MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004572	AATT	2	8	30519	30526	50 %	50 %	0 %	0 %	28492996
502	NC_004572	GGC	2	6	30544	30549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28492996
503	NC_004572	CT	3	6	30605	30610	0 %	50 %	0 %	50 %	28492996
504	NC_004572	ACC	2	6	30643	30648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28492996
505	NC_004572	GCC	2	6	30682	30687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492997
506	NC_004572	CCA	2	6	30705	30710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28492997
507	NC_004572	TAT	2	6	30716	30721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492997
508	NC_004572	ATTG	2	8	30732	30739	25 %	50 %	25 %	0 %	28492997
509	NC_004572	AC	3	6	30806	30811	50 %	0 %	0 %	50 %	28492997
510	NC_004572	AAT	2	6	30885	30890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492997
511	NC_004572	CTCAA	2	10	30910	30919	40 %	20 %	0 %	40 %	28492997
512	NC_004572	C	6	6	30921	30926	0 %	0 %	0 %	100 %	28492997
513	NC_004572	TCA	2	6	30991	30996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492997
514	NC_004572	TCT	2	6	31051	31056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492997
515	NC_004572	ATT	2	6	31113	31118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492997
516	NC_004572	GCC	2	6	31186	31191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492997
517	NC_004572	TCA	2	6	31270	31275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492997
518	NC_004572	AT	3	6	31280	31285	50 %	50 %	0 %	0 %	28492997
519	NC_004572	GCA	2	6	31312	31317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492997
520	NC_004572	GCC	2	6	31328	31333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492997
521	NC_004572	TCA	2	6	31456	31461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492997
522	NC_004572	CGA	2	6	31494	31499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492997
523	NC_004572	CACTGT	2	12	31551	31562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28492997
524	NC_004572	AAG	2	6	32062	32067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492998
525	NC_004572	CT	3	6	32091	32096	0 %	50 %	0 %	50 %	28492998
526	NC_004572	TG	3	6	32126	32131	0 %	50 %	50 %	0 %	28492998
527	NC_004572	ACT	2	6	32294	32299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492998
528	NC_004572	GA	3	6	32327	32332	50 %	0 %	50 %	0 %	28492998
529	NC_004572	ACT	2	6	32380	32385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492998
530	NC_004572	TGC	3	9	32412	32420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492998
531	NC_004572	GGT	2	6	32446	32451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28492998
532	NC_004572	AC	3	6	32506	32511	50 %	0 %	0 %	50 %	28492998
533	NC_004572	TAT	2	6	32590	32595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492999
534	NC_004572	TGG	2	6	32602	32607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28492999
535	NC_004572	GAT	2	6	32677	32682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492999
536	NC_004572	TAT	2	6	32684	32689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492999
537	NC_004572	ATG	2	6	32705	32710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492999
538	NC_004572	AAC	2	6	32737	32742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492999
539	NC_004572	AT	3	6	32907	32912	50 %	50 %	0 %	0 %	28492999
540	NC_004572	GTT	2	6	33011	33016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492999
541	NC_004572	GAA	2	6	33050	33055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492999
542	NC_004572	TTTA	2	8	33186	33193	25 %	75 %	0 %	0 %	28492999
543	NC_004572	GTTG	2	8	33320	33327	0 %	50 %	50 %	0 %	28492999
544	NC_004572	TGGA	2	8	33352	33359	25 %	25 %	50 %	0 %	28492999
545	NC_004572	GAT	3	9	33362	33370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492999
546	NC_004572	CCT	2	6	33430	33435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28492999
547	NC_004572	ACT	2	6	33467	33472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493000
548	NC_004572	T	7	7	33546	33552	0 %	100 %	0 %	0 %	28493000
549	NC_004572	A	8	8	33594	33601	100 %	0 %	0 %	0 %	28493000
550	NC_004572	A	6	6	33720	33725	100 %	0 %	0 %	0 %	28493000
551	NC_004572	ATG	2	6	33769	33774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493000
552	NC_004572	AT	3	6	33863	33868	50 %	50 %	0 %	0 %	28493000
553	NC_004572	GGAT	2	8	33921	33928	25 %	25 %	50 %	0 %	28493000
554	NC_004572	AG	3	6	34001	34006	50 %	0 %	50 %	0 %	28493000
555	NC_004572	CAA	2	6	34196	34201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493000
556	NC_004572	ACTC	2	8	34209	34216	25 %	25 %	0 %	50 %	28493000
557	NC_004572	A	6	6	34246	34251	100 %	0 %	0 %	0 %	28493000
558	NC_004572	TC	3	6	34252	34257	0 %	50 %	0 %	50 %	28493000
559	NC_004572	TCATTG	2	12	34307	34318	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28493000
560	NC_004572	TGT	2	6	34352	34357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493001
561	NC_004572	TAG	2	6	34362	34367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493001
562	NC_004572	T	7	7	34491	34497	0 %	100 %	0 %	0 %	28493001
563	NC_004572	TCA	2	6	34527	34532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493001
564	NC_004572	CAA	2	6	34535	34540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493001
