MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006461	GGA	2	6	214316	214321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980187
5502	NC_006461	AGG	2	6	214378	214383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980187
5503	NC_006461	ACACC	2	10	214388	214397	40 %	0 %	0 %	60 %	55980187
5504	NC_006461	TCC	2	6	214429	214434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980187
5505	NC_006461	CCTTGG	2	12	214450	214461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980187
5506	NC_006461	GGA	2	6	214490	214495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980187
5507	NC_006461	C	7	7	214523	214529	0 %	0 %	0 %	100 %	55980187
5508	NC_006461	CCGGG	2	10	214570	214579	0 %	0 %	60 %	40 %	55980188
5509	NC_006461	GCC	2	6	214587	214592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980188
5510	NC_006461	GGA	2	6	214600	214605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980188
5511	NC_006461	GCGGGT	2	12	214621	214632	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55980188
5512	NC_006461	ACC	3	9	214757	214765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980188
5513	NC_006461	CCT	2	6	214801	214806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980188
5514	NC_006461	GCC	2	6	214836	214841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980188
5515	NC_006461	TCC	2	6	214866	214871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980188
5516	NC_006461	ACG	2	6	214878	214883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980188
5517	NC_006461	CACC	2	8	214891	214898	25 %	0 %	0 %	75 %	55980188
5518	NC_006461	CACC	2	8	214903	214910	25 %	0 %	0 %	75 %	55980188
5519	NC_006461	G	7	7	214951	214957	0 %	0 %	100 %	0 %	55980188
5520	NC_006461	AGG	2	6	214968	214973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980188
5521	NC_006461	CTC	2	6	214985	214990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980188
5522	NC_006461	CCCG	2	8	215015	215022	0 %	0 %	25 %	75 %	55980188
5523	NC_006461	GCC	2	6	215034	215039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980188
5524	NC_006461	G	7	7	215048	215054	0 %	0 %	100 %	0 %	55980188
5525	NC_006461	GTCCTC	2	12	215057	215068	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55980188
5526	NC_006461	GCG	2	6	215092	215097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980188
5527	NC_006461	GCG	2	6	215125	215130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980188
5528	NC_006461	CCT	2	6	215131	215136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980188
5529	NC_006461	C	7	7	215173	215179	0 %	0 %	0 %	100 %	55980188
5530	NC_006461	GAGG	2	8	215203	215210	25 %	0 %	75 %	0 %	55980188
5531	NC_006461	CTC	2	6	215219	215224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980188
5532	NC_006461	AAG	2	6	215299	215304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980189
5533	NC_006461	GGA	2	6	215310	215315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980189
5534	NC_006461	G	8	8	215319	215326	0 %	0 %	100 %	0 %	55980189
5535	NC_006461	GTG	2	6	215539	215544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980189
5536	NC_006461	TCCG	2	8	215614	215621	0 %	25 %	25 %	50 %	55980189
5537	NC_006461	GCC	2	6	215626	215631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980189
5538	NC_006461	CTC	2	6	215632	215637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980189
5539	NC_006461	GCC	3	9	215648	215656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980189
5540	NC_006461	CTACGG	2	12	215709	215720	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55980189
5541	NC_006461	TCA	2	6	215756	215761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980189
5542	NC_006461	GGA	3	9	215775	215783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980189
5543	NC_006461	TCC	2	6	215824	215829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980190
5544	NC_006461	CCA	2	6	215848	215853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980190
5545	NC_006461	CTC	2	6	215895	215900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980190
5546	NC_006461	CTC	3	9	215991	215999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980190
5547	NC_006461	CCT	3	9	216080	216088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980190
5548	NC_006461	CCT	2	6	216119	216124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980190
5549	NC_006461	CGGA	2	8	216180	216187	25 %	0 %	50 %	25 %	55980190
5550	NC_006461	CTT	2	6	216194	216199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980190
5551	NC_006461	TGG	2	6	216226	216231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980190
5552	NC_006461	TCC	2	6	216256	216261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980190
5553	NC_006461	AGG	2	6	216289	216294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980190
5554	NC_006461	TCC	2	6	216295	216300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980190
5555	NC_006461	GTG	2	6	216372	216377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980190
5556	NC_006461	CCTGA	2	10	216443	216452	20 %	20 %	20 %	40 %	55980190
5557	NC_006461	CAT	2	6	216563	216568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980191
5558	NC_006461	CGA	2	6	216584	216589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980191
5559	NC_006461	GGGCAA	2	12	216590	216601	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55980191
5560	NC_006461	GGT	2	6	216602	216607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980191
5561	NC_006461	GTG	2	6	216675	216680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980191
5562	NC_006461	CCT	2	6	216707	216712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980191
