MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006461	GCC	2	6	157795	157800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980130
4002	NC_006461	CCA	2	6	157813	157818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980130
4003	NC_006461	AGGCC	2	10	157882	157891	20 %	0 %	40 %	40 %	55980130
4004	NC_006461	GTA	2	6	157931	157936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980130
4005	NC_006461	GGT	2	6	157949	157954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980130
4006	NC_006461	GCG	2	6	158061	158066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980130
4007	NC_006461	CCG	2	6	158071	158076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980130
4008	NC_006461	GGA	2	6	158107	158112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980130
4009	NC_006461	CGG	2	6	158130	158135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980130
4010	NC_006461	TTC	2	6	158166	158171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980130
4011	NC_006461	C	6	6	158238	158243	0 %	0 %	0 %	100 %	55980130
4012	NC_006461	TCC	2	6	158274	158279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980130
4013	NC_006461	CCT	3	9	158524	158532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980131
4014	NC_006461	CCGTGG	2	12	158581	158592	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980131
4015	NC_006461	TGG	3	9	158590	158598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980131
4016	NC_006461	CGT	2	6	158611	158616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980131
4017	NC_006461	CGTACT	2	12	158641	158652	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55980131
4018	NC_006461	TCC	2	6	158661	158666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980131
4019	NC_006461	CGG	2	6	158667	158672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980131
4020	NC_006461	GCG	2	6	158684	158689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980131
4021	NC_006461	GC	3	6	158691	158696	0 %	0 %	50 %	50 %	55980131
4022	NC_006461	GCG	2	6	158714	158719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980131
4023	NC_006461	CTC	3	9	158726	158734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980131
4024	NC_006461	G	7	7	158743	158749	0 %	0 %	100 %	0 %	55980131
4025	NC_006461	AGG	2	6	158754	158759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980131
4026	NC_006461	GGGAGA	2	12	158767	158778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980131
4027	NC_006461	GCT	2	6	158782	158787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980131
4028	NC_006461	CTT	2	6	158831	158836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980131
4029	NC_006461	GGC	2	6	158843	158848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980131
4030	NC_006461	CGGG	2	8	158971	158978	0 %	0 %	75 %	25 %	55980131
4031	NC_006461	GCT	2	6	158992	158997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980131
4032	NC_006461	GGC	2	6	159037	159042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980131
4033	NC_006461	CTC	2	6	159044	159049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980131
4034	NC_006461	CAC	2	6	159095	159100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980131
4035	NC_006461	CTCCAC	2	12	159170	159181	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55980131
4036	NC_006461	CAC	2	6	159206	159211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980131
4037	NC_006461	GGT	2	6	159370	159375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980131
4038	NC_006461	CCA	2	6	159460	159465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980131
4039	NC_006461	CCA	2	6	159475	159480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980131
4040	NC_006461	CTT	2	6	159521	159526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980131
4041	NC_006461	CTC	3	9	159530	159538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980131
4042	NC_006461	CGG	2	6	159549	159554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980131
4043	NC_006461	CGG	2	6	159576	159581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980131
4044	NC_006461	CTG	2	6	159608	159613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980131
4045	NC_006461	C	6	6	159705	159710	0 %	0 %	0 %	100 %	55980131
4046	NC_006461	TCT	2	6	159796	159801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980131
4047	NC_006461	TCC	2	6	159891	159896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980131
4048	NC_006461	TGG	2	6	159910	159915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980131
4049	NC_006461	GAT	2	6	159932	159937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980131
4050	NC_006461	ACC	2	6	159990	159995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980131
4051	NC_006461	GTG	2	6	160373	160378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980132
4052	NC_006461	CTT	2	6	160460	160465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980132
4053	NC_006461	GGA	2	6	160507	160512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980132
4054	NC_006461	CCT	2	6	160522	160527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980132
4055	NC_006461	ACC	2	6	160577	160582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980132
4056	NC_006461	CCGG	2	8	160617	160624	0 %	0 %	50 %	50 %	55980132
