MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_004572	GA	3	6	372681	372686	50 %	0 %	50 %	0 %	28493257
5503	NC_004572	GCT	3	9	372778	372786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493257
5504	NC_004572	TGA	2	6	372990	372995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493257
5505	NC_004572	AAT	2	6	373075	373080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493257
5506	NC_004572	ACTC	2	8	373142	373149	25 %	25 %	0 %	50 %	28493257
5507	NC_004572	TGCGC	2	10	373196	373205	0 %	20 %	40 %	40 %	28493257
5508	NC_004572	TTA	2	6	373433	373438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493257
5509	NC_004572	CCA	2	6	373481	373486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493257
5510	NC_004572	A	6	6	373610	373615	100 %	0 %	0 %	0 %	28493257
5511	NC_004572	GTG	2	6	373673	373678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493257
5512	NC_004572	GCA	2	6	373693	373698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493257
5513	NC_004572	TG	3	6	373730	373735	0 %	50 %	50 %	0 %	28493257
5514	NC_004572	ATT	2	6	373795	373800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493257
5515	NC_004572	TC	5	10	373835	373844	0 %	50 %	0 %	50 %	28493257
5516	NC_004572	T	6	6	373860	373865	0 %	100 %	0 %	0 %	28493257
5517	NC_004572	AG	3	6	373869	373874	50 %	0 %	50 %	0 %	28493257
5518	NC_004572	GAT	2	6	373893	373898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493257
5519	NC_004572	GA	3	6	373946	373951	50 %	0 %	50 %	0 %	28493257
5520	NC_004572	ATT	2	6	373960	373965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493257
5521	NC_004572	TGA	2	6	374270	374275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493258
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5523	NC_004572	CGT	2	6	374322	374327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493258
5524	NC_004572	GGA	2	6	374331	374336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493258
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5535	NC_004572	AAG	2	6	374834	374839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493258
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5540	NC_004572	GTCA	2	8	375061	375068	25 %	25 %	25 %	25 %	28493259
5541	NC_004572	A	6	6	375142	375147	100 %	0 %	0 %	0 %	28493259
5542	NC_004572	T	6	6	375160	375165	0 %	100 %	0 %	0 %	28493259
5543	NC_004572	GAT	2	6	375241	375246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493259
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5546	NC_004572	TAT	2	6	375353	375358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493259
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5550	NC_004572	A	8	8	375495	375502	100 %	0 %	0 %	0 %	28493259
5551	NC_004572	A	6	6	375509	375514	100 %	0 %	0 %	0 %	28493259
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5556	NC_004572	ATCTG	2	10	375681	375690	20 %	40 %	20 %	20 %	28493259
5557	NC_004572	GA	3	6	375701	375706	50 %	0 %	50 %	0 %	28493259
5558	NC_004572	TTC	2	6	375731	375736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493259
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5560	NC_004572	CTT	2	6	375769	375774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493259
5561	NC_004572	GCA	2	6	375799	375804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493259
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5599	NC_004572	GAG	2	6	377710	377715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493261
5600	NC_004572	CG	5	10	377777	377786	0 %	0 %	50 %	50 %	28493261
5601	NC_004572	AG	3	6	377813	377818	50 %	0 %	50 %	0 %	28493261
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5604	NC_004572	ATTC	2	8	378058	378065	25 %	50 %	0 %	25 %	28493261
5605	NC_004572	GC	3	6	378096	378101	0 %	0 %	50 %	50 %	28493261
5606	NC_004572	G	6	6	378120	378125	0 %	0 %	100 %	0 %	28493261
5607	NC_004572	GT	3	6	378273	378278	0 %	50 %	50 %	0 %	28493261
5608	NC_004572	CAGA	2	8	378405	378412	50 %	0 %	25 %	25 %	28493262
5609	NC_004572	CTT	2	6	378440	378445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493262
5610	NC_004572	TACGGG	2	12	378451	378462	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	28493262
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5612	NC_004572	CAA	2	6	378526	378531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493262
5613	NC_004572	T	6	6	378569	378574	0 %	100 %	0 %	0 %	28493262
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5615	NC_004572	TAC	2	6	378614	378619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493262
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5617	NC_004572	TTG	2	6	378741	378746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493262
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5619	NC_004572	ACA	2	6	378873	378878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493262
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5623	NC_004572	GCA	2	6	379129	379134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493262
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