MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006462	G	6	6	40200	40205	0 %	0 %	100 %	0 %	55978230
1002	NC_006462	CCCG	2	8	40215	40222	0 %	0 %	25 %	75 %	55978230
1003	NC_006462	CCTC	2	8	40245	40252	0 %	25 %	0 %	75 %	55978230
1004	NC_006462	C	6	6	40254	40259	0 %	0 %	0 %	100 %	55978230
1005	NC_006462	CTC	2	6	40267	40272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1006	NC_006462	GCA	2	6	40275	40280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978230
1007	NC_006462	GGC	2	6	40281	40286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978230
1008	NC_006462	AGG	2	6	40325	40330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1009	NC_006462	AGG	3	9	40343	40351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1010	NC_006462	GCC	2	6	40409	40414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978230
1011	NC_006462	TCC	2	6	40421	40426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1012	NC_006462	GAG	2	6	40438	40443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1013	NC_006462	CCTCC	2	10	40477	40486	0 %	20 %	0 %	80 %	55978230
1014	NC_006462	CCCT	2	8	40511	40518	0 %	25 %	0 %	75 %	55978230
1015	NC_006462	AGG	2	6	40547	40552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1016	NC_006462	GGC	2	6	40569	40574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978230
1017	NC_006462	CGGCC	2	10	40656	40665	0 %	0 %	40 %	60 %	55978230
1018	NC_006462	CCTCC	2	10	40699	40708	0 %	20 %	0 %	80 %	55978230
1019	NC_006462	CTC	2	6	40726	40731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1020	NC_006462	CCCTC	2	10	40791	40800	0 %	20 %	0 %	80 %	55978230
1021	NC_006462	AGG	2	6	40817	40822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1022	NC_006462	GAG	2	6	40864	40869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1023	NC_006462	GGGCC	2	10	40870	40879	0 %	0 %	60 %	40 %	55978230
1024	NC_006462	TCC	2	6	40880	40885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1025	NC_006462	CCT	2	6	40899	40904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1026	NC_006462	GAG	2	6	40918	40923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1027	NC_006462	AAGG	2	8	40993	41000	50 %	0 %	50 %	0 %	55978230
1028	NC_006462	C	6	6	41001	41006	0 %	0 %	0 %	100 %	55978230
1029	NC_006462	AGG	2	6	41027	41032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1030	NC_006462	AGGG	2	8	41075	41082	25 %	0 %	75 %	0 %	55978230
1031	NC_006462	TCC	2	6	41087	41092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1032	NC_006462	GGA	2	6	41129	41134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1033	NC_006462	CTC	2	6	41143	41148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1034	NC_006462	GAGG	2	8	41184	41191	25 %	0 %	75 %	0 %	55978230
1035	NC_006462	CGC	2	6	41195	41200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978230
1036	NC_006462	AGG	2	6	41222	41227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1037	NC_006462	CCCA	2	8	41278	41285	25 %	0 %	0 %	75 %	55978230
1038	NC_006462	GAG	2	6	41425	41430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1039	NC_006462	CTC	2	6	41437	41442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1040	NC_006462	AGG	2	6	41444	41449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1041	NC_006462	CCT	2	6	41524	41529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978231
1042	NC_006462	GGA	2	6	41545	41550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978231
1043	NC_006462	TCCCC	2	10	41596	41605	0 %	20 %	0 %	80 %	55978231
1044	NC_006462	AGGTCC	2	12	41613	41624	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55978231
1045	NC_006462	TGG	2	6	41655	41660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978231
1046	NC_006462	GGT	2	6	41698	41703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978231
1047	NC_006462	C	7	7	41831	41837	0 %	0 %	0 %	100 %	55978231
1048	NC_006462	GCC	2	6	41844	41849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978231
1049	NC_006462	GGCG	2	8	41878	41885	0 %	0 %	75 %	25 %	55978231
1050	NC_006462	CTC	2	6	41924	41929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978231
1051	NC_006462	CAC	2	6	41951	41956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978231
1052	NC_006462	GGGA	2	8	41963	41970	25 %	0 %	75 %	0 %	55978231
1053	NC_006462	GCG	2	6	41982	41987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978231
1054	NC_006462	GCC	3	9	41997	42005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978231
1055	NC_006462	GTG	2	6	42006	42011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978231
1056	NC_006462	CGG	2	6	42031	42036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978231
1057	NC_006462	GAG	2	6	42038	42043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978231
1058	NC_006462	CGC	2	6	42071	42076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978231
1059	NC_006462	AGG	2	6	42090	42095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978231
1060	NC_006462	CCT	2	6	42106	42111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978231
1061	NC_006462	GGT	2	6	42181	42186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978231
1062	NC_006462	CAC	2	6	42200	42205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978231
1063	NC_006462	CCG	2	6	42235	42240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978231
1064	NC_006462	GGC	2	6	42260	42265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978231
1065	NC_006462	GGA	2	6	42274	42279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978231
1066	NC_006462	CCT	2	6	42304	42309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978231
1067	NC_006462	CCA	2	6	42334	42339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978231
