MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_005835	AGGGG	2	10	207075	207084	20 %	0 %	80 %	0 %	46198528
5502	NC_005835	AGG	3	9	207086	207094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198528
5503	NC_005835	CAC	2	6	207151	207156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198528
5504	NC_005835	GAG	2	6	207193	207198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198528
5505	NC_005835	GCC	2	6	207223	207228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198528
5506	NC_005835	AGG	2	6	207242	207247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198528
5507	NC_005835	GGT	2	6	207367	207372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198529
5508	NC_005835	TCT	2	6	207421	207426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198529
5509	NC_005835	CCA	2	6	207436	207441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198529
5510	NC_005835	CCCGG	2	10	207443	207452	0 %	0 %	40 %	60 %	46198529
5511	NC_005835	GCC	2	6	207471	207476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198529
5512	NC_005835	GTA	2	6	207524	207529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198529
5513	NC_005835	AGG	2	6	207541	207546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198529
5514	NC_005835	CGG	2	6	207589	207594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198529
5515	NC_005835	CGG	3	9	207646	207654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198529
5516	NC_005835	CCCG	2	8	207657	207664	0 %	0 %	25 %	75 %	46198529
5517	NC_005835	CCG	2	6	207682	207687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198529
5518	NC_005835	AGT	2	6	207688	207693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198529
5519	NC_005835	CG	3	6	207729	207734	0 %	0 %	50 %	50 %	46198529
5520	NC_005835	GGA	3	9	207775	207783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198529
5521	NC_005835	G	6	6	207842	207847	0 %	0 %	100 %	0 %	46198529
5522	NC_005835	CCT	2	6	207853	207858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198529
5523	NC_005835	ACC	2	6	207864	207869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198529
5524	NC_005835	AGG	2	6	207987	207992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198529
5525	NC_005835	CAT	2	6	207998	208003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198529
5526	NC_005835	CGAAGA	2	12	208021	208032	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	46198529
5527	NC_005835	TGG	2	6	208033	208038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198529
5528	NC_005835	TGG	2	6	208075	208080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198529
5529	NC_005835	TCG	2	6	208164	208169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198529
5530	NC_005835	GGC	2	6	208199	208204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198529
5531	NC_005835	CGT	2	6	208219	208224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198529
5532	NC_005835	TCC	2	6	208233	208238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198529
5533	NC_005835	C	7	7	208268	208274	0 %	0 %	0 %	100 %	46198529
5534	NC_005835	CGGC	2	8	208317	208324	0 %	0 %	50 %	50 %	46198529
5535	NC_005835	GGCGAA	2	12	208331	208342	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46198529
5536	NC_005835	AGG	2	6	208359	208364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198529
5537	NC_005835	GCG	2	6	208365	208370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198529
5538	NC_005835	GCC	2	6	208419	208424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198529
5539	NC_005835	CCT	2	6	208442	208447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198529
5540	NC_005835	CCT	2	6	208707	208712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198530
5541	NC_005835	GCC	2	6	208728	208733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198530
5542	NC_005835	G	6	6	208755	208760	0 %	0 %	100 %	0 %	46198530
5543	NC_005835	G	7	7	208793	208799	0 %	0 %	100 %	0 %	46198530
5544	NC_005835	CGGCCA	2	12	208833	208844	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46198530
5545	NC_005835	CCTC	2	8	208851	208858	0 %	25 %	0 %	75 %	46198530
5546	NC_005835	GTG	2	6	208859	208864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198530
5547	NC_005835	AGGGCG	2	12	208910	208921	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46198530
5548	NC_005835	CGCA	2	8	208958	208965	25 %	0 %	25 %	50 %	46198530
5549	NC_005835	CCA	2	6	209040	209045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198530
5550	NC_005835	CCTG	2	8	209067	209074	0 %	25 %	25 %	50 %	46198530
5551	NC_005835	GCC	2	6	209156	209161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198530
5552	NC_005835	G	7	7	209190	209196	0 %	0 %	100 %	0 %	46198530
5553	NC_005835	CCCG	2	8	209245	209252	0 %	0 %	25 %	75 %	46198530
5554	NC_005835	GGC	2	6	209286	209291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198530
5555	NC_005835	GAG	2	6	209299	209304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198530
5556	NC_005835	C	7	7	209311	209317	0 %	0 %	0 %	100 %	46198530
