MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006462	GCC	2	6	254528	254533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978432
6002	NC_006462	ACG	2	6	254543	254548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978432
6003	NC_006462	CTT	2	6	254625	254630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978432
6004	NC_006462	GGGC	2	8	254873	254880	0 %	0 %	75 %	25 %	55978432
6005	NC_006462	CAT	2	6	254928	254933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978432
6006	NC_006462	CGG	2	6	255004	255009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978432
6007	NC_006462	GCC	2	6	255107	255112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978432
6008	NC_006462	GCC	2	6	255184	255189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978432
6009	NC_006462	TCA	2	6	255269	255274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978432
6010	NC_006462	TTC	2	6	255583	255588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978433
6011	NC_006462	AGG	2	6	255620	255625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978433
6012	NC_006462	ACC	2	6	255662	255667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978433
6013	NC_006462	C	6	6	255731	255736	0 %	0 %	0 %	100 %	55978433
6014	NC_006462	CAC	2	6	255831	255836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978433
6015	NC_006462	CTC	2	6	255859	255864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978433
6016	NC_006462	TAC	2	6	255877	255882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978433
6017	NC_006462	C	6	6	255886	255891	0 %	0 %	0 %	100 %	55978433
6018	NC_006462	AAG	2	6	255898	255903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978433
6019	NC_006462	C	6	6	255905	255910	0 %	0 %	0 %	100 %	55978433
6020	NC_006462	GCC	2	6	255956	255961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978433
6021	NC_006462	CCT	2	6	255975	255980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978433
6022	NC_006462	CAA	2	6	255999	256004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978433
6023	NC_006462	ATG	2	6	256012	256017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978433
6024	NC_006462	CAC	2	6	256153	256158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978433
6025	NC_006462	AAC	2	6	256192	256197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978433
6026	NC_006462	GGCC	2	8	256236	256243	0 %	0 %	50 %	50 %	55978433
6027	NC_006462	CGG	2	6	256293	256298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978433
6028	NC_006462	GGA	2	6	256371	256376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978433
6029	NC_006462	CAT	2	6	256392	256397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978433
6030	NC_006462	TTC	2	6	256426	256431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978433
6031	NC_006462	AGA	2	6	256452	256457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978433
6032	NC_006462	GGC	2	6	256464	256469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978433
6033	NC_006462	TGG	3	9	256583	256591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978434
6034	NC_006462	CGA	2	6	256689	256694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978434
6035	NC_006462	CGG	2	6	256725	256730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978434
6036	NC_006462	CCAACC	2	12	256798	256809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978434
6037	NC_006462	GCC	2	6	256812	256817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978434

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.