MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004572	AGC	2	6	317746	317751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493197
4502	NC_004572	AGG	2	6	317796	317801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493197
4503	NC_004572	TGGC	2	8	317887	317894	0 %	25 %	50 %	25 %	28493197
4504	NC_004572	GAT	2	6	317913	317918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493197
4505	NC_004572	TTG	2	6	317962	317967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493197
4506	NC_004572	A	6	6	317984	317989	100 %	0 %	0 %	0 %	28493197
4507	NC_004572	AGG	2	6	318013	318018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493197
4508	NC_004572	AG	3	6	318089	318094	50 %	0 %	50 %	0 %	28493197
4509	NC_004572	AGC	2	6	318199	318204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493197
4510	NC_004572	TTG	2	6	318205	318210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493197
4511	NC_004572	TGGG	2	8	318218	318225	0 %	25 %	75 %	0 %	28493197
4512	NC_004572	A	6	6	318252	318257	100 %	0 %	0 %	0 %	28493197
4513	NC_004572	AGT	2	6	318405	318410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493197
4514	NC_004572	CAG	2	6	318436	318441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493197
4515	NC_004572	ATC	2	6	318540	318545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493198
4516	NC_004572	TTC	2	6	318554	318559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493198
4517	NC_004572	TCT	2	6	318561	318566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493198
4518	NC_004572	TGC	2	6	318674	318679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493198
4519	NC_004572	TGT	2	6	318701	318706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493198
4520	NC_004572	GTAA	2	8	318794	318801	50 %	25 %	25 %	0 %	28493198
4521	NC_004572	ATC	2	6	318875	318880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493198
4522	NC_004572	TTGCA	2	10	318918	318927	20 %	40 %	20 %	20 %	28493198
4523	NC_004572	TGA	2	6	318934	318939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493198
4524	NC_004572	TGCA	2	8	318944	318951	25 %	25 %	25 %	25 %	28493198
4525	NC_004572	GAAA	2	8	319025	319032	75 %	0 %	25 %	0 %	28493199
4526	NC_004572	TGT	3	9	319091	319099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493199
4527	NC_004572	TGT	2	6	319262	319267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493200
4528	NC_004572	T	7	7	319286	319292	0 %	100 %	0 %	0 %	28493200
4529	NC_004572	TTG	2	6	319297	319302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493200
4530	NC_004572	TG	3	6	319309	319314	0 %	50 %	50 %	0 %	28493200
4531	NC_004572	TTC	2	6	319343	319348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493200
4532	NC_004572	CTG	2	6	319374	319379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493200
4533	NC_004572	CTT	2	6	319380	319385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493200
4534	NC_004572	T	6	6	319413	319418	0 %	100 %	0 %	0 %	28493200
4535	NC_004572	TG	3	6	319532	319537	0 %	50 %	50 %	0 %	28493200
4536	NC_004572	CTT	2	6	319618	319623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493200
4537	NC_004572	T	7	7	319710	319716	0 %	100 %	0 %	0 %	28493200
4538	NC_004572	G	6	6	319753	319758	0 %	0 %	100 %	0 %	28493201
4539	NC_004572	TGC	2	6	319808	319813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493201
4540	NC_004572	TCTT	2	8	319814	319821	0 %	75 %	0 %	25 %	28493201
4541	NC_004572	GAG	2	6	319842	319847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493201
4542	NC_004572	GCC	2	6	319868	319873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493201
4543	NC_004572	CGGGG	2	10	319874	319883	0 %	0 %	80 %	20 %	28493201
4544	NC_004572	GTG	2	6	319900	319905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493201
4545	NC_004572	CTTG	2	8	319925	319932	0 %	50 %	25 %	25 %	28493201
4546	NC_004572	TGA	2	6	319982	319987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493201
4547	NC_004572	GTT	2	6	320043	320048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493201
4548	NC_004572	GCA	2	6	320081	320086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493201
4549	NC_004572	TG	3	6	320107	320112	0 %	50 %	50 %	0 %	28493201
4550	NC_004572	T	6	6	320151	320156	0 %	100 %	0 %	0 %	28493201
4551	NC_004572	TCT	2	6	320189	320194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493202
4552	NC_004572	A	6	6	320202	320207	100 %	0 %	0 %	0 %	28493202
4553	NC_004572	A	6	6	320249	320254	100 %	0 %	0 %	0 %	28493202
4554	NC_004572	CAT	2	6	320271	320276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493202
4555	NC_004572	AGA	2	6	320293	320298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493202
4556	NC_004572	TTA	2	6	320307	320312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493202
4557	NC_004572	CTG	2	6	320352	320357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493202
4558	NC_004572	CGA	2	6	320395	320400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493202
4559	NC_004572	ATT	2	6	320417	320422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493202
4560	NC_004572	ACT	2	6	320459	320464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493202
4561	NC_004572	GCG	2	6	320479	320484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493202
4562	NC_004572	GAG	2	6	320486	320491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493202
4563	NC_004572	GAA	2	6	320614	320619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493202
4564	NC_004572	A	7	7	320654	320660	100 %	0 %	0 %	0 %	28493202
