MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005835	GGA	2	6	131572	131577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198456
3502	NC_005835	TGG	2	6	131601	131606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198456
3503	NC_005835	GAG	2	6	131693	131698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198456
3504	NC_005835	GTG	2	6	131729	131734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198456
3505	NC_005835	AAG	2	6	131735	131740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198456
3506	NC_005835	AGG	2	6	131760	131765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198456
3507	NC_005835	CT	3	6	131846	131851	0 %	50 %	0 %	50 %	46198456
3508	NC_005835	GCG	2	6	131880	131885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198456
3509	NC_005835	CTG	2	6	131897	131902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198456
3510	NC_005835	GGA	2	6	131929	131934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198456
3511	NC_005835	CGC	2	6	131983	131988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198456
3512	NC_005835	CCCCT	2	10	131996	132005	0 %	20 %	0 %	80 %	46198456
3513	NC_005835	TCG	2	6	132111	132116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198457
3514	NC_005835	GTG	2	6	132185	132190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198457
3515	NC_005835	GTG	2	6	132212	132217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198457
3516	NC_005835	AGG	2	6	132402	132407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198457
3517	NC_005835	GGA	3	9	132557	132565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198458
3518	NC_005835	GGC	2	6	132593	132598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198458
3519	NC_005835	GGA	2	6	132605	132610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198458
3520	NC_005835	GGA	2	6	132689	132694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198458
3521	NC_005835	CGC	2	6	132707	132712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198458
3522	NC_005835	G	7	7	132747	132753	0 %	0 %	100 %	0 %	46198458
3523	NC_005835	GAG	2	6	132755	132760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198458
3524	NC_005835	CCA	2	6	132761	132766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198458
3525	NC_005835	C	7	7	132770	132776	0 %	0 %	0 %	100 %	46198458
3526	NC_005835	ACG	2	6	132928	132933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198458
3527	NC_005835	TCC	2	6	132958	132963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198458
3528	NC_005835	GGA	2	6	132982	132987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198458
3529	NC_005835	CG	3	6	133026	133031	0 %	0 %	50 %	50 %	46198458
3530	NC_005835	G	6	6	133088	133093	0 %	0 %	100 %	0 %	46198458
3531	NC_005835	C	6	6	133099	133104	0 %	0 %	0 %	100 %	46198458
3532	NC_005835	GAG	2	6	133119	133124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198458
3533	NC_005835	GGT	3	9	133133	133141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198458
3534	NC_005835	CTT	2	6	133154	133159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198458
3535	NC_005835	GGA	2	6	133169	133174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198458
3536	NC_005835	GCC	2	6	133194	133199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198458
3537	NC_005835	CGTGGC	2	12	133220	133231	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198458
3538	NC_005835	CGG	2	6	133328	133333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198458
3539	NC_005835	CCA	2	6	133354	133359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198458
3540	NC_005835	CGTGGA	2	12	133406	133417	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46198458
3541	NC_005835	GCCAAG	2	12	133473	133484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198458
3542	NC_005835	CAC	2	6	133493	133498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198458
3543	NC_005835	CTC	2	6	133611	133616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198458
3544	NC_005835	CTT	2	6	133655	133660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198458
3545	NC_005835	GCG	2	6	133703	133708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198458
3546	NC_005835	CGC	2	6	133781	133786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198458
3547	NC_005835	GAG	3	9	133800	133808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198458
3548	NC_005835	CCT	2	6	133811	133816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198458
3549	NC_005835	AGG	2	6	133837	133842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198458
3550	NC_005835	GGAAG	2	10	133881	133890	40 %	0 %	60 %	0 %	46198459
3551	NC_005835	GGA	2	6	133927	133932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198459
3552	NC_005835	CCCGC	2	10	133963	133972	0 %	0 %	20 %	80 %	46198459
3553	NC_005835	CGC	2	6	134024	134029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198459
3554	NC_005835	ACC	2	6	134045	134050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198459
3555	NC_005835	GAG	2	6	134099	134104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198459
3556	NC_005835	GCG	2	6	134105	134110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198459
3557	NC_005835	CGC	2	6	134236	134241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198459
3558	NC_005835	ATC	2	6	134273	134278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198459
3559	NC_005835	G	6	6	134298	134303	0 %	0 %	100 %	0 %	46198459
3560	NC_005835	CGG	2	6	134315	134320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198459
3561	NC_005835	TGGTCC	2	12	134322	134333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198459
3562	NC_005835	CCGCCA	2	12	134358	134369	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	46198459
