MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006462	CCT	2	6	184395	184400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978365
4502	NC_006462	GCC	3	9	184414	184422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978365
4503	NC_006462	CCCCGA	2	12	184479	184490	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55978365
4504	NC_006462	GGGGC	2	10	184553	184562	0 %	0 %	80 %	20 %	55978365
4505	NC_006462	GCGA	2	8	184591	184598	25 %	0 %	50 %	25 %	55978365
4506	NC_006462	GGAG	2	8	184717	184724	25 %	0 %	75 %	0 %	55978365
4507	NC_006462	TCC	2	6	184756	184761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978366
4508	NC_006462	TCC	2	6	184768	184773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978366
4509	NC_006462	GCCCAG	2	12	184782	184793	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55978366
4510	NC_006462	TGG	2	6	184849	184854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978366
4511	NC_006462	AAC	2	6	184914	184919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978366
4512	NC_006462	AAC	3	9	184929	184937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978366
4513	NC_006462	CCA	2	6	184966	184971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978366
4514	NC_006462	CCT	2	6	184975	184980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978366
4515	NC_006462	AGG	2	6	184994	184999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978366
4516	NC_006462	GCC	2	6	185007	185012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978366
4517	NC_006462	GC	3	6	185032	185037	0 %	0 %	50 %	50 %	55978366
4518	NC_006462	G	6	6	185062	185067	0 %	0 %	100 %	0 %	55978366
4519	NC_006462	CTC	2	6	185154	185159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978366
4520	NC_006462	TGGG	2	8	185256	185263	0 %	25 %	75 %	0 %	55978366
4521	NC_006462	TGG	3	9	185320	185328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978366
4522	NC_006462	A	6	6	185354	185359	100 %	0 %	0 %	0 %	55978366
4523	NC_006462	TGG	2	6	185362	185367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978366
4524	NC_006462	ACG	2	6	185371	185376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978366
4525	NC_006462	GTGA	2	8	185388	185395	25 %	25 %	50 %	0 %	55978366
4526	NC_006462	TGG	2	6	185440	185445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978366
4527	NC_006462	CTC	2	6	185525	185530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978366
4528	NC_006462	AAC	2	6	185556	185561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978366
4529	NC_006462	TTC	2	6	185562	185567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978366
4530	NC_006462	CA	3	6	185600	185605	50 %	0 %	0 %	50 %	55978366
4531	NC_006462	A	6	6	185605	185610	100 %	0 %	0 %	0 %	55978366
4532	NC_006462	GTGGAC	2	12	185637	185648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55978366
4533	NC_006462	TCA	2	6	185773	185778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978366
4534	NC_006462	CGG	2	6	185810	185815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978366
4535	NC_006462	CCT	2	6	185819	185824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978366
4536	NC_006462	GTG	4	12	185889	185900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978366
4537	NC_006462	CGG	2	6	185911	185916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978366
4538	NC_006462	GTG	2	6	185946	185951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978366
4539	NC_006462	CGG	3	9	185959	185967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978366
4540	NC_006462	GAC	2	6	186000	186005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978366
4541	NC_006462	G	6	6	186038	186043	0 %	0 %	100 %	0 %	55978366
4542	NC_006462	TGCG	2	8	186051	186058	0 %	25 %	50 %	25 %	55978366
4543	NC_006462	GCCA	2	8	186084	186091	25 %	0 %	25 %	50 %	55978366
4544	NC_006462	GGC	2	6	186093	186098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978366
4545	NC_006462	TCC	2	6	186103	186108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978366
4546	NC_006462	AGG	2	6	186229	186234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978366
4547	NC_006462	GGT	2	6	186257	186262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978366
4548	NC_006462	CTC	2	6	186363	186368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978366
4549	NC_006462	G	6	6	186371	186376	0 %	0 %	100 %	0 %	55978366
4550	NC_006462	GTG	2	6	186381	186386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978366
4551	NC_006462	GCCCAG	2	12	186387	186398	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55978366
4552	NC_006462	GT	3	6	186415	186420	0 %	50 %	50 %	0 %	55978366
4553	NC_006462	CTT	2	6	186458	186463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978366
4554	NC_006462	ACA	3	9	186466	186474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978366
4555	NC_006462	ACC	2	6	186489	186494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978366
4556	NC_006462	C	7	7	186499	186505	0 %	0 %	0 %	100 %	55978366
4557	NC_006462	GGCT	2	8	186510	186517	0 %	25 %	50 %	25 %	55978366
4558	NC_006462	C	7	7	186527	186533	0 %	0 %	0 %	100 %	55978366
4559	NC_006462	TCT	2	6	186619	186624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978366
4560	NC_006462	ACG	3	9	186625	186633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978366
4561	NC_006462	GCG	2	6	186643	186648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978366
4562	NC_006462	ACG	2	6	186655	186660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978366
4563	NC_006462	CGGG	2	8	186670	186677	0 %	0 %	75 %	25 %	55978366
