MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006461	G	6	6	60239	60244	0 %	0 %	100 %	0 %	55980032
1502	NC_006461	GTC	2	6	60249	60254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980032
1503	NC_006461	GGGAA	2	10	60282	60291	40 %	0 %	60 %	0 %	55980032
1504	NC_006461	GAG	2	6	60345	60350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980032
1505	NC_006461	G	6	6	60350	60355	0 %	0 %	100 %	0 %	55980032
1506	NC_006461	AGG	2	6	60373	60378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980032
1507	NC_006461	TGG	2	6	60403	60408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980032
1508	NC_006461	GGT	2	6	60434	60439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980032
1509	NC_006461	AGG	3	9	60496	60504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980032
1510	NC_006461	GCGG	2	8	60519	60526	0 %	0 %	75 %	25 %	55980032
1511	NC_006461	GCC	2	6	60542	60547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980032
1512	NC_006461	CTC	2	6	60552	60557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980032
1513	NC_006461	GGA	2	6	60566	60571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980032
1514	NC_006461	GCCC	2	8	60580	60587	0 %	0 %	25 %	75 %	55980032
1515	NC_006461	CCG	2	6	60609	60614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980032
1516	NC_006461	AGGT	2	8	60700	60707	25 %	25 %	50 %	0 %	55980032
1517	NC_006461	GAG	2	6	60720	60725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980032
1518	NC_006461	G	6	6	60748	60753	0 %	0 %	100 %	0 %	55980032
1519	NC_006461	CTC	2	6	60798	60803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980032
1520	NC_006461	CAC	3	9	60804	60812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980032
1521	NC_006461	G	6	6	60821	60826	0 %	0 %	100 %	0 %	55980032
1522	NC_006461	GAG	3	9	60834	60842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980032
1523	NC_006461	CCG	2	6	60844	60849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980032
1524	NC_006461	CG	3	6	60869	60874	0 %	0 %	50 %	50 %	55980032
1525	NC_006461	C	6	6	60912	60917	0 %	0 %	0 %	100 %	55980032
1526	NC_006461	GGT	2	6	60989	60994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980032
1527	NC_006461	CCG	2	6	61045	61050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980032
1528	NC_006461	CCG	2	6	61103	61108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980032
1529	NC_006461	GGGGC	2	10	61109	61118	0 %	0 %	80 %	20 %	55980032
1530	NC_006461	CCT	2	6	61121	61126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980032
1531	NC_006461	CCT	2	6	61151	61156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980032
1532	NC_006461	GGC	2	6	61163	61168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980032
1533	NC_006461	CCCACC	2	12	61177	61188	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	55980032
1534	NC_006461	CGC	2	6	61191	61196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980032
1535	NC_006461	GCC	2	6	61207	61212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980032
1536	NC_006461	GGGC	2	8	61277	61284	0 %	0 %	75 %	25 %	55980032
1537	NC_006461	C	6	6	61301	61306	0 %	0 %	0 %	100 %	55980032
1538	NC_006461	CTC	3	9	61326	61334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980032
1539	NC_006461	AGG	2	6	61354	61359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980032
1540	NC_006461	CCA	2	6	61400	61405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980032
1541	NC_006461	G	6	6	61473	61478	0 %	0 %	100 %	0 %	55980032
1542	NC_006461	G	7	7	61482	61488	0 %	0 %	100 %	0 %	55980032
1543	NC_006461	G	6	6	61514	61519	0 %	0 %	100 %	0 %	55980032
1544	NC_006461	GCC	2	6	61534	61539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980032
1545	NC_006461	TCC	2	6	61558	61563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980032
1546	NC_006461	TGGCG	2	10	61598	61607	0 %	20 %	60 %	20 %	55980032
1547	NC_006461	AGGG	2	8	61615	61622	25 %	0 %	75 %	0 %	55980032
1548	NC_006461	C	6	6	61626	61631	0 %	0 %	0 %	100 %	55980032
1549	NC_006461	CAC	3	9	61638	61646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980032
1550	NC_006461	C	6	6	61661	61666	0 %	0 %	0 %	100 %	55980032
1551	NC_006461	CGC	2	6	61684	61689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980032
1552	NC_006461	CCT	2	6	61697	61702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980032
1553	NC_006461	CTCC	2	8	61703	61710	0 %	25 %	0 %	75 %	55980032
1554	NC_006461	AGGG	2	8	61718	61725	25 %	0 %	75 %	0 %	55980032
1555	NC_006461	GGT	2	6	61849	61854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980033
1556	NC_006461	CTC	2	6	61859	61864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1557	NC_006461	CCT	2	6	61867	61872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1558	NC_006461	C	7	7	61890	61896	0 %	0 %	0 %	100 %	55980033
1559	NC_006461	CTC	4	12	61928	61939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1560	NC_006461	TCC	2	6	61941	61946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1561	NC_006461	TC	3	6	61947	61952	0 %	50 %	0 %	50 %	55980033