3563	NC_005835	GCC	2	6	134462	134467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198459
3564	NC_005835	AGG	2	6	134538	134543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198459
3565	NC_005835	CTA	2	6	134557	134562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198459
3566	NC_005835	CAT	2	6	134584	134589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198459
3567	NC_005835	CGG	2	6	134665	134670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198459
3568	NC_005835	GGGC	2	8	134671	134678	0 %	0 %	75 %	25 %	46198459
3569	NC_005835	TGG	2	6	134736	134741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198459
3570	NC_005835	GAG	2	6	134750	134755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198459
3571	NC_005835	GGGCCT	2	12	134835	134846	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198459
3572	NC_005835	AAG	2	6	134876	134881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198459
3573	NC_005835	CTC	2	6	134924	134929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198459
3574	NC_005835	ACG	2	6	134955	134960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198459
3575	NC_005835	C	7	7	134990	134996	0 %	0 %	0 %	100 %	46198459
3576	NC_005835	C	7	7	135049	135055	0 %	0 %	0 %	100 %	46198459
3577	NC_005835	AGG	2	6	135081	135086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198459
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3579	NC_005835	AAG	2	6	135164	135169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198459
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3581	NC_005835	CAC	2	6	135319	135324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198460
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3584	NC_005835	CAT	2	6	135400	135405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198460
3585	NC_005835	GAT	2	6	135442	135447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198460
3586	NC_005835	CAT	2	6	135580	135585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198460
3587	NC_005835	CAG	2	6	135712	135717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198460
3588	NC_005835	CCAA	2	8	135723	135730	50 %	0 %	0 %	50 %	46198460
3589	NC_005835	CTT	2	6	135736	135741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198460
3590	NC_005835	CCAGGA	2	12	135820	135831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198461
3591	NC_005835	GCC	3	9	135846	135854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198461
3592	NC_005835	AGG	3	9	135906	135914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198461
3593	NC_005835	CCT	2	6	135937	135942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198461
3594	NC_005835	CGG	2	6	135965	135970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198461
3595	NC_005835	AGG	2	6	135987	135992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198461
3596	NC_005835	GAG	2	6	135995	136000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198461
3597	NC_005835	GAG	2	6	136052	136057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198461
3598	NC_005835	GCC	2	6	136059	136064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198461
3599	NC_005835	GCCAGG	2	12	136146	136157	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198461
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3601	NC_005835	AGG	2	6	136191	136196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198461
3602	NC_005835	CCAGG	2	10	136199	136208	20 %	0 %	40 %	40 %	46198461
3603	NC_005835	C	6	6	136241	136246	0 %	0 %	0 %	100 %	46198461
3604	NC_005835	AAGCC	2	10	136254	136263	40 %	0 %	20 %	40 %	46198461
3605	NC_005835	C	6	6	136276	136281	0 %	0 %	0 %	100 %	46198461
3606	NC_005835	GGAA	2	8	136303	136310	50 %	0 %	50 %	0 %	46198461
3607	NC_005835	GAAGCG	2	12	136331	136342	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46198461
3608	NC_005835	GGA	2	6	136438	136443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198461
3609	NC_005835	GGC	2	6	136445	136450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198461
3610	NC_005835	CCT	2	6	136464	136469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198461
3611	NC_005835	CTT	2	6	136581	136586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198462
3612	NC_005835	AGA	2	6	136604	136609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198462
3613	NC_005835	GCC	2	6	136657	136662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198462
3614	NC_005835	TCC	2	6	136693	136698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198462
3615	NC_005835	GGC	2	6	136836	136841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198462
3616	NC_005835	TTTGG	2	10	136896	136905	0 %	60 %	40 %	0 %	46198462
3617	NC_005835	G	6	6	136939	136944	0 %	0 %	100 %	0 %	46198462
3618	NC_005835	CCA	3	9	136979	136987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198462
3619	NC_005835	CTCCCG	2	12	137007	137018	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198462
3620	NC_005835	GGGA	2	8	137040	137047	25 %	0 %	75 %	0 %	46198462
3621	NC_005835	GGC	2	6	137079	137084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198462
3622	NC_005835	TCC	2	6	137137	137142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198463
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3624	NC_005835	GGCC	2	8	137230	137237	0 %	0 %	50 %	50 %	46198463
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3871	NC_005835	ATG	2	6	146253	146258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198473
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3999	NC_005835	CTC	2	6	151083	151088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198478
4000	NC_005835	GCC	2	6	151134	151139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198478

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