MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006461	TCC	2	6	196337	196342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980169
5002	NC_006461	TCC	3	9	196442	196450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980169
5003	NC_006461	CTC	2	6	196456	196461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980169
5004	NC_006461	G	6	6	196537	196542	0 %	0 %	100 %	0 %	55980169
5005	NC_006461	CCT	2	6	196548	196553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980169
5006	NC_006461	G	6	6	196557	196562	0 %	0 %	100 %	0 %	55980169
5007	NC_006461	CCA	2	6	196569	196574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980169
5008	NC_006461	TGG	3	9	196691	196699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980169
5009	NC_006461	GGA	2	6	196737	196742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980169
5010	NC_006461	TGA	2	6	196769	196774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980169
5011	NC_006461	CCGC	2	8	196781	196788	0 %	0 %	25 %	75 %	55980169
5012	NC_006461	CCT	2	6	196800	196805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980169
5013	NC_006461	TAC	2	6	196858	196863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980169
5014	NC_006461	GGCCC	2	10	196902	196911	0 %	0 %	40 %	60 %	55980169
5015	NC_006461	GAG	2	6	196981	196986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980169
5016	NC_006461	CCT	2	6	196998	197003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980169
5017	NC_006461	ACC	2	6	197012	197017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980169
5018	NC_006461	TCC	2	6	197090	197095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980169
5019	NC_006461	C	6	6	197124	197129	0 %	0 %	0 %	100 %	55980169
5020	NC_006461	TCC	2	6	197174	197179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980169
5021	NC_006461	C	7	7	197183	197189	0 %	0 %	0 %	100 %	55980169
5022	NC_006461	ACC	2	6	197209	197214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980169
5023	NC_006461	TGG	2	6	197234	197239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980169
5024	NC_006461	CTC	2	6	197263	197268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980169
5025	NC_006461	CGGGA	2	10	197302	197311	20 %	0 %	60 %	20 %	55980169
5026	NC_006461	GGA	2	6	197339	197344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980169
5027	NC_006461	GGT	2	6	197388	197393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980169
5028	NC_006461	TGG	2	6	197407	197412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980169
5029	NC_006461	ACC	2	6	197444	197449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980169
5030	NC_006461	TCCAC	2	10	197492	197501	20 %	20 %	0 %	60 %	55980169
5031	NC_006461	GTGGAG	2	12	197506	197517	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55980169
5032	NC_006461	CTC	2	6	197586	197591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980170
5033	NC_006461	AGG	2	6	197596	197601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980170
5034	NC_006461	GGA	2	6	197624	197629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980170
5035	NC_006461	GCC	2	6	197668	197673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980170
5036	NC_006461	GGA	2	6	197678	197683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980170
5037	NC_006461	GGCG	2	8	197705	197712	0 %	0 %	75 %	25 %	55980170
5038	NC_006461	GCCC	2	8	197725	197732	0 %	0 %	25 %	75 %	55980170
5039	NC_006461	GAG	2	6	197736	197741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980170
5040	NC_006461	GGCG	2	8	197759	197766	0 %	0 %	75 %	25 %	55980170
5041	NC_006461	CTC	2	6	197841	197846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980170
5042	NC_006461	CCA	3	9	197867	197875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980170
5043	NC_006461	AGG	2	6	197890	197895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980170
5044	NC_006461	GCG	2	6	197929	197934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980170
5045	NC_006461	GGTGCA	2	12	197937	197948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55980170
5046	NC_006461	GCAGGG	2	12	197976	197987	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980170
5047	NC_006461	GCC	2	6	197995	198000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980170
5048	NC_006461	AGG	2	6	198004	198009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980170
5049	NC_006461	GCGG	2	8	198012	198019	0 %	0 %	75 %	25 %	55980170
5050	NC_006461	GCCCGG	2	12	198034	198045	0 %	0 %	50 %	50 %	55980170
5051	NC_006461	CAC	2	6	198054	198059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980170
5052	NC_006461	TCC	2	6	198064	198069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980170
5053	NC_006461	C	6	6	198134	198139	0 %	0 %	0 %	100 %	55980170
5054	NC_006461	GTG	2	6	198210	198215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980170
5055	NC_006461	CGG	2	6	198266	198271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980170
5056	NC_006461	CCT	2	6	198296	198301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980170
5057	NC_006461	GAG	2	6	198318	198323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980170
5058	NC_006461	GCC	2	6	198332	198337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980170
5059	NC_006461	GAG	2	6	198378	198383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980170
5060	NC_006461	GTG	2	6	198384	198389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980170
5061	NC_006461	CGG	2	6	198398	198403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980170
5062	NC_006461	TGGCCT	2	12	198422	198433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980170
5063	NC_006461	CCT	2	6	198479	198484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980170
5064	NC_006461	CGGGC	2	10	198485	198494	0 %	0 %	60 %	40 %	55980170
5065	NC_006461	CCT	2	6	198506	198511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980170
5066	NC_006461	CCA	2	6	198572	198577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980170
5067	NC_006461	GCC	2	6	198580	198585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980170
5068	NC_006461	AGG	2	6	198607	198612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980170
5069	NC_006461	CTT	2	6	198615	198620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980170
5070	NC_006461	CCAAG	2	10	198683	198692	40 %	0 %	20 %	40 %	55980170
5071	NC_006461	CAC	2	6	198732	198737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980170
5072	NC_006461	GAG	2	6	198750	198755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980170
