520	TCT	2	6	206100	206105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484517
3565	NC_007520	TAA	2	6	206192	206197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484517
3566	NC_007520	GCTT	2	8	206208	206215	0 %	50 %	25 %	25 %	78484517
3567	NC_007520	GGTT	2	8	206293	206300	0 %	50 %	50 %	0 %	78484517
3568	NC_007520	TCT	2	6	206337	206342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484517
3569	NC_007520	TGC	2	6	206378	206383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484517
3570	NC_007520	TGG	3	9	206437	206445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484517
3571	NC_007520	TGAA	2	8	206449	206456	50 %	25 %	25 %	0 %	78484517
3572	NC_007520	ATG	2	6	206466	206471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484517
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3582	NC_007520	ATT	2	6	207301	207306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484518
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3588	NC_007520	CAA	2	6	207647	207652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484518
3589	NC_007520	GAA	2	6	207821	207826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484518
3590	NC_007520	TTG	2	6	207906	207911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484518
3591	NC_007520	ATTAT	2	10	207966	207975	40 %	60 %	0 %	0 %	78484518
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3595	NC_007520	TGG	2	6	208217	208222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484519
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3597	NC_007520	ATC	2	6	208270	208275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484519
3598	NC_007520	GT	3	6	208277	208282	0 %	50 %	50 %	0 %	78484519
3599	NC_007520	GC	3	6	208382	208387	0 %	0 %	50 %	50 %	78484519
3600	NC_007520	T	6	6	208418	208423	0 %	100 %	0 %	0 %	78484519
3601	NC_007520	TTG	3	9	208429	208437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484519
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3603	NC_007520	ATT	2	6	208579	208584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484519
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3605	NC_007520	ATCG	2	8	208710	208717	25 %	25 %	25 %	25 %	78484519
3606	NC_007520	AT	3	6	208848	208853	50 %	50 %	0 %	0 %	78484519
3607	NC_007520	TGA	2	6	208895	208900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484520
3608	NC_007520	ACG	2	6	208994	208999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484520
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3610	NC_007520	TGG	2	6	209069	209074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484520
3611	NC_007520	GT	3	6	209152	209157	0 %	50 %	50 %	0 %	78484520
3612	NC_007520	CAA	2	6	209176	209181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484520
3613	NC_007520	A	6	6	209180	209185	100 %	0 %	0 %	0 %	78484520
3614	NC_007520	CGT	2	6	209239	209244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484520
3615	NC_007520	TGGTA	2	10	209251	209260	20 %	40 %	40 %	0 %	78484520
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3619	NC_007520	T	6	6	209431	209436	0 %	100 %	0 %	0 %	78484520
3620	NC_007520	ACA	2	6	209437	209442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484520
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3999	NC_007520	CGTT	2	8	230250	230257	0 %	50 %	25 %	25 %	78484541
4000	NC_007520	A	6	6	230287	230292	100 %	0 %	0 %	0 %	78484541

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