MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 449

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004572	GTTTT	2	10	4906	4915	0 %	80 %	20 %	0 %	28492972
2	NC_004572	TATGT	2	10	5172	5181	20 %	60 %	20 %	0 %	28492972
3	NC_004572	CAGGG	2	10	5811	5820	20 %	0 %	60 %	20 %	28492972
4	NC_004572	AAGGC	2	10	5874	5883	40 %	0 %	40 %	20 %	28492972
5	NC_004572	TGCCG	2	10	6907	6916	0 %	20 %	40 %	40 %	28492973
6	NC_004572	AGCTG	2	10	8546	8555	20 %	20 %	40 %	20 %	28492973
7	NC_004572	ATGGT	2	10	10019	10028	20 %	40 %	40 %	0 %	28492975
8	NC_004572	AGAAC	2	10	11240	11249	60 %	0 %	20 %	20 %	28492977
9	NC_004572	ATAAA	2	10	15878	15887	80 %	20 %	0 %	0 %	28492983
10	NC_004572	CTTGT	2	10	15955	15964	0 %	60 %	20 %	20 %	28492983
11	NC_004572	AGCAA	2	10	16056	16065	60 %	0 %	20 %	20 %	28492983
12	NC_004572	TGACT	2	10	16182	16191	20 %	40 %	20 %	20 %	28492983
13	NC_004572	CCAAT	2	10	26792	26801	40 %	20 %	0 %	40 %	28492992
14	NC_004572	TCAAT	2	10	28050	28059	40 %	40 %	0 %	20 %	28492993
15	NC_004572	CTCAA	2	10	30910	30919	40 %	20 %	0 %	40 %	28492997
16	NC_004572	GAACA	2	10	37353	37362	60 %	0 %	20 %	20 %	28493004
17	NC_004572	CGACT	2	10	37736	37745	20 %	20 %	20 %	40 %	28493005
18	NC_004572	CTATT	2	10	41524	41533	20 %	60 %	0 %	20 %	28493007
19	NC_004572	TGTTC	2	10	44359	44368	0 %	60 %	20 %	20 %	28493012
20	NC_004572	TCGTT	2	10	46702	46711	0 %	60 %	20 %	20 %	28493014
21	NC_004572	TTACC	2	10	48641	48650	20 %	40 %	0 %	40 %	28493016
22	NC_004572	TCTTG	2	10	53380	53389	0 %	60 %	20 %	20 %	28493020
23	NC_004572	TGGTA	2	10	57565	57574	20 %	40 %	40 %	0 %	28493023
24	NC_004572	TGGTA	2	10	58705	58714	20 %	40 %	40 %	0 %	28493024
25	NC_004572	AATAA	2	10	61433	61442	80 %	20 %	0 %	0 %	28493027
26	NC_004572	ATTTG	2	10	63677	63686	20 %	60 %	20 %	0 %	28493029
27	NC_004572	GATGC	2	10	66514	66523	20 %	20 %	40 %	20 %	28493031
28	NC_004572	AGGAT	2	10	69647	69656	40 %	20 %	40 %	0 %	28493032
29	NC_004572	ATCTG	2	10	78366	78375	20 %	40 %	20 %	20 %	28493039
30	NC_004572	CATGA	2	10	79090	79099	40 %	20 %	20 %	20 %	28493039
31	NC_004572	ATTTC	2	10	79835	79844	20 %	60 %	0 %	20 %	28493039
32	NC_004572	CAAAT	2	10	81695	81704	60 %	20 %	0 %	20 %	28493040
33	NC_004572	TTTTG	2	10	85987	85996	0 %	80 %	20 %	0 %	28493044
34	NC_004572	GACTG	2	10	88385	88394	20 %	20 %	40 %	20 %	28493046
35	NC_004572	AGGCA	2	10	89070	89079	40 %	0 %	40 %	20 %	28493047
36	NC_004572	TCAGA	2	10	89545	89554	40 %	20 %	20 %	20 %	28493047
37	NC_004572	CAGAG	2	10	89875	89884	40 %	0 %	40 %	20 %	28493047
38	NC_004572	TGCGC	2	10	91795	91804	0 %	20 %	40 %	40 %	28493049
39	NC_004572	TGAAT	2	10	92540	92549	40 %	40 %	20 %	0 %	28493049
40	NC_004572	GCGCT	2	10	95746	95755	0 %	20 %	40 %	40 %	28493053
41	NC_004572	AAATG	2	10	97011	97020	60 %	20 %	20 %	0 %	28493054
42	NC_004572	ACAAG	2	10	98250	98259	60 %	0 %	20 %	20 %	28493055
43	NC_004572	TACAT	2	10	98466	98475	40 %	40 %	0 %	20 %	28493055
44	NC_004572	AGCGT	2	10	99678	99687	20 %	20 %	40 %	20 %	28493056
45	NC_004572	CTGTG	2	10	99779	99788	0 %	40 %	40 %	20 %	28493056
