MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004572	TGA	2	6	196895	196900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493124
3002	NC_004572	TTG	2	6	196918	196923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493124
3003	NC_004572	CGTG	2	8	196932	196939	0 %	25 %	50 %	25 %	28493124
3004	NC_004572	GTT	2	6	196956	196961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493125
3005	NC_004572	ACTG	2	8	196968	196975	25 %	25 %	25 %	25 %	28493125
3006	NC_004572	GCG	2	6	196993	196998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493125
3007	NC_004572	GCT	2	6	197005	197010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493125
3008	NC_004572	CTG	2	6	197048	197053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493125
3009	NC_004572	CA	3	6	197058	197063	50 %	0 %	0 %	50 %	28493125
3010	NC_004572	CGC	2	6	197109	197114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493125
3011	NC_004572	GGCA	2	8	197337	197344	25 %	0 %	50 %	25 %	28493126
3012	NC_004572	TCATC	2	10	197352	197361	20 %	40 %	0 %	40 %	28493126
3013	NC_004572	GC	4	8	197631	197638	0 %	0 %	50 %	50 %	28493126
3014	NC_004572	ATG	2	6	197687	197692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493126
3015	NC_004572	AGG	2	6	197723	197728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493126
3016	NC_004572	GC	3	6	197796	197801	0 %	0 %	50 %	50 %	28493126
3017	NC_004572	TCGAC	2	10	197825	197834	20 %	20 %	20 %	40 %	28493126
3018	NC_004572	GAAA	2	8	197878	197885	75 %	0 %	25 %	0 %	28493127
3019	NC_004572	TAAT	2	8	198042	198049	50 %	50 %	0 %	0 %	28493127
3020	NC_004572	A	6	6	198062	198067	100 %	0 %	0 %	0 %	28493127
3021	NC_004572	CGGC	2	8	198093	198100	0 %	0 %	50 %	50 %	28493127
3022	NC_004572	GTT	2	6	198161	198166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493127
3023	NC_004572	A	6	6	198184	198189	100 %	0 %	0 %	0 %	28493127
3024	NC_004572	TG	3	6	198372	198377	0 %	50 %	50 %	0 %	28493127
3025	NC_004572	AAT	2	6	198383	198388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493127
3026	NC_004572	AG	3	6	198392	198397	50 %	0 %	50 %	0 %	28493127
3027	NC_004572	T	8	8	198399	198406	0 %	100 %	0 %	0 %	28493127
3028	NC_004572	GCG	2	6	198432	198437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493127
3029	NC_004572	CTTTGA	2	12	198460	198471	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28493127
3030	NC_004572	TCT	2	6	198511	198516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493127
3031	NC_004572	GAG	2	6	198536	198541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493127
3032	NC_004572	CAG	2	6	198544	198549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493127
3033	NC_004572	TGAACA	2	12	198796	198807	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	28493127
3034	NC_004572	AC	3	6	198815	198820	50 %	0 %	0 %	50 %	28493127
3035	NC_004572	GCA	2	6	198821	198826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493127
3036	NC_004572	ATGCG	2	10	198877	198886	20 %	20 %	40 %	20 %	28493127
3037	NC_004572	TTG	2	6	198915	198920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493127
3038	NC_004572	AAG	2	6	198951	198956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493127
3039	NC_004572	CGC	2	6	199058	199063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493127
3040	NC_004572	TC	3	6	199147	199152	0 %	50 %	0 %	50 %	28493127
3041	NC_004572	TC	3	6	199196	199201	0 %	50 %	0 %	50 %	28493127
3042	NC_004572	TAA	2	6	199231	199236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493127
3043	NC_004572	AGA	2	6	199319	199324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493127
3044	NC_004572	A	6	6	199327	199332	100 %	0 %	0 %	0 %	28493127
3045	NC_004572	A	6	6	199387	199392	100 %	0 %	0 %	0 %	28493127
3046	NC_004572	GC	3	6	199411	199416	0 %	0 %	50 %	50 %	28493127
3047	NC_004572	AGC	2	6	199446	199451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493127
3048	NC_004572	ATT	2	6	199467	199472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493127
3049	NC_004572	TGT	2	6	199585	199590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493127
3050	NC_004572	TC	3	6	199611	199616	0 %	50 %	0 %	50 %	28493127
3051	NC_004572	G	6	6	199641	199646	0 %	0 %	100 %	0 %	28493127
3052	NC_004572	TCCG	2	8	199763	199770	0 %	25 %	25 %	50 %	28493127
3053	NC_004572	CTG	2	6	199803	199808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493127
3054	NC_004572	GTT	2	6	199823	199828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493127
