MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006462	CA	3	6	4342	4347	50 %	0 %	0 %	50 %	55978194
2	NC_006462	GC	3	6	8073	8078	0 %	0 %	50 %	50 %	55978198
3	NC_006462	GC	3	6	12433	12438	0 %	0 %	50 %	50 %	55978205
4	NC_006462	GA	3	6	13132	13137	50 %	0 %	50 %	0 %	55978205
5	NC_006462	GC	3	6	15515	15520	0 %	0 %	50 %	50 %	55978208
6	NC_006462	TC	3	6	17749	17754	0 %	50 %	0 %	50 %	55978211
7	NC_006462	GC	3	6	19498	19503	0 %	0 %	50 %	50 %	55978212
8	NC_006462	GC	3	6	25469	25474	0 %	0 %	50 %	50 %	55978217
9	NC_006462	CG	3	6	28187	28192	0 %	0 %	50 %	50 %	55978219
10	NC_006462	GC	3	6	33610	33615	0 %	0 %	50 %	50 %	55978224
11	NC_006462	GC	3	6	34934	34939	0 %	0 %	50 %	50 %	55978225
12	NC_006462	GA	3	6	35470	35475	50 %	0 %	50 %	0 %	55978225
13	NC_006462	TC	3	6	54934	54939	0 %	50 %	0 %	50 %	55978248
14	NC_006462	GC	3	6	55202	55207	0 %	0 %	50 %	50 %	55978248
15	NC_006462	GC	3	6	60642	60647	0 %	0 %	50 %	50 %	55978251
16	NC_006462	AG	3	6	65803	65808	50 %	0 %	50 %	0 %	55978257
17	NC_006462	CG	3	6	72510	72515	0 %	0 %	50 %	50 %	55978264
18	NC_006462	CG	3	6	72735	72740	0 %	0 %	50 %	50 %	55978264
19	NC_006462	GC	3	6	76426	76431	0 %	0 %	50 %	50 %	55978268
20	NC_006462	CG	3	6	78598	78603	0 %	0 %	50 %	50 %	55978270
21	NC_006462	GC	3	6	80618	80623	0 %	0 %	50 %	50 %	55978273
22	NC_006462	TC	3	6	84345	84350	0 %	50 %	0 %	50 %	55978276
23	NC_006462	GA	3	6	87570	87575	50 %	0 %	50 %	0 %	55978281
24	NC_006462	GC	3	6	92723	92728	0 %	0 %	50 %	50 %	55978286
25	NC_006462	CG	3	6	93236	93241	0 %	0 %	50 %	50 %	55978286
26	NC_006462	CT	3	6	96267	96272	0 %	50 %	0 %	50 %	55978291
27	NC_006462	CT	3	6	96523	96528	0 %	50 %	0 %	50 %	55978292
28	NC_006462	GC	3	6	100852	100857	0 %	0 %	50 %	50 %	55978296
29	NC_006462	CG	3	6	104061	104066	0 %	0 %	50 %	50 %	55978299
30	NC_006462	GC	3	6	104318	104323	0 %	0 %	50 %	50 %	55978299
31	NC_006462	AG	3	6	112854	112859	50 %	0 %	50 %	0 %	55978308
32	NC_006462	GC	3	6	113073	113078	0 %	0 %	50 %	50 %	55978308
33	NC_006462	CT	3	6	114835	114840	0 %	50 %	0 %	50 %	55978309
34	NC_006462	TC	3	6	125796	125801	0 %	50 %	0 %	50 %	55978322
35	NC_006462	GC	3	6	127734	127739	0 %	0 %	50 %	50 %	55978324
36	NC_006462	AG	3	6	140157	140162	50 %	0 %	50 %	0 %	55978333
37	NC_006462	GC	3	6	150332	150337	0 %	0 %	50 %	50 %	55978341
38	NC_006462	GC	3	6	154509	154514	0 %	0 %	50 %	50 %	55978345
39	NC_006462	GA	3	6	155052	155057	50 %	0 %	50 %	0 %	55978345
40	NC_006462	GA	3	6	155149	155154	50 %	0 %	50 %	0 %	55978345
41	NC_006462	GC	3	6	158051	158056	0 %	0 %	50 %	50 %	55978349
42	NC_006462	GC	3	6	158962	158967	0 %	0 %	50 %	50 %	55978351
43	NC_006462	CT	3	6	160359	160364	0 %	50 %	0 %	50 %	55978353
44	NC_006462	GC	3	6	162621	162626	0 %	0 %	50 %	50 %	55978355
45	NC_006462	GC	3	6	164364	164369	0 %	0 %	50 %	50 %	55978355
46	NC_006462	CG	3	6	165394	165399	0 %	0 %	50 %	50 %	55978355
47	NC_006462	GC	3	6	165615	165620	0 %	0 %	50 %	50 %	55978355
48	NC_006462	CG	3	6	168891	168896	0 %	0 %	50 %	50 %	55978358
49	NC_006462	CT	3	6	172331	172336	0 %	50 %	0 %	50 %	55978361