4565	NC_004572	TTC	2	6	320697	320702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493202
4566	NC_004572	AAGG	2	8	320713	320720	50 %	0 %	50 %	0 %	28493202
4567	NC_004572	CATT	2	8	320738	320745	25 %	50 %	0 %	25 %	28493202
4568	NC_004572	CTC	2	6	320753	320758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493202
4569	NC_004572	AAT	2	6	320759	320764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493202
4570	NC_004572	A	6	6	320801	320806	100 %	0 %	0 %	0 %	28493202
4571	NC_004572	T	6	6	320809	320814	0 %	100 %	0 %	0 %	28493202
4572	NC_004572	GTT	2	6	320954	320959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493203
4573	NC_004572	ATT	2	6	320997	321002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493203
4574	NC_004572	AGG	2	6	321036	321041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493203
4575	NC_004572	AT	3	6	321065	321070	50 %	50 %	0 %	0 %	28493203
4576	NC_004572	GGC	2	6	321105	321110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493203
4577	NC_004572	AGC	2	6	321156	321161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493203
4578	NC_004572	TCTA	2	8	321222	321229	25 %	50 %	0 %	25 %	28493203
4579	NC_004572	TTC	2	6	321303	321308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493203
4580	NC_004572	GA	3	6	321359	321364	50 %	0 %	50 %	0 %	28493203
4581	NC_004572	CTGT	2	8	321388	321395	0 %	50 %	25 %	25 %	28493204
4582	NC_004572	TGA	2	6	321406	321411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493204
4583	NC_004572	GCATAA	2	12	321447	321458	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	28493204
4584	NC_004572	AGG	2	6	321557	321562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493204
4585	NC_004572	AG	3	6	321649	321654	50 %	0 %	50 %	0 %	28493204
4586	NC_004572	CT	3	6	321778	321783	0 %	50 %	0 %	50 %	28493204
4587	NC_004572	AG	3	6	321805	321810	50 %	0 %	50 %	0 %	28493204
4588	NC_004572	T	6	6	321844	321849	0 %	100 %	0 %	0 %	28493205
4589	NC_004572	GT	3	6	321862	321867	0 %	50 %	50 %	0 %	28493205
4590	NC_004572	CA	3	6	321882	321887	50 %	0 %	0 %	50 %	28493205
4591	NC_004572	TGC	2	6	322000	322005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493205
4592	NC_004572	TAA	2	6	322102	322107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493205
4593	NC_004572	A	6	6	322106	322111	100 %	0 %	0 %	0 %	28493205
4594	NC_004572	AAT	2	6	322166	322171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493205
4595	NC_004572	A	6	6	322182	322187	100 %	0 %	0 %	0 %	28493205
4596	NC_004572	AAT	2	6	322234	322239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493205
4597	NC_004572	TAC	2	6	322410	322415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493205
4598	NC_004572	AACA	2	8	322495	322502	75 %	0 %	0 %	25 %	28493205
4599	NC_004572	GCT	2	6	322507	322512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493205
4600	NC_004572	GTT	2	6	322538	322543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493205
4601	NC_004572	GAAT	2	8	322579	322586	50 %	25 %	25 %	0 %	28493205
4602	NC_004572	TGG	2	6	322600	322605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493205
4603	NC_004572	AAAG	2	8	322625	322632	75 %	0 %	25 %	0 %	28493205
4604	NC_004572	TCG	2	6	322657	322662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493205
4605	NC_004572	TAT	2	6	322687	322692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493205
4606	NC_004572	AG	3	6	322729	322734	50 %	0 %	50 %	0 %	28493205
4607	NC_004572	GTC	2	6	322824	322829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493205
4608	NC_004572	CCAG	2	8	322976	322983	25 %	0 %	25 %	50 %	28493206
4609	NC_004572	GTT	2	6	323015	323020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493206
4610	NC_004572	ATT	2	6	323133	323138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493206
4611	NC_004572	TAA	2	6	323218	323223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493206
4612	NC_004572	CAGAAT	2	12	323240	323251	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	28493206
4613	NC_004572	AAG	2	6	323279	323284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493206
4614	NC_004572	TTGT	2	8	323313	323320	0 %	75 %	25 %	0 %	28493206
4615	NC_004572	CCA	2	6	323334	323339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493206
4616	NC_004572	TCG	2	6	323355	323360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493206
4617	NC_004572	TGA	2	6	323399	323404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493206
4618	NC_004572	TGC	2	6	323414	323419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493206
4619	NC_004572	CTTT	2	8	323462	323469	0 %	75 %	0 %	25 %	28493207
4620	NC_004572	AAC	2	6	323525	323530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493207
4621	NC_004572	ACA	2	6	323587	323592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493207
4622	NC_004572	CAAA	2	8	323641	323648	75 %	0 %	0 %	25 %	28493207
4623	NC_004572	ATT	2	6	323649	323654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493207
4624	NC_004572	T	6	6	323780	323785	0 %	100 %	0 %	0 %	28493207
4625	NC_004572	TC	3	6	323799	323804	0 %	50 %	0 %	50 %	28493207
4626	NC_004572	TCT	2	6	323871	323876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493207
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4749	NC_004572	TCTTG	2	10	330011	330020	0 %	60 %	20 %	20 %	28493214
4750	NC_004572	TGC	2	6	330047	330052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493214
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