MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006461	CAC	2	6	234408	234413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980210
6002	NC_006461	CCA	2	6	234434	234439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980210
6003	NC_006461	GGA	2	6	234455	234460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980210
6004	NC_006461	TCC	3	9	234463	234471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980210
6005	NC_006461	AGG	2	6	234487	234492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980210
6006	NC_006461	ACC	2	6	234496	234501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980210
6007	NC_006461	CCT	2	6	234503	234508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980210
6008	NC_006461	GC	3	6	234516	234521	0 %	0 %	50 %	50 %	55980210
6009	NC_006461	TCC	3	9	234526	234534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980210
6010	NC_006461	CCA	2	6	234753	234758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980211
6011	NC_006461	CCCG	2	8	234938	234945	0 %	0 %	25 %	75 %	55980211
6012	NC_006461	GGTGAG	2	12	234955	234966	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55980211
6013	NC_006461	TCCGC	2	10	235005	235014	0 %	20 %	20 %	60 %	55980211
6014	NC_006461	AGG	2	6	235097	235102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980211
6015	NC_006461	CCA	2	6	235131	235136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980211
6016	NC_006461	AGG	2	6	235172	235177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980211
6017	NC_006461	GCG	3	9	235301	235309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980212
6018	NC_006461	CCT	2	6	235432	235437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980212
6019	NC_006461	TTC	2	6	235452	235457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980212
6020	NC_006461	CTC	3	9	235474	235482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980213
6021	NC_006461	CGG	2	6	235483	235488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980213
6022	NC_006461	CCACC	2	10	235515	235524	20 %	0 %	0 %	80 %	55980213
6023	NC_006461	CCG	2	6	235550	235555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980213
6024	NC_006461	CGC	2	6	235623	235628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980213
6025	NC_006461	CGG	2	6	235695	235700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980213
6026	NC_006461	CTC	2	6	235750	235755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980213
6027	NC_006461	GGC	2	6	235764	235769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980213
6028	NC_006461	G	6	6	235812	235817	0 %	0 %	100 %	0 %	55980213
6029	NC_006461	GCG	2	6	235874	235879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980213
6030	NC_006461	TCC	2	6	235904	235909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980213
6031	NC_006461	GTC	2	6	235927	235932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980213
6032	NC_006461	GCTC	2	8	235965	235972	0 %	25 %	25 %	50 %	55980213
6033	NC_006461	CCCT	2	8	235982	235989	0 %	25 %	0 %	75 %	55980213
6034	NC_006461	GGC	2	6	236010	236015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980213
6035	NC_006461	GGC	2	6	236070	236075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980213
6036	NC_006461	GGT	2	6	236091	236096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980213
6037	NC_006461	C	7	7	236115	236121	0 %	0 %	0 %	100 %	55980213
6038	NC_006461	CCG	2	6	236178	236183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980213
6039	NC_006461	CCGG	2	8	236199	236206	0 %	0 %	50 %	50 %	55980213
6040	NC_006461	CAC	2	6	236296	236301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980214
6041	NC_006461	GGC	2	6	236427	236432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980214
6042	NC_006461	CTC	2	6	236443	236448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980214
6043	NC_006461	GAT	2	6	236491	236496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980214
6044	NC_006461	TGG	3	9	236871	236879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980215
6045	NC_006461	CGGAG	2	10	236889	236898	20 %	0 %	60 %	20 %	55980215
6046	NC_006461	TGT	2	6	236958	236963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980215
6047	NC_006461	CGG	2	6	236977	236982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980215
6048	NC_006461	CCGCC	2	10	237043	237052	0 %	0 %	20 %	80 %	55980215
6049	NC_006461	GAT	2	6	237064	237069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980215
6050	NC_006461	TTGGGG	2	12	237101	237112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980215
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6052	NC_006461	CCA	2	6	237180	237185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980215
6053	NC_006461	TCCA	2	8	237197	237204	25 %	25 %	0 %	50 %	55980215
6054	NC_006461	TCT	2	6	237216	237221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980215
6055	NC_006461	GAT	2	6	237223	237228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980215
6056	NC_006461	CTC	2	6	237229	237234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980215
6057	NC_006461	GCC	2	6	237235	237240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980215
6058	NC_006461	CCT	2	6	237258	237263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980215
6059	NC_006461	CCT	2	6	237267	237272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980215
6060	NC_006461	TCT	2	6	237276	237281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980215
6061	NC_006461	GCG	2	6	237364	237369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980215
6062	NC_006461	GGC	2	6	237445	237450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980215
6063	NC_006461	TTG	2	6	237470	237475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980215
6064	NC_006461	AGG	2	6	237491	237496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980215
6065	NC_006461	CAC	2	6	237545	237550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980216
6066	NC_006461	ATC	2	6	237582	237587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980216
6067	NC_006461	GCG	2	6	237591	237596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980216
