MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006462	AGG	2	6	162919	162924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4002	NC_006462	C	6	6	162959	162964	0 %	0 %	0 %	100 %	55978355
4003	NC_006462	GGGC	2	8	162973	162980	0 %	0 %	75 %	25 %	55978355
4004	NC_006462	GGGCCA	2	12	163016	163027	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55978355
4005	NC_006462	CGGTG	2	10	163055	163064	0 %	20 %	60 %	20 %	55978355
4006	NC_006462	TGA	2	6	163070	163075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978355
4007	NC_006462	CCT	2	6	163130	163135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4008	NC_006462	GAG	2	6	163149	163154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4009	NC_006462	G	6	6	163170	163175	0 %	0 %	100 %	0 %	55978355
4010	NC_006462	GCTCCC	2	12	163187	163198	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55978355
4011	NC_006462	CCT	2	6	163199	163204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4012	NC_006462	AGG	3	9	163216	163224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4013	NC_006462	CTCCCG	2	12	163305	163316	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55978355
4014	NC_006462	CGG	2	6	163355	163360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978355
4015	NC_006462	AAG	2	6	163377	163382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978355
4016	NC_006462	TCC	2	6	163393	163398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4017	NC_006462	CCA	2	6	163451	163456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978355
4018	NC_006462	TCC	2	6	163459	163464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4019	NC_006462	G	6	6	163505	163510	0 %	0 %	100 %	0 %	55978355
4020	NC_006462	CCT	2	6	163538	163543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4021	NC_006462	GAG	2	6	163563	163568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4022	NC_006462	TCT	2	6	163583	163588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978355
4023	NC_006462	GAG	2	6	163614	163619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4024	NC_006462	CTC	2	6	163645	163650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4025	NC_006462	CGGTCG	2	12	163666	163677	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55978355
4026	NC_006462	GGT	2	6	163745	163750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978355
4027	NC_006462	GCCC	2	8	163790	163797	0 %	0 %	25 %	75 %	55978355
4028	NC_006462	ACC	2	6	163837	163842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978355
4029	NC_006462	CTC	2	6	163851	163856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4030	NC_006462	GCG	2	6	163893	163898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978355
4031	NC_006462	GCCG	2	8	163904	163911	0 %	0 %	50 %	50 %	55978355
4032	NC_006462	TTG	2	6	163936	163941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55978355
4033	NC_006462	CCA	4	12	163949	163960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978355
4034	NC_006462	GCC	2	6	163980	163985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978355
4035	NC_006462	C	6	6	163991	163996	0 %	0 %	0 %	100 %	55978355
4036	NC_006462	CCGGTC	2	12	164004	164015	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55978355
4037	NC_006462	GAG	2	6	164031	164036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4038	NC_006462	CGGGG	2	10	164060	164069	0 %	0 %	80 %	20 %	55978355
4039	NC_006462	AGG	2	6	164080	164085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4040	NC_006462	AGCCG	2	10	164087	164096	20 %	0 %	40 %	40 %	55978355
4041	NC_006462	GAG	3	9	164133	164141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4042	NC_006462	CCG	2	6	164162	164167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978355
4043	NC_006462	GGC	2	6	164174	164179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978355
4044	NC_006462	AGG	2	6	164314	164319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4045	NC_006462	G	6	6	164330	164335	0 %	0 %	100 %	0 %	55978355
4046	NC_006462	CCT	2	6	164339	164344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4047	NC_006462	GC	3	6	164364	164369	0 %	0 %	50 %	50 %	55978355
4048	NC_006462	TCC	2	6	164401	164406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4049	NC_006462	AGG	2	6	164407	164412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4050	NC_006462	TCC	2	6	164458	164463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4051	NC_006462	AGG	2	6	164555	164560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4052	NC_006462	GGT	2	6	164573	164578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978355
4053	NC_006462	CCG	2	6	164589	164594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978355
4054	NC_006462	GGA	2	6	164651	164656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4055	NC_006462	CCT	2	6	164678	164683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4056	NC_006462	GGA	2	6	164699	164704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4057	NC_006462	C	6	6	164712	164717	0 %	0 %	0 %	100 %	55978355
4058	NC_006462	GCC	2	6	164726	164731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978355
4059	NC_006462	C	6	6	164744	164749	0 %	0 %	0 %	100 %	55978355