3055	NC_004572	T	7	7	199878	199884	0 %	100 %	0 %	0 %	28493127
3056	NC_004572	GAT	2	6	199907	199912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493127
3057	NC_004572	GGCC	2	8	200014	200021	0 %	0 %	50 %	50 %	28493127
3058	NC_004572	GTT	2	6	200087	200092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493127
3059	NC_004572	T	7	7	200198	200204	0 %	100 %	0 %	0 %	28493127
3060	NC_004572	GGA	2	6	200206	200211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493127
3061	NC_004572	TAC	3	9	200342	200350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493127
3062	NC_004572	TGG	2	6	200356	200361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493127
3063	NC_004572	T	8	8	200473	200480	0 %	100 %	0 %	0 %	28493128
3064	NC_004572	TG	3	6	200543	200548	0 %	50 %	50 %	0 %	28493128
3065	NC_004572	TTG	2	6	200557	200562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493128
3066	NC_004572	TTG	2	6	200581	200586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493128
3067	NC_004572	AG	3	6	201514	201519	50 %	0 %	50 %	0 %	28493129
3068	NC_004572	GA	3	6	201522	201527	50 %	0 %	50 %	0 %	28493129
3069	NC_004572	GAA	2	6	201562	201567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493129
3070	NC_004572	A	6	6	201578	201583	100 %	0 %	0 %	0 %	28493129
3071	NC_004572	ATT	2	6	201644	201649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493129
3072	NC_004572	TAC	2	6	201670	201675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493129
3073	NC_004572	TGC	2	6	201690	201695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493129
3074	NC_004572	ATG	2	6	201740	201745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493129
3075	NC_004572	TCGC	2	8	201789	201796	0 %	25 %	25 %	50 %	28493129
3076	NC_004572	CA	3	6	201887	201892	50 %	0 %	0 %	50 %	28493129
3077	NC_004572	TTA	2	6	201896	201901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493129
3078	NC_004572	CTT	2	6	201967	201972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493129
3079	NC_004572	ATG	2	6	201973	201978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493129
3080	NC_004572	TTG	2	6	202151	202156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493129
3081	NC_004572	TGC	2	6	202224	202229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493129
3082	NC_004572	ATCC	2	8	202310	202317	25 %	25 %	0 %	50 %	28493129
3083	NC_004572	GCG	2	6	202370	202375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493129
3084	NC_004572	AGC	2	6	202380	202385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493129
3085	NC_004572	GA	3	6	202402	202407	50 %	0 %	50 %	0 %	28493129
3086	NC_004572	TGT	2	6	202428	202433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493129
3087	NC_004572	CT	3	6	202466	202471	0 %	50 %	0 %	50 %	28493129
3088	NC_004572	TGGGG	2	10	202572	202581	0 %	20 %	80 %	0 %	28493129
3089	NC_004572	AT	3	6	202585	202590	50 %	50 %	0 %	0 %	28493129
3090	NC_004572	GCA	2	6	202606	202611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493129
3091	NC_004572	GCGT	2	8	202643	202650	0 %	25 %	50 %	25 %	28493129
3092	NC_004572	GAA	2	6	202654	202659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493129
3093	NC_004572	GCC	2	6	202700	202705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493129
3094	NC_004572	C	6	6	202704	202709	0 %	0 %	0 %	100 %	28493129
3095	NC_004572	TTC	2	6	202751	202756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493129
3096	NC_004572	GGTA	2	8	202761	202768	25 %	25 %	50 %	0 %	28493129
3097	NC_004572	AAC	2	6	202801	202806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493129
3098	NC_004572	AAC	2	6	202822	202827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493129
3099	NC_004572	GCA	2	6	202834	202839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493129
3100	NC_004572	ATGG	2	8	202946	202953	25 %	25 %	50 %	0 %	28493129
3101	NC_004572	CA	3	6	202970	202975	50 %	0 %	0 %	50 %	28493129
3102	NC_004572	TC	3	6	203006	203011	0 %	50 %	0 %	50 %	28493129
3103	NC_004572	GTC	2	6	203025	203030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493129
3104	NC_004572	TGA	2	6	203172	203177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493129
3105	NC_004572	TGA	2	6	203220	203225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493129
3106	NC_004572	AT	3	6	203251	203256	50 %	50 %	0 %	0 %	28493129
3107	NC_004572	CGC	2	6	203276	203281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493129
3108	NC_004572	TTG	2	6	203354	203359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493129
