MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 41956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007520	AAG	2	6	27789	27794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484370
502	NC_007520	TAT	2	6	27808	27813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484370
503	NC_007520	CCA	2	6	27825	27830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484370
504	NC_007520	CATG	2	8	27871	27878	25 %	25 %	25 %	25 %	78484370
505	NC_007520	A	6	6	27899	27904	100 %	0 %	0 %	0 %	78484370
506	NC_007520	CGA	2	6	28011	28016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484370
507	NC_007520	CAA	2	6	28021	28026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484370
508	NC_007520	AGA	3	9	28096	28104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484370
509	NC_007520	GTT	2	6	28118	28123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484370
510	NC_007520	GCC	3	9	28162	28170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484370
511	NC_007520	ATC	2	6	28227	28232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484370
512	NC_007520	AAG	2	6	28263	28268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484370
513	NC_007520	CTT	2	6	28311	28316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484370
514	NC_007520	CAAA	2	8	28354	28361	75 %	0 %	0 %	25 %	78484370
515	NC_007520	GAT	2	6	28370	28375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484370
516	NC_007520	CCG	2	6	28382	28387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484370
517	NC_007520	ATG	2	6	28449	28454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484370
518	NC_007520	TCA	2	6	28479	28484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484370
519	NC_007520	CCG	2	6	28511	28516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484370
520	NC_007520	ATG	2	6	28557	28562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484370
521	NC_007520	ATC	2	6	28577	28582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484370
522	NC_007520	TTC	2	6	28617	28622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484370
523	NC_007520	TTG	2	6	28668	28673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484370
524	NC_007520	TGG	2	6	28707	28712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484370
525	NC_007520	GC	3	6	28756	28761	0 %	0 %	50 %	50 %	78484370
526	NC_007520	A	6	6	28835	28840	100 %	0 %	0 %	0 %	78484370
527	NC_007520	ACAA	2	8	28875	28882	75 %	0 %	0 %	25 %	78484370
528	NC_007520	TTG	2	6	28932	28937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484370
529	NC_007520	AGA	2	6	28945	28950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484370
530	NC_007520	GAA	2	6	29260	29265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484371
531	NC_007520	GGT	2	6	29312	29317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484371
532	NC_007520	ATG	2	6	29342	29347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484371
533	NC_007520	ATT	2	6	29350	29355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484371
534	NC_007520	GTC	2	6	29359	29364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484371
535	NC_007520	GGC	2	6	29427	29432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484371
536	NC_007520	TTG	2	6	29435	29440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484371
537	NC_007520	GAAAAA	2	12	29515	29526	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	78484371
538	NC_007520	GAA	2	6	29536	29541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484371
539	NC_007520	CCAA	2	8	29609	29616	50 %	0 %	0 %	50 %	78484371
540	NC_007520	ATG	2	6	29639	29644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484371
541	NC_007520	GCC	2	6	29725	29730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484371
542	NC_007520	TGG	2	6	29765	29770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484371
543	NC_007520	ATT	3	9	29797	29805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484371
544	NC_007520	CTG	2	6	29824	29829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484371
545	NC_007520	CGG	2	6	29859	29864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484371
546	NC_007520	T	6	6	30007	30012	0 %	100 %	0 %	0 %	78484372
547	NC_007520	GGC	2	6	30021	30026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484372
548	NC_007520	GCC	2	6	30036	30041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484372
549	NC_007520	CCA	2	6	30086	30091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484372
550	NC_007520	CAC	2	6	30099	30104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484372
551	NC_007520	ATAAA	2	10	30129	30138	80 %	20 %	0 %	0 %	78484372
552	NC_007520	CCAA	2	8	30161	30168	50 %	0 %	0 %	50 %	78484372
553	NC_007520	AAT	2	6	30172	30177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484372
554	NC_007520	GCC	2	6	30181	30186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484372
555	NC_007520	ATC	2	6	30222	30227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484372
