MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006462	C	6	6	140233	140238	0 %	0 %	0 %	100 %	55978333
3502	NC_006462	GGA	2	6	140247	140252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978333
3503	NC_006462	ACC	2	6	140254	140259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978333
3504	NC_006462	G	6	6	140324	140329	0 %	0 %	100 %	0 %	55978333
3505	NC_006462	AGG	2	6	140330	140335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978333
3506	NC_006462	CTC	2	6	140338	140343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978333
3507	NC_006462	AGGCC	2	10	140366	140375	20 %	0 %	40 %	40 %	55978333
3508	NC_006462	CCG	2	6	140394	140399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978333
3509	NC_006462	GGGTGG	2	12	140405	140416	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	55978333
3510	NC_006462	GCCC	2	8	140434	140441	0 %	0 %	25 %	75 %	55978333
3511	NC_006462	G	6	6	140566	140571	0 %	0 %	100 %	0 %	55978333
3512	NC_006462	CTA	2	6	140691	140696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978333
3513	NC_006462	G	7	7	140725	140731	0 %	0 %	100 %	0 %	55978333
3514	NC_006462	GGCCC	2	10	140742	140751	0 %	0 %	40 %	60 %	55978333
3515	NC_006462	CCTA	2	8	140762	140769	25 %	25 %	0 %	50 %	55978333
3516	NC_006462	AGG	2	6	140777	140782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978333
3517	NC_006462	CCCA	2	8	140800	140807	25 %	0 %	0 %	75 %	55978333
3518	NC_006462	CTG	2	6	140812	140817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978333
3519	NC_006462	GAG	2	6	140909	140914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978334
3520	NC_006462	CTGGAG	2	12	140922	140933	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55978334
3521	NC_006462	CGCCTA	2	12	140975	140986	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55978334
3522	NC_006462	CCT	2	6	141017	141022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978334
3523	NC_006462	CTC	3	9	141036	141044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978334
3524	NC_006462	GCC	2	6	141064	141069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978334
3525	NC_006462	GGC	2	6	141101	141106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978334
3526	NC_006462	AGG	2	6	141109	141114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978334
3527	NC_006462	GAA	2	6	141132	141137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978334
3528	NC_006462	TCC	2	6	141160	141165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978334
3529	NC_006462	GGA	2	6	141215	141220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978334
3530	NC_006462	CCT	2	6	141224	141229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978334
3531	NC_006462	C	6	6	141253	141258	0 %	0 %	0 %	100 %	55978334
3532	NC_006462	GAGG	2	8	141329	141336	25 %	0 %	75 %	0 %	55978334
3533	NC_006462	AGG	2	6	141361	141366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978334
3534	NC_006462	GGC	2	6	141373	141378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978334
3535	NC_006462	CTT	2	6	141572	141577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978334
3536	NC_006462	G	6	6	141715	141720	0 %	0 %	100 %	0 %	55978334
3537	NC_006462	GGA	2	6	141740	141745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978334
3538	NC_006462	ACT	2	6	141766	141771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978334
3539	NC_006462	GAG	2	6	141792	141797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978334
3540	NC_006462	GAG	2	6	141807	141812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978334
3541	NC_006462	CTC	2	6	141930	141935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978334
3542	NC_006462	ACC	2	6	141946	141951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978334
3543	NC_006462	TGG	2	6	142027	142032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978334
3544	NC_006462	AGG	2	6	142051	142056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978334
3545	NC_006462	GGA	2	6	142065	142070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978335
3546	NC_006462	GCGG	2	8	142107	142114	0 %	0 %	75 %	25 %	55978335
3547	NC_006462	G	6	6	142113	142118	0 %	0 %	100 %	0 %	55978335
3548	NC_006462	CTC	2	6	142159	142164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978335
3549	NC_006462	TCC	2	6	142322	142327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978335
3550	NC_006462	GCC	2	6	142492	142497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978335
3551	NC_006462	CTT	3	9	142503	142511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978335
3552	NC_006462	GGT	2	6	142536	142541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978335
3553	NC_006462	CCG	2	6	142575	142580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978335
3554	NC_006462	CGGG	2	8	142585	142592	0 %	0 %	75 %	25 %	55978335
3555	NC_006462	TCC	2	6	142610	142615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978335
3556	NC_006462	GGC	3	9	142692	142700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978335
3557	NC_006462	TGG	2	6	142715	142720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978335
3558	NC_006462	GGA	2	6	142721	142726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978335
3559	NC_006462	CTC	2	6	142756	142761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978335
3560	NC_006462	GGA	2	6	142817	142822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978335
3561	NC_006462	GGAG	2	8	142877	142884	25 %	0 %	75 %	0 %	55978335
3562	NC_006462	CTC	2	6	142906	142911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978335
3563	NC_006462	AGG	2	6	142955	142960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978335
3564	NC_006462	AGG	2	6	143000	143005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978335
3565	NC_006462	GCC	2	6	143017	143022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978335
3566	NC_006462	CTC	2	6	143059	143064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978335
3567	NC_006462	GGA	2	6	143121	143126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978335
3568	NC_006462	CTT	2	6	143158	143163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978335
3569	NC_006462	GAG	2	6	143176	143181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978335
3570	NC_006462	CCT	2	6	143214	143219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978335
3571	NC_006462	TCC	2	6	143225	143230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978335
3572	NC_006462	GCC	2	6	143255	143260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978335
3573	NC_006462	GGA	2	6	143303	143308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978335
3574	NC_006462	CTC	2	6	143317	143322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978335
3575	NC_006462	CGCC	2	8	143367	143374	0 %	0 %	25 %	75 %	55978335