46	NC_004572	TATTG	2	10	100385	100394	20 %	60 %	20 %	0 %	28493057
47	NC_004572	GAATT	2	10	111989	111998	40 %	40 %	20 %	0 %	28493067
48	NC_004572	GTTTT	2	10	113034	113043	0 %	80 %	20 %	0 %	28493067
49	NC_004572	CAGTA	2	10	114626	114635	40 %	20 %	20 %	20 %	28493068
50	NC_004572	TTGTT	2	10	116815	116824	0 %	80 %	20 %	0 %	28493069
51	NC_004572	ATGCC	2	10	119024	119033	20 %	20 %	20 %	40 %	28493071
52	NC_004572	AGGTG	2	10	120592	120601	20 %	20 %	60 %	0 %	28493071
53	NC_004572	TGGTG	2	10	122161	122170	0 %	40 %	60 %	0 %	28493071
54	NC_004572	TAGGT	2	10	122882	122891	20 %	40 %	40 %	0 %	28493071
55	NC_004572	GTCTG	2	10	123461	123470	0 %	40 %	40 %	20 %	28493071
56	NC_004572	TGTTC	2	10	123814	123823	0 %	60 %	20 %	20 %	28493071
57	NC_004572	CAGAA	2	10	125326	125335	60 %	0 %	20 %	20 %	28493071
58	NC_004572	GTGTG	2	10	126260	126269	0 %	40 %	60 %	0 %	28493074
59	NC_004572	TTAGC	2	10	127369	127378	20 %	40 %	20 %	20 %	28493076
60	NC_004572	GTGAT	2	10	131748	131757	20 %	40 %	40 %	0 %	28493079
61	NC_004572	TTTCT	2	10	133306	133315	0 %	80 %	0 %	20 %	28493084
62	NC_004572	TTTTG	2	10	133357	133366	0 %	80 %	20 %	0 %	28493084
63	NC_004572	TTTTG	2	10	133689	133698	0 %	80 %	20 %	0 %	28493084
64	NC_004572	AGGAC	2	10	135421	135430	40 %	0 %	40 %	20 %	28493085
65	NC_004572	GCCGC	2	10	135789	135798	0 %	0 %	40 %	60 %	28493085
66	NC_004572	TTGTA	2	10	137555	137564	20 %	60 %	20 %	0 %	28493086
67	NC_004572	GCCAT	2	10	139149	139158	20 %	20 %	20 %	40 %	28493088
68	NC_004572	AACTG	2	10	139933	139942	40 %	20 %	20 %	20 %	28493088
69	NC_004572	CAAGA	2	10	140935	140944	60 %	0 %	20 %	20 %	28493088
70	NC_004572	TATTG	2	10	144487	144496	20 %	60 %	20 %	0 %	28493091
71	NC_004572	TTATT	2	10	146456	146465	20 %	80 %	0 %	0 %	28493092
72	NC_004572	CTTTC	2	10	152107	152116	0 %	60 %	0 %	40 %	28493097
73	NC_004572	CAGCA	2	10	155604	155613	40 %	0 %	20 %	40 %	28493101
74	NC_004572	GCTCA	2	10	156651	156660	20 %	20 %	20 %	40 %	28493102
75	NC_004572	CAATG	2	10	159378	159387	40 %	20 %	20 %	20 %	28493103
76	NC_004572	ATCAA	2	10	163030	163039	60 %	20 %	0 %	20 %	28493106
77	NC_004572	GTTTT	2	10	163713	163722	0 %	80 %	20 %	0 %	28493107
78	NC_004572	CATGA	2	10	190276	190285	40 %	20 %	20 %	20 %	28493119
79	NC_004572	TACAG	2	10	190814	190823	40 %	20 %	20 %	20 %	28493120
80	NC_004572	TACAG	2	10	190847	190856	40 %	20 %	20 %	20 %	28493120
81	NC_004572	ACAAA	2	10	193751	193760	80 %	0 %	0 %	20 %	28493123
82	NC_004572	TGTTT	2	10	195233	195242	0 %	80 %	20 %	0 %	28493124
83	NC_004572	GAAGT	2	10	196833	196842	40 %	20 %	40 %	0 %	28493124
84	NC_004572	TCATC	2	10	197352	197361	20 %	40 %	0 %	40 %	28493126
85	NC_004572	TCGAC	2	10	197825	197834	20 %	20 %	20 %	40 %	28493126
86	NC_004572	ATGCG	2	10	198877	198886	20 %	20 %	40 %	20 %	28493127
87	NC_004572	TGGGG	2	10	202572	202581	0 %	20 %	80 %	0 %	28493129
88	NC_004572	TGCAC	2	10	204454	204463	20 %	20 %	20 %	40 %	28493130
89	NC_004572	GGTTG	2	10	204904	204913	0 %	40 %	60 %	0 %	28493131
90	NC_004572	TTTCT	2	10	205104	205113	0 %	80 %	0 %	20 %	28493131
91	NC_004572	AATGC	2	10	211073	211082	40 %	20 %	20 %	20 %	28493136