4060	NC_006462	CCT	2	6	164762	164767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4061	NC_006462	CCT	2	6	164783	164788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4062	NC_006462	TCC	2	6	164924	164929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4063	NC_006462	CCT	2	6	164954	164959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4064	NC_006462	TTC	2	6	164965	164970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978355
4065	NC_006462	AGG	2	6	165064	165069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4066	NC_006462	CGT	2	6	165077	165082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978355
4067	NC_006462	GAG	2	6	165174	165179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4068	NC_006462	CCT	2	6	165182	165187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355
4069	NC_006462	CCG	2	6	165245	165250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978355
4070	NC_006462	GAG	2	6	165261	165266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4071	NC_006462	CCG	2	6	165291	165296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978355
4072	NC_006462	CCCT	2	8	165298	165305	0 %	25 %	0 %	75 %	55978355
4073	NC_006462	GAG	2	6	165324	165329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4074	NC_006462	GGT	2	6	165336	165341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978355
4075	NC_006462	CAC	2	6	165387	165392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978355
4076	NC_006462	CG	3	6	165394	165399	0 %	0 %	50 %	50 %	55978355
4077	NC_006462	GGGCG	2	10	165423	165432	0 %	0 %	80 %	20 %	55978355
4078	NC_006462	GAA	2	6	165447	165452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978355
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4080	NC_006462	G	7	7	165512	165518	0 %	0 %	100 %	0 %	55978355
4081	NC_006462	CGC	2	6	165558	165563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978355
4082	NC_006462	CGC	3	9	165584	165592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978355
4083	NC_006462	GC	3	6	165615	165620	0 %	0 %	50 %	50 %	55978355
4084	NC_006462	CCG	2	6	166099	166104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978356
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4086	NC_006462	C	6	6	166184	166189	0 %	0 %	0 %	100 %	55978356
4087	NC_006462	GCCT	2	8	166241	166248	0 %	25 %	25 %	50 %	55978356
4088	NC_006462	GAG	2	6	166255	166260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978356
4089	NC_006462	CCT	2	6	166284	166289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978356
4090	NC_006462	GGC	2	6	166420	166425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978356
4091	NC_006462	TGA	2	6	166428	166433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978356
4092	NC_006462	GAG	2	6	166462	166467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978356
4093	NC_006462	TCC	2	6	166523	166528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978356
4094	NC_006462	C	6	6	166565	166570	0 %	0 %	0 %	100 %	55978356
4095	NC_006462	CTC	2	6	166582	166587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978356
4096	NC_006462	GGC	2	6	166609	166614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978356
4097	NC_006462	CCG	2	6	166618	166623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978356
4098	NC_006462	C	6	6	166702	166707	0 %	0 %	0 %	100 %	55978357
4099	NC_006462	GCCCC	2	10	166746	166755	0 %	0 %	20 %	80 %	55978357
4100	NC_006462	CGCT	2	8	166766	166773	0 %	25 %	25 %	50 %	55978357
4101	NC_006462	GGA	2	6	166778	166783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978357
4102	NC_006462	GGCCC	2	10	166808	166817	0 %	0 %	40 %	60 %	55978357
4103	NC_006462	GTC	2	6	166818	166823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978357
4104	NC_006462	TCC	3	9	166846	166854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978357
4105	NC_006462	GCC	2	6	166882	166887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978357
4106	NC_006462	CAG	2	6	166902	166907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978357
4107	NC_006462	GCGG	2	8	166950	166957	0 %	0 %	75 %	25 %	55978357
4108	NC_006462	CCA	2	6	167030	167035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978357
4109	NC_006462	CGG	2	6	167078	167083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978357
4110	NC_006462	CCG	2	6	167140	167145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978357
4111	NC_006462	GGA	2	6	167153	167158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978357
4112	NC_006462	TGGGCC	2	12	167173	167184	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55978357
4113	NC_006462	CTC	2	6	167220	167225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978357
4114	NC_006462	CCG	2	6	167268	167273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978357
4115	NC_006462	CCCGG	2	10	167297	167306	0 %	0 %	40 %	60 %	55978357
4116	NC_006462	GGGCAG	2	12	167316	167327	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55978357
4117	NC_006462	CTC	2	6	167340	167345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978357
4118	NC_006462	GCC	2	6	167992	167997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978358
4119	NC_006462	GAAGC	2	10	168051	168060	40 %	0 %	40 %	20 %	55978358
4120	NC_006462	CTCC	2	8	168125	168132	0 %	25 %	0 %	75 %	55978358
4121	NC_006462	GGA	2	6	168179	168184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978358
