MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005835	CAC	2	6	55033	55038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198369
1502	NC_005835	GTG	2	6	55039	55044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198369
1503	NC_005835	GCT	2	6	55258	55263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198370
1504	NC_005835	GCC	2	6	55295	55300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198370
1505	NC_005835	GAG	2	6	55358	55363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198370
1506	NC_005835	CCT	2	6	55369	55374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198370
1507	NC_005835	TCC	2	6	55377	55382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198370
1508	NC_005835	CCG	2	6	55447	55452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198370
1509	NC_005835	GAG	2	6	55520	55525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198370
1510	NC_005835	GCG	2	6	55567	55572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198370
1511	NC_005835	GGGC	2	8	55578	55585	0 %	0 %	75 %	25 %	46198370
1512	NC_005835	CGG	2	6	55621	55626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198370
1513	NC_005835	C	6	6	55635	55640	0 %	0 %	0 %	100 %	46198370
1514	NC_005835	CTA	2	6	55672	55677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198370
1515	NC_005835	CTC	2	6	55739	55744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198370
1516	NC_005835	CCT	2	6	55756	55761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198370
1517	NC_005835	CGC	2	6	55823	55828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198370
1518	NC_005835	GCC	2	6	55855	55860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198371
1519	NC_005835	TGGCGG	2	12	55873	55884	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46198371
1520	NC_005835	GGC	2	6	55909	55914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198371
1521	NC_005835	GGC	2	6	55958	55963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198371
1522	NC_005835	TCC	2	6	56001	56006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198371
1523	NC_005835	CTC	2	6	56027	56032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198371
1524	NC_005835	CCT	2	6	56095	56100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198371
1525	NC_005835	GGA	2	6	56129	56134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198371
1526	NC_005835	GAG	2	6	56171	56176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198371
1527	NC_005835	C	6	6	56185	56190	0 %	0 %	0 %	100 %	46198371
1528	NC_005835	GCCCCG	2	12	56229	56240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198371
1529	NC_005835	CGC	2	6	56273	56278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198371
1530	NC_005835	CGG	2	6	56290	56295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198371
1531	NC_005835	C	7	7	56312	56318	0 %	0 %	0 %	100 %	46198371
1532	NC_005835	C	7	7	56431	56437	0 %	0 %	0 %	100 %	46198371
1533	NC_005835	ACC	2	6	56442	56447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198371
1534	NC_005835	GTG	2	6	56466	56471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198371
1535	NC_005835	TCC	2	6	56481	56486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198371
1536	NC_005835	GCC	2	6	56604	56609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198371
1537	NC_005835	TCA	2	6	56635	56640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198371
1538	NC_005835	CCT	2	6	56659	56664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198371
1539	NC_005835	GAA	2	6	56690	56695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198371
1540	NC_005835	GAG	2	6	56696	56701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198371
1541	NC_005835	GAA	2	6	56726	56731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198371
1542	NC_005835	GAC	2	6	56921	56926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198372
1543	NC_005835	ACT	2	6	56943	56948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198372
1544	NC_005835	AGG	2	6	56964	56969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198372
1545	NC_005835	CCG	2	6	57024	57029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198372
1546	NC_005835	G	7	7	57079	57085	0 %	0 %	100 %	0 %	46198372
1547	NC_005835	GGC	2	6	57124	57129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198372
1548	NC_005835	GAT	2	6	57163	57168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198372
1549	NC_005835	C	7	7	57187	57193	0 %	0 %	0 %	100 %	46198372
1550	NC_005835	GGA	2	6	57205	57210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198372
1551	NC_005835	G	6	6	57242	57247	0 %	0 %	100 %	0 %	46198372
1552	NC_005835	GTG	2	6	57254	57259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198372
1553	NC_005835	CCGC	2	8	57369	57376	0 %	0 %	25 %	75 %	46198372
1554	NC_005835	CAC	2	6	57382	57387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198372
1555	NC_005835	GGA	2	6	57391	57396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198372
1556	NC_005835	GGA	2	6	57400	57405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198372
1557	NC_005835	CTC	2	6	57407	57412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198372
1558	NC_005835	GGC	2	6	57414	57419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198372
1559	NC_005835	TGG	2	6	57441	57446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198372
1560	NC_005835	TCA	2	6	57471	57476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198372
1561	NC_005835	GCG	2	6	57496	57501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198372
1562	NC_005835	CTC	2	6	57539	57544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198372
1563	NC_005835	GCG	2	6	57551	57556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198372
