MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 5427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_005838	GCGG	2	8	189825	189832	0 %	0 %	75 %	25 %	46255264
4502	NC_005838	TGG	2	6	189863	189868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255264
4503	NC_005838	GGT	2	6	189960	189965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255264
4504	NC_005838	CGG	2	6	190088	190093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255265
4505	NC_005838	CCCG	2	8	190197	190204	0 %	0 %	25 %	75 %	46255265
4506	NC_005838	GTG	2	6	190230	190235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255265
4507	NC_005838	GGAG	2	8	190238	190245	25 %	0 %	75 %	0 %	46255265
4508	NC_005838	GAG	3	9	190243	190251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255265
4509	NC_005838	CGG	2	6	190254	190259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255265
4510	NC_005838	TGG	3	9	190276	190284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255265
4511	NC_005838	TCC	2	6	190293	190298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255265
4512	NC_005838	GGC	2	6	190337	190342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255265
4513	NC_005838	G	6	6	190490	190495	0 %	0 %	100 %	0 %	46255265
4514	NC_005838	GAG	2	6	190518	190523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255265
4515	NC_005838	GTG	3	9	190581	190589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255265
4516	NC_005838	TCC	2	6	190609	190614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255265
4517	NC_005838	TCC	2	6	190639	190644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255265
4518	NC_005838	GGC	3	9	190745	190753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255265
4519	NC_005838	TCC	2	6	190795	190800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255265
4520	NC_005838	CCT	2	6	190808	190813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255265
4521	NC_005838	GCG	2	6	190866	190871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255265
4522	NC_005838	GGT	2	6	190916	190921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255265
4523	NC_005838	AGG	2	6	190966	190971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255265
4524	NC_005838	TGG	3	9	191002	191010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255265
4525	NC_005838	CGG	3	9	191011	191019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255265
4526	NC_005838	CGGG	2	8	191027	191034	0 %	0 %	75 %	25 %	46255265
4527	NC_005838	ACT	2	6	191044	191049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255265
4528	NC_005838	G	6	6	191065	191070	0 %	0 %	100 %	0 %	46255265
4529	NC_005838	CCT	2	6	191110	191115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255265
4530	NC_005838	C	6	6	191131	191136	0 %	0 %	0 %	100 %	46255265
4531	NC_005838	G	7	7	191148	191154	0 %	0 %	100 %	0 %	46255265
4532	NC_005838	G	6	6	191186	191191	0 %	0 %	100 %	0 %	46255265
4533	NC_005838	CCT	2	6	191198	191203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255265
4534	NC_005838	GGC	2	6	191219	191224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255265
4535	NC_005838	C	6	6	191224	191229	0 %	0 %	0 %	100 %	46255265
4536	NC_005838	CGG	2	6	191236	191241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255265
4537	NC_005838	CCT	2	6	191249	191254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255265
4538	NC_005838	G	6	6	191263	191268	0 %	0 %	100 %	0 %	46255265
4539	NC_005838	CTC	2	6	191298	191303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255265
4540	NC_005838	GGAGG	2	10	191324	191333	20 %	0 %	80 %	0 %	46255265
4541	NC_005838	CGC	2	6	191348	191353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255265
4542	NC_005838	G	6	6	191369	191374	0 %	0 %	100 %	0 %	46255265
4543	NC_005838	GCC	2	6	191398	191403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255265
4544	NC_005838	GAG	2	6	191421	191426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255265
4545	NC_005838	GGC	2	6	191477	191482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255265
4546	NC_005838	G	6	6	191487	191492	0 %	0 %	100 %	0 %	46255265
4547	NC_005838	GCC	2	6	191496	191501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255265
4548	NC_005838	CGG	2	6	191614	191619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255265
4549	NC_005838	CCCG	2	8	191640	191647	0 %	0 %	25 %	75 %	46255265
4550	NC_005838	GGT	2	6	191648	191653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255265
4551	NC_005838	GAGG	2	8	191670	191677	25 %	0 %	75 %	0 %	46255265
4552	NC_005838	G	6	6	191709	191714	0 %	0 %	100 %	0 %	46255265
4553	NC_005838	CCT	2	6	191753	191758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255265
4554	NC_005838	GGGACG	2	12	191773	191784	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46255265
4555	NC_005838	GGA	2	6	191798	191803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255265
4556	NC_005838	G	6	6	191809	191814	0 %	0 %	100 %	0 %	46255265
4557	NC_005838	G	6	6	191839	191844	0 %	0 %	100 %	0 %	46255265
4558	NC_005838	CCT	2	6	191849	191854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255265
4559	NC_005838	CGCT	2	8	192592	192599	0 %	25 %	25 %	50 %	46255266
4560	NC_005838	AAG	2	6	192677	192682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255266
4561	NC_005838	TCC	3	9	192698	192706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255266
4562	NC_005838	TTG	2	6	192707	192712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46255266
4563	NC_005838	GCC	2	6	192786	192791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255266