4057	NC_006461	ACCCC	2	10	160659	160668	20 %	0 %	0 %	80 %	55980132
4058	NC_006461	CTCC	2	8	160714	160721	0 %	25 %	0 %	75 %	55980132
4059	NC_006461	GCC	2	6	160739	160744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980132
4060	NC_006461	TGG	2	6	160767	160772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980132
4061	NC_006461	G	6	6	160776	160781	0 %	0 %	100 %	0 %	55980132
4062	NC_006461	CCT	2	6	160789	160794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980132
4063	NC_006461	CCT	2	6	160807	160812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980132
4064	NC_006461	CCG	2	6	160837	160842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980132
4065	NC_006461	GAG	2	6	160871	160876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980132
4066	NC_006461	GCCC	3	12	160901	160912	0 %	0 %	25 %	75 %	55980133
4067	NC_006461	CCA	2	6	160924	160929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980133
4068	NC_006461	CCA	2	6	160945	160950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980133
4069	NC_006461	GCC	2	6	160986	160991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980133
4070	NC_006461	CCGGTC	2	12	161003	161014	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980133
4071	NC_006461	AGG	2	6	161022	161027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980133
4072	NC_006461	ACC	2	6	161064	161069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980133
4073	NC_006461	TGA	2	6	161095	161100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980133
4074	NC_006461	TCC	2	6	161121	161126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980133
4075	NC_006461	TCG	2	6	161209	161214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980133
4076	NC_006461	AGG	2	6	161247	161252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980133
4077	NC_006461	GAG	2	6	161258	161263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980133
4078	NC_006461	GCCAGG	2	12	161283	161294	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980133
4079	NC_006461	GC	3	6	161299	161304	0 %	0 %	50 %	50 %	55980133
4080	NC_006461	GAG	2	6	161433	161438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980134
4081	NC_006461	GTA	2	6	161457	161462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980134
4082	NC_006461	AGG	3	9	161539	161547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980134
4083	NC_006461	CCCA	2	8	161551	161558	25 %	0 %	0 %	75 %	55980134
4084	NC_006461	AGC	2	6	161593	161598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980134
4085	NC_006461	AGCC	2	8	161629	161636	25 %	0 %	25 %	50 %	55980134
4086	NC_006461	GGC	2	6	161652	161657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980134
4087	NC_006461	GCG	2	6	161670	161675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980134
4088	NC_006461	C	6	6	161687	161692	0 %	0 %	0 %	100 %	55980134
4089	NC_006461	CCAGGT	2	12	161699	161710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55980134
4090	NC_006461	GAG	2	6	161718	161723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980134
4091	NC_006461	AGGCCC	2	12	161753	161764	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980134
4092	NC_006461	TCC	2	6	161770	161775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980134
4093	NC_006461	C	6	6	161782	161787	0 %	0 %	0 %	100 %	55980134
4094	NC_006461	GCC	2	6	161788	161793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980134
4095	NC_006461	GGGCCA	2	12	161798	161809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980134
4096	NC_006461	GCC	2	6	161821	161826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980134
4097	NC_006461	GC	3	6	161845	161850	0 %	0 %	50 %	50 %	55980134
4098	NC_006461	CCG	2	6	161954	161959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980135
4099	NC_006461	CCA	2	6	161964	161969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980135
4100	NC_006461	CGCC	2	8	161979	161986	0 %	0 %	25 %	75 %	55980135
4101	NC_006461	AGG	2	6	162008	162013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980135
4102	NC_006461	CCA	2	6	162066	162071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980135
4103	NC_006461	CTC	2	6	162100	162105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980135
4104	NC_006461	AGG	2	6	162116	162121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980135
4105	NC_006461	GAG	2	6	162133	162138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980135
4106	NC_006461	CCCG	2	8	162152	162159	0 %	0 %	25 %	75 %	55980135
4107	NC_006461	GCC	2	6	162185	162190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980135
4108	NC_006461	AGG	2	6	162197	162202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980135
4109	NC_006461	CGG	2	6	162204	162209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980135
4110	NC_006461	CCA	2	6	162222	162227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980135
4111	NC_006461	C	6	6	162233	162238	0 %	0 %	0 %	100 %	55980135
4112	NC_006461	AGG	3	9	162266	162274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980135
4113	NC_006461	CGG	2	6	162312	162317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980135
4114	NC_006461	CCG	2	6	162346	162351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980135
4115	NC_006461	CCT	2	6	162372	162377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980135
