MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005835	CGC	2	6	35854	35859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198346
1002	NC_005835	TCC	2	6	35894	35899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198346
1003	NC_005835	CTC	2	6	35917	35922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198346
1004	NC_005835	GGC	2	6	35928	35933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198346
1005	NC_005835	TCC	2	6	35972	35977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198346
1006	NC_005835	GGC	2	6	35995	36000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198346
1007	NC_005835	GGT	2	6	36082	36087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198346
1008	NC_005835	G	6	6	36101	36106	0 %	0 %	100 %	0 %	46198346
1009	NC_005835	AGG	3	9	36113	36121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198346
1010	NC_005835	GCC	2	6	36149	36154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198346
1011	NC_005835	GTC	2	6	36232	36237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198346
1012	NC_005835	CTC	2	6	36242	36247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198346
1013	NC_005835	GCG	2	6	36268	36273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198346
1014	NC_005835	GGC	2	6	36358	36363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198347
1015	NC_005835	TGG	2	6	36381	36386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198347
1016	NC_005835	TGG	2	6	36402	36407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198347
1017	NC_005835	GGA	2	6	36442	36447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1018	NC_005835	CCA	2	6	36454	36459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198347
1019	NC_005835	GCC	2	6	36467	36472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198347
1020	NC_005835	G	6	6	36477	36482	0 %	0 %	100 %	0 %	46198347
1021	NC_005835	CTC	2	6	36545	36550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198347
1022	NC_005835	CCT	2	6	36562	36567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198347
1023	NC_005835	AGG	2	6	36570	36575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1024	NC_005835	G	8	8	36574	36581	0 %	0 %	100 %	0 %	46198347
1025	NC_005835	G	6	6	36601	36606	0 %	0 %	100 %	0 %	46198347
1026	NC_005835	GAG	2	6	36608	36613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1027	NC_005835	GCGG	2	8	36640	36647	0 %	0 %	75 %	25 %	46198347
1028	NC_005835	C	6	6	36678	36683	0 %	0 %	0 %	100 %	46198347
1029	NC_005835	GGC	2	6	36701	36706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198347
1030	NC_005835	GGA	2	6	36730	36735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1031	NC_005835	GCCTTG	2	12	36758	36769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198347
1032	NC_005835	GAG	2	6	36770	36775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1033	NC_005835	GCCC	2	8	36808	36815	0 %	0 %	25 %	75 %	46198347
1034	NC_005835	AGG	2	6	36825	36830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1035	NC_005835	GGGCC	2	10	36867	36876	0 %	0 %	60 %	40 %	46198347
1036	NC_005835	ACG	2	6	36906	36911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198347
1037	NC_005835	TGG	2	6	36912	36917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198347
1038	NC_005835	AGG	2	6	36981	36986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1039	NC_005835	AGG	2	6	37005	37010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1040	NC_005835	GAG	2	6	37034	37039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1041	NC_005835	CGGG	2	8	37194	37201	0 %	0 %	75 %	25 %	46198348
1042	NC_005835	GGT	2	6	37218	37223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198348
1043	NC_005835	GAG	2	6	37252	37257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198348
1044	NC_005835	GGA	2	6	37275	37280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198348
1045	NC_005835	TCC	2	6	37292	37297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198348
1046	NC_005835	ACGAGG	2	12	37325	37336	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46198348
1047	NC_005835	CCT	2	6	37365	37370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198348
1048	NC_005835	ACCC	2	8	37372	37379	25 %	0 %	0 %	75 %	46198348
1049	NC_005835	GGT	2	6	37404	37409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198348
1050	NC_005835	CCT	3	9	37413	37421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198348
1051	NC_005835	CTA	2	6	37428	37433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198348
1052	NC_005835	GCG	2	6	37505	37510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198348
1053	NC_005835	TGG	3	9	37514	37522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198348
1054	NC_005835	G	7	7	37531	37537	0 %	0 %	100 %	0 %	46198348
1055	NC_005835	TGA	2	6	37577	37582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198348
1056	NC_005835	CGC	2	6	37686	37691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198348
1057	NC_005835	TGG	2	6	37745	37750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198348
1058	NC_005835	CACC	2	8	37773	37780	25 %	0 %	0 %	75 %	46198348
1059	NC_005835	GGC	3	9	37950	37958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198348
1060	NC_005835	G	7	7	37971	37977	0 %	0 %	100 %	0 %	46198348
1061	NC_005835	GGA	2	6	37986	37991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198348
1062	NC_005835	GGT	2	6	37992	37997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198348
1063	NC_005835	G	7	7	38058	38064	0 %	0 %	100 %	0 %	46198349
1064	NC_005835	CCTC	2	8	38122	38129	0 %	25 %	0 %	75 %	46198349
1065	NC_005835	TGG	2	6	38149	38154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198349
