MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 1876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004572	CA	3	6	337	342	50 %	0 %	0 %	50 %	28492968
2	NC_004572	AC	3	6	374	379	50 %	0 %	0 %	50 %	28492968
3	NC_004572	TA	3	6	540	545	50 %	50 %	0 %	0 %	28492968
4	NC_004572	AC	3	6	568	573	50 %	0 %	0 %	50 %	28492968
5	NC_004572	GT	3	6	904	909	0 %	50 %	50 %	0 %	28492968
6	NC_004572	AT	3	6	1002	1007	50 %	50 %	0 %	0 %	28492968
7	NC_004572	AT	3	6	1238	1243	50 %	50 %	0 %	0 %	28492968
8	NC_004572	AT	3	6	1400	1405	50 %	50 %	0 %	0 %	28492968
9	NC_004572	GA	4	8	2598	2605	50 %	0 %	50 %	0 %	28492969
10	NC_004572	CT	3	6	3381	3386	0 %	50 %	0 %	50 %	28492970
11	NC_004572	GA	3	6	3609	3614	50 %	0 %	50 %	0 %	28492970
12	NC_004572	TG	3	6	4008	4013	0 %	50 %	50 %	0 %	28492971
13	NC_004572	AC	3	6	4492	4497	50 %	0 %	0 %	50 %	28492972
14	NC_004572	AT	4	8	5305	5312	50 %	50 %	0 %	0 %	28492972
15	NC_004572	AC	3	6	5349	5354	50 %	0 %	0 %	50 %	28492972
16	NC_004572	GC	3	6	5669	5674	0 %	0 %	50 %	50 %	28492972
17	NC_004572	AG	3	6	5676	5681	50 %	0 %	50 %	0 %	28492972
18	NC_004572	AG	3	6	6074	6079	50 %	0 %	50 %	0 %	28492972
19	NC_004572	AG	3	6	6261	6266	50 %	0 %	50 %	0 %	28492972
20	NC_004572	AT	3	6	6427	6432	50 %	50 %	0 %	0 %	28492972
21	NC_004572	CT	3	6	7271	7276	0 %	50 %	0 %	50 %	28492973
22	NC_004572	GC	4	8	7565	7572	0 %	0 %	50 %	50 %	28492973
23	NC_004572	TA	3	6	7983	7988	50 %	50 %	0 %	0 %	28492973
24	NC_004572	CA	3	6	8098	8103	50 %	0 %	0 %	50 %	28492973
25	NC_004572	TA	3	6	8574	8579	50 %	50 %	0 %	0 %	28492973
26	NC_004572	GC	3	6	10201	10206	0 %	0 %	50 %	50 %	28492975
27	NC_004572	AT	3	6	10303	10308	50 %	50 %	0 %	0 %	28492975
28	NC_004572	CT	3	6	10699	10704	0 %	50 %	0 %	50 %	28492976
29	NC_004572	CA	3	6	11254	11259	50 %	0 %	0 %	50 %	28492977
30	NC_004572	GT	3	6	12904	12909	0 %	50 %	50 %	0 %	28492980
31	NC_004572	GC	3	6	13812	13817	0 %	0 %	50 %	50 %	28492981
32	NC_004572	TC	3	6	14602	14607	0 %	50 %	0 %	50 %	28492982
33	NC_004572	CT	3	6	15257	15262	0 %	50 %	0 %	50 %	28492982
34	NC_004572	GT	3	6	15293	15298	0 %	50 %	50 %	0 %	28492982
35	NC_004572	GA	3	6	15696	15701	50 %	0 %	50 %	0 %	28492983
36	NC_004572	TA	3	6	15787	15792	50 %	50 %	0 %	0 %	28492983
37	NC_004572	GT	3	6	15848	15853	0 %	50 %	50 %	0 %	28492983
38	NC_004572	CG	3	6	16008	16013	0 %	0 %	50 %	50 %	28492983
39	NC_004572	AT	3	6	16169	16174	50 %	50 %	0 %	0 %	28492983
40	NC_004572	GC	3	6	17054	17059	0 %	0 %	50 %	50 %	28492984
41	NC_004572	TG	3	6	17351	17356	0 %	50 %	50 %	0 %	28492984
42	NC_004572	TC	3	6	17496	17501	0 %	50 %	0 %	50 %	28492984
43	NC_004572	CT	3	6	17922	17927	0 %	50 %	0 %	50 %	28492984
44	NC_004572	TG	3	6	20490	20495	0 %	50 %	50 %	0 %	28492987
45	NC_004572	AT	3	6	21601	21606	50 %	50 %	0 %	0 %	28492987
46	NC_004572	AT	3	6	22113	22118	50 %	50 %	0 %	0 %	28492987
47	NC_004572	AT	3	6	22213	22218	50 %	50 %	0 %	0 %	28492987
48	NC_004572	GC	3	6	22766	22771	0 %	0 %	50 %	50 %	28492988
49	NC_004572	GT	3	6	22863	22868	0 %	50 %	50 %	0 %	28492988
50	NC_004572	CT	3	6	24208	24213	0 %	50 %	0 %	50 %	28492990
51	NC_004572	TA	3	6	24422	24427	50 %	50 %	0 %	0 %	28492990
52	NC_004572	GC	3	6	26450	26455	0 %	0 %	50 %	50 %	28492991
53	NC_004572	AT	3	6	26898	26903	50 %	50 %	0 %	0 %	28492992
54	NC_004572	GA	3	6	27047	27052	50 %	0 %	50 %	0 %	28492993
55	NC_004572	CG	3	6	27324	27329	0 %	0 %	50 %	50 %	28492993
56	NC_004572	AT	3	6	28044	28049	50 %	50 %	0 %	0 %	28492993
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58	NC_004572	AT	3	6	28113	28118	50 %	50 %	0 %	0 %	28492993
59	NC_004572	GA	3	6	28222	28227	50 %	0 %	50 %	0 %	28492993
60	NC_004572	AT	3	6	28443	28448	50 %	50 %	0 %	0 %	28492994
61	NC_004572	GA	3	6	29219	29224	50 %	0 %	50 %	0 %	28492995
62	NC_004572	AC	3	6	29841	29846	50 %	0 %	0 %	50 %	28492996
63	NC_004572	CT	3	6	30605	30610	0 %	50 %	0 %	50 %	28492996
