MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005835	GGC	2	6	18271	18276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198328
502	NC_005835	G	6	6	18279	18284	0 %	0 %	100 %	0 %	46198328
503	NC_005835	GGGGC	2	10	18297	18306	0 %	0 %	80 %	20 %	46198328
504	NC_005835	GGC	2	6	18376	18381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198328
505	NC_005835	GGT	2	6	18436	18441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198328
506	NC_005835	TCC	2	6	18459	18464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198328
507	NC_005835	CTC	2	6	18497	18502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198328
508	NC_005835	AGG	2	6	18504	18509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198328
509	NC_005835	CCA	2	6	18555	18560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198328
510	NC_005835	GGA	2	6	18562	18567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198328
511	NC_005835	CGC	2	6	18577	18582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198328
512	NC_005835	CCG	2	6	18678	18683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198328
513	NC_005835	CGC	2	6	18736	18741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198328
514	NC_005835	C	6	6	18762	18767	0 %	0 %	0 %	100 %	46198328
515	NC_005835	CGC	2	6	18775	18780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198328
516	NC_005835	ACCCCA	2	12	18819	18830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198328
517	NC_005835	CAG	3	9	18851	18859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198328
518	NC_005835	CCT	2	6	18904	18909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198328
519	NC_005835	CCT	2	6	19002	19007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198329
520	NC_005835	G	7	7	19023	19029	0 %	0 %	100 %	0 %	46198329
521	NC_005835	G	6	6	19167	19172	0 %	0 %	100 %	0 %	46198329
522	NC_005835	AGG	2	6	19178	19183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198329
523	NC_005835	GAG	2	6	19237	19242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198329
524	NC_005835	GCC	2	6	19256	19261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198329
525	NC_005835	GGT	2	6	19305	19310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198329
526	NC_005835	G	6	6	19319	19324	0 %	0 %	100 %	0 %	46198329
527	NC_005835	G	6	6	19345	19350	0 %	0 %	100 %	0 %	46198329
528	NC_005835	CG	3	6	19371	19376	0 %	0 %	50 %	50 %	46198329
529	NC_005835	GAG	2	6	19384	19389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198329
530	NC_005835	GTGGAG	2	12	19408	19419	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	46198329
531	NC_005835	GTG	2	6	19420	19425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198329
532	NC_005835	CCT	2	6	19476	19481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198329
533	NC_005835	CCG	3	9	19499	19507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198329
534	NC_005835	CGC	2	6	19530	19535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198329
535	NC_005835	AGG	2	6	19547	19552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198329
536	NC_005835	CCG	2	6	19562	19567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198329
537	NC_005835	CGC	2	6	19587	19592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198329
538	NC_005835	GGA	2	6	19632	19637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198329
539	NC_005835	GAGG	2	8	19697	19704	25 %	0 %	75 %	0 %	46198330
540	NC_005835	GAG	2	6	19707	19712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198330
541	NC_005835	GGC	2	6	19733	19738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198330
542	NC_005835	GCCC	2	8	19771	19778	0 %	0 %	25 %	75 %	46198330
543	NC_005835	GGA	2	6	19793	19798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198330
544	NC_005835	AGG	3	9	19807	19815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198330
545	NC_005835	GGAGCT	2	12	19823	19834	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46198330
546	NC_005835	TGG	2	6	19911	19916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
547	NC_005835	TGG	2	6	19938	19943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
548	NC_005835	TCC	3	9	19974	19982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198331
549	NC_005835	CGG	2	6	20002	20007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198331
550	NC_005835	G	6	6	20027	20032	0 %	0 %	100 %	0 %	46198331
551	NC_005835	TGG	2	6	20040	20045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
552	NC_005835	GCG	2	6	20114	20119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198331
553	NC_005835	GAG	2	6	20132	20137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198331
554	NC_005835	CCT	2	6	20208	20213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198331
555	NC_005835	CTT	2	6	20224	20229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198331
556	NC_005835	GGT	2	6	20233	20238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
557	NC_005835	GCGGG	2	10	20251	20260	0 %	0 %	80 %	20 %	46198331
558	NC_005835	TCC	3	9	20385	20393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198331
559	NC_005835	GGA	2	6	20404	20409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198331
560	NC_005835	TGG	2	6	20415	20420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
561	NC_005835	G	6	6	20422	20427	0 %	0 %	100 %	0 %	46198331
562	NC_005835	GGT	2	6	20449	20454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
563	NC_005835	GGA	3	9	20458	20466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198331
564	NC_005835	G	6	6	20478	20483	0 %	0 %	100 %	0 %	46198331
565	NC_005835	G	6	6	20506	20511	0 %	0 %	100 %	0 %	46198331
566	NC_005835	CTT	2	6	20518	20523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198331
567	NC_005835	GGT	2	6	20533	20538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
568	NC_005835	G	7	7	20548	20554	0 %	0 %	100 %	0 %	46198331
569	NC_005835	ACCTGG	2	12	20565	20576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198331
570	NC_005835	GCG	2	6	20578	20583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198331
571	NC_005835	CG	3	6	20593	20598	0 %	0 %	50 %	50 %	46198331
572	NC_005835	GCGG	2	8	20674	20681	0 %	0 %	75 %	25 %	46198331
573	NC_005835	TCC	2	6	20772	20777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198331
574	NC_005835	C	6	6	20787	20792	0 %	0 %	0 %	100 %	46198331
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579	NC_005835	CTC	2	6	21167	21172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198331
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586	NC_005835	GGGGC	2	10	21423	21432	0 %	0 %	80 %	20 %	46198331
587	NC_005835	G	7	7	21469	21475	0 %	0 %	100 %	0 %	46198331
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598	NC_005835	CCA	2	6	21755	21760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198332
599	NC_005835	AGG	2	6	21787	21792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198332
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610	NC_005835	CGC	2	6	22111	22116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198333
611	NC_005835	GTG	2	6	22127	22132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198333
612	NC_005835	CGGG	2	8	22159	22166	0 %	0 %	75 %	25 %	46198333
613	NC_005835	CGC	2	6	22269	22274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198334
614	NC_005835	CCA	3	9	22277	22285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198334
615	NC_005835	GCCC	2	8	22476	22483	0 %	0 %	25 %	75 %	46198334
616	NC_005835	CGG	2	6	22499	22504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198334
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620	NC_005835	GAG	2	6	22560	22565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198334
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622	NC_005835	CGG	2	6	22637	22642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198334
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625	NC_005835	G	6	6	22676	22681	0 %	0 %	100 %	0 %	46198334
626	NC_005835	CCT	3	9	22682	22690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198334
627	NC_005835	GGGCCA	2	12	22700	22711	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198334
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629	NC_005835	CGA	2	6	22739	22744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198334
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