MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 4334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006462	GGC	2	6	18	23	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978184
2	NC_006462	CAC	2	6	62	67	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978184
3	NC_006462	GCC	2	6	146	151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978184
4	NC_006462	CGC	2	6	193	198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978184
5	NC_006462	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978184
6	NC_006462	ACC	2	6	534	539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978185
7	NC_006462	AGG	2	6	540	545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978185
8	NC_006462	CCT	2	6	595	600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978185
9	NC_006462	AAC	2	6	726	731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978185
10	NC_006462	GTT	2	6	1087	1092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55978186
11	NC_006462	GCC	4	12	1219	1230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978186
12	NC_006462	CCT	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978187
13	NC_006462	CTC	2	6	1380	1385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978187
14	NC_006462	GCC	2	6	1400	1405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978187
15	NC_006462	CGC	2	6	1429	1434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978187
16	NC_006462	CCA	2	6	1484	1489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978187
17	NC_006462	CCT	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978187
18	NC_006462	TCC	2	6	1517	1522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978187
19	NC_006462	CAC	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978187
20	NC_006462	CAC	2	6	1695	1700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978187
21	NC_006462	TCC	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978188
22	NC_006462	CCA	2	6	1957	1962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978188
23	NC_006462	TCC	2	6	2049	2054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978188
24	NC_006462	GGC	2	6	2060	2065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978188
25	NC_006462	GGA	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978188
26	NC_006462	GTG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978188
27	NC_006462	GCC	2	6	2217	2222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978188
28	NC_006462	CAT	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978188
29	NC_006462	TCT	2	6	2251	2256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978188
30	NC_006462	AGG	2	6	2286	2291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978188
31	NC_006462	TCC	2	6	2298	2303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978188
32	NC_006462	GCC	2	6	2331	2336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978188
33	NC_006462	TCC	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978189
34	NC_006462	GAG	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978189
35	NC_006462	CCT	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978189
36	NC_006462	GCC	2	6	2467	2472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978189
37	NC_006462	AGG	2	6	2475	2480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978189
38	NC_006462	CCT	2	6	2605	2610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978189
39	NC_006462	TCC	2	6	2637	2642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978189
40	NC_006462	TGA	2	6	2728	2733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978190
41	NC_006462	GCC	2	6	2802	2807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978190
42	NC_006462	CTC	2	6	2813	2818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978190
43	NC_006462	CCT	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978190
44	NC_006462	CTC	2	6	3382	3387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978191
45	NC_006462	GCC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978191
46	NC_006462	GAG	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978191
47	NC_006462	CTC	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978191
48	NC_006462	GGA	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978192
49	NC_006462	GGT	2	6	3788	3793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978192
50	NC_006462	GCG	2	6	3923	3928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978192
51	NC_006462	CAC	2	6	4137	4142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978193
52	NC_006462	CCT	2	6	4145	4150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978193
53	NC_006462	GCC	2	6	4175	4180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978193
54	NC_006462	CGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978193
55	NC_006462	CCA	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978194
56	NC_006462	TCC	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978194
57	NC_006462	GGC	2	6	4476	4481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978194
58	NC_006462	AAG	2	6	4552	4557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978194
59	NC_006462	GTG	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978194
60	NC_006462	TGT	2	6	5051	5056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55978195
61	NC_006462	CTC	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978195
62	NC_006462	TGG	2	6	5088	5093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978195
63	NC_006462	GAA	2	6	5142	5147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978195
64	NC_006462	GAA	2	6	5205	5210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978195
65	NC_006462	GAG	2	6	5272	5277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978195
66	NC_006462	GAG	2	6	5299	5304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978195
67	NC_006462	CTC	2	6	5368	5373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978195
68	NC_006462	TCC	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978195
69	NC_006462	GCG	2	6	5521	5526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978195
70	NC_006462	GCC	2	6	5637	5642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978195
71	NC_006462	AGT	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978195
72	NC_006462	AGG	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978195
73	NC_006462	GCC	2	6	5685	5690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978195
74	NC_006462	GCC	2	6	5803	5808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978196
75	NC_006462	GCG	2	6	5831	5836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978196
76	NC_006462	TCC	3	9	5872	5880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978196
77	NC_006462	CCG	2	6	5907	5912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978196
78	NC_006462	CCA	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978196
79	NC_006462	GAA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978196
80	NC_006462	CGG	2	6	6140	6145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978197
81	NC_006462	CCA	2	6	6193	6198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
82	NC_006462	CTC	3	9	6205	6213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
83	NC_006462	TCC	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
84	NC_006462	TCC	2	6	6335	6340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
85	NC_006462	CCA	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
86	NC_006462	CCA	2	6	6399	6404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
87	NC_006462	ACC	2	6	6434	6439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
88	NC_006462	GGT	2	6	6462	6467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978197
89	NC_006462	CCT	2	6	6537	6542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
90	NC_006462	AGG	2	6	6558	6563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978197
91	NC_006462	CTC	2	6	6625	6630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
92	NC_006462	CAC	2	6	6682	6687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
93	NC_006462	GGC	2	6	6714	6719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978197
94	NC_006462	GGA	2	6	6804	6809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978197
95	NC_006462	CTC	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
96	NC_006462	CGG	2	6	6866	6871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978197
97	NC_006462	CCT	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
98	NC_006462	CCA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
99	NC_006462	GGC	2	6	6991	6996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978197
100	NC_006462	AGA	2	6	7109	7114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978198
101	NC_006462	GGC	2	6	7257	7262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978198
102	NC_006462	CCT	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978198
103	NC_006462	TGG	2	6	7565	7570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978198
104	NC_006462	CCA	2	6	7610	7615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978198