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65	NC_004572	AT	3	6	31280	31285	50 %	50 %	0 %	0 %	28492997
66	NC_004572	CT	3	6	32091	32096	0 %	50 %	0 %	50 %	28492998
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68	NC_004572	GA	3	6	32327	32332	50 %	0 %	50 %	0 %	28492998
69	NC_004572	AC	3	6	32506	32511	50 %	0 %	0 %	50 %	28492998
70	NC_004572	AT	3	6	32907	32912	50 %	50 %	0 %	0 %	28492999
71	NC_004572	AT	3	6	33863	33868	50 %	50 %	0 %	0 %	28493000
72	NC_004572	AG	3	6	34001	34006	50 %	0 %	50 %	0 %	28493000
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74	NC_004572	TA	3	6	34713	34718	50 %	50 %	0 %	0 %	28493001
75	NC_004572	TC	3	6	34720	34725	0 %	50 %	0 %	50 %	28493001
76	NC_004572	CT	3	6	34931	34936	0 %	50 %	0 %	50 %	28493001
77	NC_004572	TC	3	6	34967	34972	0 %	50 %	0 %	50 %	28493001
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80	NC_004572	GA	3	6	36259	36264	50 %	0 %	50 %	0 %	28493003
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82	NC_004572	CG	3	6	36914	36919	0 %	0 %	50 %	50 %	28493003
83	NC_004572	GA	3	6	36952	36957	50 %	0 %	50 %	0 %	28493003
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90	NC_004572	GC	3	6	44054	44059	0 %	0 %	50 %	50 %	28493011
91	NC_004572	GC	3	6	44231	44236	0 %	0 %	50 %	50 %	28493012
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93	NC_004572	AG	3	6	48187	48192	50 %	0 %	50 %	0 %	28493016
94	NC_004572	AG	3	6	48457	48462	50 %	0 %	50 %	0 %	28493016
95	NC_004572	AG	3	6	48468	48473	50 %	0 %	50 %	0 %	28493016
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98	NC_004572	AG	3	6	49076	49081	50 %	0 %	50 %	0 %	28493017
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104	NC_004572	AG	3	6	50680	50685	50 %	0 %	50 %	0 %	28493018
105	NC_004572	TC	3	6	51004	51009	0 %	50 %	0 %	50 %	28493018
106	NC_004572	GC	3	6	52195	52200	0 %	0 %	50 %	50 %	28493019
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108	NC_004572	AT	3	6	52670	52675	50 %	50 %	0 %	0 %	28493019
109	NC_004572	TG	3	6	53072	53077	0 %	50 %	50 %	0 %	28493019
110	NC_004572	AC	3	6	53320	53325	50 %	0 %	0 %	50 %	28493020
111	NC_004572	AT	3	6	53535	53540	50 %	50 %	0 %	0 %	28493020
112	NC_004572	GC	3	6	54168	54173	0 %	0 %	50 %	50 %	28493021
113	NC_004572	TA	3	6	54517	54522	50 %	50 %	0 %	0 %	28493021
114	NC_004572	GA	3	6	54629	54634	50 %	0 %	50 %	0 %	28493021
115	NC_004572	AT	3	6	55084	55089	50 %	50 %	0 %	0 %	28493022
116	NC_004572	AT	3	6	56219	56224	50 %	50 %	0 %	0 %	28493022
117	NC_004572	AT	3	6	56296	56301	50 %	50 %	0 %	0 %	28493022
118	NC_004572	TC	3	6	56310	56315	0 %	50 %	0 %	50 %	28493022
119	NC_004572	TA	3	6	56846	56851	50 %	50 %	0 %	0 %	28493023
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122	NC_004572	AG	4	8	58796	58803	50 %	0 %	50 %	0 %	28493024
123	NC_004572	GA	3	6	59297	59302	50 %	0 %	50 %	0 %	28493025
124	NC_004572	AT	3	6	61137	61142	50 %	50 %	0 %	0 %	28493027
125	NC_004572	CA	3	6	61829	61834	50 %	0 %	0 %	50 %	28493027
126	NC_004572	TC	3	6	62428	62433	0 %	50 %	0 %	50 %	28493028
127	NC_004572	TG	3	6	64041	64046	0 %	50 %	50 %	0 %	28493029
128	NC_004572	CA	3	6	64185	64190	50 %	0 %	0 %	50 %	28493029
129	NC_004572	AT	3	6	64202	64207	50 %	50 %	0 %	0 %	28493029
130	NC_004572	GA	3	6	65167	65172	50 %	0 %	50 %	0 %	28493030
131	NC_004572	CT	3	6	65201	65206	0 %	50 %	0 %	50 %	28493030
132	NC_004572	GA	3	6	66603	66608	50 %	0 %	50 %	0 %	28493031
133	NC_004572	CA	3	6	66657	66662	50 %	0 %	0 %	50 %	28493031
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136	NC_004572	TA	3	6	68467	68472	50 %	50 %	0 %	0 %	28493032
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144	NC_004572	AG	3	6	71737	71742	50 %	0 %	50 %	0 %	28493035
145	NC_004572	AG	3	6	72342	72347	50 %	0 %	50 %	0 %	28493036
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