5073	NC_006461	CCT	2	6	198788	198793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980170
5074	NC_006461	CCG	2	6	198803	198808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980170
5075	NC_006461	CAC	3	9	198819	198827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980170
5076	NC_006461	GCC	2	6	198865	198870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980170
5077	NC_006461	TCC	2	6	198889	198894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980170
5078	NC_006461	CCA	2	6	198914	198919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980170
5079	NC_006461	GC	3	6	199106	199111	0 %	0 %	50 %	50 %	55980171
5080	NC_006461	GCGCC	2	10	199138	199147	0 %	0 %	40 %	60 %	55980171
5081	NC_006461	GGA	2	6	199150	199155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980171
5082	NC_006461	CCT	2	6	199165	199170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980171
5083	NC_006461	CCG	2	6	199171	199176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980171
5084	NC_006461	GAG	2	6	199217	199222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980171
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5086	NC_006461	CAC	2	6	199279	199284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980171
5087	NC_006461	GCG	2	6	199325	199330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980171
5088	NC_006461	ACT	2	6	199341	199346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980171
5089	NC_006461	AGG	2	6	199395	199400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980171
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5091	NC_006461	C	6	6	199458	199463	0 %	0 %	0 %	100 %	55980171
5092	NC_006461	CCG	2	6	199485	199490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980171
5093	NC_006461	CTC	2	6	199580	199585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980171
5094	NC_006461	GGC	2	6	199658	199663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980171
5095	NC_006461	GTG	2	6	199727	199732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980171
5096	NC_006461	TAC	2	6	199763	199768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980171
5097	NC_006461	TGG	2	6	199833	199838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980171
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5099	NC_006461	CCT	2	6	199873	199878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980171
5100	NC_006461	CTT	2	6	199946	199951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980171
5101	NC_006461	GCA	2	6	200008	200013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980171
5102	NC_006461	CCT	2	6	200056	200061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980171
5103	NC_006461	CCTCC	2	10	200099	200108	0 %	20 %	0 %	80 %	55980171
5104	NC_006461	C	7	7	200110	200116	0 %	0 %	0 %	100 %	55980171
5105	NC_006461	C	7	7	200126	200132	0 %	0 %	0 %	100 %	55980171
5106	NC_006461	GGA	2	6	200185	200190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980171
5107	NC_006461	AGG	4	12	200225	200236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980172
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5109	NC_006461	AGG	2	6	200303	200308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980172
5110	NC_006461	GGT	2	6	200341	200346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980172
5111	NC_006461	CCA	2	6	200355	200360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980172
5112	NC_006461	GGGTGA	2	12	200388	200399	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55980172
5113	NC_006461	GAA	2	6	200416	200421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980172
5114	NC_006461	GAG	2	6	200425	200430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980172
5115	NC_006461	AGG	3	9	200456	200464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980172
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5118	NC_006461	CGAGG	2	10	200494	200503	20 %	0 %	60 %	20 %	55980172
5119	NC_006461	C	6	6	200567	200572	0 %	0 %	0 %	100 %	55980172
5120	NC_006461	AGAGGA	2	12	200577	200588	50 %	0 %	50 %	0 %	55980172
5121	NC_006461	GGT	2	6	200619	200624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980172
5122	NC_006461	GGCGAA	2	12	200671	200682	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55980172
5123	NC_006461	GGA	2	6	200700	200705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980172
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5125	NC_006461	C	7	7	200749	200755	0 %	0 %	0 %	100 %	55980172
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5251	NC_006461	GGC	2	6	204479	204484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980176
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5360	NC_006461	GAG	2	6	208917	208922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980182
5361	NC_006461	G	6	6	208937	208942	0 %	0 %	100 %	0 %	55980182
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5373	NC_006461	CCA	2	6	209519	209524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980182
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5375	NC_006461	CCG	2	6	209788	209793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980183
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5441	NC_006461	CGT	2	6	212144	212149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980185
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5481	NC_006461	GAGGT	2	10	213666	213675	20 %	20 %	60 %	0 %	55980186
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5490	NC_006461	GGGGC	2	10	214095	214104	0 %	0 %	80 %	20 %	55980187
5491	NC_006461	CGC	2	6	214118	214123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980187
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5493	NC_006461	CTT	2	6	214155	214160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980187
5494	NC_006461	GGC	2	6	214184	214189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980187
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5496	NC_006461	CTC	2	6	214218	214223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980187
5497	NC_006461	GGCCAA	2	12	214232	214243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980187
5498	NC_006461	ACC	2	6	214246	214251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980187
5499	NC_006461	TCC	2	6	214252	214257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980187
5500	NC_006461	GAG	2	6	214278	214283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980187

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