MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 5427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005838	G	6	6	56143	56148	0 %	0 %	100 %	0 %	46255132
1502	NC_005838	GTGG	2	8	56150	56157	0 %	25 %	75 %	0 %	46255132
1503	NC_005838	CTC	2	6	56250	56255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255132
1504	NC_005838	TCC	2	6	56275	56280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255132
1505	NC_005838	TGGG	2	8	56310	56317	0 %	25 %	75 %	0 %	46255132
1506	NC_005838	TCC	2	6	56327	56332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255132
1507	NC_005838	G	7	7	56357	56363	0 %	0 %	100 %	0 %	46255132
1508	NC_005838	CTC	2	6	56385	56390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255132
1509	NC_005838	ACCC	2	8	56397	56404	25 %	0 %	0 %	75 %	46255132
1510	NC_005838	GGA	2	6	56456	56461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255132
1511	NC_005838	GCT	2	6	56483	56488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255132
1512	NC_005838	CTT	3	9	56506	56514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255133
1513	NC_005838	TCTTCC	2	12	56520	56531	0 %	50 %	0 %	50 %	46255133
1514	NC_005838	TCC	3	9	56529	56537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1515	NC_005838	CTC	2	6	56552	56557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1516	NC_005838	CCT	2	6	56563	56568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1517	NC_005838	GCCCC	2	10	56587	56596	0 %	0 %	20 %	80 %	46255133
1518	NC_005838	CCTC	2	8	56616	56623	0 %	25 %	0 %	75 %	46255133
1519	NC_005838	CTC	2	6	56675	56680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1520	NC_005838	GAC	2	6	56711	56716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255133
1521	NC_005838	GGC	2	6	56752	56757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255133
1522	NC_005838	ACC	2	6	56763	56768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255133
1523	NC_005838	CCT	2	6	56779	56784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1524	NC_005838	C	7	7	56793	56799	0 %	0 %	0 %	100 %	46255133
1525	NC_005838	GAA	2	6	56818	56823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255133
1526	NC_005838	AGG	2	6	56847	56852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255133
1527	NC_005838	G	6	6	56856	56861	0 %	0 %	100 %	0 %	46255133
1528	NC_005838	GGTCTT	2	12	56863	56874	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	46255133
1529	NC_005838	CCGACG	2	12	56877	56888	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46255133
1530	NC_005838	GAG	2	6	56897	56902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255133
1531	NC_005838	CGG	2	6	56911	56916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255133
1532	NC_005838	AGG	2	6	56967	56972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255133
1533	NC_005838	AGGG	2	8	56981	56988	25 %	0 %	75 %	0 %	46255133
1534	NC_005838	TGG	2	6	56994	56999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255133
1535	NC_005838	TGA	2	6	57006	57011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255133
1536	NC_005838	TC	3	6	57019	57024	0 %	50 %	0 %	50 %	46255133
1537	NC_005838	TCC	2	6	57027	57032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1538	NC_005838	GGC	2	6	57091	57096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255133
1539	NC_005838	G	6	6	57110	57115	0 %	0 %	100 %	0 %	46255133
1540	NC_005838	GGA	2	6	57142	57147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255133
1541	NC_005838	TGGCCC	2	12	57150	57161	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46255133
1542	NC_005838	G	6	6	57194	57199	0 %	0 %	100 %	0 %	46255133
1543	NC_005838	GAA	2	6	57253	57258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255133
1544	NC_005838	GAA	2	6	57277	57282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255133
1545	NC_005838	TCC	2	6	57291	57296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1546	NC_005838	ACC	2	6	57312	57317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255133
1547	NC_005838	CCCTG	2	10	57330	57339	0 %	20 %	20 %	60 %	46255133
1548	NC_005838	TTC	2	6	57341	57346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255133
1549	NC_005838	G	6	6	57407	57412	0 %	0 %	100 %	0 %	46255133
1550	NC_005838	GCCC	2	8	57421	57428	0 %	0 %	25 %	75 %	46255133
1551	NC_005838	C	6	6	57444	57449	0 %	0 %	0 %	100 %	46255133
1552	NC_005838	TCC	3	9	57453	57461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1553	NC_005838	CCT	2	6	57469	57474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1554	NC_005838	CTC	2	6	57479	57484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1555	NC_005838	GA	3	6	57645	57650	50 %	0 %	50 %	0 %	46255134
1556	NC_005838	C	6	6	57728	57733	0 %	0 %	0 %	100 %	46255134
1557	NC_005838	C	6	6	57752	57757	0 %	0 %	0 %	100 %	46255134
1558	NC_005838	CCA	2	6	57769	57774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255134
1559	NC_005838	CCT	2	6	57829	57834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255134
1560	NC_005838	CGCCCC	2	12	57844	57855	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	46255134
1561	NC_005838	C	6	6	57895	57900	0 %	0 %	0 %	100 %	46255134
1562	NC_005838	CCT	2	6	57904	57909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255134
1563	NC_005838	AGG	2	6	57950	57955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255134
1564	NC_005838	C	7	7	57973	57979	0 %	0 %	0 %	100 %	46255134
1565	NC_005838	CAC	2	6	58010	58015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255134
1566	NC_005838	GCC	2	6	58036	58041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255134