565	NC_004572	GGTCTG	2	12	34543	34554	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28493001
566	NC_004572	ATAC	2	8	34586	34593	50 %	25 %	0 %	25 %	28493001
567	NC_004572	CAA	2	6	34648	34653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493001
568	NC_004572	TA	3	6	34713	34718	50 %	50 %	0 %	0 %	28493001
569	NC_004572	TC	3	6	34720	34725	0 %	50 %	0 %	50 %	28493001
570	NC_004572	CCGC	2	8	34778	34785	0 %	0 %	25 %	75 %	28493001
571	NC_004572	AGA	2	6	34836	34841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493001
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573	NC_004572	CT	3	6	34931	34936	0 %	50 %	0 %	50 %	28493001
574	NC_004572	TC	3	6	34967	34972	0 %	50 %	0 %	50 %	28493001
575	NC_004572	TAT	2	6	34984	34989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493001
576	NC_004572	T	6	6	35003	35008	0 %	100 %	0 %	0 %	28493001
577	NC_004572	AAT	2	6	35255	35260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493002
578	NC_004572	GCT	2	6	35294	35299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493002
579	NC_004572	CAG	2	6	35302	35307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493002
580	NC_004572	T	6	6	35317	35322	0 %	100 %	0 %	0 %	28493002
581	NC_004572	AGA	2	6	35355	35360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493002
582	NC_004572	GAAT	2	8	35408	35415	50 %	25 %	25 %	0 %	28493002
583	NC_004572	TGT	2	6	35466	35471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493002
584	NC_004572	TC	3	6	35475	35480	0 %	50 %	0 %	50 %	28493002
585	NC_004572	TTG	2	6	35566	35571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493002
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588	NC_004572	CT	3	6	35675	35680	0 %	50 %	0 %	50 %	28493002
589	NC_004572	TAAA	2	8	35684	35691	75 %	25 %	0 %	0 %	28493002
590	NC_004572	ATT	2	6	35711	35716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493002
591	NC_004572	ACA	2	6	35727	35732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493002
592	NC_004572	AAAT	2	8	35782	35789	75 %	25 %	0 %	0 %	28493002
593	NC_004572	ATA	2	6	35843	35848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493002
594	NC_004572	ATA	2	6	36019	36024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493002
595	NC_004572	GTT	2	6	36139	36144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493003
596	NC_004572	CGG	2	6	36159	36164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493003
597	NC_004572	AGC	2	6	36179	36184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493003
598	NC_004572	TGA	2	6	36185	36190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493003
599	NC_004572	TGA	2	6	36216	36221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493003
600	NC_004572	TGA	2	6	36234	36239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493003
601	NC_004572	TGA	2	6	36249	36254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493003
602	NC_004572	GA	3	6	36259	36264	50 %	0 %	50 %	0 %	28493003
603	NC_004572	ATT	2	6	36265	36270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493003
604	NC_004572	A	6	6	36339	36344	100 %	0 %	0 %	0 %	28493003
605	NC_004572	ATC	2	6	36366	36371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493003
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608	NC_004572	ATG	2	6	36683	36688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493003
609	NC_004572	ACA	2	6	36753	36758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493003
610	NC_004572	GC	3	6	36776	36781	0 %	0 %	50 %	50 %	28493003
611	NC_004572	GGC	2	6	36782	36787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493003
612	NC_004572	CG	3	6	36914	36919	0 %	0 %	50 %	50 %	28493003
613	NC_004572	A	7	7	36936	36942	100 %	0 %	0 %	0 %	28493003
614	NC_004572	GA	3	6	36952	36957	50 %	0 %	50 %	0 %	28493003
615	NC_004572	GCA	2	6	36962	36967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493003
616	NC_004572	GCA	2	6	37080	37085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493003
617	NC_004572	AGG	2	6	37255	37260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493004
618	NC_004572	TCT	2	6	37264	37269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493004
619	NC_004572	CTG	2	6	37314	37319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493004
620	NC_004572	AGA	2	6	37336	37341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493004
621	NC_004572	GAACA	2	10	37353	37362	60 %	0 %	20 %	20 %	28493004
622	NC_004572	ATT	2	6	37378	37383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493004
623	NC_004572	AAG	2	6	37452	37457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493004
624	NC_004572	CCA	2	6	37458	37463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493004
625	NC_004572	A	6	6	37545	37550	100 %	0 %	0 %	0 %	28493004
626	NC_004572	ACT	2	6	37614	37619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493004
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628	NC_004572	CCTT	2	8	37669	37676	0 %	50 %	0 %	50 %	28493005
629	NC_004572	CAC	2	6	37703	37708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493005
630	NC_004572	CTT	2	6	37714	37719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493005
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632	NC_004572	AAC	3	9	38033	38041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493005
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