1066	NC_005835	CCT	2	6	38276	38281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198349
1067	NC_005835	CGG	2	6	38288	38293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198349
1068	NC_005835	GTG	2	6	38307	38312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198349
1069	NC_005835	CGTGGC	2	12	38318	38329	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198349
1070	NC_005835	CAT	2	6	38420	38425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198349
1071	NC_005835	GGGGC	2	10	38462	38471	0 %	0 %	80 %	20 %	46198349
1072	NC_005835	CAT	2	6	38504	38509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198349
1073	NC_005835	G	6	6	38550	38555	0 %	0 %	100 %	0 %	46198349
1074	NC_005835	CCCA	2	8	38565	38572	25 %	0 %	0 %	75 %	46198349
1075	NC_005835	AGC	2	6	38575	38580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198349
1076	NC_005835	GCC	2	6	38590	38595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198349
1077	NC_005835	AGG	2	6	38602	38607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198349
1078	NC_005835	CTT	2	6	38618	38623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198349
1079	NC_005835	GAC	2	6	38637	38642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198349
1080	NC_005835	ACC	2	6	38665	38670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198349
1081	NC_005835	CCGGGA	2	12	38752	38763	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198349
1082	NC_005835	CGC	2	6	38774	38779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198349
1083	NC_005835	GAG	2	6	38792	38797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198349
1084	NC_005835	TGGA	2	8	38887	38894	25 %	25 %	50 %	0 %	46198349
1085	NC_005835	TGGA	2	8	38915	38922	25 %	25 %	50 %	0 %	46198349
1086	NC_005835	TGG	2	6	39292	39297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198350
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1088	NC_005835	GAG	2	6	39504	39509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198350
1089	NC_005835	TGG	2	6	39544	39549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198350
1090	NC_005835	GA	3	6	39563	39568	50 %	0 %	50 %	0 %	46198350
1091	NC_005835	CTC	2	6	39573	39578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198350
1092	NC_005835	GCCC	2	8	39610	39617	0 %	0 %	25 %	75 %	46198351
1093	NC_005835	GCC	2	6	39620	39625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198351
1094	NC_005835	GAA	2	6	39702	39707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198351
1095	NC_005835	CGG	2	6	39764	39769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198351
1096	NC_005835	TCCA	2	8	39787	39794	25 %	25 %	0 %	50 %	46198351
1097	NC_005835	CCT	2	6	39830	39835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198351
1098	NC_005835	CCT	2	6	39923	39928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198351
1099	NC_005835	GA	3	6	40054	40059	50 %	0 %	50 %	0 %	46198351
1100	NC_005835	GC	3	6	40134	40139	0 %	0 %	50 %	50 %	46198351
1101	NC_005835	CGT	2	6	40166	40171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198351
1102	NC_005835	CCA	3	9	40175	40183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198351
1103	NC_005835	CGGG	2	8	40222	40229	0 %	0 %	75 %	25 %	46198351
1104	NC_005835	C	6	6	40243	40248	0 %	0 %	0 %	100 %	46198351
1105	NC_005835	CTC	2	6	40335	40340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198351
1106	NC_005835	CGG	2	6	40343	40348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198351
1107	NC_005835	CAG	2	6	40416	40421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198351
1108	NC_005835	CTG	2	6	40470	40475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198351
1109	NC_005835	GGT	2	6	40482	40487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198351
1110	NC_005835	CCT	2	6	40496	40501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198351
1111	NC_005835	G	6	6	40541	40546	0 %	0 %	100 %	0 %	46198351
1112	NC_005835	CCGCG	2	10	40602	40611	0 %	0 %	40 %	60 %	46198351
1113	NC_005835	CCG	2	6	40616	40621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198351
1114	NC_005835	CCT	3	9	40622	40630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198351
1115	NC_005835	C	6	6	40656	40661	0 %	0 %	0 %	100 %	46198351
1116	NC_005835	TGG	2	6	40712	40717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198351
1117	NC_005835	CCGC	2	8	40939	40946	0 %	0 %	25 %	75 %	46198352
1118	NC_005835	CTC	2	6	40955	40960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198352
1119	NC_005835	GGC	2	6	41012	41017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198352
1120	NC_005835	CCGCCT	2	12	41035	41046	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198352
1121	NC_005835	CCT	2	6	41128	41133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198352
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1123	NC_005835	GGC	2	6	41149	41154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198352
1124	NC_005835	GGC	2	6	41161	41166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198352
1125	NC_005835	CGCC	2	8	41188	41195	0 %	0 %	25 %	75 %	46198352
1126	NC_005835	TCC	2	6	41196	41201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198352
1127	NC_005835	GGTG	2	8	41209	41216	0 %	25 %	75 %	0 %	46198352
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1129	NC_005835	TGA	2	6	41233	41238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198352
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1252	NC_005835	GCG	2	6	46104	46109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198357
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