MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 5427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005838	GAG	2	6	38490	38495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255113
1002	NC_005838	TGGCC	2	10	38545	38554	0 %	20 %	40 %	40 %	46255113
1003	NC_005838	TCC	2	6	38560	38565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255113
1004	NC_005838	TGG	2	6	38617	38622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255113
1005	NC_005838	GGA	2	6	38690	38695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255113
1006	NC_005838	CGCCTT	2	12	38723	38734	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	46255113
1007	NC_005838	CTT	2	6	38783	38788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255113
1008	NC_005838	CGC	2	6	38882	38887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255113
1009	NC_005838	CCA	2	6	38888	38893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255113
1010	NC_005838	CCT	3	9	38894	38902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255113
1011	NC_005838	CTT	2	6	39032	39037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255113
1012	NC_005838	C	6	6	39086	39091	0 %	0 %	0 %	100 %	46255113
1013	NC_005838	ACT	2	6	39157	39162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255113
1014	NC_005838	CGGGGA	2	12	39184	39195	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46255113
1015	NC_005838	CGGCCA	2	12	39229	39240	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46255113
1016	NC_005838	CAC	2	6	39270	39275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255113
1017	NC_005838	GCC	2	6	39333	39338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255113
1018	NC_005838	GTG	2	6	39366	39371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255113
1019	NC_005838	GCC	2	6	39414	39419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255113
1020	NC_005838	GAA	2	6	39432	39437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255113
1021	NC_005838	CTA	2	6	39521	39526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255113
1022	NC_005838	CCAG	2	8	39538	39545	25 %	0 %	25 %	50 %	46255113
1023	NC_005838	CG	3	6	39590	39595	0 %	0 %	50 %	50 %	46255113
1024	NC_005838	AAG	2	6	39642	39647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255114
1025	NC_005838	CCG	2	6	39677	39682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255114
1026	NC_005838	CGG	2	6	39694	39699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255114
1027	NC_005838	GCTCC	2	10	39728	39737	0 %	20 %	20 %	60 %	46255114
1028	NC_005838	CAC	2	6	39773	39778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255114
1029	NC_005838	GGAG	2	8	39823	39830	25 %	0 %	75 %	0 %	46255114
1030	NC_005838	AGG	2	6	39831	39836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255114
1031	NC_005838	CGC	2	6	39845	39850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255114
1032	NC_005838	AGG	2	6	39922	39927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255114
1033	NC_005838	CCGC	2	8	39931	39938	0 %	0 %	25 %	75 %	46255114
1034	NC_005838	TCC	2	6	39954	39959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255114
1035	NC_005838	TCC	2	6	39963	39968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255114
1036	NC_005838	GCC	2	6	40087	40092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255114
1037	NC_005838	CCA	2	6	40102	40107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255114
1038	NC_005838	GAG	2	6	40193	40198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255114
1039	NC_005838	C	6	6	40202	40207	0 %	0 %	0 %	100 %	46255114
1040	NC_005838	GAG	2	6	40235	40240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255114
1041	NC_005838	GTT	2	6	40277	40282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46255114
1042	NC_005838	CCT	2	6	40333	40338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255114
1043	NC_005838	C	6	6	40354	40359	0 %	0 %	0 %	100 %	46255114
1044	NC_005838	GAG	2	6	40367	40372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255114
1045	NC_005838	ACC	2	6	40404	40409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255114
1046	NC_005838	C	6	6	40418	40423	0 %	0 %	0 %	100 %	46255114
1047	NC_005838	GCC	2	6	40442	40447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255114
1048	NC_005838	GC	4	8	40465	40472	0 %	0 %	50 %	50 %	46255114
1049	NC_005838	GGCCC	2	10	40478	40487	0 %	0 %	40 %	60 %	46255114
1050	NC_005838	CGC	2	6	40502	40507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255114
1051	NC_005838	A	7	7	40509	40515	100 %	0 %	0 %	0 %	46255114
1052	NC_005838	GTTCTG	2	12	40732	40743	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	46255115
1053	NC_005838	GGCC	2	8	40752	40759	0 %	0 %	50 %	50 %	46255115
1054	NC_005838	AGG	2	6	40868	40873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255115
1055	NC_005838	CGC	2	6	40896	40901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255115
1056	NC_005838	GGT	2	6	40917	40922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255115
1057	NC_005838	CTA	2	6	40983	40988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255115
1058	NC_005838	GCC	2	6	40996	41001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255115
1059	NC_005838	CCT	2	6	41043	41048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255115
1060	NC_005838	CTT	2	6	41055	41060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255115
1061	NC_005838	CGGG	2	8	41065	41072	0 %	0 %	75 %	25 %	46255115
1062	NC_005838	GGT	2	6	41088	41093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255115
1063	NC_005838	CGG	2	6	41114	41119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255115
