MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004572	TTTG	2	8	290514	290521	0 %	75 %	25 %	0 %	28493175
4002	NC_004572	TCT	2	6	290551	290556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493175
4003	NC_004572	TGG	2	6	290601	290606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493175
4004	NC_004572	ATG	2	6	290648	290653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493175
4005	NC_004572	T	7	7	290669	290675	0 %	100 %	0 %	0 %	28493175
4006	NC_004572	AT	3	6	290720	290725	50 %	50 %	0 %	0 %	28493175
4007	NC_004572	TGG	2	6	290766	290771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493175
4008	NC_004572	TTC	2	6	290777	290782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493175
4009	NC_004572	TGT	2	6	290832	290837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493175
4010	NC_004572	TGC	2	6	290908	290913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493175
4011	NC_004572	TGG	2	6	291240	291245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493176
4012	NC_004572	CGA	2	6	291278	291283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493176
4013	NC_004572	AG	3	6	291289	291294	50 %	0 %	50 %	0 %	28493176
4014	NC_004572	GTT	2	6	291299	291304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493176
4015	NC_004572	TGAT	2	8	291311	291318	25 %	50 %	25 %	0 %	28493176
4016	NC_004572	AT	4	8	291404	291411	50 %	50 %	0 %	0 %	28493176
4017	NC_004572	AGA	2	6	291471	291476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493176
4018	NC_004572	GGCC	2	8	291498	291505	0 %	0 %	50 %	50 %	28493176
4019	NC_004572	AAT	2	6	291591	291596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493176
4020	NC_004572	GAT	2	6	291610	291615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493176
4021	NC_004572	AC	3	6	291713	291718	50 %	0 %	0 %	50 %	28493176
4022	NC_004572	TGT	2	6	291779	291784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493176
4023	NC_004572	T	6	6	291853	291858	0 %	100 %	0 %	0 %	28493176
4024	NC_004572	GCTGG	2	10	291984	291993	0 %	20 %	60 %	20 %	28493176
4025	NC_004572	GAT	2	6	292032	292037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493176
4026	NC_004572	AAG	2	6	292090	292095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493176
4027	NC_004572	CAAT	2	8	292103	292110	50 %	25 %	0 %	25 %	28493176
4028	NC_004572	T	7	7	292143	292149	0 %	100 %	0 %	0 %	28493176
4029	NC_004572	TTG	2	6	292166	292171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493176
4030	NC_004572	CTTT	2	8	292192	292199	0 %	75 %	0 %	25 %	28493176
4031	NC_004572	GTT	2	6	292254	292259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493176
4032	NC_004572	ATA	2	6	292298	292303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493176
4033	NC_004572	TGC	2	6	292343	292348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493176
4034	NC_004572	GCT	2	6	292362	292367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493176
4035	NC_004572	TC	3	6	292493	292498	0 %	50 %	0 %	50 %	28493176
4036	NC_004572	CGC	2	6	292499	292504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493176
4037	NC_004572	GT	4	8	292576	292583	0 %	50 %	50 %	0 %	28493177
4038	NC_004572	TGAT	2	8	292589	292596	25 %	50 %	25 %	0 %	28493177
4039	NC_004572	ATT	2	6	292603	292608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493177
4040	NC_004572	CTG	2	6	292619	292624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493177
4041	NC_004572	CCA	2	6	292703	292708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493177
4042	NC_004572	AG	3	6	292732	292737	50 %	0 %	50 %	0 %	28493177
4043	NC_004572	TGG	2	6	292791	292796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493177
4044	NC_004572	GTT	2	6	292816	292821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493177
4045	NC_004572	ATCA	2	8	292841	292848	50 %	25 %	0 %	25 %	28493177
4046	NC_004572	TTG	2	6	292908	292913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493177
4047	NC_004572	TTC	3	9	292947	292955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493177
4048	NC_004572	TTC	2	6	293073	293078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493177
4049	NC_004572	A	6	6	293106	293111	100 %	0 %	0 %	0 %	28493177
4050	NC_004572	GTT	2	6	293144	293149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493177
4051	NC_004572	TA	3	6	293235	293240	50 %	50 %	0 %	0 %	28493177
4052	NC_004572	TTTCG	2	10	293243	293252	0 %	60 %	20 %	20 %	28493177
4053	NC_004572	GAA	2	6	293362	293367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493177
4054	NC_004572	TCT	2	6	293416	293421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493177
4055	NC_004572	TTA	2	6	293459	293464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493177
4056	NC_004572	TAT	2	6	293493	293498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493177
