MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006462	GAC	2	6	207964	207969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5002	NC_006462	CTT	2	6	208020	208025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978382
5003	NC_006462	AGC	2	6	208034	208039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5004	NC_006462	CTG	2	6	208048	208053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5005	NC_006462	GCC	2	6	208081	208086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5006	NC_006462	GAG	2	6	208096	208101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978382
5007	NC_006462	TCCT	2	8	208120	208127	0 %	50 %	0 %	50 %	55978382
5008	NC_006462	TCC	2	6	208147	208152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978382
5009	NC_006462	GCC	2	6	208202	208207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5010	NC_006462	GCC	2	6	208311	208316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5011	NC_006462	GCTG	2	8	208320	208327	0 %	25 %	50 %	25 %	55978382
5012	NC_006462	GCG	2	6	208398	208403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5013	NC_006462	GGT	2	6	208404	208409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978382
5014	NC_006462	GCT	2	6	208413	208418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5015	NC_006462	GGC	2	6	208466	208471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5016	NC_006462	CCT	2	6	208489	208494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978382
5017	NC_006462	CCG	3	9	208495	208503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5018	NC_006462	CTG	2	6	208516	208521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5019	NC_006462	GAG	2	6	208522	208527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978382
5020	NC_006462	CTG	2	6	208564	208569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5021	NC_006462	GCG	2	6	208570	208575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5022	NC_006462	GGA	2	6	208617	208622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978382
5023	NC_006462	CCGGGA	2	12	208626	208637	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55978382
5024	NC_006462	GCC	2	6	208726	208731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5025	NC_006462	CTG	2	6	208765	208770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5026	NC_006462	CG	3	6	208774	208779	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5027	NC_006462	GTC	2	6	208792	208797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5028	NC_006462	GCC	2	6	208822	208827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5029	NC_006462	GCG	2	6	208830	208835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5030	NC_006462	GGC	2	6	208839	208844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5031	NC_006462	TCT	2	6	208848	208853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978382
5032	NC_006462	GGGCAG	2	12	208906	208917	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55978382
5033	NC_006462	TGG	2	6	208922	208927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978382
5034	NC_006462	CGT	2	6	208928	208933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5035	NC_006462	CG	5	10	208958	208967	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5036	NC_006462	CGA	2	6	208992	208997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5037	NC_006462	CTC	2	6	209032	209037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978382
5038	NC_006462	CGA	2	6	209046	209051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5039	NC_006462	CTT	2	6	209068	209073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978382
5040	NC_006462	GCG	2	6	209074	209079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5041	NC_006462	G	6	6	209177	209182	0 %	0 %	100 %	0 %	55978382
5042	NC_006462	GCC	2	6	209201	209206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5043	NC_006462	CGT	2	6	209211	209216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5044	NC_006462	CG	3	6	209227	209232	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5045	NC_006462	TGC	2	6	209267	209272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5046	NC_006462	AGC	2	6	209273	209278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5047	NC_006462	AGG	2	6	209297	209302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978382
5048	NC_006462	GCGCC	2	10	209304	209313	0 %	0 %	40 %	60 %	55978382
5049	NC_006462	GCG	2	6	209314	209319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5050	NC_006462	CCCG	2	8	209338	209345	0 %	0 %	25 %	75 %	55978382
5051	NC_006462	CCA	2	6	209354	209359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978382
5052	NC_006462	CTC	2	6	209368	209373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978382
5053	NC_006462	CG	3	6	209381	209386	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5054	NC_006462	TGC	2	6	209409	209414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5055	NC_006462	TGG	2	6	209456	209461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978382
5056	NC_006462	CCG	2	6	209544	209549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5057	NC_006462	CTG	2	6	209572	209577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5058	NC_006462	GC	3	6	209605	209610	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5059	NC_006462	GAGGC	2	10	209680	209689	20 %	0 %	60 %	20 %	55978382
5060	NC_006462	GCC	2	6	209712	209717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5061	NC_006462	TGG	2	6	209747	209752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978382
5062	NC_006462	TTC	2	6	209755	209760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978382
5063	NC_006462	CG	3	6	209764	209769	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5064	NC_006462	GAG	2	6	209770	209775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978382
5065	NC_006462	CGC	3	9	209780	209788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5066	NC_006462	ATC	2	6	209794	209799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978382
5067	NC_006462	CAG	2	6	209896	209901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5068	NC_006462	GGA	2	6	209916	209921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978382
5069	NC_006462	GCT	2	6	209943	209948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5070	NC_006462	GAA	2	6	209968	209973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978382