4564	NC_005838	AGC	2	6	192809	192814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255266
4565	NC_005838	AGG	2	6	192919	192924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255267
4566	NC_005838	GTC	2	6	193080	193085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255267
4567	NC_005838	CGG	2	6	193105	193110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255267
4568	NC_005838	GAG	2	6	193116	193121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255267
4569	NC_005838	ACC	2	6	193129	193134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255267
4570	NC_005838	CCAACG	2	12	193172	193183	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	46255267
4571	NC_005838	GGC	2	6	193187	193192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255267
4572	NC_005838	GAG	2	6	193242	193247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255267
4573	NC_005838	GAG	2	6	193269	193274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255267
4574	NC_005838	AGG	2	6	193291	193296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255267
4575	NC_005838	GCGG	2	8	193316	193323	0 %	0 %	75 %	25 %	46255267
4576	NC_005838	GCTCC	2	10	193326	193335	0 %	20 %	20 %	60 %	46255267
4577	NC_005838	CGG	2	6	193388	193393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255267
4578	NC_005838	GC	3	6	193432	193437	0 %	0 %	50 %	50 %	46255267
4579	NC_005838	GTA	2	6	193632	193637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255267
4580	NC_005838	GAG	2	6	193692	193697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255267
4581	NC_005838	ACC	2	6	193708	193713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255267
4582	NC_005838	TCC	2	6	193735	193740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255267
4583	NC_005838	CGG	2	6	193783	193788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255267
4584	NC_005838	C	6	6	193804	193809	0 %	0 %	0 %	100 %	46255267
4585	NC_005838	G	6	6	193925	193930	0 %	0 %	100 %	0 %	46255268
4586	NC_005838	G	6	6	193944	193949	0 %	0 %	100 %	0 %	46255268
4587	NC_005838	GCC	2	6	193986	193991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255268
4588	NC_005838	CGG	2	6	194031	194036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255268
4589	NC_005838	GTA	2	6	194051	194056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255268
4590	NC_005838	GGCCC	2	10	194153	194162	0 %	0 %	40 %	60 %	46255268
4591	NC_005838	C	6	6	194188	194193	0 %	0 %	0 %	100 %	46255268
4592	NC_005838	GCC	2	6	194194	194199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255268
4593	NC_005838	CCA	2	6	194212	194217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255268
4594	NC_005838	AAG	2	6	194222	194227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255268
4595	NC_005838	CTC	2	6	194261	194266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255268
4596	NC_005838	GGT	3	9	194314	194322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255268
4597	NC_005838	ACC	2	6	194376	194381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255268
4598	NC_005838	TCCCT	2	10	194642	194651	0 %	40 %	0 %	60 %	46255269
4599	NC_005838	CT	3	6	194650	194655	0 %	50 %	0 %	50 %	46255269
4600	NC_005838	CGG	2	6	194715	194720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255269
4601	NC_005838	GGA	2	6	194728	194733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255269
4602	NC_005838	AGG	2	6	194764	194769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255269
4603	NC_005838	GCC	2	6	194803	194808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255269
4604	NC_005838	CTTC	2	8	194816	194823	0 %	50 %	0 %	50 %	46255269
4605	NC_005838	CTT	2	6	194826	194831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255269
4606	NC_005838	CGC	2	6	194867	194872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255269
4607	NC_005838	GGC	2	6	194887	194892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255269
4608	NC_005838	CCT	2	6	194970	194975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255269
4609	NC_005838	GAG	2	6	195027	195032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255269
4610	NC_005838	C	6	6	195163	195168	0 %	0 %	0 %	100 %	46255269
4611	NC_005838	C	6	6	195182	195187	0 %	0 %	0 %	100 %	46255269
4612	NC_005838	GCGG	2	8	195200	195207	0 %	0 %	75 %	25 %	46255269
4613	NC_005838	GCG	2	6	195224	195229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255269
4614	NC_005838	TGG	2	6	195325	195330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255269
4615	NC_005838	CGG	2	6	195348	195353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255269
4616	NC_005838	CGC	2	6	195462	195467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255269
4617	NC_005838	CCG	2	6	195542	195547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255269
4618	NC_005838	CGC	2	6	195552	195557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255269
4619	NC_005838	CACCC	2	10	195558	195567	20 %	0 %	0 %	80 %	46255269
4620	NC_005838	GGT	2	6	195569	195574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255269
4621	NC_005838	GGA	2	6	195575	195580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255269
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4624	NC_005838	GTG	2	6	195702	195707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255269
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5000	NC_005838	GGC	2	6	217404	217409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255288

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