1068	NC_006462	CGG	3	9	42349	42357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978231
1069	NC_006462	CCA	3	9	42358	42366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978231
1070	NC_006462	C	6	6	42370	42375	0 %	0 %	0 %	100 %	55978231
1071	NC_006462	GCG	2	6	42408	42413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978231
1072	NC_006462	CCT	2	6	42427	42432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978231
1073	NC_006462	G	7	7	42451	42457	0 %	0 %	100 %	0 %	55978231
1074	NC_006462	GGGA	2	8	42581	42588	25 %	0 %	75 %	0 %	55978232
1075	NC_006462	GGAC	2	8	42602	42609	25 %	0 %	50 %	25 %	55978232
1076	NC_006462	CGG	2	6	42620	42625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978232
1077	NC_006462	CTTC	2	8	42661	42668	0 %	50 %	0 %	50 %	55978232
1078	NC_006462	CCT	2	6	42690	42695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978232
1079	NC_006462	CGG	2	6	42710	42715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978232
1080	NC_006462	C	6	6	42731	42736	0 %	0 %	0 %	100 %	55978232
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1083	NC_006462	C	6	6	42846	42851	0 %	0 %	0 %	100 %	55978232
1084	NC_006462	G	7	7	42937	42943	0 %	0 %	100 %	0 %	55978232
1085	NC_006462	GCGG	2	8	42948	42955	0 %	0 %	75 %	25 %	55978232
1086	NC_006462	GGA	2	6	42972	42977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978232
1087	NC_006462	GCGGTG	2	12	43000	43011	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55978232
1088	NC_006462	AGG	2	6	43021	43026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978232
1089	NC_006462	GAG	2	6	43054	43059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978232
1090	NC_006462	ACC	2	6	43394	43399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978233
1091	NC_006462	GGC	2	6	43401	43406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978233
1092	NC_006462	G	7	7	43471	43477	0 %	0 %	100 %	0 %	55978233
1093	NC_006462	CCT	2	6	43485	43490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
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1095	NC_006462	CGGG	2	8	43515	43522	0 %	0 %	75 %	25 %	55978233
1096	NC_006462	TCC	3	9	43553	43561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
1097	NC_006462	TGG	2	6	43565	43570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978233
1098	NC_006462	CTC	2	6	43591	43596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
1099	NC_006462	C	7	7	43613	43619	0 %	0 %	0 %	100 %	55978233
1100	NC_006462	CTC	2	6	43633	43638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
1101	NC_006462	CTC	3	9	43645	43653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
1102	NC_006462	CCG	2	6	43712	43717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978233
1103	NC_006462	CTT	2	6	43743	43748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978233
1104	NC_006462	CTC	2	6	43762	43767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
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1108	NC_006462	GGCCTC	2	12	43939	43950	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55978233
1109	NC_006462	CCT	2	6	43956	43961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
1110	NC_006462	C	6	6	44009	44014	0 %	0 %	0 %	100 %	55978234
1111	NC_006462	AAG	2	6	44025	44030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978234
1112	NC_006462	CAC	2	6	44048	44053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978234
1113	NC_006462	CGC	3	9	44063	44071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978234
1114	NC_006462	GGC	2	6	44072	44077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978234
1115	NC_006462	GCCCTC	2	12	44088	44099	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55978234
1116	NC_006462	GGT	2	6	44117	44122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978234
1117	NC_006462	GGC	2	6	44146	44151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978234
1118	NC_006462	AAGG	2	8	44177	44184	50 %	0 %	50 %	0 %	55978234
1119	NC_006462	TGG	2	6	44197	44202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978234
1120	NC_006462	GAT	2	6	44204	44209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978234
1121	NC_006462	GAC	2	6	44223	44228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978234
1122	NC_006462	GCGA	2	8	44274	44281	25 %	0 %	50 %	25 %	55978234
1123	NC_006462	G	6	6	44294	44299	0 %	0 %	100 %	0 %	55978234
1124	NC_006462	GTG	2	6	44313	44318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978234
1125	NC_006462	GAT	2	6	44378	44383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978234
1126	NC_006462	CGG	2	6	44441	44446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978234
1127	NC_006462	GGA	2	6	44447	44452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978234
1128	NC_006462	AAG	2	6	44460	44465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978234
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1130	NC_006462	GTG	2	6	44523	44528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978234
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1259	NC_006462	CGC	2	6	48917	48922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978239
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1381	NC_006462	C	6	6	52828	52833	0 %	0 %	0 %	100 %	55978244
1382	NC_006462	GAG	2	6	52865	52870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978244
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1384	NC_006462	GTG	2	6	52911	52916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978244
1385	NC_006462	CCG	2	6	52939	52944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978244
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