MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_005835	CTT	2	6	189421	189426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198510
5002	NC_005835	G	6	6	189429	189434	0 %	0 %	100 %	0 %	46198510
5003	NC_005835	GCC	2	6	189543	189548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198510
5004	NC_005835	CAC	2	6	189589	189594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198510
5005	NC_005835	CGGGA	2	10	189602	189611	20 %	0 %	60 %	20 %	46198510
5006	NC_005835	GAC	2	6	189632	189637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198510
5007	NC_005835	CCT	2	6	189649	189654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198510
5008	NC_005835	GGCC	2	8	189671	189678	0 %	0 %	50 %	50 %	46198511
5009	NC_005835	CTC	2	6	189734	189739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198511
5010	NC_005835	GCG	2	6	189764	189769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198511
5011	NC_005835	CTC	2	6	189788	189793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198511
5012	NC_005835	AGGT	2	8	189798	189805	25 %	25 %	50 %	0 %	46198511
5013	NC_005835	CTC	2	6	189851	189856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198511
5014	NC_005835	GAG	2	6	189899	189904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198511
5015	NC_005835	CTC	2	6	189914	189919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198511
5016	NC_005835	GGC	2	6	189950	189955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198511
5017	NC_005835	CTC	2	6	189959	189964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198511
5018	NC_005835	GAG	2	6	189971	189976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198511
5019	NC_005835	GAG	2	6	190142	190147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198512
5020	NC_005835	GGT	2	6	190159	190164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198512
5021	NC_005835	CCG	2	6	190167	190172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198512
5022	NC_005835	CCA	2	6	190176	190181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198512
5023	NC_005835	GGAC	2	8	190206	190213	25 %	0 %	50 %	25 %	46198512
5024	NC_005835	GAG	2	6	190226	190231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198512
5025	NC_005835	CAC	2	6	190247	190252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198512
5026	NC_005835	TGG	2	6	190254	190259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198512
5027	NC_005835	GAG	2	6	190313	190318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198512
5028	NC_005835	TGG	3	9	190356	190364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198512
5029	NC_005835	G	7	7	190363	190369	0 %	0 %	100 %	0 %	46198512
5030	NC_005835	CTA	2	6	190375	190380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198512
5031	NC_005835	CCG	2	6	190418	190423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198512
5032	NC_005835	AGG	2	6	190437	190442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198512
5033	NC_005835	CTC	2	6	190481	190486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198512
5034	NC_005835	CGCC	2	8	190516	190523	0 %	0 %	25 %	75 %	46198512
5035	NC_005835	A	6	6	190531	190536	100 %	0 %	0 %	0 %	46198512
5036	NC_005835	GAG	2	6	190540	190545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198512
5037	NC_005835	CCCGG	2	10	190588	190597	0 %	0 %	40 %	60 %	46198512
5038	NC_005835	C	7	7	190610	190616	0 %	0 %	0 %	100 %	46198512
5039	NC_005835	AAG	2	6	190628	190633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198512
5040	NC_005835	GGA	2	6	190675	190680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198512
5041	NC_005835	GGA	2	6	190714	190719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198512
5042	NC_005835	AGG	2	6	190782	190787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198512
5043	NC_005835	CCT	2	6	190798	190803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198512
5044	NC_005835	GGA	2	6	190819	190824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198512
5045	NC_005835	G	7	7	190920	190926	0 %	0 %	100 %	0 %	46198512
5046	NC_005835	GAG	2	6	190928	190933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198512
5047	NC_005835	G	6	6	191023	191028	0 %	0 %	100 %	0 %	46198513
5048	NC_005835	C	6	6	191035	191040	0 %	0 %	0 %	100 %	46198513
5049	NC_005835	GGA	2	6	191126	191131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198513
5050	NC_005835	GTG	2	6	191172	191177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198513
5051	NC_005835	ACA	2	6	191188	191193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46198513
5052	NC_005835	CAC	2	6	191213	191218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198513
5053	NC_005835	GCC	2	6	191227	191232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198513
5054	NC_005835	C	6	6	191250	191255	0 %	0 %	0 %	100 %	46198513
5055	NC_005835	CTC	2	6	191339	191344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198513
5056	NC_005835	CTT	2	6	191360	191365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198513
5057	NC_005835	CCA	2	6	191368	191373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198513
5058	NC_005835	GCC	3	9	191424	191432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198513
5059	NC_005835	GCC	2	6	191436	191441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198513
5060	NC_005835	C	6	6	191449	191454	0 %	0 %	0 %	100 %	46198513
5061	NC_005835	G	6	6	191474	191479	0 %	0 %	100 %	0 %	46198513
5062	NC_005835	CGC	2	6	191495	191500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198513
5063	NC_005835	GCG	2	6	191506	191511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198513
5064	NC_005835	CTC	2	6	191622	191627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198513
5065	NC_005835	C	8	8	191678	191685	0 %	0 %	0 %	100 %	46198513
5066	NC_005835	AGG	2	6	191692	191697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198513
5067	NC_005835	C	7	7	191715	191721	0 %	0 %	0 %	100 %	46198513
5068	NC_005835	GTG	2	6	191733	191738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198513
