MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_005835	TGA	2	6	151148	151153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198478
4002	NC_005835	ACC	2	6	151183	151188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198478
4003	NC_005835	GCCCC	2	10	151219	151228	0 %	0 %	20 %	80 %	46198478
4004	NC_005835	GCCC	2	8	151296	151303	0 %	0 %	25 %	75 %	46198478
4005	NC_005835	GAT	2	6	151311	151316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198478
4006	NC_005835	CCTCCA	2	12	151364	151375	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	46198478
4007	NC_005835	GTC	2	6	151437	151442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198478
4008	NC_005835	CGG	2	6	151460	151465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198478
4009	NC_005835	CGA	2	6	151466	151471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198478
4010	NC_005835	CCGT	2	8	151477	151484	0 %	25 %	25 %	50 %	46198478
4011	NC_005835	CAC	2	6	151488	151493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198478
4012	NC_005835	CCA	2	6	151550	151555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198478
4013	NC_005835	TTG	2	6	151570	151575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46198478
4014	NC_005835	CCCG	2	8	151591	151598	0 %	0 %	25 %	75 %	46198478
4015	NC_005835	C	6	6	151705	151710	0 %	0 %	0 %	100 %	46198478
4016	NC_005835	ACC	2	6	151729	151734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198478
4017	NC_005835	CTT	2	6	151737	151742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198478
4018	NC_005835	GTA	2	6	151767	151772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198478
4019	NC_005835	CCA	2	6	151799	151804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198478
4020	NC_005835	CTT	2	6	151809	151814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198478
4021	NC_005835	CCT	2	6	151868	151873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198478
4022	NC_005835	G	6	6	151874	151879	0 %	0 %	100 %	0 %	46198478
4023	NC_005835	C	6	6	151897	151902	0 %	0 %	0 %	100 %	46198478
4024	NC_005835	CTCC	2	8	151912	151919	0 %	25 %	0 %	75 %	46198478
4025	NC_005835	TGA	2	6	151937	151942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198478
4026	NC_005835	CTC	2	6	151959	151964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198478
4027	NC_005835	CCT	2	6	151979	151984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198478
4028	NC_005835	CGG	2	6	152007	152012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198478
4029	NC_005835	CGG	2	6	152336	152341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198479
4030	NC_005835	GGA	2	6	152356	152361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198479
4031	NC_005835	CCT	2	6	152371	152376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198479
4032	NC_005835	GGC	2	6	152407	152412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198479
4033	NC_005835	GCGG	2	8	152461	152468	0 %	0 %	75 %	25 %	46198479
4034	NC_005835	TGGCCT	2	12	152562	152573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198479
4035	NC_005835	AGG	2	6	152598	152603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198479
4036	NC_005835	TCCTGG	2	12	152604	152615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198479
4037	NC_005835	GAC	3	9	152618	152626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198479
4038	NC_005835	CGC	3	9	152638	152646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198479
4039	NC_005835	GTG	2	6	152669	152674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198479
4040	NC_005835	GCGG	2	8	152713	152720	0 %	0 %	75 %	25 %	46198479
4041	NC_005835	CTT	2	6	152806	152811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198479
4042	NC_005835	GAGGGG	2	12	152876	152887	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	46198479
4043	NC_005835	TCC	2	6	152955	152960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198479
4044	NC_005835	CCTGGC	2	12	153042	153053	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198479
4045	NC_005835	GCC	2	6	153066	153071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198479
4046	NC_005835	CTC	2	6	153113	153118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198479
4047	NC_005835	CG	3	6	153139	153144	0 %	0 %	50 %	50 %	46198479
4048	NC_005835	GAG	2	6	153167	153172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198479
4049	NC_005835	CCA	2	6	153174	153179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198479
4050	NC_005835	GGGCG	2	10	153195	153204	0 %	0 %	80 %	20 %	46198480
4051	NC_005835	GAA	2	6	153208	153213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198480
4052	NC_005835	GGC	2	6	153216	153221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198480
4053	NC_005835	ACC	3	9	153248	153256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198480
4054	NC_005835	C	6	6	153283	153288	0 %	0 %	0 %	100 %	46198480
4055	NC_005835	CCA	4	12	153291	153302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198480
4056	NC_005835	TCC	2	6	153311	153316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198480
4057	NC_005835	TGG	2	6	153332	153337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198480
4058	NC_005835	CCT	2	6	153348	153353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198480
4059	NC_005835	TGGA	2	8	153419	153426	25 %	25 %	50 %	0 %	46198480
4060	NC_005835	AGG	2	6	153461	153466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198480
4061	NC_005835	GGC	2	6	153487	153492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198480
4062	NC_005835	G	6	6	153567	153572	0 %	0 %	100 %	0 %	46198480
4063	NC_005835	GCC	2	6	153713	153718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198480
4064	NC_005835	CCA	2	6	153738	153743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198480
4065	NC_005835	C	7	7	153766	153772	0 %	0 %	0 %	100 %	46198480
4066	NC_005835	G	6	6	153774	153779	0 %	0 %	100 %	0 %	46198480
4067	NC_005835	GAG	3	9	153859	153867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198480
4068	NC_005835	GAG	2	6	153901	153906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198480
4069	NC_005835	GGT	2	6	153907	153912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198480