4564	NC_006462	CCA	2	6	186733	186738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978366
4565	NC_006462	ACG	2	6	186829	186834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978366
4566	NC_006462	GCC	2	6	186955	186960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978366
4567	NC_006462	GTG	2	6	186999	187004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978366
4568	NC_006462	CCT	2	6	187069	187074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978366
4569	NC_006462	GAC	2	6	187119	187124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978366
4570	NC_006462	GCTTC	2	10	187135	187144	0 %	40 %	20 %	40 %	55978366
4571	NC_006462	C	6	6	187236	187241	0 %	0 %	0 %	100 %	55978366
4572	NC_006462	CTC	2	6	187272	187277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978366
4573	NC_006462	GTG	2	6	187311	187316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978366
4574	NC_006462	ACC	2	6	187338	187343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978366
4575	NC_006462	G	6	6	187352	187357	0 %	0 %	100 %	0 %	55978366
4576	NC_006462	GGGGA	2	10	187419	187428	20 %	0 %	80 %	0 %	55978366
4577	NC_006462	TTC	2	6	187518	187523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978366
4578	NC_006462	GAC	2	6	187617	187622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978366
4579	NC_006462	GTG	2	6	187644	187649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978366
4580	NC_006462	GCG	2	6	187824	187829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978367
4581	NC_006462	GCGG	2	8	187877	187884	0 %	0 %	75 %	25 %	55978367
4582	NC_006462	AGG	2	6	187926	187931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978367
4583	NC_006462	CCT	2	6	187993	187998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978367
4584	NC_006462	GGGCCT	2	12	188005	188016	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55978367
4585	NC_006462	CGG	3	9	188017	188025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978367
4586	NC_006462	GGC	2	6	188027	188032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978367
4587	NC_006462	AAG	2	6	188042	188047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978367
4588	NC_006462	C	7	7	188051	188057	0 %	0 %	0 %	100 %	55978367
4589	NC_006462	GGGGA	2	10	188120	188129	20 %	0 %	80 %	0 %	55978367
4590	NC_006462	CTC	2	6	188162	188167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978367
4591	NC_006462	CCT	2	6	188185	188190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978367
4592	NC_006462	GGAGG	2	10	188212	188221	20 %	0 %	80 %	0 %	55978367
4593	NC_006462	GCG	2	6	188243	188248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978367
4594	NC_006462	GA	3	6	188284	188289	50 %	0 %	50 %	0 %	55978367
4595	NC_006462	GCC	3	9	188325	188333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978367
4596	NC_006462	TGG	2	6	188334	188339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978367
4597	NC_006462	G	6	6	188383	188388	0 %	0 %	100 %	0 %	55978367
4598	NC_006462	CCA	2	6	188398	188403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978367
4599	NC_006462	GCC	2	6	188418	188423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978367
4600	NC_006462	CCTG	2	8	188538	188545	0 %	25 %	25 %	50 %	55978368
4601	NC_006462	GGT	2	6	188565	188570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978368
4602	NC_006462	TCGGCC	2	12	188588	188599	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55978368
4603	NC_006462	GAA	2	6	188623	188628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978368
4604	NC_006462	CCG	2	6	188665	188670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978368
4605	NC_006462	CCA	2	6	188679	188684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978368
4606	NC_006462	GGC	2	6	188715	188720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978368
4607	NC_006462	AGGA	2	8	188729	188736	50 %	0 %	50 %	0 %	55978368
4608	NC_006462	CTC	2	6	188767	188772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978368
4609	NC_006462	CCT	2	6	188775	188780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978368
4610	NC_006462	CTC	2	6	188791	188796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978368
4611	NC_006462	GGA	2	6	188826	188831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978368
4612	NC_006462	CCA	2	6	188832	188837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978368
4613	NC_006462	GGC	2	6	188839	188844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978368
4614	NC_006462	CCA	2	6	188889	188894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978368
4615	NC_006462	CGG	2	6	188930	188935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978368
4616	NC_006462	GCGG	2	8	188944	188951	0 %	0 %	75 %	25 %	55978368
4617	NC_006462	CCA	2	6	188955	188960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978368
4618	NC_006462	CCCT	2	8	188999	189006	0 %	25 %	0 %	75 %	55978368
4619	NC_006462	CCT	2	6	189051	189056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978368
4620	NC_006462	G	6	6	189068	189073	0 %	0 %	100 %	0 %	55978368
4621	NC_006462	C	6	6	189223	189228	0 %	0 %	0 %	100 %	55978368
4622	NC_006462	GCG	2	6	189314	189319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978368
4623	NC_006462	GAG	2	6	189349	189354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978368
4624	NC_006462	CTC	2	6	189373	189378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978368
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4626	NC_006462	CGCC	2	8	191218	191225	0 %	0 %	25 %	75 %	55978369
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