5069	NC_005835	GGA	2	6	191783	191788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198513
5070	NC_005835	TCCC	2	8	191844	191851	0 %	25 %	0 %	75 %	46198513
5071	NC_005835	CGC	2	6	191861	191866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198513
5072	NC_005835	CTA	2	6	191867	191872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198513
5073	NC_005835	CGG	2	6	191884	191889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198513
5074	NC_005835	ACG	2	6	191914	191919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198513
5075	NC_005835	GCG	2	6	191933	191938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198513
5076	NC_005835	GAG	2	6	191949	191954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198513
5077	NC_005835	GAT	2	6	191963	191968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198513
5078	NC_005835	CT	3	6	192033	192038	0 %	50 %	0 %	50 %	46198513
5079	NC_005835	CTA	2	6	192044	192049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198513
5080	NC_005835	CTA	2	6	192056	192061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198513
5081	NC_005835	CCG	3	9	192080	192088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198513
5082	NC_005835	AGGCCC	2	12	192100	192111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46198513
5083	NC_005835	CCT	4	12	192128	192139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198513
5084	NC_005835	CAC	2	6	192143	192148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198513
5085	NC_005835	C	6	6	192148	192153	0 %	0 %	0 %	100 %	46198513
5086	NC_005835	GGA	2	6	192203	192208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198513
5087	NC_005835	GCCC	2	8	192242	192249	0 %	0 %	25 %	75 %	46198513
5088	NC_005835	CTC	2	6	192297	192302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198513
5089	NC_005835	G	6	6	192310	192315	0 %	0 %	100 %	0 %	46198513
5090	NC_005835	CTT	2	6	192327	192332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198513
5091	NC_005835	GGC	2	6	192335	192340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198513
5092	NC_005835	GAG	2	6	192351	192356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198513
5093	NC_005835	GCC	2	6	192410	192415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198514
5094	NC_005835	CCCTG	2	10	192481	192490	0 %	20 %	20 %	60 %	46198514
5095	NC_005835	GTG	2	6	192527	192532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198514
5096	NC_005835	TCC	2	6	192555	192560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198514
5097	NC_005835	GGA	2	6	192562	192567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198514
5098	NC_005835	GGT	3	9	192619	192627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198514
5099	NC_005835	CCTGGA	2	12	192628	192639	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198514
5100	NC_005835	CCT	2	6	192685	192690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198514
5101	NC_005835	G	7	7	192700	192706	0 %	0 %	100 %	0 %	46198514
5102	NC_005835	CCCG	2	8	192741	192748	0 %	0 %	25 %	75 %	46198514
5103	NC_005835	GGA	2	6	192796	192801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198514
5104	NC_005835	GGA	2	6	192814	192819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198514
5105	NC_005835	CTC	2	6	192842	192847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198514
5106	NC_005835	CGC	2	6	192874	192879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198514
5107	NC_005835	TCC	2	6	192894	192899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198514
5108	NC_005835	GTG	2	6	192941	192946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198514
5109	NC_005835	GTG	2	6	193079	193084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198514
5110	NC_005835	CCT	2	6	193226	193231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198515
5111	NC_005835	CGGG	2	8	193232	193239	0 %	0 %	75 %	25 %	46198515
5112	NC_005835	GGTGGA	2	12	193280	193291	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	46198515
5113	NC_005835	CTA	2	6	193325	193330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198515
5114	NC_005835	GCC	2	6	193339	193344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198515
5115	NC_005835	TCC	3	9	193363	193371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198515
5116	NC_005835	G	6	6	193378	193383	0 %	0 %	100 %	0 %	46198515
5117	NC_005835	AGG	2	6	193384	193389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198515
5118	NC_005835	CGGGAG	2	12	193434	193445	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46198515
5119	NC_005835	GGA	2	6	193454	193459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198515
5120	NC_005835	C	7	7	193465	193471	0 %	0 %	0 %	100 %	46198515
5121	NC_005835	CCGGGT	2	12	193490	193501	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198515
5122	NC_005835	AGG	2	6	193516	193521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198515
5123	NC_005835	GGA	2	6	193562	193567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198515
5124	NC_005835	CGG	2	6	193572	193577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198515
5125	NC_005835	GAG	2	6	193593	193598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198515
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5249	NC_005835	CTG	2	6	198028	198033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198519
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5252	NC_005835	GCCC	2	8	198258	198265	0 %	0 %	25 %	75 %	46198519
5253	NC_005835	GAG	2	6	198289	198294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198519
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5498	NC_005835	CCA	2	6	207024	207029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198528
5499	NC_005835	GCG	2	6	207059	207064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198528
5500	NC_005835	AGG	2	6	207065	207070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198528

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