4070	NC_005835	GAG	2	6	153913	153918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198480
4071	NC_005835	GAG	3	9	153925	153933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198480
4072	NC_005835	GGC	2	6	153955	153960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198480
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4074	NC_005835	G	6	6	153973	153978	0 %	0 %	100 %	0 %	46198480
4075	NC_005835	AGG	2	6	154037	154042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198480
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4077	NC_005835	GCCAGG	2	12	154058	154069	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198480
4078	NC_005835	GAG	2	6	154087	154092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198480
4079	NC_005835	TCC	2	6	154121	154126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198480
4080	NC_005835	CCT	2	6	154211	154216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198481
4081	NC_005835	GGA	2	6	154241	154246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198481
4082	NC_005835	CCCG	2	8	154258	154265	0 %	0 %	25 %	75 %	46198481
4083	NC_005835	CCCT	2	8	154270	154277	0 %	25 %	0 %	75 %	46198481
4084	NC_005835	CGC	2	6	154303	154308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198481
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4089	NC_005835	ACC	2	6	154537	154542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198481
4090	NC_005835	G	6	6	154547	154552	0 %	0 %	100 %	0 %	46198481
4091	NC_005835	GCC	2	6	154570	154575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198481
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4094	NC_005835	CCA	2	6	154838	154843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198481
4095	NC_005835	CCT	2	6	154847	154852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198481
4096	NC_005835	CGG	2	6	154877	154882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198481
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4098	NC_005835	CTCC	2	8	154951	154958	0 %	25 %	0 %	75 %	46198481
4099	NC_005835	G	6	6	154999	155004	0 %	0 %	100 %	0 %	46198481
4100	NC_005835	TCC	3	9	155005	155013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198481
4101	NC_005835	AGG	2	6	155014	155019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198481
4102	NC_005835	GAG	2	6	155022	155027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198481
4103	NC_005835	GAG	3	9	155052	155060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198481
4104	NC_005835	CTC	2	6	155109	155114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198481
4105	NC_005835	GTA	2	6	155124	155129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198481
4106	NC_005835	AGG	3	9	155161	155169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198481
4107	NC_005835	CTCCC	2	10	155190	155199	0 %	20 %	0 %	80 %	46198481
4108	NC_005835	ACC	2	6	155206	155211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198481
4109	NC_005835	C	6	6	155226	155231	0 %	0 %	0 %	100 %	46198481
4110	NC_005835	GAG	2	6	155263	155268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198481
4111	NC_005835	GCG	2	6	155271	155276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198481
4112	NC_005835	CTC	2	6	155277	155282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198481
4113	NC_005835	GAG	2	6	155307	155312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198481
4114	NC_005835	G	6	6	155318	155323	0 %	0 %	100 %	0 %	46198481
4115	NC_005835	CGGGG	2	10	155346	155355	0 %	0 %	80 %	20 %	46198481
4116	NC_005835	CCT	2	6	155360	155365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198481
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4119	NC_005835	CCTC	2	8	155516	155523	0 %	25 %	0 %	75 %	46198482
4120	NC_005835	AGG	2	6	155558	155563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198482
4121	NC_005835	GGGCGC	2	12	155610	155621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198482
4122	NC_005835	CCA	2	6	155643	155648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198482
4123	NC_005835	TCC	2	6	155714	155719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198482
4124	NC_005835	CAT	2	6	155722	155727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198482
4125	NC_005835	CTC	3	9	155746	155754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198482
4126	NC_005835	G	6	6	155823	155828	0 %	0 %	100 %	0 %	46198482
4127	NC_005835	CCT	2	6	155841	155846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198482
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4131	NC_005835	GGC	2	6	155949	155954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198482
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4249	NC_005835	GTG	2	6	160661	160666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198485
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4265	NC_005835	CTC	2	6	161271	161276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198486
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4357	NC_005835	TGGACC	2	12	164907	164918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198491
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4359	NC_005835	ACT	2	6	164967	164972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198491
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4364	NC_005835	CAAGGT	2	12	165127	165138	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46198491
4365	NC_005835	CAT	2	6	165142	165147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198491
4366	NC_005835	GTG	2	6	165230	165235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198491
4367	NC_005835	CTC	2	6	165275	165280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198491
4368	NC_005835	AAG	2	6	165427	165432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161611246
4369	NC_005835	GCGGA	2	10	165559	165568	20 %	0 %	60 %	20 %	161611246
4370	NC_005835	CTC	3	9	165574	165582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161611246
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4499	NC_005835	CCG	2	6	169654	169659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198498
4500	NC_005835	TTG	2	6	169680	169685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46198498

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