5071	NC_006462	GGC	2	6	209974	209979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5072	NC_006462	GCT	2	6	209994	209999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5073	NC_006462	GCG	2	6	210024	210029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5074	NC_006462	CG	3	6	210075	210080	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5075	NC_006462	CAA	2	6	210091	210096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978382
5076	NC_006462	GAA	2	6	210097	210102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978382
5077	NC_006462	GCC	2	6	210121	210126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5078	NC_006462	GC	3	6	210196	210201	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5079	NC_006462	CTG	2	6	210247	210252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5080	NC_006462	AAGG	2	8	210285	210292	50 %	0 %	50 %	0 %	55978382
5081	NC_006462	G	6	6	211152	211157	0 %	0 %	100 %	0 %	55978383
5082	NC_006462	TCT	2	6	211176	211181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978383
5083	NC_006462	CCT	2	6	211188	211193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978383
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5085	NC_006462	CCG	2	6	211318	211323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978383
5086	NC_006462	CAC	2	6	211435	211440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978383
5087	NC_006462	GGC	2	6	211462	211467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978383
5088	NC_006462	CCT	2	6	211473	211478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978383
5089	NC_006462	CTT	2	6	211494	211499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978383
5090	NC_006462	TCC	2	6	211532	211537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978383
5091	NC_006462	CAG	2	6	211540	211545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978383
5092	NC_006462	CAC	2	6	211594	211599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978383
5093	NC_006462	CGC	2	6	211685	211690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978383
5094	NC_006462	TCCCA	2	10	211724	211733	20 %	20 %	0 %	60 %	55978383
5095	NC_006462	GCC	2	6	211920	211925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978384
5096	NC_006462	CGTC	2	8	211936	211943	0 %	25 %	25 %	50 %	55978384
5097	NC_006462	GCC	2	6	212001	212006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978384
5098	NC_006462	CTGA	2	8	212012	212019	25 %	25 %	25 %	25 %	55978384
5099	NC_006462	CGG	2	6	212023	212028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978384
5100	NC_006462	CCA	2	6	212059	212064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978384
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5102	NC_006462	GGT	2	6	212147	212152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978384
5103	NC_006462	GTA	2	6	212168	212173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978384
5104	NC_006462	AAG	2	6	212202	212207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978384
5105	NC_006462	CCT	2	6	212309	212314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978384
5106	NC_006462	C	6	6	212329	212334	0 %	0 %	0 %	100 %	55978384
5107	NC_006462	GGC	2	6	212423	212428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978385
5108	NC_006462	GAG	2	6	212543	212548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978385
5109	NC_006462	CCA	2	6	212596	212601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978385
5110	NC_006462	G	6	6	212617	212622	0 %	0 %	100 %	0 %	55978385
5111	NC_006462	G	6	6	212624	212629	0 %	0 %	100 %	0 %	55978385
5112	NC_006462	GGA	2	6	212635	212640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978385
5113	NC_006462	CCG	2	6	212650	212655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978385
5114	NC_006462	CGGAG	2	10	212680	212689	20 %	0 %	60 %	20 %	55978385
5115	NC_006462	G	6	6	212693	212698	0 %	0 %	100 %	0 %	55978385
5116	NC_006462	CCA	4	12	212704	212715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978385
5117	NC_006462	TCC	2	6	212798	212803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978386
5118	NC_006462	ACC	2	6	212843	212848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978386
5119	NC_006462	GCC	2	6	212936	212941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978386
5120	NC_006462	GGCG	2	8	213244	213251	0 %	0 %	75 %	25 %	55978387
5121	NC_006462	CTC	3	9	213254	213262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978387
5122	NC_006462	CGG	2	6	213331	213336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978387
5123	NC_006462	CCTC	2	8	213351	213358	0 %	25 %	0 %	75 %	55978387
5124	NC_006462	CCA	2	6	213370	213375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978387
5125	NC_006462	GAG	2	6	213410	213415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978387
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5128	NC_006462	GGC	2	6	213669	213674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978388
5129	NC_006462	GGCG	2	8	213704	213711	0 %	0 %	75 %	25 %	55978388
5130	NC_006462	C	6	6	213721	213726	0 %	0 %	0 %	100 %	55978388
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5132	NC_006462	C	6	6	213865	213870	0 %	0 %	0 %	100 %	55978388
5133	NC_006462	C	6	6	213889	213894	0 %	0 %	0 %	100 %	55978389
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5149	NC_006462	GCC	2	6	214323	214328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978389
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5222	NC_006462	GGGGT	2	10	218382	218391	0 %	20 %	80 %	0 %	55978393
5223	NC_006462	CTT	2	6	218487	218492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978393
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5230	NC_006462	GAG	2	6	218928	218933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228861784
5231	NC_006462	GC	3	6	218982	218987	0 %	0 %	50 %	50 %	228861784
5232	NC_006462	GCG	2	6	219006	219011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	228861784
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5240	NC_006462	GAG	2	6	219225	219230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228861784
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5242	NC_006462	GCG	2	6	219287	219292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	228861784
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5374	NC_006462	GCC	2	6	224845	224850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978402
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5378	NC_006462	GCC	2	6	224959	224964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978402
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