4116	NC_006461	ACC	2	6	162395	162400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980135
4117	NC_006461	CCT	2	6	162498	162503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980135
4118	NC_006461	ACGC	2	8	162577	162584	25 %	0 %	25 %	50 %	55980135
4119	NC_006461	CCT	2	6	162601	162606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980135
4120	NC_006461	GAT	2	6	162668	162673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980136
4121	NC_006461	AAG	2	6	162702	162707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980136
4122	NC_006461	GGA	2	6	162770	162775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980136
4123	NC_006461	TGG	2	6	162853	162858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980136
4124	NC_006461	GGA	2	6	162890	162895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980136
4125	NC_006461	GGT	2	6	162896	162901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980136
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4229	NC_006461	GAC	2	6	166876	166881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980142
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4232	NC_006461	GCC	2	6	166985	166990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980142
4233	NC_006461	CTC	2	6	166996	167001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980142
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4236	NC_006461	GTG	2	6	167051	167056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980142
4237	NC_006461	CCCGC	2	10	167065	167074	0 %	0 %	20 %	80 %	55980142
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4240	NC_006461	CGGG	2	8	167172	167179	0 %	0 %	75 %	25 %	55980142
4241	NC_006461	GGT	2	6	167257	167262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980142
4242	NC_006461	GAA	2	6	167275	167280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980142
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4245	NC_006461	CCA	2	6	167364	167369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980142
4246	NC_006461	CCG	3	9	167377	167385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980142
4247	NC_006461	G	6	6	167429	167434	0 %	0 %	100 %	0 %	55980142
4248	NC_006461	GCC	2	6	167468	167473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980142
4249	NC_006461	ACCAGG	2	12	167507	167518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980142
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4251	NC_006461	GCG	2	6	167618	167623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980142
4252	NC_006461	GGA	2	6	167652	167657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980142
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4372	NC_006461	CTC	2	6	172010	172015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4373	NC_006461	AGG	2	6	172029	172034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4374	NC_006461	GGC	2	6	172047	172052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980149
4375	NC_006461	CTC	2	6	172076	172081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4376	NC_006461	CCT	2	6	172156	172161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4377	NC_006461	G	6	6	172192	172197	0 %	0 %	100 %	0 %	55980149
4378	NC_006461	GGC	2	6	172212	172217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980149
4379	NC_006461	TCC	2	6	172218	172223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4380	NC_006461	CAT	2	6	172241	172246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980149
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4384	NC_006461	TGA	2	6	172351	172356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980149
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4393	NC_006461	GGC	2	6	172709	172714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980149
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4400	NC_006461	GGA	2	6	173035	173040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
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4402	NC_006461	GCC	2	6	173098	173103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980149
4403	NC_006461	GCG	2	6	173141	173146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980149
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4482	NC_006461	TCCGG	2	10	176731	176740	0 %	20 %	40 %	40 %	55980149
4483	NC_006461	GCG	2	6	176744	176749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980149
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4492	NC_006461	CGT	2	6	177070	177075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980149
4493	NC_006461	TGG	2	6	177076	177081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980149
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4495	NC_006461	GAA	2	6	177173	177178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980149
4496	NC_006461	GGA	2	6	177241	177246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4497	NC_006461	GAG	2	6	177410	177415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4498	NC_006461	GGTGA	2	10	177416	177425	20 %	20 %	60 %	0 %	55980149
4499	NC_006461	CCG	2	6	177475	177480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980149
4500	NC_006461	CTT	2	6	177530	177535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980149

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