MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004572	TTGG	2	8	63511	63518	0 %	50 %	50 %	0 %	28493029
1002	NC_004572	CAT	2	6	63573	63578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493029
1003	NC_004572	AGG	2	6	63658	63663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493029
1004	NC_004572	ATTTG	2	10	63677	63686	20 %	60 %	20 %	0 %	28493029
1005	NC_004572	ACT	2	6	63694	63699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493029
1006	NC_004572	GTT	2	6	63811	63816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493029
1007	NC_004572	T	6	6	63907	63912	0 %	100 %	0 %	0 %	28493029
1008	NC_004572	ACA	2	6	63929	63934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493029
1009	NC_004572	TCT	2	6	63972	63977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493029
1010	NC_004572	TG	3	6	64041	64046	0 %	50 %	50 %	0 %	28493029
1011	NC_004572	T	8	8	64154	64161	0 %	100 %	0 %	0 %	28493029
1012	NC_004572	CA	3	6	64185	64190	50 %	0 %	0 %	50 %	28493029
1013	NC_004572	AT	3	6	64202	64207	50 %	50 %	0 %	0 %	28493029
1014	NC_004572	TCG	2	6	64307	64312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493029
1015	NC_004572	ACA	2	6	64388	64393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493029
1016	NC_004572	T	7	7	64395	64401	0 %	100 %	0 %	0 %	28493029
1017	NC_004572	CTT	2	6	64608	64613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493030
1018	NC_004572	CCA	2	6	64665	64670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493030
1019	NC_004572	TGT	3	9	64732	64740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493030
1020	NC_004572	GAA	2	6	64920	64925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493030
1021	NC_004572	TTG	2	6	64974	64979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493030
1022	NC_004572	ATT	2	6	64984	64989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493030
1023	NC_004572	T	8	8	65013	65020	0 %	100 %	0 %	0 %	28493030
1024	NC_004572	A	6	6	65024	65029	100 %	0 %	0 %	0 %	28493030
1025	NC_004572	GA	3	6	65167	65172	50 %	0 %	50 %	0 %	28493030
1026	NC_004572	CT	3	6	65201	65206	0 %	50 %	0 %	50 %	28493030
1027	NC_004572	AAT	2	6	65213	65218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493030
1028	NC_004572	TGCT	2	8	65397	65404	0 %	50 %	25 %	25 %	28493030
1029	NC_004572	GTT	2	6	65450	65455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493030
1030	NC_004572	GGC	2	6	65778	65783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493031
1031	NC_004572	TGT	2	6	65826	65831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493031
1032	NC_004572	TTCT	2	8	65881	65888	0 %	75 %	0 %	25 %	28493031
1033	NC_004572	T	7	7	65909	65915	0 %	100 %	0 %	0 %	28493031
1034	NC_004572	ATA	2	6	65917	65922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493031
1035	NC_004572	AAG	2	6	65946	65951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493031
1036	NC_004572	TTG	2	6	65978	65983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493031
1037	NC_004572	CCGC	2	8	66242	66249	0 %	0 %	25 %	75 %	28493031
1038	NC_004572	ATC	2	6	66407	66412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493031
1039	NC_004572	TGA	2	6	66429	66434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493031
1040	NC_004572	TTG	2	6	66446	66451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493031
1041	NC_004572	ATT	2	6	66463	66468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493031
1042	NC_004572	GATGC	2	10	66514	66523	20 %	20 %	40 %	20 %	28493031
1043	NC_004572	GA	3	6	66603	66608	50 %	0 %	50 %	0 %	28493031
1044	NC_004572	CA	3	6	66657	66662	50 %	0 %	0 %	50 %	28493031
1045	NC_004572	AGT	2	6	66714	66719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493031
1046	NC_004572	G	6	6	66866	66871	0 %	0 %	100 %	0 %	28493031
1047	NC_004572	A	6	6	66908	66913	100 %	0 %	0 %	0 %	28493031
1048	NC_004572	TAC	2	6	66937	66942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493031
1049	NC_004572	GCG	2	6	66959	66964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493031
1050	NC_004572	TGA	3	9	67020	67028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493031
1051	NC_004572	TTG	2	6	67115	67120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493031
1052	NC_004572	CTAG	2	8	67222	67229	25 %	25 %	25 %	25 %	28493031
1053	NC_004572	CCG	2	6	67341	67346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493032
1054	NC_004572	AGG	2	6	67364	67369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493032
1055	NC_004572	GC	3	6	67372	67377	0 %	0 %	50 %	50 %	28493032
1056	NC_004572	TTC	2	6	67412	67417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493032
1057	NC_004572	TTA	2	6	67424	67429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493032
1058	NC_004572	GCC	2	6	67447	67452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493032
1059	NC_004572	GC	3	6	67489	67494	0 %	0 %	50 %	50 %	28493032
1060	NC_004572	TTC	2	6	67649	67654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493032
1061	NC_004572	TGAGGG	2	12	67656	67667	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	28493032
1062	NC_004572	CTGC	2	8	67705	67712	0 %	25 %	25 %	50 %	28493032
1063	NC_004572	CAG	2	6	67717	67722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493032
1064	NC_004572	AGA	2	6	67740	67745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493032