1064	NC_005838	GGC	2	6	41137	41142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255115
1065	NC_005838	CCTTC	2	10	41160	41169	0 %	40 %	0 %	60 %	46255115
1066	NC_005838	CCG	2	6	41198	41203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255115
1067	NC_005838	GCG	2	6	41227	41232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255115
1068	NC_005838	AAGG	2	8	41317	41324	50 %	0 %	50 %	0 %	46255115
1069	NC_005838	GTG	2	6	41344	41349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255115
1070	NC_005838	C	6	6	41390	41395	0 %	0 %	0 %	100 %	46255116
1071	NC_005838	CTT	2	6	41424	41429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255116
1072	NC_005838	CTC	2	6	41441	41446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255116
1073	NC_005838	CTC	2	6	41471	41476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255116
1074	NC_005838	G	6	6	41518	41523	0 %	0 %	100 %	0 %	46255116
1075	NC_005838	CCTGGC	2	12	41560	41571	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46255116
1076	NC_005838	CCTC	2	8	41578	41585	0 %	25 %	0 %	75 %	46255116
1077	NC_005838	GCC	2	6	41591	41596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255116
1078	NC_005838	CCT	2	6	41629	41634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255116
1079	NC_005838	G	6	6	41639	41644	0 %	0 %	100 %	0 %	46255116
1080	NC_005838	CTC	2	6	41672	41677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255116
1081	NC_005838	CTC	2	6	41687	41692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255116
1082	NC_005838	TGG	2	6	41763	41768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255116
1083	NC_005838	GCC	2	6	41811	41816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255116
1084	NC_005838	CCT	2	6	41827	41832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255116
1085	NC_005838	GAGG	2	8	41929	41936	25 %	0 %	75 %	0 %	46255116
1086	NC_005838	TCC	2	6	41946	41951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255116
1087	NC_005838	G	6	6	41957	41962	0 %	0 %	100 %	0 %	46255116
1088	NC_005838	CCT	4	12	41974	41985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255116
1089	NC_005838	CTC	2	6	42032	42037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255116
1090	NC_005838	CCT	2	6	42040	42045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255116
1091	NC_005838	GGGC	2	8	42051	42058	0 %	0 %	75 %	25 %	46255116
1092	NC_005838	CTC	2	6	42154	42159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255117
1093	NC_005838	CCCCG	2	10	42243	42252	0 %	0 %	20 %	80 %	46255117
1094	NC_005838	CTC	3	9	42265	42273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255117
1095	NC_005838	CTT	2	6	42286	42291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255117
1096	NC_005838	CCT	2	6	42312	42317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255117
1097	NC_005838	GGCG	2	8	42371	42378	0 %	0 %	75 %	25 %	46255117
1098	NC_005838	GGA	2	6	42387	42392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255117
1099	NC_005838	CCG	2	6	42393	42398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255117
1100	NC_005838	TCC	2	6	42404	42409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255117
1101	NC_005838	GGA	2	6	42411	42416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255117
1102	NC_005838	CTA	2	6	42426	42431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255117
1103	NC_005838	GCCCTC	2	12	42436	42447	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46255117
1104	NC_005838	C	6	6	42458	42463	0 %	0 %	0 %	100 %	46255117
1105	NC_005838	GGACCT	2	12	42495	42506	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46255117
1106	NC_005838	GGC	2	6	42516	42521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255117
1107	NC_005838	GGGCCC	2	12	42524	42535	0 %	0 %	50 %	50 %	46255117
1108	NC_005838	GGC	2	6	42564	42569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255117
1109	NC_005838	CTC	2	6	42589	42594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255117
1110	NC_005838	TCC	2	6	42620	42625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255117
1111	NC_005838	GTG	2	6	42643	42648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255117
1112	NC_005838	GGA	2	6	42657	42662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255117
1113	NC_005838	GGC	2	6	42695	42700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255117
1114	NC_005838	TCC	2	6	42719	42724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255117
1115	NC_005838	G	6	6	42725	42730	0 %	0 %	100 %	0 %	46255117
1116	NC_005838	GAG	2	6	42820	42825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255117
1117	NC_005838	CTC	2	6	42871	42876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255117
1118	NC_005838	GAC	3	9	42883	42891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255117
1119	NC_005838	GCGGG	2	10	42922	42931	0 %	0 %	80 %	20 %	46255117
1120	NC_005838	AGGG	2	8	42940	42947	25 %	0 %	75 %	0 %	46255117
1121	NC_005838	CCT	2	6	42954	42959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255117
1122	NC_005838	CCT	2	6	42963	42968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255117
1123	NC_005838	GGC	2	6	42974	42979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255117
1124	NC_005838	GGGC	2	8	43004	43011	0 %	0 %	75 %	25 %	46255117
1125	NC_005838	CTC	2	6	43117	43122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255117
1126	NC_005838	G	7	7	43131	43137	0 %	0 %	100 %	0 %	46255117
1127	NC_005838	TCC	2	6	43148	43153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255117
1128	NC_005838	GCCCT	2	10	43171	43180	0 %	20 %	20 %	60 %	46255117
1129	NC_005838	CGGG	2	8	43203	43210	0 %	0 %	75 %	25 %	46255117
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