3576	NC_006462	CCT	2	6	143385	143390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978335
3577	NC_006462	GCC	2	6	143457	143462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978335
3578	NC_006462	CGAGCC	2	12	143563	143574	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55978336
3579	NC_006462	GCG	2	6	143594	143599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978336
3580	NC_006462	CTC	2	6	143657	143662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978336
3581	NC_006462	GGCCAG	2	12	143663	143674	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55978336
3582	NC_006462	CCT	3	9	143685	143693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978336
3583	NC_006462	GAG	2	6	143698	143703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978336
3584	NC_006462	GGA	2	6	143718	143723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978336
3585	NC_006462	TCC	2	6	143771	143776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978336
3586	NC_006462	ACG	2	6	143797	143802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978336
3587	NC_006462	AAGTA	2	10	143834	143843	60 %	20 %	20 %	0 %	55978336
3588	NC_006462	TTTTC	2	10	143975	143984	0 %	80 %	0 %	20 %	55978336
3589	NC_006462	GTA	2	6	144884	144889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978337
3590	NC_006462	CAT	2	6	144905	144910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978337
3591	NC_006462	GAG	2	6	144917	144922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978337
3592	NC_006462	CCA	2	6	144937	144942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978337
3593	NC_006462	CTT	2	6	144950	144955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978337
3594	NC_006462	GGT	2	6	144979	144984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978337
3595	NC_006462	CCA	2	6	145018	145023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978337
3596	NC_006462	CGC	2	6	145044	145049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978337
3597	NC_006462	AGG	2	6	145050	145055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978337
3598	NC_006462	T	6	6	145064	145069	0 %	100 %	0 %	0 %	55978337
3599	NC_006462	CTC	2	6	145080	145085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978337
3600	NC_006462	CTC	2	6	145103	145108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978337
3601	NC_006462	AGG	2	6	145132	145137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978337
3602	NC_006462	AGG	2	6	145173	145178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978337
3603	NC_006462	GCC	2	6	145191	145196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978337
3604	NC_006462	CCTCGG	2	12	145231	145242	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55978337
3605	NC_006462	GAG	2	6	145253	145258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978337
3606	NC_006462	GGA	2	6	145318	145323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978337
3607	NC_006462	CCT	2	6	145333	145338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978337
3608	NC_006462	CCG	2	6	145354	145359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978337
3609	NC_006462	CCCG	2	8	145387	145394	0 %	0 %	25 %	75 %	55978337
3610	NC_006462	TCC	2	6	145401	145406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978337
3611	NC_006462	CCA	2	6	145414	145419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978337
3612	NC_006462	GAG	3	9	145499	145507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978337
3613	NC_006462	CGGT	2	8	145518	145525	0 %	25 %	50 %	25 %	55978337
3614	NC_006462	GGC	2	6	145556	145561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978337
3615	NC_006462	GGT	2	6	145564	145569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978337
3616	NC_006462	GAG	2	6	145616	145621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978337
3617	NC_006462	GGT	2	6	145627	145632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978337
3618	NC_006462	TGG	2	6	145639	145644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978337
3619	NC_006462	TGG	2	6	145671	145676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978337
3620	NC_006462	GCG	2	6	145683	145688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978337
3621	NC_006462	AGG	2	6	145689	145694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978337
3622	NC_006462	GGGT	2	8	145732	145739	0 %	25 %	75 %	0 %	55978337
3623	NC_006462	CCAGGT	2	12	145762	145773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55978337
3624	NC_006462	CCCGGC	2	12	147058	147069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978338
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3746	NC_006462	GCC	2	6	151892	151897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978343
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3749	NC_006462	GGAG	2	8	151959	151966	25 %	0 %	75 %	0 %	55978343
3750	NC_006462	CCT	2	6	151987	151992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978343
3751	NC_006462	CTA	2	6	151999	152004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978343
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3753	NC_006462	GCC	2	6	152066	152071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978343
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3854	NC_006462	ACC	2	6	155372	155377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978345
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3859	NC_006462	GTG	2	6	155453	155458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978345
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3862	NC_006462	AGGA	2	8	155622	155629	50 %	0 %	50 %	0 %	55978345
3863	NC_006462	CTT	2	6	155654	155659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978346
3864	NC_006462	GGGACA	2	12	155808	155819	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55978346
3865	NC_006462	CTC	4	12	155897	155908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978346
3866	NC_006462	CCT	2	6	155956	155961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978346
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3868	NC_006462	GGACCT	2	12	156094	156105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55978346
3869	NC_006462	GAG	2	6	156119	156124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978346
3870	NC_006462	CGC	2	6	156130	156135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978346
3871	NC_006462	GTG	2	6	156191	156196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978346
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3999	NC_006462	GAG	2	6	162885	162890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978355
4000	NC_006462	CCT	2	6	162896	162901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978355

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