5563	NC_006461	AGG	3	9	216787	216795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980191
5564	NC_006461	AGG	2	6	216811	216816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980191
5565	NC_006461	TCC	2	6	216859	216864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980191
5566	NC_006461	CAC	2	6	216867	216872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980191
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5568	NC_006461	CAC	2	6	216905	216910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980191
5569	NC_006461	AAG	2	6	216947	216952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980191
5570	NC_006461	GCC	2	6	217009	217014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980191
5571	NC_006461	GGA	2	6	217061	217066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980191
5572	NC_006461	CCT	2	6	217133	217138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980191
5573	NC_006461	CCT	2	6	217166	217171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980191
5574	NC_006461	CTG	2	6	217194	217199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980191
5575	NC_006461	TCCCA	2	10	217236	217245	20 %	20 %	0 %	60 %	55980191
5576	NC_006461	G	7	7	217250	217256	0 %	0 %	100 %	0 %	55980191
5577	NC_006461	TGG	2	6	217261	217266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980191
5578	NC_006461	CAC	2	6	217377	217382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980191
5579	NC_006461	GCG	2	6	217396	217401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980191
5580	NC_006461	CAC	3	9	217409	217417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980191
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5582	NC_006461	GCTG	2	8	217438	217445	0 %	25 %	50 %	25 %	55980191
5583	NC_006461	TGG	2	6	217450	217455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980191
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5585	NC_006461	GCCC	2	8	217566	217573	0 %	0 %	25 %	75 %	55980191
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5588	NC_006461	GGA	2	6	217691	217696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980191
5589	NC_006461	GGA	2	6	217742	217747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980191
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5591	NC_006461	GGCCCA	2	12	217858	217869	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980192
5592	NC_006461	TCC	2	6	217970	217975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980192
5593	NC_006461	CCT	2	6	218028	218033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980192
5594	NC_006461	CCT	2	6	218037	218042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980192
5595	NC_006461	CTC	2	6	218083	218088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980192
5596	NC_006461	GGC	2	6	218089	218094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980192
5597	NC_006461	GC	3	6	218099	218104	0 %	0 %	50 %	50 %	55980192
5598	NC_006461	GAC	2	6	218239	218244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980192
5599	NC_006461	GAC	2	6	218299	218304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980192
5600	NC_006461	TCT	2	6	218331	218336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980192
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5602	NC_006461	CTC	2	6	218452	218457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980192
5603	NC_006461	CGGG	2	8	218511	218518	0 %	0 %	75 %	25 %	55980192
5604	NC_006461	CGTAGG	2	12	218535	218546	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55980192
5605	NC_006461	GGCGG	2	10	218688	218697	0 %	0 %	80 %	20 %	55980193
5606	NC_006461	CAT	2	6	218700	218705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980193
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5608	NC_006461	AGG	2	6	218828	218833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980193
5609	NC_006461	GTG	2	6	219040	219045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980193
5610	NC_006461	C	6	6	219070	219075	0 %	0 %	0 %	100 %	55980193
5611	NC_006461	TCT	2	6	219104	219109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980193
5612	NC_006461	GTC	2	6	219127	219132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980193
5613	NC_006461	GGT	2	6	219210	219215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980193
5614	NC_006461	GTGGAG	2	12	219220	219231	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55980193
5615	NC_006461	TGG	2	6	219235	219240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980193
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5620	NC_006461	GTG	2	6	219322	219327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980193
5621	NC_006461	GTG	3	9	219349	219357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980193
5622	NC_006461	GGT	2	6	219372	219377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980193
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5624	NC_006461	GAG	2	6	219427	219432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980193
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5996	NC_006461	ACC	2	6	234136	234141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980210
5997	NC_006461	GAAGG	2	10	234150	234159	40 %	0 %	60 %	0 %	55980210
5998	NC_006461	CCA	2	6	234236	234241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980210
5999	NC_006461	ACC	2	6	234265	234270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980210
6000	NC_006461	GAG	2	6	234288	234293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980210

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