1564	NC_005835	TGG	2	6	57597	57602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198372
1565	NC_005835	CGTCCT	2	12	57616	57627	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	46198372
1566	NC_005835	G	6	6	57759	57764	0 %	0 %	100 %	0 %	46198372
1567	NC_005835	CAC	2	6	57805	57810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198372
1568	NC_005835	GGT	2	6	57814	57819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198372
1569	NC_005835	GGGGGT	2	12	57823	57834	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	46198372
1570	NC_005835	GGC	3	9	57859	57867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198372
1571	NC_005835	G	6	6	57905	57910	0 %	0 %	100 %	0 %	46198372
1572	NC_005835	CGC	2	6	57943	57948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198372
1573	NC_005835	GCA	2	6	57972	57977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198372
1574	NC_005835	GAG	2	6	58007	58012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198372
1575	NC_005835	CCG	2	6	58083	58088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198372
1576	NC_005835	AAG	2	6	58130	58135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198372
1577	NC_005835	G	6	6	58207	58212	0 %	0 %	100 %	0 %	46198372
1578	NC_005835	AAG	2	6	58265	58270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198372
1579	NC_005835	ACG	2	6	58320	58325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198372
1580	NC_005835	TGG	3	9	58326	58334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198372
1581	NC_005835	AGG	2	6	58338	58343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198372
1582	NC_005835	ACT	2	6	58350	58355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198372
1583	NC_005835	GGC	2	6	58374	58379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198373
1584	NC_005835	CTT	2	6	58399	58404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198373
1585	NC_005835	CGGG	2	8	58406	58413	0 %	0 %	75 %	25 %	46198373
1586	NC_005835	TCC	2	6	58433	58438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198373
1587	NC_005835	CCA	2	6	58452	58457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198373
1588	NC_005835	CTT	2	6	58483	58488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198373
1589	NC_005835	CCGC	2	8	58560	58567	0 %	0 %	25 %	75 %	46198373
1590	NC_005835	CTC	2	6	58676	58681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198374
1591	NC_005835	CGCC	2	8	58726	58733	0 %	0 %	25 %	75 %	46198374
1592	NC_005835	CGC	2	6	58766	58771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198374
1593	NC_005835	CCTCCG	2	12	58828	58839	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198374
1594	NC_005835	CCT	2	6	58900	58905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198374
1595	NC_005835	GAG	2	6	58913	58918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198374
1596	NC_005835	TAC	2	6	58955	58960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198374
1597	NC_005835	CCTC	2	8	58975	58982	0 %	25 %	0 %	75 %	46198374
1598	NC_005835	CTC	2	6	58985	58990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198374
1599	NC_005835	GAG	2	6	59009	59014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198374
1600	NC_005835	AGG	2	6	59028	59033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198374
1601	NC_005835	GGGC	2	8	59039	59046	0 %	0 %	75 %	25 %	46198374
1602	NC_005835	GGCG	2	8	59084	59091	0 %	0 %	75 %	25 %	46198374
1603	NC_005835	G	6	6	59184	59189	0 %	0 %	100 %	0 %	46198375
1604	NC_005835	CTG	2	6	59223	59228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198375
1605	NC_005835	GGA	2	6	59237	59242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198375
1606	NC_005835	AGG	2	6	59260	59265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198375
1607	NC_005835	GCC	2	6	59303	59308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198375
1608	NC_005835	CAG	2	6	59362	59367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198375
1609	NC_005835	GCAGG	2	10	59373	59382	20 %	0 %	60 %	20 %	46198375
1610	NC_005835	AGT	2	6	59399	59404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198375
1611	NC_005835	CCA	2	6	59423	59428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198375
1612	NC_005835	CCA	2	6	59432	59437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198375
1613	NC_005835	GAG	2	6	59629	59634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198376
1614	NC_005835	GTC	2	6	59671	59676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198376
1615	NC_005835	CCGTC	2	10	59754	59763	0 %	20 %	20 %	60 %	46198376
1616	NC_005835	CTT	2	6	59911	59916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198376
1617	NC_005835	CTC	2	6	59920	59925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198376
1618	NC_005835	GGC	2	6	59949	59954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198376
1619	NC_005835	AGG	2	6	59972	59977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198376
1620	NC_005835	GGC	2	6	60004	60009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198376
1621	NC_005835	GCG	2	6	60023	60028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198376
1622	NC_005835	C	6	6	60098	60103	0 %	0 %	0 %	100 %	46198376
1623	NC_005835	GCG	2	6	60104	60109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198376
1624	NC_005835	AGA	2	6	60129	60134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198376
1625	NC_005835	CTT	2	6	60139	60144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198376
1626	NC_005835	GGC	2	6	60162	60167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198376
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1628	NC_005835	CAC	2	6	60211	60216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198376
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