1065	NC_004572	GAA	2	6	67926	67931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493032
1066	NC_004572	CTG	2	6	67970	67975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493032
1067	NC_004572	TCG	2	6	67976	67981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493032
1068	NC_004572	CAA	2	6	68031	68036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493032
1069	NC_004572	AAG	2	6	68110	68115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493032
1070	NC_004572	TTG	2	6	68177	68182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493032
1071	NC_004572	CTG	2	6	68192	68197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493032
1072	NC_004572	GCA	2	6	68212	68217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493032
1073	NC_004572	GTG	2	6	68243	68248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493032
1074	NC_004572	CAA	2	6	68267	68272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493032
1075	NC_004572	TGA	2	6	68277	68282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493032
1076	NC_004572	CAT	2	6	68407	68412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493032
1077	NC_004572	TGC	2	6	68442	68447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493032
1078	NC_004572	TA	3	6	68467	68472	50 %	50 %	0 %	0 %	28493032
1079	NC_004572	TTGA	2	8	68506	68513	25 %	50 %	25 %	0 %	28493032
1080	NC_004572	CTGT	2	8	68536	68543	0 %	50 %	25 %	25 %	28493032
1081	NC_004572	GC	3	6	68565	68570	0 %	0 %	50 %	50 %	28493032
1082	NC_004572	A	7	7	68578	68584	100 %	0 %	0 %	0 %	28493032
1083	NC_004572	TGT	2	6	68592	68597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493032
1084	NC_004572	GAAA	2	8	68658	68665	75 %	0 %	25 %	0 %	28493032
1085	NC_004572	TGA	3	9	68822	68830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493032
1086	NC_004572	AAG	2	6	68835	68840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493032
1087	NC_004572	CG	3	6	68906	68911	0 %	0 %	50 %	50 %	28493032
1088	NC_004572	CCCG	2	8	69093	69100	0 %	0 %	25 %	75 %	28493032
1089	NC_004572	TTG	2	6	69104	69109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493032
1090	NC_004572	GAA	2	6	69115	69120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493032
1091	NC_004572	CGC	2	6	69145	69150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493032
1092	NC_004572	GTT	2	6	69163	69168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493032
1093	NC_004572	TGA	2	6	69174	69179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493032
1094	NC_004572	GAA	2	6	69229	69234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493032
1095	NC_004572	GTC	2	6	69236	69241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493032
1096	NC_004572	T	6	6	69360	69365	0 %	100 %	0 %	0 %	28493032
1097	NC_004572	TGA	2	6	69441	69446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493032
1098	NC_004572	TGC	2	6	69561	69566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493032
1099	NC_004572	CCA	2	6	69599	69604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493032
1100	NC_004572	AGGAT	2	10	69647	69656	40 %	20 %	40 %	0 %	28493032
1101	NC_004572	CTG	2	6	69670	69675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493032
1102	NC_004572	CAA	2	6	70072	70077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493033
1103	NC_004572	GCA	2	6	70155	70160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493033
1104	NC_004572	CA	3	6	70159	70164	50 %	0 %	0 %	50 %	28493033
1105	NC_004572	CAA	2	6	70167	70172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493033
1106	NC_004572	GTC	2	6	70257	70262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493034
1107	NC_004572	T	6	6	70330	70335	0 %	100 %	0 %	0 %	28493034
1108	NC_004572	TTG	2	6	70388	70393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493034
1109	NC_004572	CTG	2	6	70397	70402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493034
1110	NC_004572	CA	3	6	70512	70517	50 %	0 %	0 %	50 %	28493034
1111	NC_004572	TGCT	2	8	70587	70594	0 %	50 %	25 %	25 %	28493035
1112	NC_004572	TTG	2	6	70627	70632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493035
1113	NC_004572	TGA	2	6	70718	70723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493035
1114	NC_004572	TGC	2	6	70730	70735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493035
1115	NC_004572	CTG	2	6	70774	70779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493035
1116	NC_004572	AAC	2	6	70787	70792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493035
1117	NC_004572	CTG	2	6	70822	70827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493035
1118	NC_004572	TTG	2	6	70828	70833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493035
1119	NC_004572	TCAT	2	8	70841	70848	25 %	50 %	0 %	25 %	28493035
1120	NC_004572	CCGC	2	8	70877	70884	0 %	0 %	25 %	75 %	28493035
1121	NC_004572	T	7	7	70932	70938	0 %	100 %	0 %	0 %	28493035
1122	NC_004572	T	7	7	70953	70959	0 %	100 %	0 %	0 %	28493035
1123	NC_004572	GCA	2	6	71013	71018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493035
1124	NC_004572	GT	3	6	71023	71028	0 %	50 %	50 %	0 %	28493035
1125	NC_004572	A	6	6	71145	71150	100 %	0 %	0 %	0 %	28493035
1126	NC_004572	GCA	2	6	71158	71163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493035
1127	NC_004572	AG	3	6	71164	71169	50 %	0 %	50 %	0 %	28493035
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