MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_004572	ACA	3	9	125421	125429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493072
2003	NC_004572	GT	3	6	125472	125477	0 %	50 %	50 %	0 %	28493072
2004	NC_004572	CGC	2	6	125567	125572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493072
2005	NC_004572	AAC	2	6	125586	125591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493072
2006	NC_004572	CT	3	6	125627	125632	0 %	50 %	0 %	50 %	28493072
2007	NC_004572	CG	3	6	125668	125673	0 %	0 %	50 %	50 %	28493072
2008	NC_004572	AGC	2	6	125684	125689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493072
2009	NC_004572	CG	3	6	125695	125700	0 %	0 %	50 %	50 %	28493072
2010	NC_004572	CTT	2	6	125703	125708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493072
2011	NC_004572	GCA	2	6	125709	125714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493072
2012	NC_004572	GC	3	6	125737	125742	0 %	0 %	50 %	50 %	28493072
2013	NC_004572	CTG	2	6	125787	125792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493072
2014	NC_004572	CAA	2	6	125809	125814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493072
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2018	NC_004572	GA	3	6	126010	126015	50 %	0 %	50 %	0 %	28493073
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2021	NC_004572	CGA	2	6	126092	126097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493073
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2034	NC_004572	TGCT	2	8	126593	126600	0 %	50 %	25 %	25 %	28493074
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2057	NC_004572	ACC	2	6	128068	128073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493076
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2243	NC_004572	AGA	2	6	139229	139234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493088
2244	NC_004572	TCG	2	6	139357	139362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493088
2245	NC_004572	CCCA	2	8	139367	139374	25 %	0 %	0 %	75 %	28493088
2246	NC_004572	GCA	3	9	139427	139435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493088
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2248	NC_004572	ATG	2	6	139598	139603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493088
2249	NC_004572	CCA	2	6	139621	139626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493088
2250	NC_004572	CAT	2	6	139662	139667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493088
2251	NC_004572	TAA	2	6	139701	139706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493088
2252	NC_004572	CCCA	2	8	139836	139843	25 %	0 %	0 %	75 %	28493088
2253	NC_004572	CACC	2	8	139874	139881	25 %	0 %	0 %	75 %	28493088
2254	NC_004572	AACTG	2	10	139933	139942	40 %	20 %	20 %	20 %	28493088
2255	NC_004572	GCT	2	6	139998	140003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493088
2256	NC_004572	TAA	2	6	140051	140056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493088
2257	NC_004572	A	6	6	140055	140060	100 %	0 %	0 %	0 %	28493088
2258	NC_004572	CAG	2	6	140100	140105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493088
2259	NC_004572	CCA	2	6	140125	140130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493088
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2261	NC_004572	ATC	2	6	140270	140275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493088
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2265	NC_004572	A	6	6	140537	140542	100 %	0 %	0 %	0 %	28493088
2266	NC_004572	GTA	2	6	140647	140652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493088
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2271	NC_004572	CTGC	2	8	141075	141082	0 %	25 %	25 %	50 %	28493089
2272	NC_004572	CAT	2	6	141108	141113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493089
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2274	NC_004572	CATG	2	8	141142	141149	25 %	25 %	25 %	25 %	28493089
2275	NC_004572	CAT	2	6	141194	141199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493089
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2282	NC_004572	TC	3	6	141649	141654	0 %	50 %	0 %	50 %	28493089
2283	NC_004572	A	7	7	141662	141668	100 %	0 %	0 %	0 %	28493089
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2356	NC_004572	TAACGA	2	12	146285	146296	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	28493092
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2371	NC_004572	CGTG	2	8	147444	147451	0 %	25 %	50 %	25 %	28493094
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2500	NC_004572	CAGACA	2	12	155282	155293	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	28493101

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