MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_005835	TTC	2	6	169707	169712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198498
4502	NC_005835	CTC	2	6	169721	169726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198498
4503	NC_005835	AGG	2	6	169774	169779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198498
4504	NC_005835	GAG	2	6	169793	169798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198498
4505	NC_005835	ACC	3	9	169908	169916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198498
4506	NC_005835	TGGG	2	8	169935	169942	0 %	25 %	75 %	0 %	46198498
4507	NC_005835	ATG	2	6	169959	169964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198498
4508	NC_005835	CGT	2	6	170038	170043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198498
4509	NC_005835	TCA	2	6	170053	170058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198498
4510	NC_005835	TCG	2	6	170103	170108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198498
4511	NC_005835	GGC	2	6	170111	170116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198498
4512	NC_005835	GCG	2	6	170121	170126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198498
4513	NC_005835	TCC	2	6	170163	170168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198498
4514	NC_005835	CCG	2	6	170227	170232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198498
4515	NC_005835	CCG	2	6	170235	170240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198498
4516	NC_005835	CGG	2	6	170278	170283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198498
4517	NC_005835	GGT	2	6	170288	170293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198498
4518	NC_005835	GGC	2	6	170303	170308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198498
4519	NC_005835	TGG	2	6	170448	170453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198498
4520	NC_005835	GCCACG	2	12	170463	170474	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46198498
4521	NC_005835	GTC	2	6	170657	170662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198498
4522	NC_005835	ACC	2	6	170676	170681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198498
4523	NC_005835	TCC	2	6	170682	170687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198498
4524	NC_005835	GCC	2	6	170688	170693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198498
4525	NC_005835	GAT	2	6	170696	170701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198498
4526	NC_005835	GCC	2	6	170754	170759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198498
4527	NC_005835	TTC	2	6	170760	170765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198498
4528	NC_005835	GAT	2	6	170783	170788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198498
4529	NC_005835	CGGT	2	8	170808	170815	0 %	25 %	50 %	25 %	46198498
4530	NC_005835	GC	3	6	170851	170856	0 %	0 %	50 %	50 %	46198498
4531	NC_005835	CCG	2	6	170869	170874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198498
4532	NC_005835	CGC	2	6	170993	170998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198499
4533	NC_005835	G	7	7	171024	171030	0 %	0 %	100 %	0 %	46198499
4534	NC_005835	CGGG	2	8	171090	171097	0 %	0 %	75 %	25 %	46198499
4535	NC_005835	CGGGCA	2	12	171149	171160	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198499
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4540	NC_005835	GGC	2	6	171251	171256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198499
4541	NC_005835	TCC	2	6	171274	171279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198499
4542	NC_005835	G	6	6	171309	171314	0 %	0 %	100 %	0 %	46198499
4543	NC_005835	TCC	2	6	171376	171381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198499
4544	NC_005835	TCC	2	6	171409	171414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198499
4545	NC_005835	GCC	2	6	171516	171521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198499
4546	NC_005835	GCG	2	6	171540	171545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198499
4547	NC_005835	GGA	2	6	171601	171606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198499
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4552	NC_005835	CGG	2	6	171709	171714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198499
4553	NC_005835	CCAG	2	8	171721	171728	25 %	0 %	25 %	50 %	46198499
4554	NC_005835	GCG	2	6	171741	171746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198499
4555	NC_005835	CTC	3	9	171750	171758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198499
4556	NC_005835	GAG	2	6	171765	171770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198499
4557	NC_005835	GCC	2	6	171825	171830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198499
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4559	NC_005835	AAC	2	6	171948	171953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46198499
4560	NC_005835	GCC	2	6	171964	171969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198499
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4563	NC_005835	CGC	2	6	172106	172111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198499
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4565	NC_005835	CTC	2	6	172213	172218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198500
4566	NC_005835	C	7	7	172234	172240	0 %	0 %	0 %	100 %	46198500
4567	NC_005835	TCC	2	6	172277	172282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198500
4568	NC_005835	GAG	2	6	172303	172308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198500
4569	NC_005835	TGA	2	6	172404	172409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198500
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4571	NC_005835	AGGG	2	8	172589	172596	25 %	0 %	75 %	0 %	46198501
4572	NC_005835	GAG	2	6	172597	172602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198501
4573	NC_005835	GTCCAG	2	12	172615	172626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198501
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4582	NC_005835	CCGC	2	8	172972	172979	0 %	0 %	25 %	75 %	46198501
4583	NC_005835	GAGGCC	2	12	172996	173007	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198501
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4588	NC_005835	G	7	7	173167	173173	0 %	0 %	100 %	0 %	46198501
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4593	NC_005835	CGT	2	6	173499	173504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198501
4594	NC_005835	TGG	2	6	173534	173539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198501
4595	NC_005835	CCT	2	6	173637	173642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198501
4596	NC_005835	ACC	2	6	173654	173659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198501
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4598	NC_005835	GAG	2	6	173713	173718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198501
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4601	NC_005835	GAC	2	6	173800	173805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198501
4602	NC_005835	C	6	6	173848	173853	0 %	0 %	0 %	100 %	46198501
4603	NC_005835	CCA	2	6	173865	173870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198501
4604	NC_005835	CTC	2	6	173929	173934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198501
4605	NC_005835	TCC	2	6	173963	173968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198501
4606	NC_005835	GGA	2	6	174009	174014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198501
4607	NC_005835	GAG	2	6	174019	174024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198501
4608	NC_005835	CGG	2	6	174030	174035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198501
4609	NC_005835	TCC	2	6	174072	174077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198501
4610	NC_005835	C	7	7	174076	174082	0 %	0 %	0 %	100 %	46198501
4611	NC_005835	CAC	3	9	174103	174111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198501
4612	NC_005835	GAG	2	6	174127	174132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198501
4613	NC_005835	CAC	2	6	174142	174147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198501
4614	NC_005835	CCCCTC	2	12	174244	174255	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	46198501
4615	NC_005835	CCCGCA	2	12	174276	174287	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	46198501
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4624	NC_005835	TCC	2	6	174536	174541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198501
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