1562	NC_006461	TCC	2	6	61975	61980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1563	NC_006461	TCC	2	6	61986	61991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1564	NC_006461	CCT	3	9	62002	62010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1565	NC_006461	GGTGGG	2	12	62011	62022	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	55980033
1566	NC_006461	CTC	2	6	62075	62080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1567	NC_006461	GGGGGC	2	12	62083	62094	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	55980033
1568	NC_006461	CTC	2	6	62123	62128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1569	NC_006461	CTC	2	6	62132	62137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1570	NC_006461	TCGG	2	8	62202	62209	0 %	25 %	50 %	25 %	55980033
1571	NC_006461	CCT	2	6	62254	62259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1572	NC_006461	CTCC	2	8	62266	62273	0 %	25 %	0 %	75 %	55980033
1573	NC_006461	CCT	4	12	62290	62301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1574	NC_006461	GCCC	2	8	62335	62342	0 %	0 %	25 %	75 %	55980033
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1579	NC_006461	CCT	4	12	62590	62601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1580	NC_006461	TGG	2	6	62616	62621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980033
1581	NC_006461	TCC	2	6	62631	62636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1582	NC_006461	GCC	2	6	62804	62809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980033
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1584	NC_006461	CTC	2	6	62825	62830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980033
1585	NC_006461	CGC	2	6	62875	62880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980034
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1588	NC_006461	C	7	7	62956	62962	0 %	0 %	0 %	100 %	55980034
1589	NC_006461	C	6	6	62966	62971	0 %	0 %	0 %	100 %	55980034
1590	NC_006461	CGGG	2	8	62982	62989	0 %	0 %	75 %	25 %	55980034
1591	NC_006461	G	6	6	62993	62998	0 %	0 %	100 %	0 %	55980034
1592	NC_006461	GGC	2	6	63011	63016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980034
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1598	NC_006461	CTGCGC	2	12	63188	63199	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980034
1599	NC_006461	CGGG	2	8	63202	63209	0 %	0 %	75 %	25 %	55980034
1600	NC_006461	GCG	2	6	63223	63228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980034
1601	NC_006461	C	6	6	63264	63269	0 %	0 %	0 %	100 %	55980034
1602	NC_006461	CGAGGA	2	12	63286	63297	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55980034
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1604	NC_006461	G	7	7	63365	63371	0 %	0 %	100 %	0 %	55980034
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1608	NC_006461	CTC	2	6	63477	63482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980034
1609	NC_006461	AGG	2	6	63568	63573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980035
1610	NC_006461	TTC	2	6	63594	63599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980035
1611	NC_006461	GCC	2	6	63600	63605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980035
1612	NC_006461	GCCCTG	2	12	63663	63674	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980035
1613	NC_006461	G	6	6	63680	63685	0 %	0 %	100 %	0 %	55980035
1614	NC_006461	GTG	2	6	63705	63710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980035
1615	NC_006461	CTC	2	6	63750	63755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980035
1616	NC_006461	TCC	2	6	63775	63780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980035
1617	NC_006461	CGCCGT	2	12	63785	63796	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980035
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1619	NC_006461	CAGACC	2	12	63919	63930	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	55980036
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1621	NC_006461	G	7	7	63984	63990	0 %	0 %	100 %	0 %	55980036
1622	NC_006461	GGA	2	6	64031	64036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980036
1623	NC_006461	CCA	2	6	64040	64045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980036
1624	NC_006461	TCC	2	6	64075	64080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980036
1625	NC_006461	GTA	2	6	64134	64139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980036
1626	NC_006461	CCA	2	6	64160	64165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980036
1627	NC_006461	GAG	2	6	64182	64187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980036
1628	NC_006461	CCA	2	6	64211	64216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980036
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1630	NC_006461	GGA	2	6	64250	64255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980036
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