3109	NC_004572	ATA	2	6	203371	203376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493129
3110	NC_004572	ATG	2	6	203492	203497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493129
3111	NC_004572	TGA	2	6	203523	203528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493129
3112	NC_004572	TTGA	2	8	203539	203546	25 %	50 %	25 %	0 %	28493129
3113	NC_004572	TGA	2	6	203592	203597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493129
3114	NC_004572	GAT	2	6	203674	203679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493129
3115	NC_004572	TA	3	6	203778	203783	50 %	50 %	0 %	0 %	28493129
3116	NC_004572	AT	4	8	203836	203843	50 %	50 %	0 %	0 %	28493129
3117	NC_004572	GAA	2	6	203865	203870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493129
3118	NC_004572	TAC	2	6	203888	203893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493129
3119	NC_004572	AGGA	2	8	203896	203903	50 %	0 %	50 %	0 %	28493129
3120	NC_004572	CAAT	3	12	204431	204442	50 %	25 %	0 %	25 %	28493130
3121	NC_004572	TGCAC	2	10	204454	204463	20 %	20 %	20 %	40 %	28493130
3122	NC_004572	TGG	2	6	204850	204855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493131
3123	NC_004572	GGTTG	2	10	204904	204913	0 %	40 %	60 %	0 %	28493131
3124	NC_004572	TTG	2	6	204918	204923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493131
3125	NC_004572	GCC	2	6	204943	204948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493131
3126	NC_004572	AAT	2	6	204958	204963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493131
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3128	NC_004572	TCG	2	6	205012	205017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493131
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3231	NC_004572	TG	3	6	215158	215163	0 %	50 %	50 %	0 %	28493137
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3241	NC_004572	CCA	2	6	219984	219989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493139
3242	NC_004572	ACGTT	2	10	220009	220018	20 %	40 %	20 %	20 %	28493139
3243	NC_004572	TC	4	8	220513	220520	0 %	50 %	0 %	50 %	28493140
3244	NC_004572	AGT	2	6	220592	220597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493140
3245	NC_004572	TCAC	2	8	220703	220710	25 %	25 %	0 %	50 %	28493140
3246	NC_004572	A	7	7	220736	220742	100 %	0 %	0 %	0 %	28493140
3247	NC_004572	AGA	2	6	220747	220752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493140
3248	NC_004572	AAG	2	6	220804	220809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493140
3249	NC_004572	CAA	2	6	220821	220826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493140
3250	NC_004572	CAGGCC	2	12	220900	220911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	28493140
3251	NC_004572	GA	3	6	220915	220920	50 %	0 %	50 %	0 %	28493140
3252	NC_004572	GTG	2	6	220942	220947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493140
3253	NC_004572	CCT	2	6	221066	221071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493140
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3259	NC_004572	GGCT	2	8	221369	221376	0 %	25 %	50 %	25 %	28493140
3260	NC_004572	CT	3	6	221474	221479	0 %	50 %	0 %	50 %	28493140
3261	NC_004572	CTG	2	6	221484	221489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493140
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3483	NC_004572	TTTG	2	8	234232	234239	0 %	75 %	25 %	0 %	28493150
3484	NC_004572	AAC	2	6	234267	234272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493150
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3489	NC_004572	A	6	6	234910	234915	100 %	0 %	0 %	0 %	28493151
3490	NC_004572	ATT	2	6	234918	234923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493151
3491	NC_004572	GA	3	6	234937	234942	50 %	0 %	50 %	0 %	28493151
3492	NC_004572	AGG	2	6	234972	234977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493151
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3494	NC_004572	TCT	2	6	235056	235061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493151
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3496	NC_004572	GGC	2	6	235178	235183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493152
3497	NC_004572	CTA	2	6	235216	235221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493152
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3500	NC_004572	TTC	2	6	235280	235285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493152

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