MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 5427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005838	CTA	2	6	17182	17187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255093
502	NC_005838	CAA	2	6	17245	17250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46255093
503	NC_005838	CCT	2	6	17284	17289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255093
504	NC_005838	C	6	6	17292	17297	0 %	0 %	0 %	100 %	46255093
505	NC_005838	TCC	2	6	17361	17366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255093
506	NC_005838	CTGG	2	8	17395	17402	0 %	25 %	50 %	25 %	46255093
507	NC_005838	CCT	2	6	17437	17442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255093
508	NC_005838	GGA	2	6	17617	17622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255093
509	NC_005838	CTC	3	9	17636	17644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255093
510	NC_005838	GGA	2	6	17650	17655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255093
511	NC_005838	CCT	2	6	17944	17949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
512	NC_005838	CCT	2	6	17959	17964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
513	NC_005838	GCC	2	6	17993	17998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255094
514	NC_005838	GTG	2	6	18035	18040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255094
515	NC_005838	CGGGG	2	10	18041	18050	0 %	0 %	80 %	20 %	46255094
516	NC_005838	GGC	2	6	18082	18087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255094
517	NC_005838	GGT	3	9	18154	18162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255094
518	NC_005838	GGAA	2	8	18201	18208	50 %	0 %	50 %	0 %	46255094
519	NC_005838	AGG	2	6	18209	18214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255094
520	NC_005838	CCT	2	6	18253	18258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
521	NC_005838	CCT	2	6	18271	18276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
522	NC_005838	TGG	2	6	18372	18377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255094
523	NC_005838	CCT	2	6	18427	18432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
524	NC_005838	CAA	2	6	18469	18474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46255094
525	NC_005838	G	6	6	18480	18485	0 %	0 %	100 %	0 %	46255094
526	NC_005838	CTC	2	6	18515	18520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
527	NC_005838	CCCTCC	2	12	18552	18563	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	46255094
528	NC_005838	GAG	2	6	18581	18586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255094
529	NC_005838	CCG	2	6	18609	18614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255094
530	NC_005838	CTC	2	6	18635	18640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
531	NC_005838	CGC	2	6	18652	18657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255094
532	NC_005838	GGT	2	6	18697	18702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255094
533	NC_005838	GAG	2	6	18719	18724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255094
534	NC_005838	TCC	2	6	18747	18752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
535	NC_005838	GCC	2	6	18759	18764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255094
536	NC_005838	TCC	2	6	18798	18803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
537	NC_005838	CCT	2	6	18880	18885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
538	NC_005838	GAG	2	6	18890	18895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255094
539	NC_005838	GGA	2	6	18901	18906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255094
540	NC_005838	CGGCCT	2	12	18922	18933	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46255094
541	NC_005838	CCA	2	6	19054	19059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255094
542	NC_005838	CCA	2	6	19081	19086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255094
543	NC_005838	GGAA	2	8	19087	19094	50 %	0 %	50 %	0 %	46255094
544	NC_005838	CCT	2	6	19096	19101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
545	NC_005838	CCT	2	6	19120	19125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
546	NC_005838	CGG	2	6	19156	19161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255094
547	NC_005838	GGA	2	6	19177	19182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255094
548	NC_005838	CCG	2	6	19281	19286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255094
549	NC_005838	C	6	6	19325	19330	0 %	0 %	0 %	100 %	46255094
550	NC_005838	TCC	3	9	19338	19346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
551	NC_005838	GGGCG	2	10	19348	19357	0 %	0 %	80 %	20 %	46255094
552	NC_005838	CCG	2	6	19419	19424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255094
553	NC_005838	GAG	2	6	19436	19441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255094
554	NC_005838	CCG	2	6	19456	19461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255094
555	NC_005838	CCA	2	6	19462	19467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255094
556	NC_005838	GGA	2	6	19468	19473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255094
557	NC_005838	C	7	7	19477	19483	0 %	0 %	0 %	100 %	46255094
558	NC_005838	GGA	2	6	19498	19503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255094
559	NC_005838	CCACC	2	10	19540	19549	20 %	0 %	0 %	80 %	46255094
560	NC_005838	GTG	3	9	19550	19558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255094
561	NC_005838	GAGGC	2	10	19616	19625	20 %	0 %	60 %	20 %	46255094
562	NC_005838	GGA	2	6	19642	19647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255094
563	NC_005838	TGGGGA	2	12	19683	19694	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	46255094
564	NC_005838	CGCC	2	8	19714	19721	0 %	0 %	25 %	75 %	46255094
565	NC_005838	CCT	2	6	19732	19737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
566	NC_005838	GGC	2	6	19765	19770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255094
567	NC_005838	AGG	2	6	19773	19778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255094
568	NC_005838	CCT	2	6	19783	19788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255094
569	NC_005838	GGCGG	2	10	19792	19801	0 %	0 %	80 %	20 %	46255094
570	NC_005838	GGCCT	2	10	19940	19949	0 %	20 %	40 %	40 %	46255095
571	NC_005838	CCT	3	9	19965	19973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255095
572	NC_005838	TCA	2	6	19977	19982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255095
573	NC_005838	AGG	2	6	20084	20089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255095