6068	NC_006461	GGT	2	6	237608	237613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980216
6069	NC_006461	TCT	2	6	237628	237633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980216
6070	NC_006461	CCGG	2	8	237683	237690	0 %	0 %	50 %	50 %	55980216
6071	NC_006461	CGGG	2	8	237742	237749	0 %	0 %	75 %	25 %	55980216
6072	NC_006461	TGGCCG	2	12	237823	237834	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980216
6073	NC_006461	ATG	2	6	237858	237863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980216
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6078	NC_006461	TGACCT	2	12	238070	238081	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55980217
6079	NC_006461	CCT	2	6	238190	238195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980217
6080	NC_006461	TCG	2	6	238237	238242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980217
6081	NC_006461	CCCCG	2	10	238266	238275	0 %	0 %	20 %	80 %	55980217
6082	NC_006461	CAC	2	6	238305	238310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980217
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6090	NC_006461	TTGGCC	2	12	238498	238509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980217
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6096	NC_006461	GCG	2	6	238846	238851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980219
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6101	NC_006461	A	7	7	239159	239165	100 %	0 %	0 %	0 %	55980220
6102	NC_006461	CTC	2	6	239184	239189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980220
6103	NC_006461	CTT	2	6	239190	239195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980220
6104	NC_006461	GCG	2	6	239228	239233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980220
6105	NC_006461	CCT	2	6	239273	239278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980220
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6108	NC_006461	TCC	2	6	239485	239490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980220
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6110	NC_006461	CCA	2	6	239714	239719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980220
6111	NC_006461	GTC	2	6	239736	239741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980220
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6113	NC_006461	CTC	2	6	239997	240002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980220
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6122	NC_006461	GGC	2	6	240846	240851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980221
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6124	NC_006461	GGA	2	6	240931	240936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980221
6125	NC_006461	GGA	2	6	240982	240987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980221
6126	NC_006461	GTG	2	6	241091	241096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980221
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6128	NC_006461	TCC	2	6	241158	241163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980221
6129	NC_006461	CT	3	6	241171	241176	0 %	50 %	0 %	50 %	55980221
6130	NC_006461	TCC	2	6	241177	241182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980221
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6132	NC_006461	GAG	2	6	241457	241462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980221
6133	NC_006461	TCC	2	6	241476	241481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980221
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6141	NC_006461	ATC	2	6	241700	241705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980221
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6143	NC_006461	C	7	7	241711	241717	0 %	0 %	0 %	100 %	55980221
6144	NC_006461	GGC	2	6	241772	241777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980221
6145	NC_006461	TGGTCC	2	12	241836	241847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980221
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6154	NC_006461	CCT	2	6	242135	242140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980222
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6243	NC_006461	GCTTCC	2	12	245330	245341	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55980226
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6249	NC_006461	GCC	2	6	245478	245483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980227
6250	NC_006461	CTC	3	9	245484	245492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980227
6251	NC_006461	AGG	2	6	245494	245499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980227
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6253	NC_006461	ATG	2	6	245523	245528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980227
6254	NC_006461	GCT	2	6	245590	245595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980227
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6281	NC_006461	G	6	6	246763	246768	0 %	0 %	100 %	0 %	55980228
6282	NC_006461	GACG	2	8	246770	246777	25 %	0 %	50 %	25 %	55980228
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6372	NC_006461	CAG	3	9	250212	250220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980231
6373	NC_006461	GCC	2	6	250253	250258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980231
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6490	NC_006461	CCTCC	2	10	254266	254275	0 %	20 %	0 %	80 %	55980236
6491	NC_006461	C	6	6	254274	254279	0 %	0 %	0 %	100 %	55980236
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6493	NC_006461	CCAG	2	8	254301	254308	25 %	0 %	25 %	50 %	55980236
6494	NC_006461	C	6	6	254331	254336	0 %	0 %	0 %	100 %	55980236
6495	NC_006461	CCT	2	6	254352	254357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980236
6496	NC_006461	C	6	6	254465	254470	0 %	0 %	0 %	100 %	55980236
6497	NC_006461	CCT	2	6	254541	254546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980236
6498	NC_006461	TCC	2	6	254552	254557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980236
6499	NC_006461	GCG	2	6	254558	254563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980236
6500	NC_006461	G	6	6	254618	254623	0 %	0 %	100 %	0 %	55980236

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