4122	NC_006462	GGCCCG	2	12	168222	168233	0 %	0 %	50 %	50 %	55978358
4123	NC_006462	CAC	2	6	168282	168287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978358
4124	NC_006462	CCA	2	6	168296	168301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978358
4125	NC_006462	CTC	2	6	168357	168362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978358
4126	NC_006462	AGG	2	6	168397	168402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978358
4127	NC_006462	ATGGCC	2	12	168418	168429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55978358
4128	NC_006462	GGC	2	6	168456	168461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978358
4129	NC_006462	GCT	3	9	168596	168604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978358
4130	NC_006462	C	6	6	168606	168611	0 %	0 %	0 %	100 %	55978358
4131	NC_006462	GCG	2	6	168630	168635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978358
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4133	NC_006462	A	6	6	168831	168836	100 %	0 %	0 %	0 %	55978358
4134	NC_006462	GAG	2	6	168849	168854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978358
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4137	NC_006462	CG	3	6	168891	168896	0 %	0 %	50 %	50 %	55978358
4138	NC_006462	GAG	2	6	168897	168902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978358
4139	NC_006462	GGT	2	6	168903	168908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978358
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4142	NC_006462	CCG	2	6	169031	169036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978358
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4150	NC_006462	TCC	2	6	169393	169398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978359
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4231	NC_006462	CCT	2	6	172943	172948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978361
4232	NC_006462	G	6	6	173016	173021	0 %	0 %	100 %	0 %	55978361
4233	NC_006462	CCG	2	6	173075	173080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978361
4234	NC_006462	CTCG	2	8	173100	173107	0 %	25 %	25 %	50 %	55978361
4235	NC_006462	G	7	7	173223	173229	0 %	0 %	100 %	0 %	55978362
4236	NC_006462	GAG	2	6	173281	173286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978362
4237	NC_006462	CCGAG	2	10	173289	173298	20 %	0 %	40 %	40 %	55978362
4238	NC_006462	GGT	2	6	173460	173465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978362
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4240	NC_006462	TGG	2	6	173534	173539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978362
4241	NC_006462	CATCCC	2	12	173583	173594	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55978362
4242	NC_006462	CTA	2	6	173604	173609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978362
4243	NC_006462	GGGA	2	8	173640	173647	25 %	0 %	75 %	0 %	55978362
4244	NC_006462	GCC	2	6	173655	173660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978362
4245	NC_006462	G	6	6	173677	173682	0 %	0 %	100 %	0 %	55978362
4246	NC_006462	AAG	2	6	173707	173712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978362
4247	NC_006462	GTG	2	6	173722	173727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978362
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4249	NC_006462	AGG	2	6	173750	173755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978362
4250	NC_006462	GAG	2	6	173770	173775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978362
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4252	NC_006462	TCT	2	6	173893	173898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978363
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4372	NC_006462	GGT	2	6	178867	178872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978364
4373	NC_006462	GGGTGC	2	12	179028	179039	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55978364
4374	NC_006462	ACC	2	6	179105	179110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978364
4375	NC_006462	CCT	2	6	179143	179148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978364
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4386	NC_006462	TCC	2	6	179762	179767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978365
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4393	NC_006462	C	6	6	180159	180164	0 %	0 %	0 %	100 %	55978365
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4402	NC_006462	GGTGGC	2	12	180417	180428	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55978365
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4492	NC_006462	GGGGA	2	10	184030	184039	20 %	0 %	80 %	0 %	55978365
4493	NC_006462	C	6	6	184064	184069	0 %	0 %	0 %	100 %	55978365
4494	NC_006462	G	6	6	184129	184134	0 %	0 %	100 %	0 %	55978365
4495	NC_006462	TGG	2	6	184184	184189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978365
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4497	NC_006462	CGG	2	6	184244	184249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978365
4498	NC_006462	CTCC	2	8	184293	184300	0 %	25 %	0 %	75 %	55978365
4499	NC_006462	CTCC	2	8	184356	184363	0 %	25 %	0 %	75 %	55978365
4500	NC_006462	ACC	2	6	184370	184375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978365

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