556	NC_007520	AAT	2	6	30236	30241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484372
557	NC_007520	ATC	2	6	30352	30357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484372
558	NC_007520	GAT	2	6	30470	30475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484372
559	NC_007520	CTT	2	6	30540	30545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484372
560	NC_007520	CAT	2	6	30692	30697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484372
561	NC_007520	C	6	6	30715	30720	0 %	0 %	0 %	100 %	78484372
562	NC_007520	CA	3	6	30894	30899	50 %	0 %	0 %	50 %	78484372
563	NC_007520	AAG	2	6	30902	30907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484372
564	NC_007520	CCG	2	6	30916	30921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484372
565	NC_007520	CCG	2	6	30979	30984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484372
566	NC_007520	CTT	2	6	31010	31015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484372
567	NC_007520	ACT	2	6	31217	31222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484373
568	NC_007520	CATC	2	8	31244	31251	25 %	25 %	0 %	50 %	78484373
569	NC_007520	TTC	2	6	31254	31259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484373
570	NC_007520	GGC	2	6	31308	31313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484373
571	NC_007520	TCA	2	6	31360	31365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484373
572	NC_007520	GC	3	6	31390	31395	0 %	0 %	50 %	50 %	78484373
573	NC_007520	TGT	2	6	31442	31447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484373
574	NC_007520	CTT	2	6	31463	31468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484373
575	NC_007520	GGC	2	6	31533	31538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484373
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577	NC_007520	CCA	2	6	31739	31744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484373
578	NC_007520	CTT	2	6	31799	31804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484373
579	NC_007520	GCG	2	6	31834	31839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484373
580	NC_007520	TTC	2	6	31863	31868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484373
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582	NC_007520	TTCA	2	8	31917	31924	25 %	50 %	0 %	25 %	78484373
583	NC_007520	TGGT	2	8	31948	31955	0 %	50 %	50 %	0 %	78484373
584	NC_007520	TTA	2	6	32002	32007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484373
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590	NC_007520	T	6	6	32386	32391	0 %	100 %	0 %	0 %	78484373
591	NC_007520	TAA	2	6	32424	32429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484373
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595	NC_007520	TTCT	2	8	32636	32643	0 %	75 %	0 %	25 %	78484373
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598	NC_007520	GTT	2	6	32728	32733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484373
599	NC_007520	GAT	2	6	32756	32761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484373
600	NC_007520	TTA	2	6	32779	32784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484373
601	NC_007520	AGA	2	6	32961	32966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484373
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608	NC_007520	ATTT	2	8	33218	33225	25 %	75 %	0 %	0 %	78484373
609	NC_007520	AACT	2	8	33312	33319	50 %	25 %	0 %	25 %	78484373
610	NC_007520	TTA	2	6	33337	33342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484373
611	NC_007520	GCC	2	6	33454	33459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484373
612	NC_007520	TAT	2	6	33476	33481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484373
613	NC_007520	ACA	2	6	33607	33612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484373
614	NC_007520	ATTTA	2	10	33636	33645	40 %	60 %	0 %	0 %	78484373
615	NC_007520	T	7	7	33710	33716	0 %	100 %	0 %	0 %	78484373
616	NC_007520	T	6	6	33720	33725	0 %	100 %	0 %	0 %	78484373
617	NC_007520	TCT	2	6	33763	33768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484373
618	NC_007520	TGAT	2	8	33785	33792	25 %	50 %	25 %	0 %	78484373
619	NC_007520	TCT	3	9	33866	33874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484373
620	NC_007520	TCA	2	6	33916	33921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484373
621	NC_007520	T	7	7	33925	33931	0 %	100 %	0 %	0 %	78484373
622	NC_007520	AC	3	6	33962	33967	50 %	0 %	0 %	50 %	78484373
623	NC_007520	T	6	6	33975	33980	0 %	100 %	0 %	0 %	78484373
624	NC_007520	AATT	2	8	34034	34041	50 %	50 %	0 %	0 %	78484373
625	NC_007520	TAT	2	6	34085	34090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484373
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627	NC_007520	CTT	2	6	34491	34496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484374
628	NC_007520	T	6	6	34559	34564	0 %	100 %	0 %	0 %	78484374
629	NC_007520	GCTT	2	8	34571	34578	0 %	50 %	25 %	25 %	78484374
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