1567	NC_005838	CG	3	6	58074	58079	0 %	0 %	50 %	50 %	46255134
1568	NC_005838	CGC	2	6	58092	58097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255134
1569	NC_005838	CCT	2	6	58099	58104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255134
1570	NC_005838	CGA	2	6	58110	58115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255134
1571	NC_005838	GTG	2	6	58155	58160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255134
1572	NC_005838	G	7	7	58174	58180	0 %	0 %	100 %	0 %	46255134
1573	NC_005838	GCC	2	6	58186	58191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255134
1574	NC_005838	AGG	2	6	58282	58287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255134
1575	NC_005838	CCT	2	6	58532	58537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255135
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1577	NC_005838	GA	4	8	58581	58588	50 %	0 %	50 %	0 %	46255135
1578	NC_005838	TCC	2	6	58599	58604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255135
1579	NC_005838	GCAAG	2	10	58613	58622	40 %	0 %	40 %	20 %	46255135
1580	NC_005838	GGT	2	6	58656	58661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255135
1581	NC_005838	TCC	2	6	58694	58699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255135
1582	NC_005838	AAG	2	6	58708	58713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255135
1583	NC_005838	GGT	3	9	58716	58724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255135
1584	NC_005838	C	6	6	58789	58794	0 %	0 %	0 %	100 %	46255135
1585	NC_005838	GAG	2	6	58810	58815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255135
1586	NC_005838	GCG	2	6	58910	58915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255136
1587	NC_005838	GGT	2	6	58928	58933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255136
1588	NC_005838	GAGG	2	8	59144	59151	25 %	0 %	75 %	0 %	46255136
1589	NC_005838	CT	3	6	59160	59165	0 %	50 %	0 %	50 %	46255136
1590	NC_005838	GGC	2	6	59183	59188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255136
1591	NC_005838	GAG	2	6	59232	59237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255136
1592	NC_005838	TG	3	6	59328	59333	0 %	50 %	50 %	0 %	46255137
1593	NC_005838	CTC	2	6	59371	59376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255137
1594	NC_005838	AGG	2	6	59409	59414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255137
1595	NC_005838	CT	3	6	59416	59421	0 %	50 %	0 %	50 %	46255137
1596	NC_005838	CGC	2	6	59436	59441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255137
1597	NC_005838	GGTCCT	2	12	59454	59465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255137
1598	NC_005838	C	7	7	59553	59559	0 %	0 %	0 %	100 %	46255137
1599	NC_005838	GGA	2	6	59565	59570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255137
1600	NC_005838	GAG	2	6	59620	59625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255137
1601	NC_005838	GAC	2	6	59722	59727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255137
1602	NC_005838	GGA	2	6	59766	59771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255137
1603	NC_005838	CCG	2	6	59784	59789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255137
1604	NC_005838	CCT	2	6	59859	59864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255137
1605	NC_005838	CCT	2	6	59868	59873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255137
1606	NC_005838	CCT	2	6	59889	59894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255137
1607	NC_005838	TCT	2	6	59966	59971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255137
1608	NC_005838	CTC	2	6	59983	59988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255137
1609	NC_005838	GCCC	2	8	60012	60019	0 %	0 %	25 %	75 %	46255137
1610	NC_005838	GCG	2	6	60045	60050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255137
1611	NC_005838	G	6	6	60053	60058	0 %	0 %	100 %	0 %	46255137
1612	NC_005838	G	7	7	60072	60078	0 %	0 %	100 %	0 %	46255137
1613	NC_005838	GGA	2	6	60114	60119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255137
1614	NC_005838	GCG	2	6	60174	60179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255137
1615	NC_005838	TCC	2	6	60194	60199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255137
1616	NC_005838	CTC	2	6	60268	60273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255137
1617	NC_005838	G	6	6	60368	60373	0 %	0 %	100 %	0 %	46255137
1618	NC_005838	CAC	2	6	60394	60399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255137
1619	NC_005838	TCT	2	6	60443	60448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255137
1620	NC_005838	TCC	2	6	60458	60463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255137
1621	NC_005838	ACCTCC	2	12	60482	60493	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	46255137
1622	NC_005838	C	8	8	60518	60525	0 %	0 %	0 %	100 %	46255137
1623	NC_005838	CAC	2	6	60529	60534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255137
1624	NC_005838	GCC	2	6	60535	60540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255137
1625	NC_005838	TCA	2	6	60683	60688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255137
1626	NC_005838	ACT	2	6	60695	60700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255137
1627	NC_005838	CCT	2	6	60767	60772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255137
1628	NC_005838	TGG	2	6	60815	60820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255137
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1630	NC_005838	GGAAGC	2	12	60961	60972	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46255138
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