5557	NC_005835	AGG	2	6	209318	209323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198530
5558	NC_005835	TCC	2	6	209348	209353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198530
5559	NC_005835	GCC	2	6	209378	209383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198530
5560	NC_005835	TGG	2	6	209384	209389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198530
5561	NC_005835	GTGG	2	8	209395	209402	0 %	25 %	75 %	0 %	46198530
5562	NC_005835	CTT	2	6	209433	209438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198530
5563	NC_005835	GAA	2	6	209458	209463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198530
5564	NC_005835	GAG	2	6	209539	209544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198530
5565	NC_005835	TCC	2	6	209546	209551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198530
5566	NC_005835	GCC	2	6	209578	209583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198530
5567	NC_005835	CGC	2	6	209875	209880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198531
5568	NC_005835	G	6	6	209888	209893	0 %	0 %	100 %	0 %	46198531
5569	NC_005835	TCG	2	6	209904	209909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198531
5570	NC_005835	AGGC	2	8	209925	209932	25 %	0 %	50 %	25 %	46198531
5571	NC_005835	AGG	2	6	209949	209954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198531
5572	NC_005835	G	6	6	209953	209958	0 %	0 %	100 %	0 %	46198531
5573	NC_005835	TAGGCC	2	12	209966	209977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198531
5574	NC_005835	C	6	6	209993	209998	0 %	0 %	0 %	100 %	46198531
5575	NC_005835	AGA	2	6	210013	210018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198531
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5577	NC_005835	G	7	7	210075	210081	0 %	0 %	100 %	0 %	46198531
5578	NC_005835	ACCC	2	8	210093	210100	25 %	0 %	0 %	75 %	46198531
5579	NC_005835	CTTCAG	2	12	210131	210142	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46198531
5580	NC_005835	ATG	2	6	210144	210149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198531
5581	NC_005835	GTA	3	9	210185	210193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198531
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5583	NC_005835	GTG	2	6	210263	210268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198531
5584	NC_005835	CCAG	2	8	210280	210287	25 %	0 %	25 %	50 %	46198531
5585	NC_005835	AGGG	2	8	210305	210312	25 %	0 %	75 %	0 %	46198531
5586	NC_005835	TCGG	2	8	210331	210338	0 %	25 %	50 %	25 %	46198531
5587	NC_005835	CCG	2	6	210339	210344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198531
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5592	NC_005835	G	7	7	210734	210740	0 %	0 %	100 %	0 %	46198532
5593	NC_005835	CTC	2	6	210741	210746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198532
5594	NC_005835	GGA	2	6	210752	210757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198532
5595	NC_005835	GCC	2	6	210769	210774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198532
5596	NC_005835	GGA	2	6	210839	210844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198532
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5600	NC_005835	CTC	2	6	210948	210953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198532
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5602	NC_005835	TCT	2	6	210968	210973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198532
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5605	NC_005835	G	6	6	211894	211899	0 %	0 %	100 %	0 %	46198533
5606	NC_005835	ACG	3	9	211930	211938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198533
5607	NC_005835	CTA	4	12	211967	211978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198533
5608	NC_005835	CCT	2	6	211981	211986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198533
5609	NC_005835	TCCT	2	8	212010	212017	0 %	50 %	0 %	50 %	46198533
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5612	NC_005835	ATG	2	6	212100	212105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198533
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5614	NC_005835	CCCG	2	8	212126	212133	0 %	0 %	25 %	75 %	46198533
5615	NC_005835	CCT	2	6	212144	212149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198533
5616	NC_005835	GGA	3	9	212201	212209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198533
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5620	NC_005835	GCCTTC	2	12	212334	212345	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	46198533
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5622	NC_005835	CCA	2	6	212431	212436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198534
5623	NC_005835	GCCC	2	8	212450	212457	0 %	0 %	25 %	75 %	46198534
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5625	NC_005835	CCA	2	6	212500	212505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198534
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6000	NC_005835	CATGGG	2	12	225431	225442	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46198545

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