4057	NC_004572	GCG	2	6	293539	293544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493177
4058	NC_004572	TGC	2	6	293577	293582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493177
4059	NC_004572	ATG	2	6	293657	293662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493177
4060	NC_004572	GAC	2	6	294151	294156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493178
4061	NC_004572	AGG	2	6	294158	294163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493178
4062	NC_004572	TGC	2	6	294225	294230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493178
4063	NC_004572	TGC	2	6	294237	294242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493178
4064	NC_004572	TTC	2	6	294371	294376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493178
4065	NC_004572	TTG	2	6	294428	294433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493178
4066	NC_004572	GTT	2	6	294478	294483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493178
4067	NC_004572	GTG	2	6	294563	294568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493178
4068	NC_004572	ATA	2	6	294670	294675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493178
4069	NC_004572	CCT	2	6	294689	294694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493178
4070	NC_004572	A	6	6	294798	294803	100 %	0 %	0 %	0 %	28493179
4071	NC_004572	GT	3	6	294827	294832	0 %	50 %	50 %	0 %	28493179
4072	NC_004572	GT	3	6	294889	294894	0 %	50 %	50 %	0 %	28493179
4073	NC_004572	TCC	2	6	294967	294972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493179
4074	NC_004572	TC	3	6	294985	294990	0 %	50 %	0 %	50 %	28493179
4075	NC_004572	CG	3	6	295001	295006	0 %	0 %	50 %	50 %	28493179
4076	NC_004572	TCT	2	6	295034	295039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493179
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4078	NC_004572	CCG	2	6	295077	295082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493179
4079	NC_004572	AGGG	2	8	295111	295118	25 %	0 %	75 %	0 %	28493179
4080	NC_004572	GCT	2	6	295151	295156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493179
4081	NC_004572	TATGTC	2	12	295229	295240	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28493179
4082	NC_004572	CGT	2	6	295284	295289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493179
4083	NC_004572	TTG	2	6	295350	295355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493179
4084	NC_004572	CTT	2	6	295412	295417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493179
4085	NC_004572	CGGG	2	8	295419	295426	0 %	0 %	75 %	25 %	28493179
4086	NC_004572	GTTAG	2	10	295580	295589	20 %	40 %	40 %	0 %	28493179
4087	NC_004572	GTT	2	6	295685	295690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493179
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4089	NC_004572	GC	3	6	295799	295804	0 %	0 %	50 %	50 %	28493179
4090	NC_004572	TC	3	6	295815	295820	0 %	50 %	0 %	50 %	28493179
4091	NC_004572	TGT	3	9	295837	295845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493179
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4093	NC_004572	CAT	2	6	295968	295973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493179
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4095	NC_004572	ACT	2	6	296069	296074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493179
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4105	NC_004572	ACT	2	6	296402	296407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493179
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4107	NC_004572	TGT	2	6	296419	296424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493179
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4109	NC_004572	CAC	2	6	296445	296450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493179
4110	NC_004572	CA	3	6	296458	296463	50 %	0 %	0 %	50 %	28493179
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4112	NC_004572	CAT	2	6	296598	296603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493179
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4115	NC_004572	ACT	2	6	296735	296740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493179
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4120	NC_004572	CA	3	6	296791	296796	50 %	0 %	0 %	50 %	28493179
4121	NC_004572	TGT	3	9	296836	296844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493179
4122	NC_004572	CAT	2	6	296931	296936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493179
4123	NC_004572	CAT	2	6	296967	296972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493179
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4125	NC_004572	ACT	2	6	297068	297073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493179
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