50	NC_006462	GC	3	6	172630	172635	0 %	0 %	50 %	50 %	55978361
51	NC_006462	CG	3	6	173784	173789	0 %	0 %	50 %	50 %	55978362
52	NC_006462	CG	3	6	175414	175419	0 %	0 %	50 %	50 %	55978363
53	NC_006462	GC	3	6	185032	185037	0 %	0 %	50 %	50 %	55978366
54	NC_006462	CA	3	6	185600	185605	50 %	0 %	0 %	50 %	55978366
55	NC_006462	GT	3	6	186415	186420	0 %	50 %	50 %	0 %	55978366
56	NC_006462	GA	3	6	188284	188289	50 %	0 %	50 %	0 %	55978367
57	NC_006462	GC	3	6	191498	191503	0 %	0 %	50 %	50 %	55978369
58	NC_006462	GC	3	6	192118	192123	0 %	0 %	50 %	50 %	55978369
59	NC_006462	CT	3	6	194591	194596	0 %	50 %	0 %	50 %	55978370
60	NC_006462	TC	3	6	194706	194711	0 %	50 %	0 %	50 %	55978370
61	NC_006462	GC	3	6	196879	196884	0 %	0 %	50 %	50 %	55978372
62	NC_006462	CT	3	6	197868	197873	0 %	50 %	0 %	50 %	55978373
63	NC_006462	AG	3	6	198339	198344	50 %	0 %	50 %	0 %	55978374
64	NC_006462	AC	3	6	204440	204445	50 %	0 %	0 %	50 %	55978380
65	NC_006462	GC	3	6	207059	207064	0 %	0 %	50 %	50 %	55978381
66	NC_006462	CG	3	6	208774	208779	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
67	NC_006462	CG	5	10	208958	208967	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
68	NC_006462	CG	3	6	209227	209232	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
69	NC_006462	CG	3	6	209381	209386	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
70	NC_006462	GC	3	6	209605	209610	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
71	NC_006462	CG	3	6	209764	209769	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
72	NC_006462	CG	3	6	210075	210080	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
73	NC_006462	GC	3	6	210196	210201	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
74	NC_006462	GA	3	6	213782	213787	50 %	0 %	50 %	0 %	55978388
75	NC_006462	CG	3	6	214211	214216	0 %	0 %	50 %	50 %	55978389
76	NC_006462	CG	3	6	215241	215246	0 %	0 %	50 %	50 %	55978390
77	NC_006462	GC	3	6	215668	215673	0 %	0 %	50 %	50 %	55978391
78	NC_006462	GC	3	6	215914	215919	0 %	0 %	50 %	50 %	55978391
79	NC_006462	CG	3	6	216433	216438	0 %	0 %	50 %	50 %	55978391
80	NC_006462	GC	3	6	218982	218987	0 %	0 %	50 %	50 %	228861784
81	NC_006462	GC	3	6	220129	220134	0 %	0 %	50 %	50 %	55978396
82	NC_006462	GC	3	6	229311	229316	0 %	0 %	50 %	50 %	55978407
83	NC_006462	CT	3	6	230530	230535	0 %	50 %	0 %	50 %	55978409
84	NC_006462	CT	3	6	231501	231506	0 %	50 %	0 %	50 %	55978409
85	NC_006462	CT	3	6	231878	231883	0 %	50 %	0 %	50 %	55978410
86	NC_006462	GC	3	6	233265	233270	0 %	0 %	50 %	50 %	55978410
87	NC_006462	GC	3	6	233876	233881	0 %	0 %	50 %	50 %	55978410
88	NC_006462	GC	3	6	236640	236645	0 %	0 %	50 %	50 %	55978413
89	NC_006462	CA	3	6	241477	241482	50 %	0 %	0 %	50 %	55978417
90	NC_006462	GA	3	6	243212	243217	50 %	0 %	50 %	0 %	55978419
91	NC_006462	CG	3	6	247833	247838	0 %	0 %	50 %	50 %	55978424
92	NC_006462	CG	3	6	248438	248443	0 %	0 %	50 %	50 %	55978424
93	NC_006462	CG	3	6	251547	251552	0 %	0 %	50 %	50 %	55978429

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.