574	NC_005838	GTCG	2	8	20139	20146	0 %	25 %	50 %	25 %	46255095
575	NC_005838	CCAGG	2	10	20176	20185	20 %	0 %	40 %	40 %	46255095
576	NC_005838	CAC	2	6	20251	20256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255095
577	NC_005838	AGG	2	6	20384	20389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255095
578	NC_005838	C	6	6	20437	20442	0 %	0 %	0 %	100 %	46255095
579	NC_005838	GAG	2	6	20473	20478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255095
580	NC_005838	GAG	2	6	20509	20514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255095
581	NC_005838	CCG	2	6	20529	20534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255095
582	NC_005838	CGT	2	6	20562	20567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255095
583	NC_005838	GGC	2	6	20629	20634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255095
584	NC_005838	GCG	2	6	20695	20700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255095
585	NC_005838	CTC	2	6	20770	20775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255095
586	NC_005838	CAC	2	6	20785	20790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255095
587	NC_005838	GGC	2	6	20803	20808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255095
588	NC_005838	GGC	2	6	20812	20817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255095
589	NC_005838	C	6	6	20870	20875	0 %	0 %	0 %	100 %	46255095
590	NC_005838	TCCTC	2	10	20916	20925	0 %	40 %	0 %	60 %	46255095
591	NC_005838	GGT	4	12	20980	20991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255095
592	NC_005838	GAA	2	6	21031	21036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255095
593	NC_005838	G	6	6	21045	21050	0 %	0 %	100 %	0 %	46255095
594	NC_005838	C	6	6	21073	21078	0 %	0 %	0 %	100 %	46255095
595	NC_005838	TGA	2	6	21159	21164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255095
596	NC_005838	GAG	2	6	21184	21189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255095
597	NC_005838	GCC	2	6	21216	21221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255095
598	NC_005838	TCC	2	6	21251	21256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255095
599	NC_005838	CGT	2	6	21267	21272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255095
600	NC_005838	AGACGA	2	12	21273	21284	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	46255095
601	NC_005838	AAGG	2	8	21308	21315	50 %	0 %	50 %	0 %	46255095
602	NC_005838	AGG	2	6	21353	21358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255095
603	NC_005838	GGA	2	6	21554	21559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255096
604	NC_005838	TCC	2	6	21583	21588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255096
605	NC_005838	TCCACG	2	12	21604	21615	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	46255096
606	NC_005838	G	6	6	21615	21620	0 %	0 %	100 %	0 %	46255096
607	NC_005838	AGG	2	6	21646	21651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255096
608	NC_005838	CAC	2	6	21689	21694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255096
609	NC_005838	CCT	2	6	21698	21703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255096
610	NC_005838	CCA	2	6	21706	21711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255096
611	NC_005838	GGA	2	6	21728	21733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255096
612	NC_005838	CTC	2	6	21786	21791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255096
613	NC_005838	GGA	2	6	21878	21883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255096
614	NC_005838	CCT	2	6	21884	21889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255096
615	NC_005838	GTG	2	6	21909	21914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255096
616	NC_005838	CCT	2	6	21956	21961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255096
617	NC_005838	CCG	2	6	21997	22002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255096
618	NC_005838	GAG	2	6	22011	22016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255096
619	NC_005838	CACC	2	8	22052	22059	25 %	0 %	0 %	75 %	46255096
620	NC_005838	C	6	6	22075	22080	0 %	0 %	0 %	100 %	46255096
621	NC_005838	CCA	2	6	22082	22087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255096
622	NC_005838	CGC	2	6	22169	22174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255096
623	NC_005838	CGG	2	6	22234	22239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255096
624	NC_005838	CCA	2	6	22271	22276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255096
625	NC_005838	G	6	6	22288	22293	0 %	0 %	100 %	0 %	46255096
626	NC_005838	TGG	2	6	22360	22365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255096
627	NC_005838	GGA	2	6	22382	22387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255096
628	NC_005838	GGC	2	6	22388	22393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255096
629	NC_005838	CCCG	2	8	22413	22420	0 %	0 %	25 %	75 %	46255096
630	NC_005838	G	6	6	22441	22446	0 %	0 %	100 %	0 %	46255096
631	NC_005838	GCGG	2	8	22463	22470	0 %	0 %	75 %	25 %	46255096
632	NC_005838	G	6	6	22517	22522	0 %	0 %	100 %	0 %	46255096
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747	NC_005838	CGC	2	6	28618	28623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255102
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753	NC_005838	CCT	2	6	28977	28982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255103
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756	NC_005838	GGC	2	6	29070	29075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255103
757	NC_005838	GAGCGC	2	12	29139	29150	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46255103
758	NC_005838	CCT	2	6	29157	29162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255103
759	NC_005838	CTC	2	6	29167	29172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255103
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761	NC_005838	CTC	2	6	29241	29246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255104
762	NC_005838	CTT	2	6	29247	29252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255104
763	NC_005838	GTG	2	6	29265	29270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255104
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766	NC_005838	TCT	2	6	29296	29301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255104
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770	NC_005838	GCGGG	2	10	29474	29483	0 %	0 %	80 %	20 %	46255104
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