92	NC_004572	GTCGT	2	10	218788	218797	0 %	40 %	40 %	20 %	28493138
93	NC_004572	ACACC	2	10	218868	218877	40 %	0 %	0 %	60 %	28493138
94	NC_004572	ACGTT	2	10	220009	220018	20 %	40 %	20 %	20 %	28493139
95	NC_004572	TGTTT	2	10	222356	222365	0 %	80 %	20 %	0 %	28493141
96	NC_004572	ATTTT	2	10	223618	223627	20 %	80 %	0 %	0 %	28493143
97	NC_004572	TTTGC	2	10	225999	226008	0 %	60 %	20 %	20 %	28493146
98	NC_004572	TCTTG	2	10	226368	226377	0 %	60 %	20 %	20 %	28493147
99	NC_004572	ATCAA	2	10	229508	229517	60 %	20 %	0 %	20 %	28493149
100	NC_004572	TCAGC	2	10	232948	232957	20 %	20 %	20 %	40 %	28493150
101	NC_004572	CGTAA	2	10	233768	233777	40 %	20 %	20 %	20 %	28493150
102	NC_004572	TACAA	2	10	235769	235778	60 %	20 %	0 %	20 %	28493153
103	NC_004572	GCGGA	2	10	235960	235969	20 %	0 %	60 %	20 %	28493153
104	NC_004572	TGGAC	2	10	236596	236605	20 %	20 %	40 %	20 %	28493153
105	NC_004572	TTGAA	2	10	237680	237689	40 %	40 %	20 %	0 %	28493154
106	NC_004572	CGTCA	2	10	239243	239252	20 %	20 %	20 %	40 %	28493155
107	NC_004572	GTGAA	2	10	250484	250493	40 %	20 %	40 %	0 %	28493162
108	NC_004572	TATTC	2	10	250590	250599	20 %	60 %	0 %	20 %	28493162
109	NC_004572	AGAAA	2	10	250816	250825	80 %	0 %	20 %	0 %	28493162
110	NC_004572	AGGTG	2	10	259816	259825	20 %	20 %	60 %	0 %	28493163
111	NC_004572	TTGGA	2	10	266888	266897	20 %	40 %	40 %	0 %	28493166
112	NC_004572	ATAAC	2	10	267287	267296	60 %	20 %	0 %	20 %	28493166
113	NC_004572	CAGTA	2	10	268373	268382	40 %	20 %	20 %	20 %	28493166
114	NC_004572	GCAGC	2	10	268429	268438	20 %	0 %	40 %	40 %	28493166
115	NC_004572	AGTAC	2	10	273381	273390	40 %	20 %	20 %	20 %	28493169
116	NC_004572	GTATC	2	10	277545	277554	20 %	40 %	20 %	20 %	28493170
117	NC_004572	ATAAC	2	10	285260	285269	60 %	20 %	0 %	20 %	28493171
118	NC_004572	CAGGT	2	10	287143	287152	20 %	20 %	40 %	20 %	28493172
119	NC_004572	GCTGG	2	10	291984	291993	0 %	20 %	60 %	20 %	28493176
120	NC_004572	TTTCG	2	10	293243	293252	0 %	60 %	20 %	20 %	28493177
121	NC_004572	GTTAG	2	10	295580	295589	20 %	40 %	40 %	0 %	28493179
122	NC_004572	CAAAT	2	10	298727	298736	60 %	20 %	0 %	20 %	28493181
123	NC_004572	GATTC	2	10	300381	300390	20 %	40 %	20 %	20 %	28493182
124	NC_004572	AACAG	2	10	301780	301789	60 %	0 %	20 %	20 %	28493183
125	NC_004572	AAAGC	2	10	303516	303525	60 %	0 %	20 %	20 %	28493184
126	NC_004572	GTTTT	2	10	304881	304890	0 %	80 %	20 %	0 %	28493186
127	NC_004572	ACAAA	2	10	308450	308459	80 %	0 %	0 %	20 %	28493189
128	NC_004572	TTTAT	2	10	311061	311070	20 %	80 %	0 %	0 %	28493191
129	NC_004572	ATTAC	2	10	314382	314391	40 %	40 %	0 %	20 %	28493194
130	NC_004572	TTACC	2	10	315073	315082	20 %	40 %	0 %	40 %	28493194
131	NC_004572	AGCGC	2	10	316064	316073	20 %	0 %	40 %	40 %	28493195
132	NC_004572	CTTTT	2	10	316772	316781	0 %	80 %	0 %	20 %	28493196
133	NC_004572	TTGCA	2	10	318918	318927	20 %	40 %	20 %	20 %	28493198
134	NC_004572	CGGGG	2	10	319874	319883	0 %	0 %	80 %	20 %	28493201
135	NC_004572	CCCTT	2	10	323962	323971	0 %	40 %	0 %	60 %	28493207
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