105	NC_006462	GCC	2	6	7663	7668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978198
106	NC_006462	GGT	2	6	7680	7685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978198
107	NC_006462	CCG	2	6	7725	7730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978198
108	NC_006462	GGT	2	6	7734	7739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978198
109	NC_006462	GAG	2	6	7743	7748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978198
110	NC_006462	CGG	2	6	7808	7813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978198
111	NC_006462	CGC	2	6	7831	7836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978198
112	NC_006462	GCG	3	9	7891	7899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978198
113	NC_006462	CCT	2	6	7934	7939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978198
114	NC_006462	GCC	2	6	7958	7963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978198
115	NC_006462	CCG	2	6	8200	8205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978199
116	NC_006462	GGA	2	6	8213	8218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978199
117	NC_006462	GGC	2	6	8294	8299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978199
118	NC_006462	GGA	2	6	8339	8344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978199
119	NC_006462	GAA	2	6	8367	8372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978199
120	NC_006462	CCT	2	6	8449	8454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978199
121	NC_006462	GCC	2	6	8566	8571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978199
122	NC_006462	CCA	2	6	8594	8599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978199
123	NC_006462	CGG	2	6	8669	8674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978199
124	NC_006462	CTC	2	6	8706	8711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978199
125	NC_006462	CCT	2	6	8714	8719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978199
126	NC_006462	CCA	2	6	8825	8830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978199
127	NC_006462	CCT	2	6	8849	8854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978199
128	NC_006462	GGC	2	6	8865	8870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978199
129	NC_006462	GGC	2	6	8907	8912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978199
130	NC_006462	GTA	2	6	8957	8962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978200
131	NC_006462	TCC	2	6	9024	9029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
132	NC_006462	AGG	2	6	9078	9083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978200
133	NC_006462	CTC	2	6	9095	9100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
134	NC_006462	CAC	3	9	9125	9133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978200
135	NC_006462	CCA	2	6	9172	9177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978200
136	NC_006462	CCG	2	6	9178	9183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978200
137	NC_006462	CCT	2	6	9184	9189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
138	NC_006462	CTC	2	6	9296	9301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
139	NC_006462	GAA	2	6	9329	9334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978200
140	NC_006462	CCT	2	6	9364	9369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
141	NC_006462	GTA	2	6	9377	9382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978200
142	NC_006462	CTC	2	6	9455	9460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
143	NC_006462	GTG	2	6	9510	9515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978200
144	NC_006462	GGC	2	6	9530	9535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978200
145	NC_006462	CCT	2	6	9562	9567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
146	NC_006462	CCT	2	6	9577	9582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
147	NC_006462	TGC	2	6	9630	9635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978200
148	NC_006462	CCA	2	6	9664	9669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978200
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150	NC_006462	GGT	2	6	9764	9769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978200
151	NC_006462	ACC	2	6	9801	9806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978200
152	NC_006462	GCC	3	9	9825	9833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978200
153	NC_006462	TCC	2	6	9864	9869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
154	NC_006462	AGG	2	6	9977	9982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978201
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156	NC_006462	GGA	2	6	9999	10004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978201
157	NC_006462	ACC	2	6	10022	10027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978201
158	NC_006462	GAG	2	6	10039	10044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978201
159	NC_006462	CGG	2	6	10086	10091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978201
160	NC_006462	CAC	2	6	10093	10098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978201
161	NC_006462	GCC	2	6	10148	10153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978201
162	NC_006462	GGA	2	6	10185	10190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978201
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164	NC_006462	AGG	2	6	10208	10213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978201
165	NC_006462	CCT	2	6	10230	10235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978201
166	NC_006462	CCT	2	6	10280	10285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978202
167	NC_006462	CAC	2	6	10329	10334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978202
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170	NC_006462	CGG	2	6	10771	10776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978203
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249	NC_006462	CAC	3	9	15295	15303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978207
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251	NC_006462	CAA	2	6	15328	15333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978207
252	NC_006462	ATC	2	6	15353	15358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978207
253	NC_006462	CTT	3	9	15629	15637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978208
254	NC_006462	CGG	2	6	15668	15673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978208
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257	NC_006462	GCG	2	6	15821	15826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978208
258	NC_006462	GAA	2	6	15858	15863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978208
259	NC_006462	CTG	2	6	15891	15896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978208
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261	NC_006462	GTG	2	6	16054	16059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978208
262	NC_006462	GCA	2	6	16109	16114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978208
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265	NC_006462	CGG	2	6	16429	16434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978209
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394	NC_006462	CCT	2	6	23915	23920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978216
395	NC_006462	CGC	2	6	23967	23972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978216
396	NC_006462	TCC	2	6	23977	23982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978216
397	NC_006462	ACC	2	6	24066	24071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978216
398	NC_006462	CCT	2	6	24080	24085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978216
399	NC_006462	GGC	2	6	24182	24187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978216
400	NC_006462	CTT	2	6	24197	24202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978216
401	NC_006462	CGC	2	6	24212	24217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978216
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429	NC_006462	CCT	2	6	25372	25377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978217
430	NC_006462	GGC	2	6	25416	25421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978217
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474	NC_006462	TCC	2	6	27940	27945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978219
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479	NC_006462	CTC	2	6	28065	28070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978219
480	NC_006462	GGC	2	6	28121	28126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978219
481	NC_006462	CCT	2	6	28166	28171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978219
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497	NC_006462	GTT	2	6	29019	29024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55978220
498	NC_006462	CCT	2	6	29033	29038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978220
499	NC_006462	CCT	2	6	29069	29074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978220
500	NC_006462	AGG	3	9	29089	29097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978220

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